Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FFB6

Protein Details
Accession C5FFB6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-47STSVTSASIRPRRRQRPRSEDGFQPPRAKRQRSAKHAETSDHydrophilic
854-873KSLEKSHRERRKPQLYKMAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-39RPRRRQRPRSEDGFQPPRAKRQRS
Subcellular Location(s) mito 12.5, nucl 12, cyto_mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007187  Nucleoporin_Nup133/Nup155_C  
IPR014908  Nucleoporin_Nup133/Nup155_N  
IPR037624  Nup133-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005643  C:nuclear pore  
GO:0017056  F:structural constituent of nuclear pore  
Pfam View protein in Pfam  
PF03177  Nucleoporin_C  
PF08801  Nucleoporin_N  
Amino Acid Sequences MFSSQGSTSVTSASIRPRRRQRPRSEDGFQPPRAKRQRSAKHAETSDDTVLDTAAYEQAHPLAVEADLDGGPSLAGGDTSIELPVRGRKEPDRSNYDSRSTLILDNGFYSATQVSTLPEPLQKSSAPFRCIISPEHGNTLILTHKHAYAWAYSSGSSSISPRDYSIFNIPEPSPRHIDPLPLGAFTSSSSTSDAGMLVVIPSTGKITFWQTISNSAILGLIKQKCNTIHGSIPGMMSGEFVTGLLNAEPSGFIITLSTGRVAHVTIMDAHGKASLNIRFLDLANRAVGGGIFGGLRSVLSGASWRRNIAAAKAGRSTQRGQREVIIATSSGLIEIWDIHWNNGSSLKIRMDTMQAISRALREADLTSENGSLVSIQVLDFAFKDTSKGPSDTEQDLSLWVLFSVTGQTTSYFVVDLAFPENQPEANQAFKVDDVYTEQDSDSTPKIYVPSPGHSAFIVFKTAIALVSLAPYEESIDGNALEFQDLIRFRERDNYVVIGSALDDVIDEHRRACCVLVIQNYGLVHLSNLRLEPEGGNDTQLTTKLRLEQIVFFENTKGNPVDFHHYRELNSESHLEEAILDISDEILRSSSRYISSIAASLEHQMTLRSNALQALAKYIKDRQVELTYLTRWQLLWNAEKMAASKAIWVLYNGLKKKYPDKDLYLGHLIETMGERFKSVTKDKDGPEDPIRHWFIYDTWQMEHIIPWIMNGIRVAYNKPQSVTPDFIDRVWQAGEISLAALESAFSFRRENARLYGIDDASLSLTNPRVAEMPEFWTSLDVNYDETENLLDTELNTCIQWMRQRPQNSDPEAEDTPAKILESNLSRQFEVFSQIYKERRQWCAMSGDRQIQNDGKSLEKSHRERRKPQLYKMAAIGHLEEAVTLAENFNDMTALVELMVEVHDKIDRKHPQKAVDRAIPGPREEALKQWRSRIDSYFVKYGEPWADAFFTRQITAGQPAMLLIMREYKDDVTRFLRKRPGYGKLSWMNEVLGEHNYDNAAKILTELATQHETNLWSKRVELALAKLSTLAARETQAGLQVNLSCFEDETELATIQESVYDNLPHLNEAIDESARLQIANDQFANIVVRSKPALRETLQRGLAKLVTRCPVQGDELADLLTLMDPIPVTEGGDNEVAGHEFSLALRALNLGGSIKGDSGYRENLEKIVWRRCMIRDDWERISATAGKTDEELEAEIRSTALFKTIMDYTNGLGLDSESNHLHRPTDILDSVDVPHKLVARLLPEQRSHLSTELDGENSLLKHYIEKGKLDHWFSWIIEHGVPEVET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.4
3 0.5
4 0.6
5 0.7
6 0.8
7 0.87
8 0.88
9 0.89
10 0.91
11 0.9
12 0.84
13 0.82
14 0.82
15 0.8
16 0.75
17 0.75
18 0.69
19 0.71
20 0.76
21 0.73
22 0.72
23 0.74
24 0.78
25 0.78
26 0.84
27 0.81
28 0.81
29 0.77
30 0.74
31 0.68
32 0.62
33 0.54
34 0.45
35 0.36
36 0.27
37 0.24
38 0.18
39 0.13
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.1
45 0.11
46 0.12
47 0.11
48 0.11
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.07
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.05
65 0.06
66 0.07
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.1
71 0.17
72 0.2
73 0.23
74 0.28
75 0.35
76 0.44
77 0.53
78 0.6
79 0.62
80 0.66
81 0.71
82 0.71
83 0.68
84 0.6
85 0.53
86 0.47
87 0.41
88 0.35
89 0.3
90 0.27
91 0.22
92 0.21
93 0.2
94 0.17
95 0.14
96 0.14
97 0.11
98 0.09
99 0.1
100 0.09
101 0.1
102 0.12
103 0.14
104 0.15
105 0.18
106 0.21
107 0.22
108 0.25
109 0.24
110 0.26
111 0.34
112 0.39
113 0.39
114 0.38
115 0.38
116 0.4
117 0.41
118 0.4
119 0.37
120 0.37
121 0.36
122 0.39
123 0.38
124 0.33
125 0.3
126 0.29
127 0.27
128 0.21
129 0.22
130 0.19
131 0.19
132 0.19
133 0.21
134 0.21
135 0.18
136 0.2
137 0.19
138 0.19
139 0.18
140 0.19
141 0.18
142 0.17
143 0.16
144 0.15
145 0.16
146 0.17
147 0.18
148 0.18
149 0.2
150 0.2
151 0.23
152 0.29
153 0.28
154 0.26
155 0.3
156 0.29
157 0.34
158 0.37
159 0.37
160 0.35
161 0.33
162 0.38
163 0.34
164 0.38
165 0.33
166 0.36
167 0.33
168 0.28
169 0.27
170 0.22
171 0.21
172 0.17
173 0.19
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.14
180 0.13
181 0.09
182 0.08
183 0.07
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.08
193 0.13
194 0.17
195 0.18
196 0.22
197 0.21
198 0.26
199 0.28
200 0.26
201 0.21
202 0.18
203 0.19
204 0.14
205 0.15
206 0.17
207 0.2
208 0.23
209 0.23
210 0.27
211 0.27
212 0.31
213 0.34
214 0.3
215 0.3
216 0.3
217 0.32
218 0.3
219 0.29
220 0.25
221 0.22
222 0.17
223 0.14
224 0.11
225 0.08
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.11
254 0.13
255 0.12
256 0.12
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.17
261 0.18
262 0.18
263 0.19
264 0.19
265 0.18
266 0.19
267 0.23
268 0.19
269 0.18
270 0.16
271 0.16
272 0.14
273 0.13
274 0.13
275 0.08
276 0.06
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.09
288 0.12
289 0.19
290 0.2
291 0.21
292 0.21
293 0.25
294 0.26
295 0.24
296 0.29
297 0.25
298 0.27
299 0.29
300 0.3
301 0.3
302 0.33
303 0.35
304 0.34
305 0.4
306 0.4
307 0.39
308 0.4
309 0.4
310 0.37
311 0.33
312 0.27
313 0.18
314 0.16
315 0.15
316 0.11
317 0.08
318 0.07
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.11
324 0.12
325 0.12
326 0.15
327 0.16
328 0.16
329 0.19
330 0.19
331 0.15
332 0.18
333 0.19
334 0.17
335 0.17
336 0.18
337 0.18
338 0.19
339 0.2
340 0.21
341 0.2
342 0.2
343 0.19
344 0.19
345 0.17
346 0.15
347 0.13
348 0.1
349 0.1
350 0.12
351 0.13
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.08
359 0.06
360 0.06
361 0.05
362 0.04
363 0.06
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.11
371 0.1
372 0.15
373 0.17
374 0.18
375 0.18
376 0.21
377 0.26
378 0.27
379 0.27
380 0.23
381 0.2
382 0.19
383 0.18
384 0.14
385 0.1
386 0.07
387 0.06
388 0.05
389 0.05
390 0.06
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.07
395 0.08
396 0.09
397 0.09
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.09
404 0.09
405 0.08
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.12
411 0.11
412 0.12
413 0.12
414 0.11
415 0.12
416 0.12
417 0.13
418 0.1
419 0.09
420 0.1
421 0.13
422 0.13
423 0.13
424 0.13
425 0.12
426 0.12
427 0.14
428 0.13
429 0.11
430 0.1
431 0.11
432 0.12
433 0.13
434 0.19
435 0.19
436 0.21
437 0.25
438 0.25
439 0.25
440 0.24
441 0.24
442 0.19
443 0.17
444 0.15
445 0.1
446 0.1
447 0.09
448 0.1
449 0.08
450 0.07
451 0.06
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.04
457 0.04
458 0.05
459 0.05
460 0.06
461 0.05
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.07
466 0.06
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.08
471 0.09
472 0.11
473 0.15
474 0.16
475 0.16
476 0.25
477 0.26
478 0.24
479 0.25
480 0.25
481 0.2
482 0.2
483 0.2
484 0.11
485 0.1
486 0.08
487 0.06
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.06
492 0.08
493 0.08
494 0.09
495 0.1
496 0.1
497 0.11
498 0.11
499 0.09
500 0.09
501 0.14
502 0.16
503 0.17
504 0.17
505 0.18
506 0.18
507 0.17
508 0.15
509 0.11
510 0.08
511 0.08
512 0.08
513 0.07
514 0.08
515 0.08
516 0.08
517 0.09
518 0.09
519 0.09
520 0.11
521 0.11
522 0.11
523 0.1
524 0.11
525 0.11
526 0.12
527 0.11
528 0.1
529 0.11
530 0.14
531 0.15
532 0.16
533 0.17
534 0.18
535 0.19
536 0.2
537 0.2
538 0.17
539 0.17
540 0.17
541 0.15
542 0.16
543 0.13
544 0.1
545 0.11
546 0.12
547 0.19
548 0.19
549 0.24
550 0.26
551 0.26
552 0.27
553 0.29
554 0.29
555 0.22
556 0.22
557 0.19
558 0.15
559 0.15
560 0.14
561 0.11
562 0.08
563 0.08
564 0.07
565 0.05
566 0.04
567 0.03
568 0.04
569 0.04
570 0.04
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.05
575 0.06
576 0.07
577 0.08
578 0.09
579 0.1
580 0.11
581 0.11
582 0.12
583 0.11
584 0.1
585 0.1
586 0.11
587 0.09
588 0.08
589 0.08
590 0.07
591 0.08
592 0.08
593 0.09
594 0.08
595 0.08
596 0.08
597 0.09
598 0.1
599 0.09
600 0.13
601 0.13
602 0.13
603 0.14
604 0.16
605 0.21
606 0.2
607 0.21
608 0.2
609 0.21
610 0.22
611 0.23
612 0.22
613 0.17
614 0.18
615 0.17
616 0.14
617 0.12
618 0.11
619 0.13
620 0.14
621 0.16
622 0.15
623 0.16
624 0.16
625 0.16
626 0.16
627 0.13
628 0.12
629 0.09
630 0.09
631 0.09
632 0.09
633 0.09
634 0.08
635 0.1
636 0.12
637 0.17
638 0.18
639 0.19
640 0.2
641 0.22
642 0.29
643 0.33
644 0.36
645 0.35
646 0.38
647 0.42
648 0.41
649 0.43
650 0.38
651 0.32
652 0.26
653 0.22
654 0.17
655 0.12
656 0.12
657 0.09
658 0.07
659 0.07
660 0.07
661 0.06
662 0.09
663 0.13
664 0.16
665 0.2
666 0.24
667 0.3
668 0.3
669 0.37
670 0.36
671 0.36
672 0.38
673 0.37
674 0.33
675 0.35
676 0.36
677 0.29
678 0.28
679 0.23
680 0.19
681 0.2
682 0.22
683 0.16
684 0.15
685 0.16
686 0.17
687 0.16
688 0.16
689 0.11
690 0.1
691 0.08
692 0.08
693 0.08
694 0.07
695 0.08
696 0.07
697 0.08
698 0.09
699 0.1
700 0.12
701 0.16
702 0.2
703 0.2
704 0.21
705 0.21
706 0.23
707 0.25
708 0.26
709 0.22
710 0.22
711 0.22
712 0.22
713 0.23
714 0.19
715 0.17
716 0.14
717 0.14
718 0.09
719 0.08
720 0.08
721 0.05
722 0.05
723 0.04
724 0.04
725 0.03
726 0.03
727 0.03
728 0.03
729 0.04
730 0.05
731 0.06
732 0.07
733 0.09
734 0.15
735 0.17
736 0.18
737 0.19
738 0.22
739 0.21
740 0.23
741 0.25
742 0.19
743 0.17
744 0.15
745 0.13
746 0.1
747 0.1
748 0.08
749 0.06
750 0.07
751 0.08
752 0.08
753 0.08
754 0.08
755 0.09
756 0.11
757 0.11
758 0.14
759 0.14
760 0.15
761 0.14
762 0.14
763 0.13
764 0.12
765 0.12
766 0.08
767 0.08
768 0.08
769 0.08
770 0.07
771 0.07
772 0.07
773 0.06
774 0.06
775 0.05
776 0.05
777 0.05
778 0.06
779 0.07
780 0.07
781 0.06
782 0.06
783 0.07
784 0.09
785 0.14
786 0.18
787 0.23
788 0.29
789 0.35
790 0.4
791 0.47
792 0.53
793 0.51
794 0.48
795 0.44
796 0.42
797 0.38
798 0.34
799 0.27
800 0.19
801 0.16
802 0.14
803 0.12
804 0.08
805 0.07
806 0.11
807 0.13
808 0.18
809 0.22
810 0.24
811 0.24
812 0.23
813 0.24
814 0.2
815 0.23
816 0.18
817 0.14
818 0.16
819 0.21
820 0.24
821 0.26
822 0.33
823 0.34
824 0.37
825 0.4
826 0.38
827 0.36
828 0.41
829 0.41
830 0.4
831 0.38
832 0.41
833 0.4
834 0.4
835 0.39
836 0.33
837 0.31
838 0.29
839 0.26
840 0.21
841 0.2
842 0.21
843 0.25
844 0.31
845 0.37
846 0.44
847 0.53
848 0.58
849 0.66
850 0.75
851 0.8
852 0.79
853 0.8
854 0.8
855 0.73
856 0.68
857 0.63
858 0.55
859 0.45
860 0.38
861 0.31
862 0.2
863 0.17
864 0.14
865 0.1
866 0.07
867 0.06
868 0.05
869 0.05
870 0.04
871 0.04
872 0.04
873 0.04
874 0.04
875 0.04
876 0.04
877 0.04
878 0.05
879 0.05
880 0.04
881 0.04
882 0.04
883 0.04
884 0.05
885 0.04
886 0.04
887 0.05
888 0.07
889 0.08
890 0.1
891 0.19
892 0.28
893 0.32
894 0.41
895 0.45
896 0.52
897 0.6
898 0.67
899 0.65
900 0.62
901 0.6
902 0.55
903 0.57
904 0.5
905 0.41
906 0.35
907 0.28
908 0.26
909 0.23
910 0.27
911 0.29
912 0.36
913 0.36
914 0.4
915 0.44
916 0.45
917 0.48
918 0.44
919 0.42
920 0.41
921 0.44
922 0.43
923 0.39
924 0.35
925 0.32
926 0.32
927 0.28
928 0.22
929 0.18
930 0.14
931 0.16
932 0.15
933 0.17
934 0.15
935 0.14
936 0.14
937 0.14
938 0.13
939 0.14
940 0.16
941 0.15
942 0.13
943 0.12
944 0.11
945 0.11
946 0.11
947 0.09
948 0.06
949 0.11
950 0.12
951 0.12
952 0.14
953 0.15
954 0.19
955 0.2
956 0.23
957 0.24
958 0.33
959 0.35
960 0.41
961 0.48
962 0.45
963 0.52
964 0.55
965 0.57
966 0.53
967 0.54
968 0.56
969 0.54
970 0.56
971 0.5
972 0.44
973 0.35
974 0.3
975 0.28
976 0.21
977 0.15
978 0.14
979 0.12
980 0.11
981 0.12
982 0.11
983 0.11
984 0.1
985 0.09
986 0.07
987 0.07
988 0.08
989 0.08
990 0.08
991 0.08
992 0.11
993 0.15
994 0.15
995 0.15
996 0.16
997 0.18
998 0.21
999 0.25
1000 0.24
1001 0.21
1002 0.21
1003 0.25
1004 0.23
1005 0.23
1006 0.21
1007 0.2
1008 0.25
1009 0.25
1010 0.24
1011 0.21
1012 0.2
1013 0.18
1014 0.17
1015 0.14
1016 0.09
1017 0.1
1018 0.11
1019 0.12
1020 0.12
1021 0.16
1022 0.17
1023 0.16
1024 0.16
1025 0.18
1026 0.17
1027 0.17
1028 0.18
1029 0.13
1030 0.12
1031 0.13
1032 0.12
1033 0.1
1034 0.11
1035 0.12
1036 0.11
1037 0.11
1038 0.11
1039 0.1
1040 0.09
1041 0.11
1042 0.1
1043 0.09
1044 0.11
1045 0.11
1046 0.12
1047 0.14
1048 0.15
1049 0.13
1050 0.12
1051 0.11
1052 0.09
1053 0.1
1054 0.12
1055 0.1
1056 0.1
1057 0.1
1058 0.12
1059 0.12
1060 0.11
1061 0.1
1062 0.14
1063 0.16
1064 0.2
1065 0.19
1066 0.17
1067 0.17
1068 0.19
1069 0.2
1070 0.15
1071 0.16
1072 0.12
1073 0.14
1074 0.16
1075 0.18
1076 0.22
1077 0.23
1078 0.28
1079 0.27
1080 0.36
1081 0.41
1082 0.47
1083 0.5
1084 0.47
1085 0.45
1086 0.43
1087 0.44
1088 0.39
1089 0.36
1090 0.33
1091 0.31
1092 0.31
1093 0.31
1094 0.31
1095 0.29
1096 0.27
1097 0.28
1098 0.25
1099 0.22
1100 0.21
1101 0.21
1102 0.17
1103 0.15
1104 0.12
1105 0.09
1106 0.06
1107 0.05
1108 0.05
1109 0.05
1110 0.05
1111 0.07
1112 0.07
1113 0.08
1114 0.09
1115 0.09
1116 0.11
1117 0.12
1118 0.11
1119 0.1
1120 0.1
1121 0.1
1122 0.09
1123 0.09
1124 0.06
1125 0.06
1126 0.06
1127 0.09
1128 0.08
1129 0.08
1130 0.08
1131 0.08
1132 0.08
1133 0.08
1134 0.09
1135 0.07
1136 0.07
1137 0.08
1138 0.09
1139 0.08
1140 0.09
1141 0.09
1142 0.12
1143 0.14
1144 0.18
1145 0.19
1146 0.22
1147 0.22
1148 0.23
1149 0.24
1150 0.29
1151 0.32
1152 0.37
1153 0.39
1154 0.39
1155 0.42
1156 0.45
1157 0.5
1158 0.45
1159 0.49
1160 0.49
1161 0.51
1162 0.53
1163 0.53
1164 0.5
1165 0.44
1166 0.45
1167 0.39
1168 0.31
1169 0.29
1170 0.26
1171 0.23
1172 0.22
1173 0.23
1174 0.2
1175 0.17
1176 0.17
1177 0.12
1178 0.12
1179 0.12
1180 0.12
1181 0.1
1182 0.1
1183 0.09
1184 0.08
1185 0.1
1186 0.1
1187 0.09
1188 0.13
1189 0.16
1190 0.18
1191 0.19
1192 0.2
1193 0.18
1194 0.21
1195 0.21
1196 0.17
1197 0.14
1198 0.14
1199 0.14
1200 0.14
1201 0.16
1202 0.14
1203 0.16
1204 0.2
1205 0.21
1206 0.21
1207 0.19
1208 0.21
1209 0.21
1210 0.25
1211 0.24
1212 0.23
1213 0.23
1214 0.23
1215 0.25
1216 0.28
1217 0.26
1218 0.2
1219 0.21
1220 0.22
1221 0.21
1222 0.22
1223 0.23
1224 0.23
1225 0.31
1226 0.37
1227 0.41
1228 0.41
1229 0.45
1230 0.47
1231 0.46
1232 0.43
1233 0.38
1234 0.34
1235 0.28
1236 0.31
1237 0.28
1238 0.25
1239 0.22
1240 0.2
1241 0.2
1242 0.18
1243 0.18
1244 0.15
1245 0.13
1246 0.15
1247 0.21
1248 0.3
1249 0.3
1250 0.34
1251 0.37
1252 0.42
1253 0.49
1254 0.51
1255 0.46
1256 0.41
1257 0.41
1258 0.37
1259 0.37
1260 0.33
1261 0.29
1262 0.25
1263 0.24
1264 0.22