Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U6XV20

Protein Details
Accession A0A4U6XV20    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-87AITAAKKRKAGRPPKKTNATKKLKQAVNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-83AKKRKAGRPPKKTNATKKLK
156-165APKRRGRPRK
233-256PAKKVPTTHGRGVGRPKKTPPKGK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR017984  Chromo_dom_subgr  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR023779  Chromodomain_CS  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00598  CHROMO_1  
PS50013  CHROMO_2  
CDD cd00024  CD_CSD  
Amino Acid Sequences MSFPLVFKGREEEMTMEELEAMSVAAKVKSTEQGTDNDDEEISLVKSDITNSPAPDTQSAITAAKKRKAGRPPKKTNATKKLKQAVNSKATVEPSSAANSSSSSYGTPEAPSSAPSSTGNLSHTAIPTGVDSDKRDDEVDVKDDAKNGASPEPASAPKRRGRPRKTQALVPNSTADQGKRIETKSRATSARVLMLLAKRQAKTNHHGLIDSARTTRAASRNGLMKPVSAKTTPAKKVPTTHGRGVGRPKKTPPKGKSIAPQFTDEEYVVEKIVDSRIDPATKEQMYMVKWKGYAAKDNTWEPKKNLRKCGAMIKTFNNSPNAKGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.2
4 0.17
5 0.15
6 0.12
7 0.1
8 0.07
9 0.05
10 0.06
11 0.07
12 0.07
13 0.08
14 0.09
15 0.12
16 0.18
17 0.2
18 0.23
19 0.24
20 0.28
21 0.31
22 0.33
23 0.32
24 0.26
25 0.24
26 0.2
27 0.18
28 0.15
29 0.11
30 0.09
31 0.08
32 0.07
33 0.08
34 0.1
35 0.12
36 0.15
37 0.18
38 0.19
39 0.22
40 0.24
41 0.26
42 0.25
43 0.25
44 0.21
45 0.19
46 0.21
47 0.19
48 0.21
49 0.26
50 0.32
51 0.35
52 0.4
53 0.43
54 0.49
55 0.58
56 0.65
57 0.69
58 0.74
59 0.79
60 0.84
61 0.89
62 0.91
63 0.91
64 0.91
65 0.9
66 0.85
67 0.85
68 0.84
69 0.77
70 0.74
71 0.72
72 0.7
73 0.67
74 0.61
75 0.54
76 0.47
77 0.45
78 0.39
79 0.31
80 0.22
81 0.17
82 0.18
83 0.16
84 0.14
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.11
90 0.09
91 0.1
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.12
97 0.11
98 0.12
99 0.13
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.14
104 0.13
105 0.14
106 0.14
107 0.14
108 0.14
109 0.14
110 0.14
111 0.13
112 0.12
113 0.11
114 0.09
115 0.1
116 0.09
117 0.1
118 0.11
119 0.14
120 0.14
121 0.15
122 0.15
123 0.14
124 0.15
125 0.16
126 0.17
127 0.15
128 0.15
129 0.15
130 0.15
131 0.15
132 0.13
133 0.12
134 0.11
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.12
140 0.14
141 0.16
142 0.18
143 0.23
144 0.27
145 0.36
146 0.45
147 0.53
148 0.57
149 0.65
150 0.7
151 0.76
152 0.73
153 0.71
154 0.7
155 0.67
156 0.63
157 0.53
158 0.46
159 0.35
160 0.34
161 0.28
162 0.2
163 0.14
164 0.13
165 0.14
166 0.16
167 0.17
168 0.22
169 0.24
170 0.3
171 0.31
172 0.35
173 0.34
174 0.33
175 0.36
176 0.31
177 0.31
178 0.26
179 0.22
180 0.2
181 0.2
182 0.21
183 0.21
184 0.24
185 0.21
186 0.26
187 0.31
188 0.33
189 0.36
190 0.42
191 0.42
192 0.38
193 0.38
194 0.35
195 0.34
196 0.31
197 0.27
198 0.19
199 0.15
200 0.14
201 0.15
202 0.2
203 0.21
204 0.22
205 0.22
206 0.25
207 0.31
208 0.31
209 0.33
210 0.28
211 0.24
212 0.24
213 0.25
214 0.25
215 0.19
216 0.22
217 0.25
218 0.34
219 0.37
220 0.39
221 0.42
222 0.42
223 0.47
224 0.53
225 0.56
226 0.53
227 0.54
228 0.57
229 0.54
230 0.56
231 0.61
232 0.6
233 0.56
234 0.54
235 0.59
236 0.61
237 0.68
238 0.74
239 0.68
240 0.71
241 0.71
242 0.72
243 0.72
244 0.72
245 0.7
246 0.62
247 0.61
248 0.53
249 0.49
250 0.45
251 0.36
252 0.27
253 0.2
254 0.19
255 0.15
256 0.13
257 0.11
258 0.1
259 0.12
260 0.11
261 0.1
262 0.13
263 0.17
264 0.19
265 0.19
266 0.23
267 0.29
268 0.28
269 0.29
270 0.27
271 0.27
272 0.28
273 0.34
274 0.33
275 0.29
276 0.29
277 0.31
278 0.35
279 0.35
280 0.42
281 0.41
282 0.45
283 0.46
284 0.53
285 0.6
286 0.61
287 0.63
288 0.59
289 0.64
290 0.67
291 0.71
292 0.74
293 0.71
294 0.7
295 0.69
296 0.75
297 0.73
298 0.71
299 0.68
300 0.64
301 0.64
302 0.62
303 0.61
304 0.58
305 0.51
306 0.47