Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4LVV1

Protein Details
Accession A0A4S4LVV1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
539-570HENGTAKKHPHRRTAPAPPKRRKPPAAPIAVGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
544-563AKKHPHRRTAPAPPKRRKPP
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, mito 1, plas 1, pero 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030125  SPIN90/Ldb17  
IPR018556  SPIN90/Ldb17_LRD  
Pfam View protein in Pfam  
PF09431  SPIN90_LRD  
Amino Acid Sequences MDDAFGIVYLIENAQQFWSELDDIVRITSNATLSNLDSTLKRFISFCASYHEQYLQSPLQLEHACGLLLDSELFTFHSERMCEILTDEATANTDPHYQLILYNVLLLHGQRQASFLRSYKRWQPIIPLLMDHVLVEIDLDIEDTYSGSTSGPSTGWKGLAIPIEAMLRSLGVRLLYEVCRASKLSKQELKIFDDEFIDRLFDLVEQTRNMQDESFNYSVIKLIVALNEQFMVASIKGPITDVAHKEVQNPQSPDVRRKYDLHAQPRGRSSEDLVMQLLVLKILYLLFTTNGTSEYFYTNDLCVLVDVFLRELGDLDDDSESLRHTYLRVLHPLLTKTQLRRTPYKRPQIVRTLESLIEHPEIRDVSPTTKRLVERCLSGEWCVQLRKGTAGKLAMSELERTSSPSDDRIAKQEHLAPPSVYKNGSQKKSFSRSVENLRSSAASSSTAAGSAQKGLEALRKQNNDSAVSLLGVAGATSSSSSKKRDRINSVDVQRERSHGHHEERQREKDTHVPPHVPIPLERPSSTTSTSSAAPTAAIHENGTAKKHPHRRTAPAPPKRRKPPAAPIAVGQTNSGATITAIKSSSSTPNVNSYGKLGRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.11
4 0.11
5 0.14
6 0.13
7 0.13
8 0.13
9 0.14
10 0.13
11 0.14
12 0.15
13 0.11
14 0.11
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.15
19 0.15
20 0.15
21 0.18
22 0.17
23 0.17
24 0.17
25 0.19
26 0.23
27 0.23
28 0.23
29 0.21
30 0.22
31 0.29
32 0.3
33 0.28
34 0.3
35 0.34
36 0.34
37 0.37
38 0.38
39 0.3
40 0.29
41 0.35
42 0.27
43 0.24
44 0.25
45 0.22
46 0.25
47 0.25
48 0.25
49 0.19
50 0.18
51 0.17
52 0.14
53 0.14
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.09
62 0.09
63 0.1
64 0.13
65 0.14
66 0.15
67 0.17
68 0.17
69 0.15
70 0.15
71 0.18
72 0.14
73 0.16
74 0.15
75 0.13
76 0.14
77 0.14
78 0.13
79 0.11
80 0.14
81 0.12
82 0.13
83 0.14
84 0.12
85 0.12
86 0.15
87 0.15
88 0.12
89 0.13
90 0.12
91 0.11
92 0.12
93 0.11
94 0.11
95 0.13
96 0.13
97 0.12
98 0.15
99 0.16
100 0.19
101 0.23
102 0.24
103 0.28
104 0.3
105 0.36
106 0.43
107 0.5
108 0.51
109 0.48
110 0.52
111 0.53
112 0.55
113 0.5
114 0.42
115 0.35
116 0.32
117 0.3
118 0.22
119 0.14
120 0.08
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.04
135 0.05
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.09
140 0.11
141 0.12
142 0.13
143 0.12
144 0.13
145 0.15
146 0.16
147 0.15
148 0.13
149 0.12
150 0.13
151 0.13
152 0.12
153 0.09
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.1
162 0.11
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.15
167 0.16
168 0.17
169 0.19
170 0.24
171 0.31
172 0.36
173 0.38
174 0.44
175 0.48
176 0.49
177 0.48
178 0.43
179 0.34
180 0.3
181 0.28
182 0.21
183 0.17
184 0.13
185 0.1
186 0.09
187 0.08
188 0.06
189 0.07
190 0.09
191 0.11
192 0.11
193 0.12
194 0.14
195 0.15
196 0.15
197 0.13
198 0.12
199 0.12
200 0.19
201 0.18
202 0.17
203 0.16
204 0.16
205 0.16
206 0.15
207 0.13
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.12
228 0.13
229 0.16
230 0.2
231 0.2
232 0.22
233 0.27
234 0.29
235 0.32
236 0.32
237 0.31
238 0.35
239 0.37
240 0.42
241 0.42
242 0.42
243 0.39
244 0.4
245 0.43
246 0.45
247 0.5
248 0.51
249 0.54
250 0.53
251 0.53
252 0.54
253 0.51
254 0.44
255 0.37
256 0.31
257 0.27
258 0.26
259 0.22
260 0.19
261 0.16
262 0.14
263 0.14
264 0.12
265 0.06
266 0.04
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.04
271 0.03
272 0.03
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.08
282 0.08
283 0.09
284 0.1
285 0.09
286 0.09
287 0.08
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.05
311 0.05
312 0.08
313 0.13
314 0.16
315 0.19
316 0.2
317 0.23
318 0.25
319 0.26
320 0.25
321 0.23
322 0.24
323 0.24
324 0.3
325 0.31
326 0.33
327 0.42
328 0.46
329 0.53
330 0.6
331 0.67
332 0.67
333 0.68
334 0.7
335 0.7
336 0.68
337 0.59
338 0.53
339 0.45
340 0.38
341 0.34
342 0.28
343 0.21
344 0.18
345 0.16
346 0.13
347 0.12
348 0.12
349 0.11
350 0.13
351 0.12
352 0.15
353 0.2
354 0.22
355 0.22
356 0.26
357 0.28
358 0.28
359 0.32
360 0.29
361 0.27
362 0.28
363 0.29
364 0.26
365 0.25
366 0.25
367 0.21
368 0.21
369 0.2
370 0.18
371 0.17
372 0.16
373 0.19
374 0.19
375 0.19
376 0.2
377 0.2
378 0.2
379 0.19
380 0.18
381 0.15
382 0.14
383 0.15
384 0.12
385 0.12
386 0.11
387 0.13
388 0.14
389 0.14
390 0.14
391 0.14
392 0.17
393 0.2
394 0.22
395 0.26
396 0.28
397 0.27
398 0.29
399 0.34
400 0.34
401 0.32
402 0.33
403 0.27
404 0.27
405 0.29
406 0.29
407 0.23
408 0.22
409 0.29
410 0.36
411 0.42
412 0.41
413 0.43
414 0.5
415 0.56
416 0.59
417 0.54
418 0.53
419 0.54
420 0.61
421 0.64
422 0.58
423 0.51
424 0.46
425 0.43
426 0.35
427 0.3
428 0.21
429 0.13
430 0.12
431 0.12
432 0.11
433 0.11
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.1
438 0.09
439 0.08
440 0.09
441 0.09
442 0.16
443 0.18
444 0.24
445 0.3
446 0.33
447 0.35
448 0.39
449 0.41
450 0.37
451 0.35
452 0.29
453 0.22
454 0.19
455 0.17
456 0.13
457 0.1
458 0.07
459 0.06
460 0.04
461 0.03
462 0.03
463 0.04
464 0.05
465 0.09
466 0.13
467 0.19
468 0.26
469 0.33
470 0.42
471 0.51
472 0.58
473 0.63
474 0.67
475 0.71
476 0.71
477 0.74
478 0.67
479 0.63
480 0.56
481 0.51
482 0.46
483 0.39
484 0.41
485 0.39
486 0.44
487 0.46
488 0.53
489 0.6
490 0.66
491 0.7
492 0.68
493 0.62
494 0.59
495 0.6
496 0.6
497 0.6
498 0.57
499 0.53
500 0.49
501 0.53
502 0.53
503 0.46
504 0.39
505 0.35
506 0.36
507 0.37
508 0.37
509 0.33
510 0.33
511 0.35
512 0.36
513 0.33
514 0.27
515 0.24
516 0.26
517 0.24
518 0.21
519 0.17
520 0.15
521 0.13
522 0.16
523 0.17
524 0.16
525 0.15
526 0.17
527 0.21
528 0.23
529 0.27
530 0.27
531 0.29
532 0.38
533 0.48
534 0.54
535 0.6
536 0.66
537 0.71
538 0.77
539 0.83
540 0.84
541 0.85
542 0.88
543 0.87
544 0.9
545 0.91
546 0.92
547 0.89
548 0.87
549 0.88
550 0.87
551 0.86
552 0.77
553 0.69
554 0.66
555 0.6
556 0.51
557 0.4
558 0.31
559 0.22
560 0.21
561 0.18
562 0.1
563 0.08
564 0.13
565 0.13
566 0.15
567 0.15
568 0.15
569 0.17
570 0.2
571 0.26
572 0.26
573 0.29
574 0.29
575 0.35
576 0.4
577 0.41
578 0.38
579 0.36