FuNGI

A0A4S4LWG2

Protein Details

Accession

A0A4S4LWG2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
241-266	EAVEKSSGKRKRCCRPQPRLFNPEIR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 10, cyto 6.5, cyto_nucl 6.5, nucl 5.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR041973 KOW_Spt5_1 IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03439 Spt5-NGN
CDD	cd06081 KOW_Spt5_1

Amino Acid Sequences

MSRQNRARKAQNPFLDLEAEEDSRDEDSEEEDGDFVDFLQDDISAEDTAGEPFLDPGPTYRAEALSDDNPSALEAIADQYKVRARQIQYGAXDTEWPLLGESERLLWSVKVKNGRRADVVEHIRCSATXVGMGGEKPPTXGEVFSXPSLXGLVYIEAPSSLDVRNAVGGHSGVNPLDAIXLXXVEERSQVYVLKTRPNSDVDFATGQWVRIRRGPYAKDLALVQEVDVXHGLLTVAVCPRIALSEKPDIEAVEKSSGKRKRCCRPQPRLFNPXEIRXLYGPASVQQHDXYLVFSAAKYRYGLRFMKVAYRSAIPCKETPSNGDVLPFLDALNQGLPFHGGLVAQILTAEAQEALRHGDRVRIISGEQSGLWGTFRHAQDGTAIVAVEASIIPGLLPSSHREDEDVDAPVTEFVVPLSSIXPYFRPGDHVKVRHEDQTGIVFAVDDVSSSVSFIETATQNTVKILCDRVDFHSLELAVARARVPDPLLIGNVFRRGDLVKVRGSGEIGTVTDAQASSVRIVRPELMDEMLGIGFAGLEFLSPEVAAEREKESSPFAPTLFQTGDIVKFKFEGCEQIGTVVDPRDPYYIWIKRTKTENKILEFPYDRLDFCSPKIAAERAKEASKPRVHDMVGTRVQIIGGPWKGYKGLVKAVREVLRTDPEVDEDVALVELDALTTQGRRFQEIKVTMILLESHPKLLPPPTEAELRALASTAFRPEGLLSLNEGLRTSTPPPIDPXSSIEPAWDPSSRTPGRNTELETFPSCQVPHPEYGVQLFLWSYIERWLDVWMXAFEVTGSTDPVIGFQYGQYERHWVETVPSSARKVNPLPGQVVVQVAARFQRQIXIPFRFLKPIPVNVGVMALVMNGSNAGFVGEVVRERYSFFIVKAAGSLAFMVEPRENLVLVNAPP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.52
3	0.44
4	0.37
5	0.31
6	0.24
7	0.19
8	0.17
9	0.16
10	0.15
11	0.15
12	0.12
13	0.09
14	0.11
15	0.12
16	0.13
17	0.12
18	0.11
19	0.11
20	0.11
21	0.1
22	0.08
23	0.08
24	0.07
25	0.06
26	0.07
27	0.07
28	0.07
29	0.08
30	0.1
31	0.08
32	0.08
33	0.09
34	0.09
35	0.09
36	0.09
37	0.08
38	0.06
39	0.08
40	0.09
41	0.1
42	0.09
43	0.11
44	0.15
45	0.16
46	0.19
47	0.19
48	0.19
49	0.2
50	0.21
51	0.24
52	0.23
53	0.24
54	0.22
55	0.2
56	0.19
57	0.18
58	0.16
59	0.11
60	0.08
61	0.06
62	0.09
63	0.11
64	0.11
65	0.11
66	0.14
67	0.19
68	0.21
69	0.25
70	0.29
71	0.31
72	0.39
73	0.45
74	0.49
75	0.46
76	0.47
77	0.45
78	0.4
79	0.37
80	0.28
81	0.23
82	0.17
83	0.14
84	0.12
85	0.11
86	0.09
87	0.09
88	0.11
89	0.11
90	0.11
91	0.12
92	0.12
93	0.18
94	0.23
95	0.28
96	0.35
97	0.41
98	0.49
99	0.55
100	0.58
101	0.56
102	0.54
103	0.53
104	0.53
105	0.56
106	0.51
107	0.47
108	0.44
109	0.4
110	0.36
111	0.34
112	0.25
113	0.16
114	0.14
115	0.13
116	0.14
117	0.15
118	0.16
119	0.15
120	0.14
121	0.14
122	0.13
123	0.13
124	0.13
125	0.13
126	0.15
127	0.17
128	0.17
129	0.18
130	0.17
131	0.16
132	0.13
133	0.12
134	0.09
135	0.07
136	0.07
137	0.06
138	0.06
139	0.07
140	0.07
141	0.09
142	0.09
143	0.09
144	0.09
145	0.09
146	0.12
147	0.12
148	0.11
149	0.11
150	0.11
151	0.11
152	0.12
153	0.13
154	0.1
155	0.1
156	0.1
157	0.08
158	0.08
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.08
163	0.08
164	0.1
165	0.1
166	0.1
167	0.11
168	0.11
169	0.12
170	0.17
171	0.19
172	0.27
173	0.29
174	0.32
175	0.35
176	0.37
177	0.38
178	0.34
179	0.33
180	0.28
181	0.27
182	0.24
183	0.26
184	0.22
185	0.21
186	0.22
187	0.24
188	0.22
189	0.25
190	0.28
191	0.29
192	0.37
193	0.39
194	0.42
195	0.46
196	0.44
197	0.4
198	0.38
199	0.34
200	0.28
201	0.25
202	0.18
203	0.14
204	0.13
205	0.12
206	0.12
207	0.09
208	0.07
209	0.07
210	0.07
211	0.04
212	0.05
213	0.05
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.08
219	0.1
220	0.11
221	0.15
222	0.23
223	0.24
224	0.25
225	0.25
226	0.23
227	0.23
228	0.23
229	0.21
230	0.19
231	0.2
232	0.2
233	0.29
234	0.35
235	0.4
236	0.47
237	0.54
238	0.59
239	0.68
240	0.78
241	0.81
242	0.86
243	0.89
244	0.92
245	0.92
246	0.89
247	0.82
248	0.78
249	0.71
250	0.65
251	0.56
252	0.46
253	0.38
254	0.32
255	0.29
256	0.21
257	0.22
258	0.19
259	0.18
260	0.18
261	0.17
262	0.17
263	0.16
264	0.16
265	0.12
266	0.12
267	0.1
268	0.09
269	0.15
270	0.14
271	0.15
272	0.15
273	0.18
274	0.18
275	0.24
276	0.26
277	0.22
278	0.25
279	0.24
280	0.31
281	0.3
282	0.3
283	0.26
284	0.27
285	0.27
286	0.3
287	0.33
288	0.28
289	0.27
290	0.31
291	0.32
292	0.3
293	0.31
294	0.28
295	0.26
296	0.24
297	0.23
298	0.18
299	0.15
300	0.15
301	0.12
302	0.09
303	0.08
304	0.08
305	0.07
306	0.08
307	0.08
308	0.07
309	0.07
310	0.07
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.05
315	0.04
316	0.06
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.03
325	0.03
326	0.04
327	0.04
328	0.07
329	0.07
330	0.09
331	0.09
332	0.12
333	0.13
334	0.15
335	0.16
336	0.14
337	0.14
338	0.14
339	0.15
340	0.12
341	0.11
342	0.1
343	0.09
344	0.08
345	0.08
346	0.07
347	0.07
348	0.13
349	0.13
350	0.15
351	0.15
352	0.15
353	0.16
354	0.17
355	0.16
356	0.1
357	0.09
358	0.07
359	0.06
360	0.06
361	0.05
362	0.04
363	0.03
364	0.02
365	0.02
366	0.02
367	0.02
368	0.03
369	0.03
370	0.04
371	0.06
372	0.12
373	0.13
374	0.13
375	0.14
376	0.16
377	0.18
378	0.19
379	0.18
380	0.12
381	0.12
382	0.12
383	0.11
384	0.09
385	0.07
386	0.05
387	0.03
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.07
395	0.12
396	0.12
397	0.12
398	0.18
399	0.19
400	0.25
401	0.3
402	0.34
403	0.32
404	0.36
405	0.37
406	0.36
407	0.35
408	0.29
409	0.24
410	0.23
411	0.2
412	0.15
413	0.13
414	0.09
415	0.07
416	0.08
417	0.06
418	0.04
419	0.04
420	0.04
421	0.04
422	0.04
423	0.05
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.06
428	0.06
429	0.07
430	0.08
431	0.09
432	0.09
433	0.09
434	0.1
435	0.09
436	0.09
437	0.1
438	0.09
439	0.1
440	0.12
441	0.15
442	0.19
443	0.18
444	0.17
445	0.17
446	0.16
447	0.15
448	0.13
449	0.1
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.05
454	0.05
455	0.06
456	0.06
457	0.07
458	0.08
459	0.08
460	0.08
461	0.08
462	0.09
463	0.09
464	0.12
465	0.12
466	0.1
467	0.1
468	0.1
469	0.13
470	0.15
471	0.17
472	0.15
473	0.17
474	0.18
475	0.17
476	0.18
477	0.15
478	0.12
479	0.1
480	0.08
481	0.08
482	0.07
483	0.07
484	0.07
485	0.06
486	0.06
487	0.07
488	0.07
489	0.07
490	0.09
491	0.1
492	0.1
493	0.11
494	0.12
495	0.11
496	0.12
497	0.12
498	0.1
499	0.09
500	0.09
501	0.09
502	0.07
503	0.06
504	0.05
505	0.03
506	0.03
507	0.03
508	0.03
509	0.02
510	0.02
511	0.02
512	0.02
513	0.03
514	0.03
515	0.03
516	0.03
517	0.04
518	0.05
519	0.06
520	0.07
521	0.09
522	0.1
523	0.11
524	0.13
525	0.14
526	0.16
527	0.16
528	0.15
529	0.15
530	0.14
531	0.17
532	0.15
533	0.14
534	0.12
535	0.12
536	0.16
537	0.16
538	0.16
539	0.13
540	0.14
541	0.13
542	0.14
543	0.13
544	0.14
545	0.13
546	0.15
547	0.15
548	0.15
549	0.15
550	0.14
551	0.15
552	0.11
553	0.1
554	0.09
555	0.1
556	0.11
557	0.11
558	0.13
559	0.2
560	0.24
561	0.27
562	0.34
563	0.35
564	0.38
565	0.47
566	0.53
567	0.51
568	0.57
569	0.59
570	0.55
571	0.6
572	0.56
573	0.53
574	0.47
575	0.41
576	0.36
577	0.31
578	0.28
579	0.25
580	0.27
581	0.23
582	0.21
583	0.27
584	0.22
585	0.22
586	0.25
587	0.25
588	0.26
589	0.27
590	0.31
591	0.27
592	0.29
593	0.31
594	0.33
595	0.38
596	0.38
597	0.39
598	0.39
599	0.4
600	0.38
601	0.4
602	0.39
603	0.39
604	0.38
605	0.35
606	0.31
607	0.27
608	0.26
609	0.22
610	0.19
611	0.16
612	0.13
613	0.15
614	0.14
615	0.15
616	0.16
617	0.16
618	0.19
619	0.16
620	0.23
621	0.26
622	0.28
623	0.3
624	0.36
625	0.39
626	0.36
627	0.35
628	0.31
629	0.3
630	0.29
631	0.28
632	0.22
633	0.2
634	0.21
635	0.2
636	0.16
637	0.12
638	0.11
639	0.09
640	0.08
641	0.06
642	0.04
643	0.03
644	0.03
645	0.03
646	0.03
647	0.04
648	0.05
649	0.06
650	0.11
651	0.12
652	0.17
653	0.18
654	0.2
655	0.29
656	0.31
657	0.33
658	0.28
659	0.28
660	0.24
661	0.23
662	0.22
663	0.14
664	0.17
665	0.15
666	0.15
667	0.15
668	0.15
669	0.16
670	0.2
671	0.21
672	0.18
673	0.22
674	0.23
675	0.26
676	0.26
677	0.27
678	0.24
679	0.23
680	0.2
681	0.16
682	0.14
683	0.12
684	0.12
685	0.12
686	0.11
687	0.1
688	0.11
689	0.11
690	0.12
691	0.12
692	0.12
693	0.11
694	0.14
695	0.14
696	0.14
697	0.14
698	0.13
699	0.13
700	0.15
701	0.16
702	0.18
703	0.19
704	0.2
705	0.25
706	0.28
707	0.29
708	0.27
709	0.3
710	0.32
711	0.31
712	0.3
713	0.25
714	0.25
715	0.27
716	0.27
717	0.25
718	0.2
719	0.3
720	0.32
721	0.34
722	0.36
723	0.39
724	0.42
725	0.43
726	0.46
727	0.42
728	0.42
729	0.43
730	0.41
731	0.38
732	0.34
733	0.33
734	0.29
735	0.27
736	0.29
737	0.29
738	0.28
739	0.29
740	0.29
741	0.28
742	0.28
743	0.26
744	0.2
745	0.17
746	0.15
747	0.11
748	0.12
749	0.1
750	0.09
751	0.13
752	0.14
753	0.13
754	0.14
755	0.15
756	0.15
757	0.15
758	0.16
759	0.12
760	0.12
761	0.11
762	0.11
763	0.1
764	0.09
765	0.1
766	0.09
767	0.09
768	0.09
769	0.09
770	0.1
771	0.11
772	0.1
773	0.1
774	0.09
775	0.16
776	0.17
777	0.19
778	0.19
779	0.23
780	0.23
781	0.27
782	0.28
783	0.21
784	0.23
785	0.28
786	0.31
787	0.31
788	0.33
789	0.32
790	0.36
791	0.38
792	0.4
793	0.38
794	0.43
795	0.43
796	0.45
797	0.44
798	0.41
799	0.4
800	0.35
801	0.32
802	0.24
803	0.21
804	0.17
805	0.16
806	0.17
807	0.17
808	0.17
809	0.16
810	0.23
811	0.24
812	0.33
813	0.36
814	0.4
815	0.41
816	0.44
817	0.5
818	0.43
819	0.48
820	0.45
821	0.47
822	0.46
823	0.46
824	0.43
825	0.37
826	0.37
827	0.28
828	0.22
829	0.16
830	0.1
831	0.06
832	0.05
833	0.05
834	0.04
835	0.04
836	0.04
837	0.04
838	0.04
839	0.04
840	0.04
841	0.06
842	0.07
843	0.09
844	0.12
845	0.14
846	0.14
847	0.15
848	0.17
849	0.21
850	0.21
851	0.2
852	0.23
853	0.22
854	0.22
855	0.22
856	0.21
857	0.16
858	0.14
859	0.14
860	0.09
861	0.09
862	0.09
863	0.12
864	0.12
865	0.12
866	0.14
867	0.15
868	0.15
869	0.14
870	0.16

A0A4S4LWG2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer