FuNGI

C5FNX6

Protein Details

Accession

C5FNX6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
114-137	AVDEKMDKRRKARREARERQEMEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
121-130	KRRKARREAR

Subcellular Location(s)

cyto 9.5, nucl 9, cyto_mito 8, mito 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR010491 PRP1_N IPR045075 Syf1-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF06424 PRP1_N PF13181 TPR_8

Amino Acid Sequences

MSGRKDFLSQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPTPEQIQEALAKRAALLGTAPPTAYGASTRGEKGGKAEKEEEDDDRYQDPEDETGLFAYGQYDRDDDEADQVYQAVDEKMDKRRKARREARERQEMEEYESKNPKIQQQFADLKRSLASVSDEDWANIPEVGDLTGKNRRARQNLRQRFYAVPDSVIANARDSTEFTTTINDDGTESHIPRGENADGTITNFADIGAARDKVLQVRLDQAAEGSSGDVASGSASSIDPKGYLTSLTKSEMKAGEVEIGDIKRVRTLLESVTKTNPKHSPGWIAIARLEEIAGRIGAARNYIARGCELCPKSEDVWLENIRLNDNHNAKIIAANAIKNNDRSTRLWIEAMKLESDSRAKKNVLRQAILHVPQSVTIWKEAVNLEENPDDARLLLAKATEMIPLSVELWLALARLETPENAQKVLNAARKAVPTSRDIWIAAARLQEQMGTAHKVNVMKRAVQSLARDSAMPKREEWIGEAEKCEEEDAILTCNAIIRETLGWGLDEDDDRKDIWMEDAKGSIARGKYETARAIYAYALRIFVNKKSVWLAAADLERNHGTKESLWQLLEKGVEACPQCEDLWMQLAKEKWQAGEIDNTRRSVAYERQLGNKDHALDLVNQGLQLYPKADKLWMLKGQIYESDGQLQQAREAYGTGTRACPKSVPLWLLASRLEEKAGVVVKARSVLDRARLAVPKNAELWTESVRVERRANNIGQAKSLMSKALQEVPNSGLLWSESIWHLEPRTHRKPRSLEAIKKVDNDPILFVTVARIFWGERRLEKAMTWFEKAIVANSDLGDVWAWYYKFLLQHGTDEKREDVLTKCIATEPKHGEIWQTVSKDPANAHKTTEEILKITLNRLE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.31
3	0.28
4	0.25
5	0.19
6	0.15
7	0.12
8	0.12
9	0.12
10	0.12
11	0.07
12	0.09
13	0.1
14	0.11
15	0.15
16	0.15
17	0.16
18	0.2
19	0.23
20	0.25
21	0.29
22	0.3
23	0.29
24	0.32
25	0.34
26	0.32
27	0.38
28	0.37
29	0.32
30	0.32
31	0.29
32	0.27
33	0.31
34	0.31
35	0.27
36	0.25
37	0.25
38	0.22
39	0.25
40	0.23
41	0.16
42	0.14
43	0.15
44	0.17
45	0.18
46	0.17
47	0.15
48	0.16
49	0.15
50	0.15
51	0.12
52	0.11
53	0.13
54	0.16
55	0.17
56	0.2
57	0.21
58	0.21
59	0.26
60	0.34
61	0.34
62	0.37
63	0.4
64	0.39
65	0.44
66	0.46
67	0.43
68	0.39
69	0.38
70	0.35
71	0.32
72	0.3
73	0.25
74	0.24
75	0.23
76	0.17
77	0.17
78	0.15
79	0.14
80	0.14
81	0.13
82	0.11
83	0.1
84	0.1
85	0.1
86	0.11
87	0.12
88	0.12
89	0.12
90	0.14
91	0.16
92	0.14
93	0.17
94	0.18
95	0.17
96	0.16
97	0.15
98	0.14
99	0.12
100	0.13
101	0.09
102	0.08
103	0.12
104	0.16
105	0.26
106	0.35
107	0.39
108	0.47
109	0.57
110	0.65
111	0.72
112	0.78
113	0.8
114	0.82
115	0.88
116	0.88
117	0.9
118	0.83
119	0.76
120	0.74
121	0.64
122	0.6
123	0.56
124	0.49
125	0.46
126	0.49
127	0.45
128	0.42
129	0.43
130	0.45
131	0.45
132	0.49
133	0.45
134	0.48
135	0.57
136	0.56
137	0.62
138	0.54
139	0.47
140	0.42
141	0.38
142	0.3
143	0.22
144	0.22
145	0.15
146	0.16
147	0.18
148	0.18
149	0.17
150	0.18
151	0.17
152	0.14
153	0.13
154	0.11
155	0.08
156	0.08
157	0.09
158	0.09
159	0.09
160	0.12
161	0.18
162	0.24
163	0.28
164	0.35
165	0.42
166	0.52
167	0.61
168	0.67
169	0.72
170	0.77
171	0.77
172	0.74
173	0.7
174	0.62
175	0.59
176	0.56
177	0.45
178	0.36
179	0.32
180	0.29
181	0.27
182	0.27
183	0.22
184	0.16
185	0.15
186	0.15
187	0.15
188	0.15
189	0.16
190	0.15
191	0.15
192	0.14
193	0.16
194	0.16
195	0.16
196	0.15
197	0.12
198	0.1
199	0.1
200	0.15
201	0.15
202	0.15
203	0.16
204	0.19
205	0.18
206	0.19
207	0.23
208	0.2
209	0.17
210	0.17
211	0.18
212	0.15
213	0.16
214	0.17
215	0.12
216	0.11
217	0.1
218	0.1
219	0.08
220	0.08
221	0.09
222	0.1
223	0.1
224	0.1
225	0.12
226	0.12
227	0.14
228	0.17
229	0.16
230	0.14
231	0.19
232	0.2
233	0.19
234	0.19
235	0.16
236	0.14
237	0.12
238	0.11
239	0.07
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.03
247	0.03
248	0.04
249	0.04
250	0.06
251	0.06
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.08
256	0.08
257	0.1
258	0.1
259	0.13
260	0.14
261	0.18
262	0.19
263	0.19
264	0.23
265	0.22
266	0.21
267	0.19
268	0.17
269	0.17
270	0.15
271	0.15
272	0.14
273	0.13
274	0.14
275	0.14
276	0.13
277	0.11
278	0.12
279	0.12
280	0.11
281	0.12
282	0.16
283	0.23
284	0.25
285	0.26
286	0.32
287	0.37
288	0.36
289	0.4
290	0.4
291	0.36
292	0.37
293	0.36
294	0.36
295	0.33
296	0.39
297	0.34
298	0.31
299	0.28
300	0.25
301	0.23
302	0.17
303	0.15
304	0.09
305	0.08
306	0.07
307	0.06
308	0.05
309	0.05
310	0.06
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.09
316	0.1
317	0.09
318	0.09
319	0.11
320	0.12
321	0.2
322	0.2
323	0.2
324	0.21
325	0.23
326	0.23
327	0.25
328	0.25
329	0.18
330	0.23
331	0.23
332	0.23
333	0.22
334	0.22
335	0.2
336	0.19
337	0.2
338	0.21
339	0.22
340	0.22
341	0.21
342	0.2
343	0.19
344	0.2
345	0.18
346	0.16
347	0.14
348	0.15
349	0.15
350	0.18
351	0.19
352	0.19
353	0.21
354	0.19
355	0.21
356	0.21
357	0.26
358	0.27
359	0.27
360	0.28
361	0.26
362	0.25
363	0.25
364	0.24
365	0.18
366	0.15
367	0.14
368	0.13
369	0.17
370	0.19
371	0.18
372	0.21
373	0.22
374	0.25
375	0.33
376	0.38
377	0.38
378	0.36
379	0.34
380	0.35
381	0.39
382	0.37
383	0.3
384	0.24
385	0.2
386	0.19
387	0.19
388	0.15
389	0.1
390	0.09
391	0.08
392	0.08
393	0.1
394	0.1
395	0.11
396	0.12
397	0.11
398	0.13
399	0.13
400	0.13
401	0.11
402	0.11
403	0.09
404	0.06
405	0.06
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.04
410	0.04
411	0.05
412	0.05
413	0.06
414	0.06
415	0.06
416	0.05
417	0.06
418	0.06
419	0.05
420	0.05
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.03
427	0.03
428	0.04
429	0.05
430	0.05
431	0.06
432	0.1
433	0.11
434	0.12
435	0.12
436	0.11
437	0.13
438	0.19
439	0.21
440	0.18
441	0.19
442	0.21
443	0.21
444	0.23
445	0.23
446	0.19
447	0.17
448	0.19
449	0.19
450	0.18
451	0.18
452	0.17
453	0.16
454	0.15
455	0.14
456	0.12
457	0.11
458	0.1
459	0.1
460	0.09
461	0.08
462	0.09
463	0.09
464	0.11
465	0.1
466	0.11
467	0.13
468	0.16
469	0.17
470	0.22
471	0.22
472	0.21
473	0.22
474	0.24
475	0.23
476	0.22
477	0.23
478	0.2
479	0.21
480	0.18
481	0.18
482	0.17
483	0.22
484	0.24
485	0.24
486	0.21
487	0.2
488	0.22
489	0.22
490	0.22
491	0.21
492	0.2
493	0.2
494	0.21
495	0.2
496	0.18
497	0.18
498	0.17
499	0.1
500	0.07
501	0.07
502	0.06
503	0.07
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.08
508	0.07
509	0.07
510	0.06
511	0.06
512	0.06
513	0.07
514	0.07
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.07
519	0.07
520	0.07
521	0.08
522	0.08
523	0.09
524	0.09
525	0.09
526	0.09
527	0.08
528	0.1
529	0.13
530	0.14
531	0.14
532	0.15
533	0.15
534	0.15
535	0.15
536	0.16
537	0.12
538	0.11
539	0.12
540	0.13
541	0.15
542	0.18
543	0.2
544	0.18
545	0.18
546	0.17
547	0.17
548	0.16
549	0.15
550	0.13
551	0.11
552	0.11
553	0.1
554	0.13
555	0.14
556	0.15
557	0.19
558	0.17
559	0.18
560	0.2
561	0.2
562	0.18
563	0.17
564	0.15
565	0.13
566	0.15
567	0.15
568	0.13
569	0.15
570	0.15
571	0.15
572	0.15
573	0.12
574	0.11
575	0.11
576	0.16
577	0.18
578	0.19
579	0.19
580	0.19
581	0.19
582	0.21
583	0.2
584	0.15
585	0.12
586	0.1
587	0.14
588	0.14
589	0.14
590	0.12
591	0.14
592	0.13
593	0.13
594	0.13
595	0.1
596	0.15
597	0.15
598	0.14
599	0.15
600	0.16
601	0.17
602	0.21
603	0.21
604	0.16
605	0.17
606	0.19
607	0.18
608	0.26
609	0.27
610	0.32
611	0.33
612	0.34
613	0.32
614	0.31
615	0.31
616	0.27
617	0.29
618	0.27
619	0.33
620	0.34
621	0.41
622	0.45
623	0.45
624	0.44
625	0.41
626	0.36
627	0.28
628	0.27
629	0.22
630	0.19
631	0.19
632	0.17
633	0.14
634	0.12
635	0.12
636	0.12
637	0.11
638	0.1
639	0.1
640	0.09
641	0.11
642	0.12
643	0.13
644	0.16
645	0.19
646	0.25
647	0.28
648	0.29
649	0.3
650	0.3
651	0.31
652	0.28
653	0.27
654	0.21
655	0.17
656	0.19
657	0.17
658	0.17
659	0.19
660	0.18
661	0.18
662	0.18
663	0.17
664	0.13
665	0.13
666	0.13
667	0.12
668	0.14
669	0.14
670	0.16
671	0.2
672	0.21
673	0.22
674	0.22
675	0.22
676	0.24
677	0.28
678	0.26
679	0.24
680	0.27
681	0.27
682	0.28
683	0.27
684	0.26
685	0.23
686	0.22
687	0.2
688	0.15
689	0.14
690	0.16
691	0.17
692	0.14
693	0.14
694	0.14
695	0.15
696	0.18
697	0.18
698	0.16
699	0.17
700	0.19
701	0.23
702	0.25
703	0.27
704	0.29
705	0.32
706	0.33
707	0.35
708	0.35
709	0.32
710	0.32
711	0.3
712	0.25
713	0.23
714	0.24
715	0.22
716	0.21
717	0.19
718	0.22
719	0.24
720	0.28
721	0.31
722	0.33
723	0.35
724	0.39
725	0.4
726	0.43
727	0.47
728	0.44
729	0.41
730	0.37
731	0.33
732	0.29
733	0.28
734	0.21
735	0.14
736	0.16
737	0.17
738	0.24
739	0.25
740	0.24
741	0.26
742	0.26
743	0.29
744	0.27
745	0.23
746	0.16
747	0.14
748	0.14
749	0.12
750	0.12
751	0.1
752	0.12
753	0.14
754	0.15
755	0.16
756	0.2
757	0.28
758	0.36
759	0.46
760	0.53
761	0.57
762	0.64
763	0.7
764	0.72
765	0.75
766	0.75
767	0.74
768	0.73
769	0.78
770	0.73
771	0.7
772	0.65
773	0.59
774	0.52
775	0.43
776	0.36
777	0.28
778	0.26
779	0.22
780	0.2
781	0.18
782	0.17
783	0.16
784	0.14
785	0.13
786	0.12
787	0.16
788	0.22
789	0.22
790	0.24
791	0.3
792	0.33
793	0.34
794	0.34
795	0.38
796	0.42
797	0.42
798	0.42
799	0.37
800	0.34
801	0.37
802	0.36
803	0.31
804	0.25
805	0.22
806	0.2
807	0.19
808	0.19
809	0.15
810	0.15
811	0.12
812	0.09
813	0.09
814	0.12
815	0.12
816	0.12
817	0.13
818	0.15
819	0.17
820	0.19
821	0.25
822	0.21
823	0.28
824	0.36
825	0.41
826	0.41
827	0.42
828	0.42
829	0.38
830	0.37
831	0.34
832	0.28
833	0.29
834	0.3
835	0.27
836	0.27
837	0.29
838	0.34
839	0.34
840	0.4
841	0.4
842	0.4
843	0.42
844	0.42
845	0.41
846	0.39
847	0.42
848	0.39
849	0.36
850	0.32
851	0.34
852	0.35
853	0.35
854	0.34
855	0.37
856	0.36
857	0.34
858	0.37
859	0.35
860	0.35
861	0.35
862	0.38
863	0.3
864	0.26
865	0.27
866	0.28
867	0.28

C5FNX6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer