Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U6X3K5

Protein Details
Accession A0A4U6X3K5    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-32NSARSKPQKMATELRKRTRSHydrophilic
63-85VEPEKVTKKKTTKVEKADKFEKIHydrophilic
92-111EKIEKVKKVEKAPKRKAPEEBasic
199-218GKVPKHAKKQKQLTNGKKEEBasic
332-357ESNWTHKVSREEKKRLERAQKLKEIGHydrophilic
408-431SAEAEKPKAAKPKAKKGGRRKSKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-136RKRTRSVTASAEKPAAKKTAKVEKVEKVEKVEKVEKVEPEKVTKKKTTKVEKADKFEKIERVEKIEKIEKVKKVEKAPKRKAPEEAQASPVAAKKQKPVKASAKSKKSKP
312-316RFKKI
343-346EKKR
413-431KPKAAKPKAKKGGRRKSKA
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MWRPTIDFSGTDNSARSKPQKMATELRKRTRSVTASAEKPAAKKTAKVEKVEKVEKVEKVEKVEPEKVTKKKTTKVEKADKFEKIERVEKIEKIEKVKKVEKAPKRKAPEEAQASPVAAKKQKPVKASAKSKKSKPEPVEEAEPETTEAAEESVVALDDAADSDEEVDADIQALAAGLDSDAEKTPAGNGTFKEGMDVGKVPKHAKKQKQLTNGKKEEPGIVFISRLPHGFYEHELKGYFSQFGPINRLRLARNKKTGASKHYAFLEFAEESTADIVSKTMDSYLLFGHILKVKTVPRDQLHEDVWKGANKRFKKIPWSKIAAGEVAKPRTESNWTHKVSREEKKRLERAQKLKEIGYEFEAPKLKEAVAPPPEPMVVDAPEEPKAVEAAPVEENPVEEAAAEEKEESAEAEKPKAAKPKAKKGGRRKSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.34
3 0.36
4 0.35
5 0.4
6 0.47
7 0.53
8 0.56
9 0.64
10 0.68
11 0.74
12 0.77
13 0.81
14 0.79
15 0.73
16 0.71
17 0.7
18 0.64
19 0.58
20 0.58
21 0.56
22 0.53
23 0.55
24 0.56
25 0.49
26 0.47
27 0.45
28 0.43
29 0.37
30 0.38
31 0.43
32 0.49
33 0.52
34 0.58
35 0.6
36 0.61
37 0.69
38 0.7
39 0.64
40 0.61
41 0.62
42 0.58
43 0.58
44 0.57
45 0.51
46 0.51
47 0.53
48 0.51
49 0.51
50 0.55
51 0.5
52 0.52
53 0.58
54 0.58
55 0.6
56 0.64
57 0.64
58 0.66
59 0.73
60 0.75
61 0.76
62 0.8
63 0.83
64 0.82
65 0.83
66 0.83
67 0.78
68 0.73
69 0.68
70 0.65
71 0.59
72 0.57
73 0.51
74 0.51
75 0.51
76 0.47
77 0.48
78 0.48
79 0.47
80 0.49
81 0.54
82 0.52
83 0.55
84 0.6
85 0.59
86 0.62
87 0.68
88 0.7
89 0.74
90 0.78
91 0.79
92 0.81
93 0.79
94 0.76
95 0.73
96 0.72
97 0.69
98 0.61
99 0.55
100 0.48
101 0.44
102 0.38
103 0.34
104 0.29
105 0.25
106 0.25
107 0.29
108 0.37
109 0.42
110 0.43
111 0.49
112 0.54
113 0.6
114 0.69
115 0.71
116 0.73
117 0.76
118 0.79
119 0.8
120 0.78
121 0.78
122 0.72
123 0.71
124 0.67
125 0.64
126 0.65
127 0.56
128 0.52
129 0.42
130 0.37
131 0.29
132 0.23
133 0.17
134 0.11
135 0.09
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.03
156 0.04
157 0.04
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.02
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.09
174 0.1
175 0.11
176 0.11
177 0.15
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.13
182 0.13
183 0.12
184 0.13
185 0.09
186 0.1
187 0.13
188 0.15
189 0.19
190 0.29
191 0.36
192 0.44
193 0.52
194 0.6
195 0.65
196 0.73
197 0.79
198 0.79
199 0.81
200 0.77
201 0.7
202 0.62
203 0.56
204 0.49
205 0.39
206 0.32
207 0.23
208 0.19
209 0.17
210 0.15
211 0.16
212 0.13
213 0.13
214 0.11
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.13
219 0.17
220 0.17
221 0.18
222 0.17
223 0.17
224 0.17
225 0.17
226 0.16
227 0.1
228 0.13
229 0.14
230 0.15
231 0.2
232 0.21
233 0.22
234 0.23
235 0.25
236 0.24
237 0.31
238 0.4
239 0.41
240 0.47
241 0.48
242 0.51
243 0.57
244 0.6
245 0.57
246 0.55
247 0.49
248 0.44
249 0.44
250 0.41
251 0.33
252 0.28
253 0.24
254 0.17
255 0.15
256 0.13
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.1
276 0.14
277 0.14
278 0.14
279 0.17
280 0.19
281 0.25
282 0.28
283 0.32
284 0.3
285 0.35
286 0.39
287 0.39
288 0.39
289 0.38
290 0.35
291 0.31
292 0.32
293 0.3
294 0.29
295 0.28
296 0.34
297 0.33
298 0.39
299 0.43
300 0.45
301 0.52
302 0.6
303 0.65
304 0.66
305 0.7
306 0.67
307 0.64
308 0.61
309 0.53
310 0.44
311 0.41
312 0.38
313 0.33
314 0.31
315 0.27
316 0.26
317 0.25
318 0.3
319 0.29
320 0.31
321 0.39
322 0.41
323 0.44
324 0.49
325 0.55
326 0.58
327 0.62
328 0.64
329 0.64
330 0.71
331 0.77
332 0.82
333 0.82
334 0.84
335 0.84
336 0.84
337 0.84
338 0.83
339 0.76
340 0.69
341 0.65
342 0.57
343 0.49
344 0.43
345 0.4
346 0.32
347 0.34
348 0.37
349 0.32
350 0.31
351 0.31
352 0.27
353 0.24
354 0.26
355 0.29
356 0.31
357 0.32
358 0.3
359 0.31
360 0.3
361 0.27
362 0.26
363 0.2
364 0.15
365 0.16
366 0.17
367 0.18
368 0.2
369 0.2
370 0.18
371 0.15
372 0.15
373 0.13
374 0.13
375 0.11
376 0.13
377 0.15
378 0.15
379 0.17
380 0.16
381 0.16
382 0.15
383 0.15
384 0.12
385 0.09
386 0.1
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.1
394 0.1
395 0.1
396 0.15
397 0.17
398 0.2
399 0.23
400 0.25
401 0.31
402 0.4
403 0.45
404 0.49
405 0.57
406 0.65
407 0.73
408 0.8
409 0.85
410 0.87
411 0.9