Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FG89

Protein Details
Accession C5FG89    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
156-183LYEQMKRDAKKKERKRKWEPYVKKTVPRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
161-174KRDAKKKERKRKWE
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003196  TFIIF_beta  
IPR040450  TFIIF_beta_HTH  
IPR040504  TFIIF_beta_N  
IPR011039  TFIIF_interaction  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005674  C:transcription factor TFIIF complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0008233  F:peptidase activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006508  P:proteolysis  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF02270  TFIIF_beta  
PF17683  TFIIF_beta_N  
CDD cd07980  TFIIF_beta  
Amino Acid Sequences MANFNAGQIKAESPANPEIKQEPDTKDTVMSDDDIYEDTGDLDFTNAAQNVWLTRIPRTLWERWSKLDDDEEIQIGTVRVEGDPTDIKRISLRLLDIPQNKGIPKDYNLRRQNVNADRSAYAVQNTYVFTEKDLPGYKDKINQFYNENQPYGRSYLYEQMKRDAKKKERKRKWEPYVKKTVPRQTAITARVHDEFNCLPVENEEYQRIAEERALESLKPKRETKFIEKVPGKMLRPKTVAAADKSNFIQVTKPAKVRAQENKTARMPQNELLDLIYACFRRYKYWPFKSLKAELRQPEVYLKQTLEIVAHLVKSGDFALTWELKPEARESNYTDALAYRDAKEELPPTAGYNFDEGSEGEPTASGIGTDADDDDNVKFENA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.32
3 0.31
4 0.33
5 0.34
6 0.36
7 0.39
8 0.41
9 0.38
10 0.38
11 0.4
12 0.37
13 0.36
14 0.33
15 0.31
16 0.26
17 0.22
18 0.18
19 0.16
20 0.16
21 0.14
22 0.14
23 0.12
24 0.1
25 0.09
26 0.08
27 0.08
28 0.07
29 0.07
30 0.06
31 0.06
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.11
37 0.11
38 0.14
39 0.16
40 0.13
41 0.16
42 0.2
43 0.2
44 0.27
45 0.33
46 0.36
47 0.42
48 0.51
49 0.51
50 0.52
51 0.56
52 0.5
53 0.46
54 0.44
55 0.37
56 0.3
57 0.29
58 0.25
59 0.2
60 0.18
61 0.16
62 0.13
63 0.11
64 0.09
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.1
70 0.14
71 0.16
72 0.21
73 0.21
74 0.22
75 0.23
76 0.24
77 0.24
78 0.22
79 0.22
80 0.21
81 0.25
82 0.32
83 0.34
84 0.36
85 0.36
86 0.36
87 0.35
88 0.32
89 0.31
90 0.27
91 0.27
92 0.34
93 0.38
94 0.46
95 0.52
96 0.54
97 0.54
98 0.53
99 0.59
100 0.57
101 0.54
102 0.46
103 0.43
104 0.39
105 0.38
106 0.36
107 0.27
108 0.2
109 0.16
110 0.14
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.13
115 0.12
116 0.12
117 0.17
118 0.16
119 0.19
120 0.22
121 0.23
122 0.25
123 0.29
124 0.29
125 0.31
126 0.34
127 0.37
128 0.36
129 0.35
130 0.35
131 0.37
132 0.45
133 0.4
134 0.38
135 0.31
136 0.3
137 0.3
138 0.28
139 0.22
140 0.14
141 0.13
142 0.2
143 0.26
144 0.3
145 0.29
146 0.33
147 0.39
148 0.41
149 0.45
150 0.47
151 0.51
152 0.57
153 0.67
154 0.73
155 0.77
156 0.85
157 0.89
158 0.91
159 0.91
160 0.92
161 0.9
162 0.88
163 0.88
164 0.82
165 0.78
166 0.75
167 0.72
168 0.66
169 0.59
170 0.52
171 0.45
172 0.46
173 0.42
174 0.38
175 0.3
176 0.27
177 0.26
178 0.25
179 0.21
180 0.19
181 0.15
182 0.14
183 0.13
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.14
188 0.12
189 0.13
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.15
203 0.21
204 0.25
205 0.28
206 0.31
207 0.31
208 0.37
209 0.44
210 0.48
211 0.52
212 0.49
213 0.55
214 0.54
215 0.53
216 0.53
217 0.52
218 0.45
219 0.43
220 0.44
221 0.41
222 0.41
223 0.39
224 0.36
225 0.36
226 0.38
227 0.33
228 0.36
229 0.3
230 0.3
231 0.3
232 0.29
233 0.23
234 0.19
235 0.19
236 0.18
237 0.25
238 0.27
239 0.29
240 0.3
241 0.33
242 0.36
243 0.42
244 0.46
245 0.46
246 0.5
247 0.52
248 0.56
249 0.56
250 0.6
251 0.56
252 0.51
253 0.48
254 0.44
255 0.44
256 0.37
257 0.35
258 0.28
259 0.25
260 0.19
261 0.16
262 0.15
263 0.11
264 0.11
265 0.14
266 0.14
267 0.17
268 0.23
269 0.34
270 0.41
271 0.5
272 0.59
273 0.61
274 0.68
275 0.71
276 0.73
277 0.71
278 0.67
279 0.67
280 0.61
281 0.62
282 0.56
283 0.5
284 0.47
285 0.42
286 0.38
287 0.33
288 0.29
289 0.24
290 0.23
291 0.23
292 0.17
293 0.14
294 0.13
295 0.12
296 0.11
297 0.11
298 0.1
299 0.09
300 0.1
301 0.1
302 0.08
303 0.06
304 0.07
305 0.12
306 0.14
307 0.15
308 0.16
309 0.17
310 0.17
311 0.19
312 0.21
313 0.24
314 0.24
315 0.27
316 0.3
317 0.35
318 0.36
319 0.35
320 0.32
321 0.27
322 0.25
323 0.26
324 0.23
325 0.18
326 0.19
327 0.2
328 0.2
329 0.23
330 0.24
331 0.22
332 0.23
333 0.22
334 0.21
335 0.21
336 0.22
337 0.19
338 0.19
339 0.18
340 0.15
341 0.16
342 0.14
343 0.15
344 0.15
345 0.14
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.1
350 0.1
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.07
355 0.07
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.1
360 0.1
361 0.11