Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U6XIH0

Protein Details
Accession A0A4U6XIH0    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-34MPPHVPRKRLREESPVKSSQKRHQAAKGQSKPVTHydrophilic
143-167TDPYGDKKGPTKREKKIRMVTHCIHBasic
213-244DAKPEKAPPKPAKPTKKTRSKAKGKKVEDEDSBasic
986-1024AEPLPAPVRAKPKPKKKAATRRSTRRRRRPVSDSEDEDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-9R
17-23KSSQKRH
154-155KR
212-238LDAKPEKAPPKPAKPTKKTRSKAKGKK
400-424GKTGGKTKKTAKNTPAKKGMAPARN
840-849RKEDEKRRKE
993-1015VRAKPKPKKKAATRRSTRRRRRP
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MPPHVPRKRLREESPVKSSQKRHQAAKGQSKPVTPSTRRKPTLYDDLDATITPDSSRAGRSALDVVSDSDEDSSLSDLSDGDFEDVPVASGGKAGESPDDDDDENDDVEFEDVPAPRTTLAKAATTSQDLQLTLDAGLGTAMTDPYGDKKGPTKREKKIRMVTHCIHVQYLLWHNAFRNAWIGDLEVQAIMMSHVPSRLWEDVERWRRASGLDAKPEKAPPKPAKPTKKTRSKAKGKKVEDEDSRDWGPAAERLDEGAIDMSHGDPLFRLMKSLVAWWRQRFRVTAPGIRKWGYMPPERLGRLRKAWETEDHDQERFGERLNGLEGFRLCAQECTGSRDVGSQLFTALMRALGLEARMVSNLQPLGFGWTKLEEADPEKDKSALPVTSNDARSDDGRTGGKTGGKTKKTAKNTPAKKGMAPARNASTRRASQKNVVIEIHGSDDELGLEHPDSDDESIVELEVTPRKSLAVSKKFDKDLEFPHYWTEVLSPVTKKYLPVDPIVKNVIGTNRDLIESLEPRGGKADKSKQVAAYVVGFSPDGTAKDVTVRYLRKQLWPGRTKGSRMPPEKVPIYNRHGKVKRYDQFDWFKSAMKGYARGDRKHPLTEEDEAEESTDLTPAQPEKKEVKEGSETLAYYKQSKEFCLERHLKREEALLPAAIPVKTFKNKAKGGEISEDPVYSRKNVVNVKSAETWHKQGRAPKPGEQPLKRVPYRAATTNRRREIAEAEALSGEKVLQGLYSFDQTDWIIPPPIKDGIIPKNEYGNIDLFAEHMCPEGAAHVPFRGAVKVCKRLKIDYAEAVVDFEFGNRMAVPVIQGVVIAEEYHDQVMEEIRKDEVERARKEDEKRRKEALRVWSKFLKGLRIVERIRQDYGQVDDSVPVFQKGAAKAVRHIRDADEEEEANQMDAEEMRMREEQMAGGFFPEGHEEEEIEQTQRFTSGFFPVVDEDDEDHDMEDALVVDHGDEEKLDTTEDGDGTADAEEASPEAEPLPAPVRAKPKPKKKAATRRSTRRRRRPVSDSEDEDEGEDDDSFVASDDDYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.8
3 0.76
4 0.75
5 0.76
6 0.74
7 0.76
8 0.74
9 0.73
10 0.73
11 0.77
12 0.79
13 0.83
14 0.82
15 0.8
16 0.77
17 0.73
18 0.68
19 0.68
20 0.67
21 0.64
22 0.65
23 0.67
24 0.74
25 0.75
26 0.73
27 0.71
28 0.69
29 0.72
30 0.66
31 0.59
32 0.5
33 0.48
34 0.45
35 0.39
36 0.32
37 0.21
38 0.16
39 0.13
40 0.12
41 0.11
42 0.12
43 0.14
44 0.14
45 0.14
46 0.15
47 0.17
48 0.2
49 0.19
50 0.19
51 0.18
52 0.18
53 0.19
54 0.19
55 0.16
56 0.13
57 0.13
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.07
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.09
82 0.11
83 0.12
84 0.15
85 0.16
86 0.18
87 0.18
88 0.18
89 0.2
90 0.19
91 0.17
92 0.14
93 0.12
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.08
98 0.11
99 0.11
100 0.14
101 0.14
102 0.15
103 0.15
104 0.16
105 0.17
106 0.18
107 0.2
108 0.2
109 0.2
110 0.24
111 0.26
112 0.28
113 0.29
114 0.27
115 0.27
116 0.24
117 0.24
118 0.2
119 0.18
120 0.14
121 0.13
122 0.1
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.09
133 0.13
134 0.13
135 0.15
136 0.23
137 0.32
138 0.42
139 0.53
140 0.59
141 0.66
142 0.77
143 0.84
144 0.87
145 0.87
146 0.87
147 0.85
148 0.85
149 0.79
150 0.75
151 0.7
152 0.6
153 0.51
154 0.41
155 0.33
156 0.29
157 0.31
158 0.29
159 0.25
160 0.26
161 0.26
162 0.31
163 0.31
164 0.27
165 0.25
166 0.2
167 0.2
168 0.19
169 0.19
170 0.15
171 0.15
172 0.14
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.14
185 0.15
186 0.17
187 0.17
188 0.21
189 0.3
190 0.4
191 0.42
192 0.39
193 0.38
194 0.36
195 0.35
196 0.39
197 0.38
198 0.37
199 0.43
200 0.45
201 0.46
202 0.48
203 0.53
204 0.49
205 0.44
206 0.46
207 0.45
208 0.52
209 0.61
210 0.69
211 0.75
212 0.8
213 0.87
214 0.87
215 0.89
216 0.87
217 0.88
218 0.89
219 0.89
220 0.9
221 0.9
222 0.9
223 0.84
224 0.86
225 0.82
226 0.8
227 0.75
228 0.73
229 0.65
230 0.59
231 0.54
232 0.45
233 0.38
234 0.3
235 0.24
236 0.19
237 0.18
238 0.14
239 0.14
240 0.14
241 0.14
242 0.13
243 0.12
244 0.1
245 0.08
246 0.06
247 0.07
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.09
254 0.12
255 0.12
256 0.13
257 0.11
258 0.14
259 0.14
260 0.2
261 0.22
262 0.26
263 0.32
264 0.37
265 0.44
266 0.44
267 0.46
268 0.43
269 0.41
270 0.44
271 0.43
272 0.45
273 0.45
274 0.48
275 0.5
276 0.48
277 0.45
278 0.37
279 0.38
280 0.36
281 0.37
282 0.35
283 0.35
284 0.4
285 0.42
286 0.45
287 0.44
288 0.44
289 0.43
290 0.44
291 0.44
292 0.42
293 0.43
294 0.45
295 0.47
296 0.47
297 0.5
298 0.47
299 0.44
300 0.4
301 0.38
302 0.35
303 0.28
304 0.23
305 0.18
306 0.15
307 0.16
308 0.17
309 0.17
310 0.14
311 0.16
312 0.15
313 0.14
314 0.15
315 0.15
316 0.14
317 0.13
318 0.13
319 0.16
320 0.17
321 0.21
322 0.22
323 0.21
324 0.21
325 0.22
326 0.22
327 0.19
328 0.19
329 0.12
330 0.1
331 0.11
332 0.11
333 0.09
334 0.08
335 0.06
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.06
346 0.06
347 0.08
348 0.09
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.12
356 0.12
357 0.12
358 0.13
359 0.13
360 0.09
361 0.12
362 0.17
363 0.19
364 0.19
365 0.2
366 0.2
367 0.2
368 0.2
369 0.21
370 0.17
371 0.15
372 0.16
373 0.2
374 0.25
375 0.26
376 0.25
377 0.22
378 0.22
379 0.21
380 0.21
381 0.18
382 0.15
383 0.15
384 0.15
385 0.15
386 0.16
387 0.18
388 0.18
389 0.26
390 0.32
391 0.32
392 0.36
393 0.43
394 0.5
395 0.55
396 0.61
397 0.61
398 0.62
399 0.68
400 0.72
401 0.72
402 0.65
403 0.58
404 0.57
405 0.56
406 0.52
407 0.47
408 0.42
409 0.38
410 0.43
411 0.43
412 0.39
413 0.37
414 0.35
415 0.4
416 0.42
417 0.39
418 0.39
419 0.44
420 0.44
421 0.41
422 0.36
423 0.29
424 0.25
425 0.23
426 0.19
427 0.13
428 0.1
429 0.07
430 0.07
431 0.06
432 0.06
433 0.05
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.04
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.04
448 0.06
449 0.09
450 0.09
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.1
455 0.15
456 0.24
457 0.29
458 0.32
459 0.37
460 0.41
461 0.42
462 0.43
463 0.41
464 0.34
465 0.31
466 0.35
467 0.31
468 0.27
469 0.27
470 0.26
471 0.23
472 0.2
473 0.15
474 0.1
475 0.1
476 0.12
477 0.11
478 0.11
479 0.14
480 0.14
481 0.14
482 0.14
483 0.18
484 0.18
485 0.2
486 0.26
487 0.24
488 0.27
489 0.28
490 0.25
491 0.2
492 0.2
493 0.19
494 0.14
495 0.14
496 0.12
497 0.11
498 0.12
499 0.12
500 0.11
501 0.11
502 0.11
503 0.11
504 0.12
505 0.12
506 0.11
507 0.14
508 0.14
509 0.12
510 0.18
511 0.25
512 0.28
513 0.31
514 0.33
515 0.32
516 0.32
517 0.31
518 0.26
519 0.19
520 0.14
521 0.11
522 0.09
523 0.08
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.06
528 0.07
529 0.07
530 0.07
531 0.1
532 0.1
533 0.11
534 0.16
535 0.17
536 0.18
537 0.25
538 0.27
539 0.28
540 0.36
541 0.41
542 0.46
543 0.49
544 0.5
545 0.5
546 0.52
547 0.5
548 0.49
549 0.51
550 0.5
551 0.49
552 0.5
553 0.46
554 0.49
555 0.48
556 0.45
557 0.41
558 0.38
559 0.41
560 0.45
561 0.44
562 0.48
563 0.5
564 0.5
565 0.52
566 0.56
567 0.56
568 0.55
569 0.55
570 0.53
571 0.55
572 0.54
573 0.52
574 0.42
575 0.39
576 0.32
577 0.3
578 0.26
579 0.2
580 0.23
581 0.19
582 0.27
583 0.29
584 0.3
585 0.34
586 0.37
587 0.39
588 0.38
589 0.37
590 0.33
591 0.31
592 0.33
593 0.3
594 0.25
595 0.23
596 0.19
597 0.19
598 0.15
599 0.12
600 0.09
601 0.08
602 0.05
603 0.05
604 0.06
605 0.08
606 0.11
607 0.12
608 0.16
609 0.2
610 0.23
611 0.29
612 0.28
613 0.3
614 0.31
615 0.31
616 0.3
617 0.27
618 0.25
619 0.2
620 0.23
621 0.2
622 0.18
623 0.19
624 0.2
625 0.19
626 0.2
627 0.23
628 0.23
629 0.24
630 0.31
631 0.38
632 0.37
633 0.45
634 0.46
635 0.43
636 0.4
637 0.42
638 0.35
639 0.3
640 0.27
641 0.19
642 0.16
643 0.16
644 0.18
645 0.13
646 0.11
647 0.1
648 0.14
649 0.18
650 0.22
651 0.26
652 0.32
653 0.36
654 0.39
655 0.43
656 0.42
657 0.42
658 0.42
659 0.38
660 0.32
661 0.29
662 0.26
663 0.2
664 0.19
665 0.17
666 0.13
667 0.15
668 0.14
669 0.2
670 0.25
671 0.28
672 0.33
673 0.34
674 0.36
675 0.36
676 0.36
677 0.36
678 0.34
679 0.36
680 0.33
681 0.36
682 0.35
683 0.41
684 0.47
685 0.51
686 0.52
687 0.54
688 0.59
689 0.63
690 0.69
691 0.64
692 0.62
693 0.61
694 0.66
695 0.6
696 0.53
697 0.47
698 0.45
699 0.46
700 0.47
701 0.48
702 0.49
703 0.59
704 0.66
705 0.67
706 0.61
707 0.58
708 0.52
709 0.47
710 0.41
711 0.36
712 0.26
713 0.24
714 0.22
715 0.22
716 0.19
717 0.15
718 0.1
719 0.05
720 0.05
721 0.04
722 0.04
723 0.04
724 0.06
725 0.07
726 0.09
727 0.09
728 0.09
729 0.11
730 0.11
731 0.12
732 0.12
733 0.13
734 0.14
735 0.13
736 0.14
737 0.16
738 0.17
739 0.16
740 0.15
741 0.2
742 0.25
743 0.31
744 0.33
745 0.3
746 0.33
747 0.34
748 0.34
749 0.3
750 0.23
751 0.18
752 0.16
753 0.15
754 0.12
755 0.11
756 0.1
757 0.08
758 0.08
759 0.06
760 0.06
761 0.06
762 0.07
763 0.08
764 0.09
765 0.1
766 0.09
767 0.1
768 0.11
769 0.12
770 0.13
771 0.13
772 0.19
773 0.26
774 0.35
775 0.39
776 0.44
777 0.46
778 0.47
779 0.52
780 0.51
781 0.48
782 0.43
783 0.42
784 0.36
785 0.33
786 0.3
787 0.24
788 0.18
789 0.13
790 0.09
791 0.07
792 0.06
793 0.07
794 0.06
795 0.07
796 0.06
797 0.07
798 0.07
799 0.07
800 0.07
801 0.06
802 0.06
803 0.06
804 0.06
805 0.06
806 0.05
807 0.05
808 0.06
809 0.06
810 0.07
811 0.07
812 0.06
813 0.06
814 0.11
815 0.14
816 0.14
817 0.14
818 0.15
819 0.16
820 0.17
821 0.23
822 0.27
823 0.33
824 0.35
825 0.4
826 0.45
827 0.51
828 0.58
829 0.62
830 0.65
831 0.65
832 0.68
833 0.71
834 0.71
835 0.71
836 0.71
837 0.71
838 0.71
839 0.65
840 0.65
841 0.63
842 0.59
843 0.56
844 0.51
845 0.47
846 0.4
847 0.44
848 0.44
849 0.47
850 0.47
851 0.49
852 0.55
853 0.51
854 0.49
855 0.43
856 0.38
857 0.33
858 0.35
859 0.31
860 0.25
861 0.22
862 0.21
863 0.21
864 0.21
865 0.18
866 0.15
867 0.12
868 0.12
869 0.17
870 0.16
871 0.22
872 0.25
873 0.25
874 0.31
875 0.4
876 0.43
877 0.4
878 0.41
879 0.37
880 0.4
881 0.42
882 0.38
883 0.32
884 0.28
885 0.27
886 0.27
887 0.24
888 0.17
889 0.13
890 0.11
891 0.08
892 0.08
893 0.1
894 0.12
895 0.12
896 0.15
897 0.16
898 0.17
899 0.17
900 0.18
901 0.17
902 0.15
903 0.16
904 0.13
905 0.13
906 0.12
907 0.11
908 0.11
909 0.12
910 0.11
911 0.12
912 0.12
913 0.12
914 0.14
915 0.18
916 0.18
917 0.17
918 0.17
919 0.16
920 0.15
921 0.16
922 0.14
923 0.11
924 0.12
925 0.15
926 0.17
927 0.17
928 0.19
929 0.19
930 0.21
931 0.21
932 0.2
933 0.17
934 0.18
935 0.19
936 0.17
937 0.16
938 0.14
939 0.13
940 0.11
941 0.1
942 0.07
943 0.06
944 0.06
945 0.06
946 0.05
947 0.06
948 0.07
949 0.06
950 0.06
951 0.08
952 0.09
953 0.1
954 0.11
955 0.1
956 0.11
957 0.13
958 0.13
959 0.11
960 0.1
961 0.1
962 0.1
963 0.1
964 0.08
965 0.06
966 0.06
967 0.06
968 0.06
969 0.06
970 0.06
971 0.06
972 0.06
973 0.07
974 0.06
975 0.09
976 0.13
977 0.16
978 0.18
979 0.24
980 0.33
981 0.4
982 0.51
983 0.58
984 0.66
985 0.73
986 0.82
987 0.87
988 0.89
989 0.92
990 0.92
991 0.93
992 0.93
993 0.94
994 0.95
995 0.95
996 0.96
997 0.95
998 0.96
999 0.95
1000 0.93
1001 0.91
1002 0.91
1003 0.89
1004 0.87
1005 0.82
1006 0.75
1007 0.67
1008 0.58
1009 0.49
1010 0.39
1011 0.3
1012 0.22
1013 0.15
1014 0.11
1015 0.09
1016 0.09
1017 0.08
1018 0.07
1019 0.07