Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U6XT77

Protein Details
Accession A0A4U6XT77    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
391-413EEATKAQQPRRRHPPRRDDFESIHydrophilic
486-515LHTWKANRRGNYHRKRRRWARTRYIVDSTRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
493-505RRGNYHRKRRRWA
653-661ARGKFKRRK
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 10.5, cyto 4.5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51257  PROKAR_LIPOPROTEIN  
Amino Acid Sequences MLRPKTLFFFLFATACLERIPLQPGPAWSSQVAKMHHLVQPRQWVSLKLLSEDTKVLQIVPNTTISLGKLGSFPSNLVIERPFHLTYEILDRRDGENFSRLRVVPPSEIHADALADLNAQNAEEEGTTLENIIAAPDGAEFELVDKESGDVVAHSRREIIDDAARQTLTTEEIEQLKQGNNTDAGKDIIAKLLLSHTAIDQKTAFSLAKYKLLKTKKYIRRFTIQPLDPLTLGKWLLEEKDAGKVLEMREEMMGLLGCWANVHFGGIPPTDKPEMVTTDGSGMLDKSEIGGRWLVVDDTGGLVTATMAERMGILYPKDPEDVEAIEFQKDVAGEGGAAGEKKTVEATANGAASQTKPEETSITEAAVGQGSSTAGTEQTTTTDNTMANDDEEATKAQQPRRRHPPRRDDFESIFAPTNTLTLIHPNNQPNLALLKYYSYDSTNPNPPHPLHPLATNLLPISWLQLLEPEEDVTYSTPPPEVSDEVLHTWKANRRGNYHRKRRRWARTRYIVDSTRAGGFSGLVIASTMDTVSVLRHTLPLLAGGAPIAIYSQSIEPLTELADCFSIARRAGWSSNPPAEAAGKSIQELERWEGSDDFPINPTLLLGANVQTSRAKRWQVLPGRTHPMMMGRGGADGYVFTGWKAVPAEGKVEARGKFKRRKLDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.17
4 0.16
5 0.16
6 0.18
7 0.23
8 0.19
9 0.21
10 0.24
11 0.27
12 0.31
13 0.3
14 0.31
15 0.27
16 0.29
17 0.31
18 0.34
19 0.34
20 0.32
21 0.33
22 0.35
23 0.37
24 0.41
25 0.4
26 0.4
27 0.49
28 0.46
29 0.49
30 0.46
31 0.45
32 0.43
33 0.46
34 0.41
35 0.33
36 0.36
37 0.33
38 0.33
39 0.32
40 0.28
41 0.24
42 0.23
43 0.21
44 0.19
45 0.2
46 0.21
47 0.21
48 0.21
49 0.19
50 0.19
51 0.19
52 0.17
53 0.17
54 0.14
55 0.13
56 0.12
57 0.14
58 0.16
59 0.15
60 0.15
61 0.16
62 0.18
63 0.17
64 0.18
65 0.18
66 0.18
67 0.19
68 0.24
69 0.22
70 0.2
71 0.21
72 0.19
73 0.19
74 0.27
75 0.3
76 0.26
77 0.27
78 0.28
79 0.29
80 0.32
81 0.32
82 0.25
83 0.28
84 0.27
85 0.29
86 0.32
87 0.31
88 0.3
89 0.33
90 0.34
91 0.31
92 0.32
93 0.34
94 0.32
95 0.32
96 0.3
97 0.25
98 0.21
99 0.17
100 0.16
101 0.11
102 0.08
103 0.07
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.06
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.05
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.06
138 0.09
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.15
143 0.15
144 0.18
145 0.19
146 0.19
147 0.2
148 0.22
149 0.24
150 0.25
151 0.25
152 0.22
153 0.21
154 0.18
155 0.14
156 0.13
157 0.11
158 0.12
159 0.15
160 0.15
161 0.15
162 0.17
163 0.17
164 0.18
165 0.18
166 0.17
167 0.18
168 0.19
169 0.19
170 0.18
171 0.17
172 0.15
173 0.15
174 0.13
175 0.11
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.15
185 0.15
186 0.16
187 0.15
188 0.15
189 0.15
190 0.16
191 0.15
192 0.09
193 0.16
194 0.16
195 0.23
196 0.24
197 0.26
198 0.32
199 0.39
200 0.44
201 0.45
202 0.54
203 0.57
204 0.65
205 0.71
206 0.69
207 0.69
208 0.68
209 0.7
210 0.69
211 0.61
212 0.55
213 0.5
214 0.46
215 0.39
216 0.35
217 0.26
218 0.19
219 0.16
220 0.12
221 0.1
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.09
227 0.13
228 0.14
229 0.13
230 0.13
231 0.15
232 0.14
233 0.17
234 0.17
235 0.13
236 0.12
237 0.13
238 0.12
239 0.1
240 0.09
241 0.05
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.13
260 0.13
261 0.15
262 0.17
263 0.17
264 0.13
265 0.14
266 0.14
267 0.13
268 0.11
269 0.08
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.07
282 0.05
283 0.05
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.04
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.04
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.07
302 0.08
303 0.09
304 0.1
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.1
314 0.09
315 0.09
316 0.08
317 0.07
318 0.05
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.05
331 0.05
332 0.06
333 0.07
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.1
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.12
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.08
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.07
367 0.08
368 0.09
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.11
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.08
378 0.08
379 0.09
380 0.08
381 0.12
382 0.16
383 0.21
384 0.26
385 0.32
386 0.41
387 0.51
388 0.62
389 0.68
390 0.74
391 0.8
392 0.84
393 0.86
394 0.84
395 0.79
396 0.7
397 0.65
398 0.56
399 0.47
400 0.39
401 0.3
402 0.24
403 0.17
404 0.14
405 0.09
406 0.09
407 0.07
408 0.11
409 0.13
410 0.16
411 0.22
412 0.25
413 0.26
414 0.26
415 0.26
416 0.22
417 0.22
418 0.18
419 0.13
420 0.11
421 0.1
422 0.11
423 0.12
424 0.12
425 0.11
426 0.13
427 0.17
428 0.22
429 0.29
430 0.3
431 0.31
432 0.34
433 0.34
434 0.36
435 0.38
436 0.37
437 0.29
438 0.29
439 0.3
440 0.28
441 0.27
442 0.23
443 0.18
444 0.14
445 0.13
446 0.11
447 0.1
448 0.09
449 0.08
450 0.07
451 0.1
452 0.11
453 0.12
454 0.13
455 0.11
456 0.1
457 0.1
458 0.11
459 0.09
460 0.09
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.09
465 0.1
466 0.13
467 0.13
468 0.14
469 0.15
470 0.17
471 0.19
472 0.2
473 0.19
474 0.16
475 0.2
476 0.23
477 0.31
478 0.35
479 0.38
480 0.43
481 0.54
482 0.65
483 0.71
484 0.77
485 0.78
486 0.82
487 0.88
488 0.92
489 0.92
490 0.91
491 0.91
492 0.91
493 0.91
494 0.89
495 0.84
496 0.81
497 0.73
498 0.66
499 0.57
500 0.48
501 0.39
502 0.32
503 0.26
504 0.18
505 0.14
506 0.11
507 0.1
508 0.08
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.05
519 0.06
520 0.07
521 0.07
522 0.08
523 0.09
524 0.1
525 0.1
526 0.1
527 0.1
528 0.1
529 0.09
530 0.08
531 0.08
532 0.06
533 0.06
534 0.05
535 0.04
536 0.04
537 0.05
538 0.06
539 0.08
540 0.08
541 0.08
542 0.09
543 0.09
544 0.1
545 0.09
546 0.09
547 0.08
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.1
552 0.13
553 0.12
554 0.13
555 0.15
556 0.18
557 0.2
558 0.25
559 0.29
560 0.33
561 0.37
562 0.37
563 0.35
564 0.33
565 0.33
566 0.29
567 0.26
568 0.22
569 0.18
570 0.18
571 0.21
572 0.21
573 0.2
574 0.22
575 0.24
576 0.23
577 0.24
578 0.26
579 0.23
580 0.23
581 0.27
582 0.26
583 0.22
584 0.2
585 0.2
586 0.18
587 0.17
588 0.16
589 0.11
590 0.1
591 0.1
592 0.1
593 0.1
594 0.13
595 0.13
596 0.15
597 0.19
598 0.2
599 0.25
600 0.32
601 0.35
602 0.37
603 0.43
604 0.52
605 0.57
606 0.64
607 0.65
608 0.66
609 0.7
610 0.65
611 0.59
612 0.5
613 0.46
614 0.39
615 0.32
616 0.27
617 0.19
618 0.19
619 0.19
620 0.17
621 0.12
622 0.09
623 0.1
624 0.08
625 0.08
626 0.07
627 0.09
628 0.09
629 0.13
630 0.14
631 0.15
632 0.18
633 0.19
634 0.23
635 0.25
636 0.27
637 0.28
638 0.32
639 0.35
640 0.38
641 0.46
642 0.53
643 0.58
644 0.64