Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4M5Y5

Protein Details
Accession A0A4S4M5Y5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
140-163ADRVATRRCPRKPRRPRSVAPVRSHydrophilic
181-202KSEKAPRAKKVKDPKAPKRAMSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
149-156PRKPRRPR
175-199QRKAAGKSEKAPRAKKVKDPKAPKR
Subcellular Location(s) mito 10.5, nucl 9, cyto_mito 9, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01390  HMG-box_NHP6-like  
Amino Acid Sequences MSVRAANERRLKIPWEMISKEGDRPKNETARPTVTVQLPPGPARASTQPLPYTRPPAPAYPPSTTSLHRLPSEYLNRKSIVHSVSLGALIDGDAVVVVDVDPLWAFDERKARRVLGSSCWAARLLPSDLLIFGPRVGMLADRVATRRCPRKPRRPRSVAPVRSLHASCAEPIHAQRKAAGKSEKAPRAKKVKDPKAPKRAMSAYMFFSQDWRERIRTENPDASFGEVGKLLGAKWKELDESEKKPYIEQAARDKQRAEQDKAEYEGKNAGSGDGDEEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.48
3 0.47
4 0.45
5 0.48
6 0.46
7 0.48
8 0.49
9 0.48
10 0.43
11 0.47
12 0.53
13 0.56
14 0.58
15 0.57
16 0.55
17 0.54
18 0.54
19 0.51
20 0.49
21 0.43
22 0.42
23 0.38
24 0.37
25 0.34
26 0.31
27 0.31
28 0.26
29 0.23
30 0.24
31 0.25
32 0.26
33 0.26
34 0.31
35 0.34
36 0.35
37 0.41
38 0.41
39 0.43
40 0.4
41 0.43
42 0.4
43 0.39
44 0.43
45 0.45
46 0.46
47 0.44
48 0.44
49 0.41
50 0.41
51 0.38
52 0.37
53 0.34
54 0.33
55 0.31
56 0.3
57 0.28
58 0.34
59 0.43
60 0.46
61 0.45
62 0.44
63 0.44
64 0.43
65 0.42
66 0.39
67 0.31
68 0.24
69 0.21
70 0.18
71 0.18
72 0.17
73 0.15
74 0.09
75 0.08
76 0.06
77 0.05
78 0.04
79 0.03
80 0.02
81 0.02
82 0.02
83 0.02
84 0.02
85 0.02
86 0.02
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.04
91 0.06
92 0.06
93 0.1
94 0.19
95 0.2
96 0.25
97 0.27
98 0.26
99 0.26
100 0.3
101 0.29
102 0.25
103 0.29
104 0.26
105 0.25
106 0.25
107 0.23
108 0.19
109 0.17
110 0.15
111 0.12
112 0.1
113 0.11
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.07
119 0.06
120 0.05
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.07
130 0.08
131 0.12
132 0.17
133 0.25
134 0.32
135 0.42
136 0.52
137 0.62
138 0.73
139 0.8
140 0.85
141 0.85
142 0.83
143 0.82
144 0.83
145 0.78
146 0.71
147 0.64
148 0.54
149 0.5
150 0.46
151 0.36
152 0.28
153 0.23
154 0.18
155 0.15
156 0.15
157 0.12
158 0.14
159 0.2
160 0.18
161 0.18
162 0.21
163 0.27
164 0.28
165 0.34
166 0.35
167 0.31
168 0.37
169 0.46
170 0.5
171 0.52
172 0.54
173 0.55
174 0.61
175 0.63
176 0.65
177 0.67
178 0.7
179 0.72
180 0.79
181 0.81
182 0.82
183 0.83
184 0.75
185 0.72
186 0.65
187 0.61
188 0.54
189 0.46
190 0.39
191 0.37
192 0.36
193 0.28
194 0.26
195 0.24
196 0.25
197 0.25
198 0.25
199 0.25
200 0.26
201 0.31
202 0.38
203 0.41
204 0.44
205 0.48
206 0.45
207 0.46
208 0.45
209 0.43
210 0.35
211 0.28
212 0.22
213 0.15
214 0.14
215 0.11
216 0.1
217 0.07
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.15
222 0.16
223 0.17
224 0.19
225 0.27
226 0.28
227 0.33
228 0.39
229 0.43
230 0.42
231 0.41
232 0.44
233 0.44
234 0.42
235 0.43
236 0.46
237 0.52
238 0.57
239 0.6
240 0.57
241 0.54
242 0.59
243 0.61
244 0.57
245 0.53
246 0.54
247 0.56
248 0.59
249 0.58
250 0.48
251 0.42
252 0.41
253 0.34
254 0.3
255 0.26
256 0.22
257 0.18
258 0.18
259 0.18