FuNGI

A0A4U6X5E8

Protein Details

Accession

A0A4U6X5E8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
117-148	LDPWNSPPRHHRRTAPRSRRRHHHKTMPITIL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
124-140	PRHHRRTAPRSRRRHHH

Subcellular Location(s)

cyto 12, cyto_nucl 12, nucl 10, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025721 Exosome_cplx_N_dom IPR026699 Exosome_RNA_bind1/RRP40/RRP4 IPR036612 KH_dom_type_1_sf IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR022967 S1_dom
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0000178 C:exosome (RNase complex) GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF14382 ECR1_N
CDD	cd05789 S1_Rrp4

Amino Acid Sequences

MIGGGDKIPSVGTLDKPENLDQLLREDRGDDCTSCRVVASVQWAVIILYNTVKFESEFANGRRCIVDGPVPLPINHKLQSAPPKLHQKSLHPVNFDLYLHHQKPHHATLIKHCEILLDPWNSPPRHHRRTAPRSRRRHHHKTMPITILAPRGTSSHQKPANYTAAADSDSDSDGGADIEGDIPMRPAKRTRGDNYDIVTPGEIITDDPQWMRGHGTYITPTTTEIVSSVAGTVTRTNKLLSVRPLRARYTPEIGDLVIGRIVEVQAKRWRVDVGSSQLAILQISAINLPGGILRKRTDTDELQIRSFFAEGDLVVAEVQQLHQDGAASLHTRSLKYGKLRNGVFVAVTGTGGGGGVVRAKRQQWVMGVARGTSKVHVTLGVNGFIWISKHVESDVSESVGLNRMEESVSANVYSSQNDRIDHETMREVARIRSVILALVENGLKVDEDMVVRGYKEAVDMGLESAEDDIYLGGERGKRLAEALLRE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.28
3	0.32
4	0.33
5	0.33
6	0.31
7	0.3
8	0.25
9	0.29
10	0.31
11	0.28
12	0.27
13	0.25
14	0.25
15	0.29
16	0.31
17	0.24
18	0.23
19	0.27
20	0.28
21	0.26
22	0.25
23	0.2
24	0.18
25	0.2
26	0.23
27	0.2
28	0.19
29	0.19
30	0.19
31	0.18
32	0.19
33	0.17
34	0.11
35	0.12
36	0.13
37	0.14
38	0.14
39	0.15
40	0.13
41	0.14
42	0.15
43	0.16
44	0.22
45	0.24
46	0.31
47	0.31
48	0.32
49	0.31
50	0.29
51	0.27
52	0.24
53	0.27
54	0.22
55	0.23
56	0.28
57	0.28
58	0.28
59	0.31
60	0.31
61	0.31
62	0.29
63	0.29
64	0.24
65	0.31
66	0.4
67	0.43
68	0.44
69	0.47
70	0.56
71	0.57
72	0.63
73	0.6
74	0.57
75	0.61
76	0.66
77	0.63
78	0.55
79	0.54
80	0.49
81	0.47
82	0.4
83	0.32
84	0.29
85	0.34
86	0.32
87	0.36
88	0.34
89	0.37
90	0.43
91	0.45
92	0.45
93	0.39
94	0.41
95	0.47
96	0.56
97	0.52
98	0.46
99	0.41
100	0.34
101	0.31
102	0.32
103	0.29
104	0.21
105	0.2
106	0.25
107	0.33
108	0.32
109	0.33
110	0.41
111	0.44
112	0.49
113	0.54
114	0.57
115	0.61
116	0.72
117	0.82
118	0.82
119	0.82
120	0.86
121	0.89
122	0.91
123	0.9
124	0.89
125	0.88
126	0.87
127	0.86
128	0.85
129	0.85
130	0.77
131	0.68
132	0.59
133	0.51
134	0.45
135	0.35
136	0.26
137	0.18
138	0.16
139	0.18
140	0.24
141	0.25
142	0.3
143	0.34
144	0.35
145	0.36
146	0.4
147	0.43
148	0.36
149	0.32
150	0.25
151	0.22
152	0.22
153	0.2
154	0.15
155	0.1
156	0.1
157	0.1
158	0.08
159	0.07
160	0.06
161	0.06
162	0.05
163	0.04
164	0.03
165	0.04
166	0.04
167	0.04
168	0.04
169	0.05
170	0.07
171	0.08
172	0.1
173	0.13
174	0.2
175	0.27
176	0.34
177	0.38
178	0.44
179	0.47
180	0.49
181	0.47
182	0.44
183	0.38
184	0.31
185	0.26
186	0.18
187	0.14
188	0.11
189	0.09
190	0.05
191	0.06
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.09
196	0.09
197	0.1
198	0.11
199	0.1
200	0.11
201	0.11
202	0.12
203	0.11
204	0.12
205	0.12
206	0.11
207	0.11
208	0.1
209	0.09
210	0.08
211	0.07
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.08
220	0.09
221	0.1
222	0.11
223	0.11
224	0.13
225	0.15
226	0.19
227	0.23
228	0.28
229	0.31
230	0.36
231	0.39
232	0.39
233	0.4
234	0.4
235	0.36
236	0.34
237	0.29
238	0.25
239	0.23
240	0.2
241	0.18
242	0.14
243	0.11
244	0.07
245	0.07
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.08
250	0.08
251	0.12
252	0.17
253	0.19
254	0.2
255	0.21
256	0.21
257	0.18
258	0.21
259	0.21
260	0.21
261	0.21
262	0.2
263	0.19
264	0.19
265	0.19
266	0.16
267	0.11
268	0.06
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.05
277	0.08
278	0.08
279	0.11
280	0.12
281	0.14
282	0.16
283	0.18
284	0.22
285	0.21
286	0.25
287	0.31
288	0.32
289	0.31
290	0.3
291	0.28
292	0.23
293	0.22
294	0.16
295	0.08
296	0.07
297	0.05
298	0.06
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.06
312	0.06
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.12
317	0.13
318	0.13
319	0.15
320	0.17
321	0.21
322	0.26
323	0.34
324	0.37
325	0.43
326	0.43
327	0.44
328	0.43
329	0.38
330	0.31
331	0.25
332	0.19
333	0.12
334	0.11
335	0.08
336	0.06
337	0.05
338	0.05
339	0.04
340	0.03
341	0.03
342	0.07
343	0.08
344	0.09
345	0.12
346	0.14
347	0.18
348	0.19
349	0.23
350	0.21
351	0.28
352	0.3
353	0.31
354	0.31
355	0.28
356	0.28
357	0.26
358	0.24
359	0.18
360	0.16
361	0.13
362	0.13
363	0.15
364	0.15
365	0.2
366	0.21
367	0.21
368	0.2
369	0.19
370	0.18
371	0.16
372	0.15
373	0.1
374	0.11
375	0.11
376	0.11
377	0.12
378	0.13
379	0.14
380	0.18
381	0.18
382	0.16
383	0.16
384	0.15
385	0.16
386	0.2
387	0.19
388	0.14
389	0.13
390	0.13
391	0.13
392	0.13
393	0.15
394	0.11
395	0.12
396	0.12
397	0.12
398	0.14
399	0.14
400	0.16
401	0.16
402	0.2
403	0.21
404	0.23
405	0.25
406	0.27
407	0.29
408	0.29
409	0.29
410	0.27
411	0.26
412	0.27
413	0.27
414	0.24
415	0.22
416	0.26
417	0.24
418	0.21
419	0.21
420	0.2
421	0.18
422	0.18
423	0.17
424	0.13
425	0.14
426	0.14
427	0.11
428	0.11
429	0.1
430	0.09
431	0.08
432	0.08
433	0.08
434	0.08
435	0.09
436	0.11
437	0.12
438	0.13
439	0.13
440	0.13
441	0.11
442	0.11
443	0.11
444	0.09
445	0.09
446	0.1
447	0.1
448	0.09
449	0.09
450	0.08
451	0.08
452	0.08
453	0.06
454	0.06
455	0.05
456	0.05
457	0.06
458	0.06
459	0.09
460	0.12
461	0.13
462	0.15
463	0.16
464	0.16
465	0.17
466	0.22

A0A4U6X5E8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer