Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q74ZA0

Protein Details
Accession Q74ZA0    Localization Confidence Low Confidence Score 7.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-126GVAPRAKMNQQRSRRFRSARDAKLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 8.5, cyto_nucl 8, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0090730  C:Las1 complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0110103  C:RNA polymerase II termination complex  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000448  P:cleavage in ITS2 between 5.8S rRNA and LSU-rRNA of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0034244  P:negative regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0071028  P:nuclear mRNA surveillance  
GO:0071035  P:nuclear polyadenylation-dependent rRNA catabolic process  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
GO:1904595  P:positive regulation of termination of RNA polymerase II transcription  
GO:0043144  P:sno(s)RNA processing  
GO:0030847  P:termination of RNA polymerase II transcription, exosome-dependent  
GO:0030846  P:termination of RNA polymerase II transcription, poly(A)-coupled  
KEGG ago:AGOS_AGR303W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPSFFRWLSRKYPKIISPVIEDTPQVVDGVKLPIDYSAANPNGELDNLYLDMNGIVHPCSHPENKPAPETEDEMLLAVFEYTNRVLNMARPRKVLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSARDAKLANEEKARVLAEREAYGEMIDDAVKAKKSWDTNAITPGTPFMDKLAAALRYWTSFKLATDPGWKNLQVIISDATVPGEGEHKIMNFIRSQRADVQYNPNTTHCIYGLDADLIFLGLATHEPHFKILREDVFAQDNRRRPRQHDMMDMSAEEKQALIEQDAEKPFLWLHVSVLREYLSAELLVPRLPFHFDLERAIDDWVFMCFFCGNDFLPHLPSLDVRENSIDILVDIWKAVLPSLKTYLTCDGKLNLKGVEKVLAQLGNRESDIFKKKYEQELRKKEAQERRKMLKNNPNVTKGKVDRNFTVPLESMPVFDVNGNAAAGSLNLTNKDFANMRKEITLANEGNTKALDALKRRSDENRTQRTSDTRDFSQEELESAIEVSKGDNLSAAASLRERILAKRKAAEDPEGAPEPKNPHKAPSASETEAATPASSETASQVDIPISTGMLTPGFLDTDTGVRLFEPGYHDRYYQAKFHVPTGSIDALRKKVVRSYVEGISWVLLYYYQGCPSWTWYYPYHYAPFASDFTGISDLSVTFDLGEPFLPYEQLMSVLPAASSHNLPDVFRSLMSDPESEIYDFYPEEFPIDMNGEKMAWKALVLLPFIDETRLLAAVRQKYPLLSEAERARNVRRDEVLLISNKNTHYERFLARLYTDPAPQPVNFRHFKSGLAGTALSDAEGFRPNTKMLCPLAAGSLPDISTNLFLKTAYRMPQLPAPSKSILLNGFIPPEAQLSPADRDAIMYKYPQRWNPHTMKHNLVPVGPAAVTQYQPRIGGYRAFLFHQQLMQDRPYPPAHMHSHSSGGPPLAQGPRVTQSRYQPRRFH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.64
3 0.68
4 0.69
5 0.62
6 0.58
7 0.57
8 0.54
9 0.46
10 0.4
11 0.34
12 0.29
13 0.26
14 0.19
15 0.14
16 0.12
17 0.12
18 0.15
19 0.14
20 0.12
21 0.12
22 0.13
23 0.14
24 0.14
25 0.14
26 0.19
27 0.21
28 0.21
29 0.21
30 0.22
31 0.22
32 0.21
33 0.2
34 0.12
35 0.12
36 0.13
37 0.13
38 0.11
39 0.1
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.1
47 0.13
48 0.18
49 0.24
50 0.26
51 0.34
52 0.42
53 0.46
54 0.5
55 0.5
56 0.49
57 0.47
58 0.47
59 0.4
60 0.33
61 0.28
62 0.23
63 0.2
64 0.15
65 0.12
66 0.08
67 0.07
68 0.05
69 0.08
70 0.09
71 0.12
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.2
76 0.31
77 0.37
78 0.4
79 0.4
80 0.42
81 0.44
82 0.45
83 0.41
84 0.33
85 0.29
86 0.26
87 0.24
88 0.24
89 0.21
90 0.2
91 0.18
92 0.15
93 0.1
94 0.13
95 0.19
96 0.26
97 0.36
98 0.45
99 0.55
100 0.66
101 0.74
102 0.8
103 0.84
104 0.82
105 0.79
106 0.8
107 0.81
108 0.78
109 0.78
110 0.72
111 0.64
112 0.68
113 0.65
114 0.57
115 0.52
116 0.45
117 0.37
118 0.36
119 0.35
120 0.25
121 0.23
122 0.23
123 0.21
124 0.2
125 0.21
126 0.19
127 0.19
128 0.17
129 0.15
130 0.11
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.08
135 0.11
136 0.12
137 0.11
138 0.13
139 0.18
140 0.21
141 0.26
142 0.32
143 0.35
144 0.38
145 0.44
146 0.44
147 0.39
148 0.36
149 0.33
150 0.27
151 0.22
152 0.18
153 0.13
154 0.13
155 0.12
156 0.13
157 0.16
158 0.15
159 0.15
160 0.17
161 0.16
162 0.17
163 0.19
164 0.18
165 0.16
166 0.17
167 0.17
168 0.21
169 0.21
170 0.22
171 0.3
172 0.32
173 0.33
174 0.36
175 0.36
176 0.31
177 0.31
178 0.3
179 0.21
180 0.2
181 0.18
182 0.15
183 0.15
184 0.14
185 0.12
186 0.1
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.13
195 0.14
196 0.16
197 0.17
198 0.21
199 0.28
200 0.28
201 0.31
202 0.34
203 0.38
204 0.4
205 0.4
206 0.47
207 0.44
208 0.46
209 0.45
210 0.39
211 0.37
212 0.35
213 0.32
214 0.23
215 0.19
216 0.16
217 0.15
218 0.15
219 0.13
220 0.12
221 0.1
222 0.1
223 0.08
224 0.07
225 0.05
226 0.04
227 0.03
228 0.04
229 0.05
230 0.06
231 0.08
232 0.09
233 0.12
234 0.14
235 0.15
236 0.18
237 0.21
238 0.22
239 0.24
240 0.25
241 0.25
242 0.29
243 0.3
244 0.32
245 0.34
246 0.39
247 0.42
248 0.49
249 0.5
250 0.5
251 0.58
252 0.62
253 0.61
254 0.63
255 0.61
256 0.56
257 0.54
258 0.49
259 0.4
260 0.32
261 0.26
262 0.16
263 0.11
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.1
269 0.11
270 0.17
271 0.18
272 0.19
273 0.18
274 0.17
275 0.17
276 0.15
277 0.15
278 0.1
279 0.11
280 0.14
281 0.15
282 0.14
283 0.15
284 0.14
285 0.13
286 0.13
287 0.11
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.11
298 0.11
299 0.14
300 0.16
301 0.16
302 0.18
303 0.2
304 0.2
305 0.18
306 0.18
307 0.14
308 0.11
309 0.11
310 0.09
311 0.07
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.08
318 0.08
319 0.09
320 0.11
321 0.11
322 0.12
323 0.12
324 0.12
325 0.11
326 0.11
327 0.14
328 0.19
329 0.18
330 0.17
331 0.18
332 0.18
333 0.17
334 0.17
335 0.12
336 0.06
337 0.07
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.07
346 0.07
347 0.09
348 0.12
349 0.13
350 0.13
351 0.16
352 0.22
353 0.22
354 0.23
355 0.22
356 0.21
357 0.25
358 0.26
359 0.26
360 0.22
361 0.21
362 0.21
363 0.2
364 0.21
365 0.16
366 0.15
367 0.15
368 0.15
369 0.13
370 0.15
371 0.16
372 0.14
373 0.14
374 0.14
375 0.13
376 0.17
377 0.24
378 0.22
379 0.22
380 0.27
381 0.31
382 0.4
383 0.5
384 0.53
385 0.57
386 0.66
387 0.7
388 0.72
389 0.71
390 0.69
391 0.69
392 0.68
393 0.67
394 0.65
395 0.66
396 0.67
397 0.69
398 0.7
399 0.69
400 0.7
401 0.69
402 0.67
403 0.67
404 0.61
405 0.58
406 0.56
407 0.5
408 0.5
409 0.46
410 0.44
411 0.39
412 0.41
413 0.42
414 0.34
415 0.33
416 0.24
417 0.19
418 0.19
419 0.17
420 0.14
421 0.11
422 0.11
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.06
427 0.06
428 0.05
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.05
435 0.05
436 0.06
437 0.06
438 0.07
439 0.07
440 0.09
441 0.1
442 0.11
443 0.16
444 0.16
445 0.17
446 0.16
447 0.17
448 0.16
449 0.17
450 0.2
451 0.15
452 0.15
453 0.18
454 0.17
455 0.17
456 0.16
457 0.14
458 0.09
459 0.1
460 0.12
461 0.12
462 0.17
463 0.2
464 0.22
465 0.23
466 0.27
467 0.32
468 0.39
469 0.47
470 0.52
471 0.51
472 0.51
473 0.52
474 0.52
475 0.52
476 0.47
477 0.41
478 0.32
479 0.33
480 0.33
481 0.31
482 0.29
483 0.22
484 0.17
485 0.14
486 0.13
487 0.09
488 0.07
489 0.07
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.05
502 0.05
503 0.06
504 0.06
505 0.08
506 0.08
507 0.11
508 0.2
509 0.24
510 0.26
511 0.3
512 0.32
513 0.34
514 0.35
515 0.35
516 0.29
517 0.26
518 0.28
519 0.25
520 0.24
521 0.2
522 0.21
523 0.23
524 0.27
525 0.32
526 0.29
527 0.3
528 0.34
529 0.35
530 0.35
531 0.35
532 0.35
533 0.29
534 0.3
535 0.27
536 0.23
537 0.22
538 0.2
539 0.14
540 0.08
541 0.07
542 0.06
543 0.06
544 0.05
545 0.05
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.07
550 0.06
551 0.06
552 0.07
553 0.06
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.06
567 0.06
568 0.06
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.07
574 0.12
575 0.14
576 0.18
577 0.2
578 0.2
579 0.22
580 0.26
581 0.27
582 0.25
583 0.25
584 0.27
585 0.27
586 0.29
587 0.3
588 0.26
589 0.25
590 0.27
591 0.26
592 0.21
593 0.23
594 0.23
595 0.21
596 0.23
597 0.24
598 0.2
599 0.21
600 0.26
601 0.26
602 0.29
603 0.31
604 0.31
605 0.3
606 0.3
607 0.26
608 0.2
609 0.18
610 0.12
611 0.08
612 0.05
613 0.05
614 0.07
615 0.08
616 0.09
617 0.1
618 0.1
619 0.11
620 0.16
621 0.2
622 0.18
623 0.21
624 0.22
625 0.27
626 0.3
627 0.33
628 0.3
629 0.27
630 0.26
631 0.23
632 0.24
633 0.2
634 0.17
635 0.14
636 0.12
637 0.13
638 0.14
639 0.12
640 0.09
641 0.09
642 0.08
643 0.09
644 0.09
645 0.07
646 0.06
647 0.07
648 0.07
649 0.07
650 0.07
651 0.06
652 0.07
653 0.07
654 0.07
655 0.06
656 0.06
657 0.06
658 0.07
659 0.07
660 0.07
661 0.07
662 0.07
663 0.07
664 0.07
665 0.08
666 0.08
667 0.09
668 0.08
669 0.12
670 0.12
671 0.12
672 0.14
673 0.15
674 0.15
675 0.14
676 0.17
677 0.14
678 0.17
679 0.19
680 0.17
681 0.15
682 0.16
683 0.17
684 0.15
685 0.14
686 0.11
687 0.1
688 0.1
689 0.11
690 0.11
691 0.1
692 0.11
693 0.11
694 0.1
695 0.1
696 0.13
697 0.11
698 0.1
699 0.11
700 0.1
701 0.1
702 0.1
703 0.1
704 0.07
705 0.07
706 0.09
707 0.11
708 0.13
709 0.13
710 0.13
711 0.13
712 0.14
713 0.14
714 0.12
715 0.1
716 0.07
717 0.08
718 0.09
719 0.08
720 0.1
721 0.16
722 0.22
723 0.24
724 0.26
725 0.25
726 0.24
727 0.26
728 0.28
729 0.27
730 0.22
731 0.26
732 0.31
733 0.37
734 0.4
735 0.4
736 0.42
737 0.44
738 0.45
739 0.45
740 0.39
741 0.37
742 0.35
743 0.36
744 0.37
745 0.33
746 0.32
747 0.29
748 0.3
749 0.27
750 0.3
751 0.28
752 0.24
753 0.24
754 0.27
755 0.28
756 0.28
757 0.3
758 0.27
759 0.27
760 0.29
761 0.29
762 0.27
763 0.28
764 0.25
765 0.26
766 0.28
767 0.27
768 0.29
769 0.31
770 0.36
771 0.37
772 0.39
773 0.43
774 0.4
775 0.41
776 0.4
777 0.37
778 0.31
779 0.29
780 0.26
781 0.19
782 0.2
783 0.19
784 0.14
785 0.11
786 0.09
787 0.09
788 0.13
789 0.14
790 0.14
791 0.16
792 0.17
793 0.19
794 0.2
795 0.24
796 0.21
797 0.22
798 0.21
799 0.2
800 0.21
801 0.2
802 0.2
803 0.15
804 0.15
805 0.13
806 0.12
807 0.12
808 0.1
809 0.12
810 0.12
811 0.12
812 0.11
813 0.11
814 0.12
815 0.16
816 0.21
817 0.23
818 0.26
819 0.27
820 0.3
821 0.35
822 0.41
823 0.44
824 0.42
825 0.42
826 0.4
827 0.4
828 0.38
829 0.36
830 0.3
831 0.26
832 0.26
833 0.22
834 0.22
835 0.2
836 0.2
837 0.16
838 0.17
839 0.14
840 0.13
841 0.13
842 0.15
843 0.19
844 0.19
845 0.2
846 0.18
847 0.19
848 0.2
849 0.21
850 0.2
851 0.21
852 0.27
853 0.34
854 0.41
855 0.46
856 0.53
857 0.56
858 0.64
859 0.68
860 0.71
861 0.71
862 0.71
863 0.72
864 0.68
865 0.69
866 0.61
867 0.53
868 0.45
869 0.37
870 0.33
871 0.24
872 0.19
873 0.15
874 0.16
875 0.17
876 0.18
877 0.21
878 0.21
879 0.22
880 0.23
881 0.23
882 0.23
883 0.26
884 0.27
885 0.29
886 0.28
887 0.3
888 0.33
889 0.34
890 0.34
891 0.32
892 0.31
893 0.3
894 0.33
895 0.35
896 0.36
897 0.34
898 0.37
899 0.36
900 0.37
901 0.35
902 0.38
903 0.4
904 0.39
905 0.43
906 0.41
907 0.43
908 0.41
909 0.41
910 0.36
911 0.31
912 0.27
913 0.23
914 0.26
915 0.26
916 0.26
917 0.25
918 0.26
919 0.33
920 0.36
921 0.39
922 0.39
923 0.46
924 0.54
925 0.64