Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FFS6

Protein Details
Accession C5FFS6    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MSRKEDKKEKKEKKSTEGDGTTBasic
317-343ATPTPSPPKPTPKSQKRRQSKAAAAAAHydrophilic
351-384IETPTPAPKKPSPEKKKSDKGKSKDKDRRASVAAHydrophilic
387-412AAPSPQEPPKSEKKTRKKRKSGIDEFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-14DKKEKKEKK
324-349PKPTPKSQKRRQSKAAAAAAAPAPAP
352-407ETPTPAPKKPSPEKKKSDKGKSKDKDRRASVAATVAAPSPQEPPKSEKKTRKKRKS
Subcellular Location(s) nucl 22.5, mito_nucl 13, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSRKEDKKEKKEKKSTEGDGTTTLVVSIDDFTRTRDSSINLLTYRINSTAQDLFLGAQQPELFPPTLTCEQVIVGLAALQSAVSDLSRAYINHANTVLNRGPSNIDIGGLNSLLENGIFQPNAAGAVDGDAGAAAAGTAGAAAEAGTVRAPSPGARSVAGTKRKRVHDPNAPKRALTAYFLYMKHERANIAAELGTNARPKEVADEGTRRWSEMSDAERQKWKQLYAENLAVYKEQMSAYKASLPPGHKVDTTVPATPKPAKAAKTSKTSKTSTKTARQEDDHDAAAEQQLQMAVHEATTEDTSSDSDSSNNDSPAATPTPSPPKPTPKSQKRRQSKAAAAAAAPAPAPVIETPTPAPKKPSPEKKKSDKGKSKDKDRRASVAATVAAPSPQEPPKSEKKTRKKRKSGIDEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.87
3 0.85
4 0.79
5 0.7
6 0.62
7 0.54
8 0.45
9 0.35
10 0.27
11 0.17
12 0.12
13 0.1
14 0.1
15 0.09
16 0.11
17 0.12
18 0.15
19 0.2
20 0.21
21 0.22
22 0.23
23 0.25
24 0.28
25 0.32
26 0.34
27 0.3
28 0.31
29 0.3
30 0.29
31 0.29
32 0.25
33 0.23
34 0.18
35 0.21
36 0.22
37 0.21
38 0.19
39 0.17
40 0.15
41 0.16
42 0.19
43 0.14
44 0.13
45 0.13
46 0.13
47 0.14
48 0.16
49 0.15
50 0.12
51 0.13
52 0.18
53 0.21
54 0.21
55 0.21
56 0.18
57 0.18
58 0.19
59 0.18
60 0.11
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.05
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.03
71 0.04
72 0.04
73 0.05
74 0.07
75 0.08
76 0.12
77 0.18
78 0.18
79 0.21
80 0.22
81 0.23
82 0.21
83 0.27
84 0.25
85 0.22
86 0.21
87 0.19
88 0.2
89 0.19
90 0.22
91 0.16
92 0.14
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.1
97 0.09
98 0.06
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.06
112 0.04
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.04
118 0.04
119 0.03
120 0.03
121 0.02
122 0.02
123 0.02
124 0.02
125 0.02
126 0.02
127 0.02
128 0.02
129 0.02
130 0.02
131 0.02
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.09
140 0.12
141 0.13
142 0.13
143 0.14
144 0.2
145 0.27
146 0.36
147 0.36
148 0.41
149 0.47
150 0.51
151 0.57
152 0.6
153 0.6
154 0.61
155 0.69
156 0.73
157 0.75
158 0.71
159 0.63
160 0.56
161 0.51
162 0.41
163 0.32
164 0.24
165 0.17
166 0.21
167 0.21
168 0.24
169 0.23
170 0.23
171 0.23
172 0.22
173 0.19
174 0.16
175 0.18
176 0.14
177 0.12
178 0.11
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.11
189 0.12
190 0.13
191 0.14
192 0.18
193 0.19
194 0.25
195 0.25
196 0.22
197 0.21
198 0.18
199 0.16
200 0.17
201 0.2
202 0.22
203 0.25
204 0.27
205 0.33
206 0.33
207 0.37
208 0.35
209 0.33
210 0.28
211 0.29
212 0.32
213 0.31
214 0.33
215 0.29
216 0.27
217 0.26
218 0.22
219 0.19
220 0.14
221 0.11
222 0.08
223 0.08
224 0.09
225 0.1
226 0.11
227 0.16
228 0.16
229 0.17
230 0.21
231 0.22
232 0.24
233 0.26
234 0.27
235 0.22
236 0.24
237 0.24
238 0.26
239 0.27
240 0.26
241 0.25
242 0.24
243 0.27
244 0.28
245 0.27
246 0.26
247 0.28
248 0.27
249 0.33
250 0.4
251 0.42
252 0.49
253 0.54
254 0.56
255 0.57
256 0.58
257 0.58
258 0.55
259 0.59
260 0.57
261 0.61
262 0.63
263 0.63
264 0.65
265 0.61
266 0.6
267 0.58
268 0.52
269 0.43
270 0.35
271 0.28
272 0.23
273 0.21
274 0.17
275 0.1
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.09
281 0.08
282 0.06
283 0.07
284 0.06
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.09
292 0.09
293 0.08
294 0.09
295 0.1
296 0.16
297 0.18
298 0.17
299 0.17
300 0.16
301 0.16
302 0.2
303 0.21
304 0.16
305 0.14
306 0.2
307 0.29
308 0.31
309 0.37
310 0.39
311 0.47
312 0.52
313 0.62
314 0.68
315 0.69
316 0.78
317 0.82
318 0.86
319 0.87
320 0.91
321 0.9
322 0.88
323 0.85
324 0.84
325 0.8
326 0.71
327 0.6
328 0.53
329 0.44
330 0.35
331 0.26
332 0.16
333 0.1
334 0.08
335 0.1
336 0.07
337 0.12
338 0.12
339 0.14
340 0.17
341 0.26
342 0.3
343 0.31
344 0.38
345 0.37
346 0.47
347 0.55
348 0.64
349 0.65
350 0.72
351 0.81
352 0.84
353 0.9
354 0.91
355 0.92
356 0.91
357 0.89
358 0.9
359 0.9
360 0.9
361 0.9
362 0.9
363 0.89
364 0.85
365 0.83
366 0.76
367 0.69
368 0.61
369 0.56
370 0.47
371 0.37
372 0.32
373 0.25
374 0.21
375 0.19
376 0.17
377 0.17
378 0.2
379 0.24
380 0.26
381 0.32
382 0.43
383 0.52
384 0.62
385 0.67
386 0.73
387 0.81
388 0.89
389 0.93
390 0.94
391 0.94
392 0.95