Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FC20

Protein Details
Accession C5FC20    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
254-283ERELRALKRDEKEKRRRRRHRSNGDSDDSLBasic
288-337LDAEPEKVERKRHRSRSRDRGHRGERPRHYERCRRRHSDRRESRSWPEKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-274KERTKWVEERERELRALKRDEKEKRRRRRHR
294-330KVERKRHRSRSRDRGHRGERPRHYERCRRRHSDRRES
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR039875  LENG1-like  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
Amino Acid Sequences MPLHLLGKKSWNVYNKDNIARVRRDEARAKAEEEEKERKRQEDEAEKRIDILRGKLLTPVSEVADKKEHSSRSREISHGDNRHSKRRRLAGENDTDRDIRLAKEESGRAYQRVKDETSRRHVSDAPIVDKSGHISLFPEEPARRHHSDKNPETEAELAQKNREFEDQYTMRFSNAAGYKQELTSAPWYSSSMTEISAHSTGIPTTNVWGNEDPRRQEREKMRLATNDPLAAMKRGVKQLREVEKERTKWVEERERELRALKRDEKEKRRRRRHRSNGDSDDSLDGFRLDAEPEKVERKRHRSRSRDRGHRGERPRHYERCRRRHSDRRESRSWPEKESVALGQASGKRYNGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.58
3 0.6
4 0.62
5 0.62
6 0.63
7 0.63
8 0.61
9 0.59
10 0.58
11 0.59
12 0.61
13 0.61
14 0.61
15 0.58
16 0.56
17 0.53
18 0.52
19 0.51
20 0.5
21 0.53
22 0.5
23 0.57
24 0.59
25 0.57
26 0.55
27 0.55
28 0.58
29 0.59
30 0.61
31 0.6
32 0.61
33 0.57
34 0.55
35 0.51
36 0.46
37 0.38
38 0.33
39 0.32
40 0.28
41 0.29
42 0.31
43 0.29
44 0.26
45 0.25
46 0.24
47 0.19
48 0.23
49 0.23
50 0.23
51 0.28
52 0.27
53 0.29
54 0.34
55 0.37
56 0.36
57 0.43
58 0.44
59 0.46
60 0.5
61 0.48
62 0.44
63 0.46
64 0.51
65 0.5
66 0.51
67 0.53
68 0.54
69 0.63
70 0.67
71 0.65
72 0.65
73 0.67
74 0.69
75 0.66
76 0.71
77 0.69
78 0.72
79 0.72
80 0.65
81 0.59
82 0.51
83 0.44
84 0.36
85 0.28
86 0.18
87 0.16
88 0.16
89 0.16
90 0.2
91 0.22
92 0.24
93 0.28
94 0.29
95 0.29
96 0.3
97 0.31
98 0.31
99 0.33
100 0.33
101 0.35
102 0.41
103 0.46
104 0.51
105 0.54
106 0.5
107 0.49
108 0.49
109 0.44
110 0.42
111 0.38
112 0.33
113 0.28
114 0.27
115 0.25
116 0.22
117 0.21
118 0.16
119 0.12
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.11
124 0.12
125 0.14
126 0.13
127 0.14
128 0.2
129 0.25
130 0.28
131 0.31
132 0.38
133 0.44
134 0.53
135 0.58
136 0.59
137 0.54
138 0.51
139 0.47
140 0.4
141 0.32
142 0.26
143 0.23
144 0.17
145 0.17
146 0.18
147 0.18
148 0.18
149 0.19
150 0.16
151 0.14
152 0.22
153 0.21
154 0.21
155 0.24
156 0.23
157 0.21
158 0.19
159 0.18
160 0.16
161 0.17
162 0.18
163 0.14
164 0.16
165 0.17
166 0.17
167 0.18
168 0.12
169 0.12
170 0.13
171 0.14
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.09
179 0.09
180 0.1
181 0.09
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.09
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.06
191 0.07
192 0.1
193 0.1
194 0.12
195 0.14
196 0.16
197 0.22
198 0.26
199 0.28
200 0.3
201 0.37
202 0.36
203 0.43
204 0.48
205 0.5
206 0.54
207 0.55
208 0.54
209 0.52
210 0.54
211 0.51
212 0.44
213 0.36
214 0.28
215 0.25
216 0.22
217 0.18
218 0.16
219 0.15
220 0.17
221 0.24
222 0.27
223 0.27
224 0.32
225 0.4
226 0.48
227 0.5
228 0.5
229 0.52
230 0.57
231 0.58
232 0.56
233 0.51
234 0.45
235 0.43
236 0.49
237 0.5
238 0.45
239 0.5
240 0.51
241 0.51
242 0.49
243 0.5
244 0.47
245 0.44
246 0.49
247 0.48
248 0.49
249 0.56
250 0.65
251 0.7
252 0.76
253 0.79
254 0.83
255 0.87
256 0.91
257 0.93
258 0.94
259 0.94
260 0.95
261 0.95
262 0.95
263 0.92
264 0.86
265 0.77
266 0.67
267 0.58
268 0.47
269 0.36
270 0.26
271 0.17
272 0.11
273 0.1
274 0.09
275 0.08
276 0.1
277 0.12
278 0.14
279 0.17
280 0.25
281 0.29
282 0.38
283 0.46
284 0.53
285 0.62
286 0.71
287 0.79
288 0.82
289 0.89
290 0.91
291 0.92
292 0.93
293 0.91
294 0.91
295 0.89
296 0.88
297 0.88
298 0.87
299 0.86
300 0.84
301 0.84
302 0.83
303 0.83
304 0.84
305 0.85
306 0.86
307 0.86
308 0.86
309 0.88
310 0.89
311 0.9
312 0.91
313 0.91
314 0.88
315 0.86
316 0.84
317 0.84
318 0.83
319 0.77
320 0.71
321 0.65
322 0.57
323 0.51
324 0.48
325 0.4
326 0.33
327 0.29
328 0.24
329 0.25
330 0.27
331 0.29
332 0.28