FuNGI

A0A4S4LLA6

Protein Details

Accession

A0A4S4LLA6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
108-128	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
933-934	GR

Subcellular Location(s)

mito 10, nucl 8, cyto 8, cyto_nucl 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSKKYPKIVTPVAEEDEVKVEGENGEEITIPINMSMPNPNEVEFDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPETEEEMMIEIFKYTERVVNMVRPRKLLFMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKEKEVAHREAVAIWESMGKSISDEEKSKKSWDQNAITPGTPFMTLLSTSLQYWVVQKANTDPGWKQLEVIISDASVPGEGEHKIMDFIRRQRANQGHDPNTRHVIYGLDADLIMLALATHEPHFRVLREDVFSQSNSTACRLCGQEGHYAAQCTGTKAEMPKQPQEKKPFIFLDVSVLREYLEVELDVSQAPFPFNLEMAIDDWVLLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLRIWKDELPRMGGYVTNHGQLILPRAQIILDGLARREDEIFRKRREAEERQNQNAKRRKLEGPVDANGSSGPSASLQLTADPRNAPVANDFAAKADSVGLGVHGGRTAAQALAGSNSDVVANRAAIRMANLSAAEMLKAEMASAMPVKRSAPPSKPAPIVPPPLAISETLASTNASDVDVPGLGSGALEDSHSSAEPMTPTKPAEDADADGEADIFMASIASVDVAASMKLSETHVVGSKRSFDEAAEDLVDDSLGDEDEDEEAPVNKSLAFKVNADGTVEQEDTVRLWEPGYKERYYRQKFSIESTDLEFKKKLTTFYVEGLAWVLCYYYQGTPSWQWFYPFHFAPFAADFEDIAKMNIDFIEGTPFKPFEQLMGVFPPASRQHIPEVFHHLMIDQTSPILDFYPTSFDIDMNGKRMAWQGVVLLPFINSTRLLEAMAPYYPKLSEDEVRRNKWGNNILFIAEEHSLYPFLESLYGKKKKQEPVPLNVTASKGMSGSVLPNPDCIPGSTYYSPLSSEGLNDIRNDRTLSALYFFPKQLTPHRSVLLPGVRRPPRALNAQDLETTRRGGRGRGRGGQPRSDFGGHASTFASQTYYGSMSSSYSTGRMQERGTSYSRPPPSYQQVSSYSLRQSQSYHSSSQINHGDVSRLPPHPPTSYNAGGYSGGRGGRPSRGGPGGYGGSSTSNRGYSGGPQRGRGGYSGGGGGGYGGPGYSGGSGGYGGYGDSHSNGYGGYSRGGSYNASRGRGRGGRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.62
3	0.66
4	0.68
5	0.65
6	0.62
7	0.59
8	0.55
9	0.48
10	0.44
11	0.37
12	0.33
13	0.28
14	0.22
15	0.16
16	0.14
17	0.12
18	0.13
19	0.12
20	0.09
21	0.09
22	0.09
23	0.09
24	0.1
25	0.1
26	0.09
27	0.08
28	0.09
29	0.09
30	0.11
31	0.17
32	0.18
33	0.21
34	0.22
35	0.23
36	0.23
37	0.24
38	0.28
39	0.22
40	0.21
41	0.19
42	0.18
43	0.18
44	0.16
45	0.15
46	0.1
47	0.09
48	0.09
49	0.08
50	0.08
51	0.09
52	0.1
53	0.12
54	0.17
55	0.2
56	0.2
57	0.28
58	0.37
59	0.43
60	0.49
61	0.49
62	0.5
63	0.51
64	0.54
65	0.48
66	0.43
67	0.37
68	0.31
69	0.28
70	0.23
71	0.18
72	0.14
73	0.13
74	0.09
75	0.09
76	0.09
77	0.13
78	0.14
79	0.17
80	0.2
81	0.28
82	0.37
83	0.44
84	0.46
85	0.46
86	0.47
87	0.47
88	0.46
89	0.42
90	0.34
91	0.29
92	0.28
93	0.25
94	0.25
95	0.21
96	0.21
97	0.17
98	0.16
99	0.12
100	0.14
101	0.2
102	0.27
103	0.37
104	0.45
105	0.55
106	0.66
107	0.74
108	0.8
109	0.82
110	0.79
111	0.76
112	0.77
113	0.77
114	0.75
115	0.77
116	0.72
117	0.68
118	0.69
119	0.63
120	0.56
121	0.55
122	0.48
123	0.39
124	0.36
125	0.32
126	0.27
127	0.28
128	0.25
129	0.16
130	0.14
131	0.15
132	0.14
133	0.14
134	0.13
135	0.11
136	0.1
137	0.14
138	0.18
139	0.18
140	0.23
141	0.28
142	0.33
143	0.35
144	0.39
145	0.42
146	0.46
147	0.51
148	0.56
149	0.56
150	0.57
151	0.61
152	0.6
153	0.53
154	0.46
155	0.38
156	0.3
157	0.24
158	0.18
159	0.12
160	0.1
161	0.1
162	0.1
163	0.12
164	0.12
165	0.12
166	0.13
167	0.13
168	0.12
169	0.14
170	0.18
171	0.18
172	0.18
173	0.19
174	0.22
175	0.28
176	0.29
177	0.3
178	0.26
179	0.31
180	0.36
181	0.35
182	0.31
183	0.26
184	0.29
185	0.26
186	0.27
187	0.19
188	0.14
189	0.14
190	0.14
191	0.11
192	0.08
193	0.07
194	0.05
195	0.07
196	0.07
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.1
201	0.11
202	0.15
203	0.2
204	0.27
205	0.36
206	0.39
207	0.4
208	0.49
209	0.55
210	0.58
211	0.61
212	0.63
213	0.62
214	0.66
215	0.69
216	0.64
217	0.62
218	0.55
219	0.46
220	0.37
221	0.29
222	0.23
223	0.21
224	0.17
225	0.12
226	0.11
227	0.1
228	0.09
229	0.08
230	0.06
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.06
237	0.07
238	0.08
239	0.12
240	0.14
241	0.14
242	0.18
243	0.2
244	0.23
245	0.26
246	0.26
247	0.26
248	0.27
249	0.27
250	0.24
251	0.22
252	0.2
253	0.17
254	0.18
255	0.16
256	0.14
257	0.17
258	0.17
259	0.17
260	0.19
261	0.21
262	0.25
263	0.26
264	0.28
265	0.26
266	0.25
267	0.24
268	0.25
269	0.23
270	0.18
271	0.17
272	0.15
273	0.16
274	0.18
275	0.25
276	0.26
277	0.3
278	0.37
279	0.46
280	0.53
281	0.59
282	0.65
283	0.66
284	0.62
285	0.65
286	0.58
287	0.51
288	0.45
289	0.37
290	0.37
291	0.3
292	0.3
293	0.22
294	0.21
295	0.18
296	0.16
297	0.16
298	0.09
299	0.08
300	0.06
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.06
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.08
317	0.09
318	0.08
319	0.07
320	0.07
321	0.06
322	0.06
323	0.05
324	0.04
325	0.03
326	0.02
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.04
331	0.05
332	0.06
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.07
337	0.08
338	0.12
339	0.12
340	0.13
341	0.12
342	0.12
343	0.12
344	0.11
345	0.11
346	0.07
347	0.05
348	0.08
349	0.1
350	0.09
351	0.1
352	0.11
353	0.15
354	0.18
355	0.22
356	0.21
357	0.23
358	0.24
359	0.24
360	0.22
361	0.21
362	0.18
363	0.2
364	0.2
365	0.17
366	0.17
367	0.16
368	0.16
369	0.15
370	0.18
371	0.15
372	0.14
373	0.13
374	0.13
375	0.13
376	0.12
377	0.12
378	0.09
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.09
383	0.1
384	0.1
385	0.11
386	0.12
387	0.17
388	0.26
389	0.33
390	0.35
391	0.4
392	0.41
393	0.46
394	0.53
395	0.55
396	0.57
397	0.6
398	0.65
399	0.67
400	0.74
401	0.7
402	0.71
403	0.7
404	0.64
405	0.58
406	0.56
407	0.53
408	0.53
409	0.56
410	0.55
411	0.51
412	0.49
413	0.47
414	0.41
415	0.37
416	0.29
417	0.23
418	0.15
419	0.1
420	0.08
421	0.05
422	0.06
423	0.06
424	0.07
425	0.06
426	0.09
427	0.11
428	0.12
429	0.14
430	0.13
431	0.13
432	0.16
433	0.16
434	0.14
435	0.13
436	0.13
437	0.12
438	0.13
439	0.12
440	0.1
441	0.1
442	0.09
443	0.08
444	0.07
445	0.06
446	0.05
447	0.05
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.04
456	0.05
457	0.04
458	0.04
459	0.05
460	0.05
461	0.06
462	0.06
463	0.05
464	0.05
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.06
469	0.05
470	0.06
471	0.06
472	0.07
473	0.07
474	0.06
475	0.07
476	0.07
477	0.07
478	0.07
479	0.06
480	0.06
481	0.07
482	0.07
483	0.06
484	0.05
485	0.05
486	0.04
487	0.04
488	0.04
489	0.03
490	0.03
491	0.04
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.07
496	0.08
497	0.11
498	0.17
499	0.21
500	0.24
501	0.28
502	0.33
503	0.37
504	0.38
505	0.35
506	0.35
507	0.35
508	0.35
509	0.31
510	0.28
511	0.24
512	0.23
513	0.23
514	0.17
515	0.13
516	0.09
517	0.09
518	0.08
519	0.07
520	0.06
521	0.06
522	0.06
523	0.05
524	0.05
525	0.04
526	0.04
527	0.04
528	0.04
529	0.04
530	0.04
531	0.03
532	0.03
533	0.03
534	0.03
535	0.03
536	0.03
537	0.03
538	0.03
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.05
543	0.04
544	0.05
545	0.06
546	0.07
547	0.08
548	0.09
549	0.09
550	0.1
551	0.1
552	0.1
553	0.11
554	0.1
555	0.1
556	0.1
557	0.1
558	0.09
559	0.08
560	0.07
561	0.05
562	0.05
563	0.04
564	0.03
565	0.02
566	0.02
567	0.02
568	0.02
569	0.02
570	0.02
571	0.02
572	0.02
573	0.02
574	0.03
575	0.03
576	0.03
577	0.03
578	0.03
579	0.04
580	0.05
581	0.05
582	0.05
583	0.06
584	0.11
585	0.12
586	0.12
587	0.13
588	0.15
589	0.15
590	0.16
591	0.15
592	0.11
593	0.13
594	0.13
595	0.13
596	0.1
597	0.1
598	0.09
599	0.09
600	0.08
601	0.05
602	0.04
603	0.03
604	0.03
605	0.03
606	0.03
607	0.03
608	0.04
609	0.04
610	0.04
611	0.05
612	0.05
613	0.06
614	0.06
615	0.06
616	0.06
617	0.07
618	0.08
619	0.12
620	0.13
621	0.13
622	0.14
623	0.16
624	0.15
625	0.16
626	0.15
627	0.12
628	0.13
629	0.12
630	0.11
631	0.09
632	0.09
633	0.08
634	0.09
635	0.08
636	0.06
637	0.06
638	0.09
639	0.11
640	0.17
641	0.22
642	0.22
643	0.23
644	0.3
645	0.41
646	0.44
647	0.46
648	0.44
649	0.45
650	0.45
651	0.48
652	0.48
653	0.4
654	0.35
655	0.33
656	0.36
657	0.31
658	0.32
659	0.28
660	0.21
661	0.25
662	0.25
663	0.24
664	0.2
665	0.24
666	0.24
667	0.25
668	0.28
669	0.22
670	0.2
671	0.19
672	0.16
673	0.11
674	0.09
675	0.07
676	0.04
677	0.05
678	0.06
679	0.06
680	0.08
681	0.08
682	0.11
683	0.13
684	0.16
685	0.19
686	0.18
687	0.21
688	0.2
689	0.24
690	0.27
691	0.26
692	0.24
693	0.21
694	0.21
695	0.2
696	0.2
697	0.17
698	0.13
699	0.12
700	0.11
701	0.1
702	0.12
703	0.1
704	0.09
705	0.08
706	0.07
707	0.07
708	0.07
709	0.07
710	0.05
711	0.05
712	0.12
713	0.12
714	0.13
715	0.14
716	0.15
717	0.15
718	0.16
719	0.16
720	0.1
721	0.14
722	0.14
723	0.14
724	0.15
725	0.16
726	0.14
727	0.14
728	0.17
729	0.15
730	0.18
731	0.18
732	0.18
733	0.24
734	0.27
735	0.3
736	0.28
737	0.36
738	0.32
739	0.31
740	0.29
741	0.23
742	0.2
743	0.19
744	0.17
745	0.08
746	0.06
747	0.06
748	0.06
749	0.06
750	0.06
751	0.06
752	0.05
753	0.06
754	0.1
755	0.11
756	0.12
757	0.13
758	0.12
759	0.14
760	0.18
761	0.19
762	0.18
763	0.18
764	0.16
765	0.17
766	0.19
767	0.18
768	0.14
769	0.13
770	0.11
771	0.13
772	0.14
773	0.13
774	0.11
775	0.09
776	0.1
777	0.1
778	0.1
779	0.07
780	0.08
781	0.08
782	0.09
783	0.09
784	0.09
785	0.1
786	0.1
787	0.11
788	0.11
789	0.1
790	0.11
791	0.1
792	0.11
793	0.12
794	0.14
795	0.18
796	0.25
797	0.35
798	0.43
799	0.46
800	0.49
801	0.5
802	0.49
803	0.51
804	0.53
805	0.44
806	0.4
807	0.38
808	0.34
809	0.32
810	0.3
811	0.24
812	0.16
813	0.14
814	0.1
815	0.1
816	0.1
817	0.09
818	0.1
819	0.07
820	0.07
821	0.1
822	0.1
823	0.14
824	0.23
825	0.3
826	0.31
827	0.38
828	0.46
829	0.51
830	0.59
831	0.65
832	0.62
833	0.64
834	0.7
835	0.66
836	0.61
837	0.55
838	0.48
839	0.38
840	0.31
841	0.23
842	0.16
843	0.12
844	0.11
845	0.09
846	0.1
847	0.12
848	0.16
849	0.15
850	0.17
851	0.17
852	0.18
853	0.18
854	0.16
855	0.16
856	0.14
857	0.21
858	0.2
859	0.21
860	0.21
861	0.21
862	0.21
863	0.19
864	0.18
865	0.12
866	0.12
867	0.14
868	0.16
869	0.16
870	0.17
871	0.18
872	0.19
873	0.2
874	0.21
875	0.17
876	0.17
877	0.17
878	0.16
879	0.16
880	0.17
881	0.17
882	0.19
883	0.19
884	0.19
885	0.2
886	0.22
887	0.3
888	0.34
889	0.38
890	0.39
891	0.4
892	0.39
893	0.37
894	0.42
895	0.4
896	0.38
897	0.37
898	0.43
899	0.46
900	0.48
901	0.5
902	0.49
903	0.47
904	0.51
905	0.5
906	0.49
907	0.48
908	0.47
909	0.47
910	0.43
911	0.41
912	0.34
913	0.33
914	0.25
915	0.27
916	0.25
917	0.28
918	0.35
919	0.4
920	0.46
921	0.52
922	0.59
923	0.63
924	0.67
925	0.7
926	0.64
927	0.57
928	0.55
929	0.48
930	0.41
931	0.34
932	0.36
933	0.27
934	0.26
935	0.23
936	0.19
937	0.18
938	0.18
939	0.17
940	0.09
941	0.1
942	0.11
943	0.12
944	0.11
945	0.11
946	0.11
947	0.11
948	0.12
949	0.13
950	0.11
951	0.12
952	0.13
953	0.17
954	0.2
955	0.22
956	0.22
957	0.28
958	0.3
959	0.33
960	0.35
961	0.35
962	0.37
963	0.43
964	0.48
965	0.46
966	0.45
967	0.5
968	0.55
969	0.58
970	0.56
971	0.52
972	0.51
973	0.52
974	0.52
975	0.47
976	0.42
977	0.4
978	0.39
979	0.35
980	0.33
981	0.34
982	0.39
983	0.39
984	0.37
985	0.35
986	0.39
987	0.38
988	0.44
989	0.43
990	0.36
991	0.34
992	0.32
993	0.31
994	0.28
995	0.33
996	0.31
997	0.27
998	0.28
999	0.31
1000	0.35
1001	0.36
1002	0.37
1003	0.36
1004	0.37
1005	0.39
1006	0.4
1007	0.36
1008	0.33
1009	0.3
1010	0.28
1011	0.26
1012	0.22
1013	0.18
1014	0.17
1015	0.18
1016	0.19
1017	0.24
1018	0.27
1019	0.27
1020	0.3
1021	0.33
1022	0.33
1023	0.31
1024	0.34
1025	0.3
1026	0.26
1027	0.25
1028	0.19
1029	0.19
1030	0.19
1031	0.21
1032	0.19
1033	0.18
1034	0.18
1035	0.19
1036	0.2
1037	0.25
1038	0.34
1039	0.41
1040	0.4
1041	0.42
1042	0.47
1043	0.47
1044	0.47
1045	0.4
1046	0.33
1047	0.25
1048	0.24
1049	0.22
1050	0.17
1051	0.15
1052	0.13
1053	0.12
1054	0.09
1055	0.07
1056	0.05
1057	0.04
1058	0.04
1059	0.04
1060	0.05
1061	0.05
1062	0.05
1063	0.05
1064	0.06
1065	0.06
1066	0.06
1067	0.06
1068	0.05
1069	0.05
1070	0.06
1071	0.07
1072	0.08
1073	0.09
1074	0.1
1075	0.1
1076	0.1
1077	0.1
1078	0.11
1079	0.13
1080	0.13
1081	0.14
1082	0.14
1083	0.14
1084	0.15
1085	0.17
1086	0.18
1087	0.18
1088	0.26
1089	0.3
1090	0.33
1091	0.34
1092	0.34
1093	0.42

A0A4S4LLA6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer