FuNGI

Q75F77

Protein Details

Accession

Q75F77

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
18-37	QLRRDFLRTRVKRNGPGKGG	Basic
228-251	DGGGRFKRGNSKRKTRQLKLLDEK	Basic
488-512	DEDSLSRKSSPKKKASRSPHAGHIY	Hydrophilic
587-608	LIKELRSKFKHPENKDRLKLFV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-37	RTRVKRNGPGKGG
232-247	RFKRGNSKRKTRQLKL
495-504	KSSPKKKASR

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005674 C:transcription factor TFIIF complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0072542 F:protein phosphatase activator activity GO:0016251 F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity GO:0001096 F:TFIIF-class transcription factor complex binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0051123 P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter GO:0001174 P:transcriptional start site selection at RNA polymerase II promoter
KEGG	ago:AGOS_AAL149C -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSNGRKAAGPQPFIKRDQLRRDFLRTRVKRNGPGKGGVKKEDPDSMEEQTRQMLQGGGGGVKREDDDYQEFPLRAANAQDLKNVKVHLLKFQSKKKIEPTKDFHLPVRLHRKDTRNVQFQLTRAEIVQRQKEIAEYKRRLEGEQGATPVSASSRESGGAEGTEGTPGDSGGALQPLAAEKPGPTTKLPEAGLAEDPTKVGLVKYDGKEQVDFDFQSGTIDPFADVAPDGGGRFKRGNSKRKTRQLKLLDEKARKLRFEEFYPWVMEDFDGLNTWVGSYEAGNSDSYVFLSAENDGSFTMIPADKVYRFTARNKYATLTIEEAEKRMEKNGAGAPRWLMKHLDNIGTTTTRYDRTRRRLKVVDGNDRQEEDDRVDNSEVELDYDEEFADDEEAPIIDGNEEENKESEQRIKKEMLQANAMGLRDDDAVEDEDDLFGEKKIDEEGEKVKKALLKTDLGALYESDDDSNPYLSESDLDDDDDKKIKKEDQDEDSLSRKSSPKKKASRSPHAGHIYVKSIKNCIIVISADKSILNNFPKGEWNPSSANHDNGAKDRTDFASRDGAPAPHELLTEQDIIDAVQGKEITLKQLIKELRSKFKHPENKDRLKLFVKRLVKLNGTFLELAR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.64
3	0.66
4	0.72
5	0.73
6	0.72
7	0.73
8	0.79
9	0.76
10	0.76
11	0.77
12	0.73
13	0.74
14	0.76
15	0.78
16	0.78
17	0.8
18	0.81
19	0.75
20	0.77
21	0.76
22	0.73
23	0.72
24	0.67
25	0.64
26	0.58
27	0.55
28	0.53
29	0.46
30	0.43
31	0.41
32	0.41
33	0.41
34	0.39
35	0.36
36	0.32
37	0.32
38	0.27
39	0.24
40	0.2
41	0.14
42	0.15
43	0.16
44	0.16
45	0.15
46	0.16
47	0.15
48	0.14
49	0.15
50	0.14
51	0.14
52	0.17
53	0.21
54	0.22
55	0.27
56	0.31
57	0.3
58	0.28
59	0.3
60	0.26
61	0.22
62	0.22
63	0.23
64	0.25
65	0.26
66	0.31
67	0.3
68	0.31
69	0.33
70	0.31
71	0.28
72	0.28
73	0.29
74	0.32
75	0.38
76	0.45
77	0.5
78	0.59
79	0.66
80	0.64
81	0.69
82	0.71
83	0.73
84	0.73
85	0.74
86	0.73
87	0.71
88	0.76
89	0.72
90	0.65
91	0.63
92	0.57
93	0.57
94	0.61
95	0.56
96	0.54
97	0.59
98	0.63
99	0.63
100	0.71
101	0.71
102	0.69
103	0.67
104	0.68
105	0.63
106	0.58
107	0.56
108	0.47
109	0.38
110	0.29
111	0.32
112	0.3
113	0.34
114	0.37
115	0.32
116	0.31
117	0.31
118	0.34
119	0.36
120	0.4
121	0.43
122	0.42
123	0.43
124	0.49
125	0.5
126	0.46
127	0.45
128	0.44
129	0.39
130	0.39
131	0.37
132	0.31
133	0.29
134	0.28
135	0.24
136	0.16
137	0.11
138	0.09
139	0.09
140	0.09
141	0.1
142	0.1
143	0.1
144	0.1
145	0.09
146	0.09
147	0.08
148	0.08
149	0.08
150	0.07
151	0.07
152	0.06
153	0.06
154	0.06
155	0.05
156	0.05
157	0.05
158	0.06
159	0.05
160	0.05
161	0.06
162	0.06
163	0.07
164	0.07
165	0.06
166	0.06
167	0.12
168	0.14
169	0.16
170	0.16
171	0.21
172	0.22
173	0.27
174	0.27
175	0.24
176	0.23
177	0.23
178	0.24
179	0.2
180	0.19
181	0.14
182	0.13
183	0.11
184	0.1
185	0.08
186	0.06
187	0.06
188	0.1
189	0.16
190	0.18
191	0.24
192	0.26
193	0.28
194	0.28
195	0.28
196	0.26
197	0.23
198	0.21
199	0.16
200	0.14
201	0.13
202	0.13
203	0.13
204	0.11
205	0.08
206	0.08
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.06
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.08
217	0.08
218	0.1
219	0.12
220	0.14
221	0.24
222	0.32
223	0.42
224	0.48
225	0.59
226	0.67
227	0.76
228	0.84
229	0.79
230	0.81
231	0.79
232	0.8
233	0.78
234	0.77
235	0.76
236	0.69
237	0.69
238	0.68
239	0.62
240	0.52
241	0.47
242	0.44
243	0.38
244	0.39
245	0.39
246	0.34
247	0.33
248	0.33
249	0.3
250	0.24
251	0.21
252	0.17
253	0.12
254	0.09
255	0.07
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.05
260	0.06
261	0.05
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.05
266	0.06
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.06
275	0.05
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.06
280	0.06
281	0.05
282	0.06
283	0.05
284	0.05
285	0.06
286	0.05
287	0.05
288	0.06
289	0.08
290	0.08
291	0.1
292	0.12
293	0.15
294	0.17
295	0.22
296	0.31
297	0.34
298	0.36
299	0.34
300	0.34
301	0.33
302	0.32
303	0.28
304	0.2
305	0.16
306	0.17
307	0.16
308	0.15
309	0.14
310	0.14
311	0.12
312	0.12
313	0.13
314	0.09
315	0.12
316	0.16
317	0.18
318	0.18
319	0.18
320	0.18
321	0.21
322	0.21
323	0.19
324	0.17
325	0.14
326	0.19
327	0.21
328	0.23
329	0.19
330	0.2
331	0.2
332	0.18
333	0.18
334	0.14
335	0.13
336	0.14
337	0.16
338	0.23
339	0.31
340	0.4
341	0.5
342	0.53
343	0.59
344	0.61
345	0.64
346	0.66
347	0.65
348	0.66
349	0.61
350	0.6
351	0.53
352	0.49
353	0.44
354	0.36
355	0.29
356	0.2
357	0.2
358	0.16
359	0.18
360	0.17
361	0.16
362	0.15
363	0.16
364	0.13
365	0.1
366	0.09
367	0.08
368	0.08
369	0.08
370	0.08
371	0.06
372	0.06
373	0.05
374	0.06
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.04
383	0.04
384	0.05
385	0.07
386	0.08
387	0.09
388	0.09
389	0.1
390	0.11
391	0.13
392	0.19
393	0.24
394	0.26
395	0.3
396	0.32
397	0.34
398	0.43
399	0.46
400	0.41
401	0.37
402	0.34
403	0.32
404	0.32
405	0.28
406	0.19
407	0.14
408	0.12
409	0.1
410	0.1
411	0.08
412	0.07
413	0.08
414	0.08
415	0.09
416	0.08
417	0.07
418	0.07
419	0.08
420	0.07
421	0.06
422	0.07
423	0.06
424	0.07
425	0.08
426	0.09
427	0.09
428	0.11
429	0.19
430	0.25
431	0.26
432	0.26
433	0.27
434	0.29
435	0.29
436	0.32
437	0.28
438	0.24
439	0.24
440	0.29
441	0.28
442	0.26
443	0.25
444	0.19
445	0.17
446	0.15
447	0.14
448	0.09
449	0.08
450	0.09
451	0.1
452	0.1
453	0.09
454	0.09
455	0.09
456	0.08
457	0.09
458	0.09
459	0.1
460	0.1
461	0.11
462	0.12
463	0.13
464	0.15
465	0.2
466	0.2
467	0.2
468	0.23
469	0.26
470	0.31
471	0.38
472	0.43
473	0.43
474	0.5
475	0.51
476	0.51
477	0.51
478	0.46
479	0.39
480	0.35
481	0.35
482	0.37
483	0.44
484	0.5
485	0.56
486	0.65
487	0.75
488	0.81
489	0.86
490	0.88
491	0.87
492	0.82
493	0.81
494	0.77
495	0.69
496	0.61
497	0.54
498	0.49
499	0.47
500	0.46
501	0.38
502	0.35
503	0.35
504	0.35
505	0.32
506	0.26
507	0.22
508	0.19
509	0.2
510	0.21
511	0.19
512	0.17
513	0.17
514	0.17
515	0.17
516	0.23
517	0.22
518	0.22
519	0.22
520	0.23
521	0.3
522	0.31
523	0.37
524	0.32
525	0.34
526	0.34
527	0.36
528	0.43
529	0.39
530	0.39
531	0.34
532	0.36
533	0.34
534	0.35
535	0.36
536	0.28
537	0.27
538	0.27
539	0.28
540	0.29
541	0.27
542	0.26
543	0.32
544	0.32
545	0.34
546	0.33
547	0.31
548	0.27
549	0.29
550	0.28
551	0.2
552	0.2
553	0.17
554	0.17
555	0.18
556	0.18
557	0.15
558	0.13
559	0.12
560	0.11
561	0.13
562	0.15
563	0.12
564	0.14
565	0.14
566	0.13
567	0.18
568	0.19
569	0.21
570	0.23
571	0.25
572	0.23
573	0.31
574	0.34
575	0.35
576	0.43
577	0.46
578	0.5
579	0.55
580	0.59
581	0.61
582	0.68
583	0.73
584	0.74
585	0.78
586	0.78
587	0.83
588	0.86
589	0.81
590	0.78
591	0.76
592	0.75
593	0.72
594	0.71
595	0.67
596	0.64
597	0.68
598	0.68
599	0.66
600	0.6
601	0.6
602	0.52
603	0.49

Q75F77

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer