Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FER3

Protein Details
Accession C5FER3    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-45APTMSQQPPSKKSKKTQEKPAKFQVAEHydrophilic
66-89EKLPVKLDKKPAKEVKPRKRAADFBasic
101-127VEYKPEVKKEPQPKKKVKSEKPAAGSMHydrophilic
136-155AEKTKKAKAKSKEAEKPAKEBasic
204-226PDSKKAMKAIRRKKKENPEPEEPBasic
315-334GANRRFKKTPWNQIEKRRLEHydrophilic
449-512KLLSAGKKEAKKSKKKAQADTSADPEKPAKDQKQSKNASKTKKLEEKPKKSRPMTKEPTSRSGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-85KPEKLPVKLDKKPAKEVKPRKR
108-154KKEPQPKKKVKSEKPAAGSMSKDKGSTAAEKTKKAKAKSKEAEKPAK
206-219SKKAMKAIRRKKKE
317-360NRRFKKTPWNQIEKRRLEAGKSRDQWSKAISKESSKRAKKAEKM
453-511AGKKEAKKSKKKAQADTSADPEKPAKDQKQSKNASKTKKLEEKPKKSRPMTKEPTSRSG
Subcellular Location(s) mito 15.5, mito_nucl 13.166, cyto_mito 9.833, nucl 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPEKKANKRKAAVTATSAPTMSQQPPSKKSKKTQEKPAKFQVAEVKISDSKLVKENGVVNGAKPEKLPVKLDKKPAKEVKPRKRAADFLSDDEDISENEVEYKPEVKKEPQPKKKVKSEKPAAGSMSKDKGSTAAEKTKKAKAKSKEAEKPAKEPSPSELDADSDVSEDDQTLALIRGFESSGESDVSEDEGFEPGQEVPKIPDSKKAMKAIRRKKKENPEPEEPGTVYVGRIPHGFYEDEMRAYFSQFGDISRLRLSRNRTTGKSKHYAFVEFTSTSVAKIVAAAMQNYLMFGHILKCKYIPNDKVHPEMWKGANRRFKKTPWNQIEKRRLEAGKSRDQWSKAISKESSKRAKKAEKMKALGYEYDIPQLKSVEDVPVAPTVQNQIEEGSMSPIAAIEDKKEETPKKQEPKSKDEVAEENTAATKTSSNGKAKKVKTSDVEPAEAVKLLSAGKKEAKKSKKKAQADTSADPEKPAKDQKQSKNASKTKKLEEKPKKSRPMTKEPTSRSGFRARAQPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.67
3 0.6
4 0.55
5 0.49
6 0.39
7 0.33
8 0.34
9 0.3
10 0.31
11 0.35
12 0.42
13 0.5
14 0.6
15 0.66
16 0.69
17 0.76
18 0.79
19 0.82
20 0.84
21 0.87
22 0.89
23 0.9
24 0.9
25 0.91
26 0.89
27 0.78
28 0.74
29 0.72
30 0.66
31 0.58
32 0.5
33 0.45
34 0.38
35 0.38
36 0.37
37 0.29
38 0.27
39 0.3
40 0.31
41 0.26
42 0.28
43 0.32
44 0.3
45 0.34
46 0.31
47 0.26
48 0.32
49 0.33
50 0.3
51 0.26
52 0.29
53 0.29
54 0.32
55 0.37
56 0.38
57 0.46
58 0.52
59 0.63
60 0.65
61 0.65
62 0.72
63 0.76
64 0.77
65 0.78
66 0.82
67 0.83
68 0.85
69 0.85
70 0.83
71 0.79
72 0.75
73 0.7
74 0.69
75 0.61
76 0.55
77 0.54
78 0.46
79 0.4
80 0.34
81 0.3
82 0.19
83 0.18
84 0.14
85 0.09
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.17
91 0.17
92 0.22
93 0.26
94 0.29
95 0.38
96 0.48
97 0.58
98 0.63
99 0.72
100 0.78
101 0.83
102 0.88
103 0.9
104 0.89
105 0.89
106 0.88
107 0.86
108 0.8
109 0.76
110 0.68
111 0.6
112 0.53
113 0.47
114 0.42
115 0.34
116 0.29
117 0.25
118 0.24
119 0.24
120 0.26
121 0.26
122 0.31
123 0.34
124 0.4
125 0.45
126 0.5
127 0.54
128 0.56
129 0.59
130 0.57
131 0.64
132 0.68
133 0.74
134 0.75
135 0.78
136 0.82
137 0.75
138 0.72
139 0.68
140 0.64
141 0.55
142 0.47
143 0.42
144 0.39
145 0.37
146 0.33
147 0.26
148 0.22
149 0.21
150 0.21
151 0.17
152 0.1
153 0.09
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.07
183 0.06
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.17
189 0.21
190 0.2
191 0.27
192 0.31
193 0.38
194 0.43
195 0.49
196 0.49
197 0.53
198 0.63
199 0.66
200 0.71
201 0.73
202 0.74
203 0.76
204 0.81
205 0.83
206 0.84
207 0.8
208 0.78
209 0.76
210 0.71
211 0.63
212 0.52
213 0.43
214 0.33
215 0.26
216 0.17
217 0.12
218 0.11
219 0.09
220 0.1
221 0.09
222 0.08
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.13
227 0.12
228 0.13
229 0.13
230 0.14
231 0.12
232 0.13
233 0.14
234 0.09
235 0.1
236 0.09
237 0.1
238 0.12
239 0.12
240 0.13
241 0.14
242 0.15
243 0.15
244 0.19
245 0.25
246 0.27
247 0.35
248 0.38
249 0.4
250 0.47
251 0.51
252 0.54
253 0.55
254 0.5
255 0.46
256 0.43
257 0.41
258 0.35
259 0.31
260 0.27
261 0.2
262 0.19
263 0.17
264 0.15
265 0.13
266 0.12
267 0.1
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.08
283 0.11
284 0.12
285 0.12
286 0.13
287 0.15
288 0.2
289 0.27
290 0.3
291 0.33
292 0.4
293 0.43
294 0.46
295 0.44
296 0.43
297 0.38
298 0.37
299 0.34
300 0.33
301 0.34
302 0.37
303 0.46
304 0.47
305 0.52
306 0.51
307 0.52
308 0.57
309 0.62
310 0.66
311 0.66
312 0.73
313 0.73
314 0.79
315 0.84
316 0.76
317 0.7
318 0.66
319 0.57
320 0.5
321 0.51
322 0.48
323 0.47
324 0.48
325 0.49
326 0.48
327 0.48
328 0.46
329 0.43
330 0.42
331 0.35
332 0.37
333 0.35
334 0.37
335 0.43
336 0.5
337 0.56
338 0.55
339 0.59
340 0.61
341 0.68
342 0.68
343 0.72
344 0.73
345 0.72
346 0.7
347 0.67
348 0.64
349 0.58
350 0.5
351 0.43
352 0.37
353 0.28
354 0.31
355 0.29
356 0.23
357 0.23
358 0.22
359 0.19
360 0.16
361 0.16
362 0.12
363 0.11
364 0.11
365 0.12
366 0.13
367 0.14
368 0.12
369 0.12
370 0.13
371 0.14
372 0.14
373 0.12
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.1
379 0.09
380 0.08
381 0.08
382 0.07
383 0.08
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.12
388 0.14
389 0.16
390 0.23
391 0.27
392 0.31
393 0.41
394 0.49
395 0.55
396 0.62
397 0.68
398 0.69
399 0.73
400 0.74
401 0.72
402 0.66
403 0.6
404 0.58
405 0.54
406 0.5
407 0.42
408 0.35
409 0.29
410 0.25
411 0.21
412 0.16
413 0.13
414 0.1
415 0.18
416 0.25
417 0.32
418 0.38
419 0.46
420 0.55
421 0.57
422 0.66
423 0.63
424 0.62
425 0.59
426 0.6
427 0.61
428 0.56
429 0.54
430 0.45
431 0.42
432 0.36
433 0.31
434 0.24
435 0.15
436 0.12
437 0.11
438 0.14
439 0.13
440 0.17
441 0.24
442 0.3
443 0.38
444 0.47
445 0.56
446 0.64
447 0.73
448 0.79
449 0.82
450 0.85
451 0.88
452 0.87
453 0.87
454 0.85
455 0.8
456 0.77
457 0.72
458 0.63
459 0.55
460 0.48
461 0.39
462 0.38
463 0.42
464 0.42
465 0.47
466 0.57
467 0.65
468 0.72
469 0.79
470 0.83
471 0.84
472 0.85
473 0.85
474 0.85
475 0.83
476 0.83
477 0.84
478 0.83
479 0.83
480 0.86
481 0.87
482 0.88
483 0.9
484 0.91
485 0.89
486 0.91
487 0.89
488 0.89
489 0.87
490 0.87
491 0.86
492 0.83
493 0.83
494 0.79
495 0.73
496 0.68
497 0.68
498 0.63
499 0.58