Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U6XJW6

Protein Details
Accession A0A4U6XJW6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
353-377LTAGLTAERHRRRKKHEQPAPAEMAHydrophilic
411-442VADTCEKRRKCGRSAHHRRRHEREAQLRARSSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
359-368AERHRRRKKH
418-432RRKCGRSAHHRRRHE
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 9.833, cyto 8, cyto_mito 6.333, mito 3.5, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031348  Helo-like_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF17111  Helo_like_N  
Amino Acid Sequences MDPLTIVTAAASLAGAVLKASFKIKETVDAYDDAPQSVADMAEEVHAVQVALRQVESVVLQDPDAIGRLDLEDVFAVAVNGCHAALLSISEAYEDLFLRSDWRARIKVLWRDGEMTRLLGRLDRKKATLTLLTQTLNLRSTQDIKALLLQNQSTLNAAKQDLQEPASYYHADFRPATSPGSLDNCDEGRPPRGVRDSVLSTTEFDFDHDLINTRTYRRALQRYVAVSRGVDPSPDRETDSLPECAPPLEPLPEEEDGGTGDRSHTGSPSESSTFQSRLSRATTLQPGPEGVSPVASPPATTPPKEPAVRSVLRSEVDDPRVVDQPATTLAVHDAARKKQPSRETPAVRAPRHLTAGLTAERHRRRKKHEQPAPAEMAESSLWRGDGAESAPSGPTTAGVNTTPGTTSAKHVADTCEKRRKCGRSAHHRRRHEREAQLRARSSEASSAAARSVDSVTDALEQLGLPKARAFGREWGRRKQTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.04
3 0.04
4 0.05
5 0.06
6 0.08
7 0.11
8 0.12
9 0.14
10 0.19
11 0.2
12 0.27
13 0.29
14 0.31
15 0.31
16 0.32
17 0.31
18 0.33
19 0.33
20 0.25
21 0.23
22 0.18
23 0.17
24 0.15
25 0.14
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.06
33 0.06
34 0.06
35 0.06
36 0.09
37 0.1
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.12
43 0.12
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.11
52 0.09
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.04
73 0.05
74 0.06
75 0.05
76 0.05
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.08
84 0.08
85 0.1
86 0.12
87 0.16
88 0.18
89 0.24
90 0.26
91 0.27
92 0.34
93 0.4
94 0.47
95 0.5
96 0.5
97 0.45
98 0.47
99 0.46
100 0.42
101 0.35
102 0.28
103 0.22
104 0.19
105 0.17
106 0.17
107 0.24
108 0.28
109 0.34
110 0.36
111 0.36
112 0.38
113 0.4
114 0.41
115 0.38
116 0.33
117 0.3
118 0.31
119 0.29
120 0.29
121 0.28
122 0.25
123 0.21
124 0.19
125 0.17
126 0.15
127 0.19
128 0.18
129 0.2
130 0.19
131 0.18
132 0.23
133 0.24
134 0.25
135 0.23
136 0.22
137 0.21
138 0.21
139 0.2
140 0.16
141 0.14
142 0.12
143 0.12
144 0.12
145 0.14
146 0.15
147 0.17
148 0.17
149 0.18
150 0.18
151 0.18
152 0.19
153 0.17
154 0.17
155 0.15
156 0.19
157 0.18
158 0.2
159 0.19
160 0.19
161 0.2
162 0.21
163 0.21
164 0.15
165 0.15
166 0.15
167 0.18
168 0.17
169 0.15
170 0.16
171 0.15
172 0.15
173 0.17
174 0.16
175 0.15
176 0.17
177 0.17
178 0.19
179 0.23
180 0.23
181 0.22
182 0.26
183 0.26
184 0.24
185 0.26
186 0.21
187 0.19
188 0.19
189 0.19
190 0.14
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.1
197 0.09
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.15
202 0.15
203 0.2
204 0.26
205 0.32
206 0.32
207 0.34
208 0.38
209 0.39
210 0.39
211 0.36
212 0.29
213 0.22
214 0.22
215 0.21
216 0.16
217 0.13
218 0.12
219 0.14
220 0.16
221 0.16
222 0.16
223 0.14
224 0.15
225 0.17
226 0.19
227 0.17
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.12
232 0.11
233 0.1
234 0.08
235 0.09
236 0.08
237 0.09
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.11
242 0.1
243 0.09
244 0.1
245 0.09
246 0.06
247 0.05
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.09
254 0.1
255 0.12
256 0.13
257 0.13
258 0.16
259 0.18
260 0.18
261 0.19
262 0.21
263 0.19
264 0.2
265 0.21
266 0.2
267 0.19
268 0.22
269 0.26
270 0.24
271 0.24
272 0.22
273 0.2
274 0.2
275 0.19
276 0.16
277 0.11
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.11
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.17
286 0.18
287 0.2
288 0.21
289 0.24
290 0.31
291 0.32
292 0.32
293 0.28
294 0.33
295 0.35
296 0.35
297 0.32
298 0.29
299 0.28
300 0.29
301 0.27
302 0.25
303 0.25
304 0.25
305 0.23
306 0.23
307 0.25
308 0.23
309 0.2
310 0.14
311 0.13
312 0.13
313 0.14
314 0.11
315 0.09
316 0.09
317 0.12
318 0.12
319 0.17
320 0.2
321 0.22
322 0.29
323 0.33
324 0.36
325 0.39
326 0.48
327 0.5
328 0.55
329 0.62
330 0.6
331 0.62
332 0.68
333 0.71
334 0.63
335 0.6
336 0.55
337 0.48
338 0.46
339 0.4
340 0.31
341 0.24
342 0.27
343 0.24
344 0.23
345 0.23
346 0.3
347 0.38
348 0.48
349 0.55
350 0.59
351 0.66
352 0.75
353 0.82
354 0.84
355 0.85
356 0.86
357 0.83
358 0.83
359 0.79
360 0.67
361 0.57
362 0.45
363 0.38
364 0.28
365 0.21
366 0.14
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.1
375 0.1
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.11
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.09
384 0.1
385 0.1
386 0.12
387 0.12
388 0.12
389 0.12
390 0.12
391 0.15
392 0.13
393 0.17
394 0.22
395 0.23
396 0.23
397 0.25
398 0.29
399 0.36
400 0.43
401 0.49
402 0.53
403 0.53
404 0.59
405 0.66
406 0.68
407 0.66
408 0.68
409 0.69
410 0.7
411 0.81
412 0.85
413 0.86
414 0.9
415 0.92
416 0.91
417 0.89
418 0.88
419 0.86
420 0.85
421 0.86
422 0.84
423 0.83
424 0.77
425 0.69
426 0.63
427 0.54
428 0.46
429 0.4
430 0.33
431 0.28
432 0.25
433 0.24
434 0.22
435 0.2
436 0.18
437 0.15
438 0.14
439 0.11
440 0.12
441 0.11
442 0.11
443 0.13
444 0.13
445 0.11
446 0.11
447 0.1
448 0.11
449 0.17
450 0.16
451 0.15
452 0.16
453 0.2
454 0.22
455 0.25
456 0.27
457 0.3
458 0.4
459 0.5
460 0.55
461 0.61