Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U6XKQ2

Protein Details
Accession A0A4U6XKQ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-34PAKVSGDGLKRKRTPNKEKSKKRVKSESESEAEHydrophilic
245-265YVEKPKKKSHNVNSLHRHKKQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-26LKRKRTPNKEKSKKRVK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 10.833, cyto_mito 4.666, mito 4.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MPAKVSGDGLKRKRTPNKEKSKKRVKSESESEAESSGDESNDPQAEILLLENEILESKKHYNNISKLIQTTSIHEDEPEAATLACVALCRVFVRLLSAGALVPRKGLPEKEAVVVQWLKERYFEYKSVLASLLAEEDLAPTMLTLALRCLKAEAQHLYEKEEYMFPQNFLEQIVAGLLGSDSDDARVEFVKKYLTQYDDIRFFTLKAIKSLAETPGSLPHYELFDDTFELLSNIGGVPTELGNFYVEKPKKKSHNVNSLHRHKKQGQDAWLAVLKLAATREQRKQVLDVMSTEIAPWFIRPELLADFLTDSYDAGGSISLLALSGVFYLIKERNLDYPSFYTKLYSLLDSEILHSKHRSRFFRLMDTFLSSTHLPAVLVASFIKRLARLSLNAPPSAIVFIVPWMYNILKRHPLCTFMIHRETRDPEAKALMEKQGVDDPFVADEADPAETHAIDSCLWEIVQLQSHYHPNVATIAKIMSEQFTKQSYNIEDFLDHSYGSLLEAEMNKQVRKPPVLEFQIPKKVFLPNDPESGFQDSLVTKLWNFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.82
3 0.83
4 0.88
5 0.89
6 0.93
7 0.95
8 0.95
9 0.94
10 0.92
11 0.92
12 0.9
13 0.89
14 0.86
15 0.84
16 0.77
17 0.7
18 0.62
19 0.51
20 0.42
21 0.32
22 0.25
23 0.17
24 0.14
25 0.11
26 0.11
27 0.15
28 0.15
29 0.15
30 0.13
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.08
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.11
44 0.17
45 0.22
46 0.26
47 0.32
48 0.41
49 0.46
50 0.54
51 0.55
52 0.53
53 0.5
54 0.48
55 0.47
56 0.39
57 0.37
58 0.36
59 0.32
60 0.29
61 0.27
62 0.26
63 0.22
64 0.23
65 0.19
66 0.13
67 0.11
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.07
72 0.06
73 0.06
74 0.05
75 0.06
76 0.07
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.13
84 0.13
85 0.12
86 0.15
87 0.17
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.16
92 0.18
93 0.2
94 0.19
95 0.23
96 0.25
97 0.26
98 0.26
99 0.23
100 0.26
101 0.26
102 0.23
103 0.24
104 0.23
105 0.21
106 0.22
107 0.24
108 0.24
109 0.27
110 0.28
111 0.26
112 0.28
113 0.28
114 0.28
115 0.27
116 0.22
117 0.18
118 0.16
119 0.12
120 0.09
121 0.08
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.08
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.14
137 0.14
138 0.17
139 0.22
140 0.22
141 0.22
142 0.27
143 0.28
144 0.3
145 0.3
146 0.28
147 0.24
148 0.22
149 0.19
150 0.2
151 0.21
152 0.18
153 0.18
154 0.18
155 0.17
156 0.16
157 0.15
158 0.08
159 0.07
160 0.06
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.03
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.07
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.13
178 0.13
179 0.17
180 0.2
181 0.21
182 0.23
183 0.26
184 0.31
185 0.32
186 0.31
187 0.3
188 0.26
189 0.24
190 0.25
191 0.26
192 0.21
193 0.19
194 0.19
195 0.18
196 0.19
197 0.21
198 0.19
199 0.15
200 0.14
201 0.13
202 0.17
203 0.19
204 0.17
205 0.16
206 0.14
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.09
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.06
231 0.07
232 0.16
233 0.19
234 0.23
235 0.28
236 0.34
237 0.42
238 0.5
239 0.59
240 0.6
241 0.67
242 0.7
243 0.75
244 0.78
245 0.81
246 0.81
247 0.74
248 0.71
249 0.64
250 0.64
251 0.62
252 0.58
253 0.53
254 0.49
255 0.46
256 0.41
257 0.38
258 0.31
259 0.23
260 0.17
261 0.12
262 0.08
263 0.08
264 0.1
265 0.12
266 0.16
267 0.21
268 0.26
269 0.28
270 0.28
271 0.29
272 0.3
273 0.29
274 0.25
275 0.22
276 0.19
277 0.18
278 0.17
279 0.15
280 0.1
281 0.09
282 0.08
283 0.07
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.07
289 0.08
290 0.1
291 0.1
292 0.09
293 0.1
294 0.09
295 0.1
296 0.08
297 0.07
298 0.05
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.02
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.06
316 0.08
317 0.09
318 0.1
319 0.11
320 0.16
321 0.18
322 0.18
323 0.18
324 0.2
325 0.23
326 0.23
327 0.22
328 0.19
329 0.17
330 0.2
331 0.18
332 0.15
333 0.12
334 0.12
335 0.13
336 0.12
337 0.14
338 0.16
339 0.16
340 0.17
341 0.19
342 0.23
343 0.28
344 0.36
345 0.39
346 0.42
347 0.49
348 0.51
349 0.58
350 0.55
351 0.52
352 0.45
353 0.45
354 0.38
355 0.29
356 0.29
357 0.19
358 0.17
359 0.14
360 0.13
361 0.09
362 0.08
363 0.09
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.09
371 0.08
372 0.09
373 0.13
374 0.15
375 0.16
376 0.2
377 0.26
378 0.28
379 0.28
380 0.27
381 0.23
382 0.21
383 0.2
384 0.16
385 0.09
386 0.06
387 0.07
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.1
393 0.13
394 0.16
395 0.2
396 0.27
397 0.28
398 0.31
399 0.3
400 0.33
401 0.32
402 0.37
403 0.38
404 0.36
405 0.44
406 0.42
407 0.43
408 0.45
409 0.47
410 0.46
411 0.46
412 0.41
413 0.34
414 0.36
415 0.35
416 0.32
417 0.3
418 0.28
419 0.24
420 0.22
421 0.23
422 0.25
423 0.24
424 0.22
425 0.2
426 0.17
427 0.16
428 0.16
429 0.14
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.07
435 0.08
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.09
440 0.09
441 0.08
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.09
448 0.1
449 0.16
450 0.16
451 0.17
452 0.2
453 0.25
454 0.26
455 0.26
456 0.23
457 0.19
458 0.24
459 0.22
460 0.19
461 0.16
462 0.15
463 0.14
464 0.15
465 0.15
466 0.12
467 0.14
468 0.15
469 0.18
470 0.2
471 0.22
472 0.22
473 0.27
474 0.28
475 0.3
476 0.3
477 0.28
478 0.25
479 0.25
480 0.29
481 0.24
482 0.19
483 0.15
484 0.14
485 0.13
486 0.13
487 0.11
488 0.07
489 0.1
490 0.11
491 0.13
492 0.18
493 0.22
494 0.23
495 0.25
496 0.32
497 0.36
498 0.4
499 0.41
500 0.42
501 0.49
502 0.55
503 0.59
504 0.59
505 0.61
506 0.67
507 0.64
508 0.59
509 0.51
510 0.51
511 0.46
512 0.46
513 0.46
514 0.4
515 0.47
516 0.46
517 0.45
518 0.43
519 0.46
520 0.39
521 0.31
522 0.3
523 0.22
524 0.23
525 0.23
526 0.21