Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U6XDI3

Protein Details
Accession A0A4U6XDI3    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
387-409KASVVPAKRGRGRPRRSPLPATEHydrophilic
452-472NIDEEPPKKRGRGRPRKNPVSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
382-422REKHIKASVVPAKRGRGRPRRSPLPATEDKPVGRTGRKPKR
457-470PPKKRGRGRPRKNP
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.166, mito_nucl 11.666, cyto_mito 4.166, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
CDD cd00024  CD_CSD  
Amino Acid Sequences RVKTLAAIGDARPDASRSHSPPSQLPPPHNPESPSQRKVLSDTAGEDLNVADRSTPADTISAAPTAVMEPMIDSAEPSGSKAPAIATPEVEAPSSTQEPSVTRSGSGVLSSVRKTINSAVQNFTAQRTGTTTVTTSIQQTSIIRKLSKEPESDKTPSPDDKEVDNNIDAANGTDPNDSLVQVGNQLETEVAEEEIRATSPVKEAAQVASPAANDNEINVATANAADDADTVKAATPIQDAIPDPAGDEDGDEEVDDPKRGVFVLDKILGHRRDPKDKTLFQMQVSWKNDEPTWEPEQNIQEDAEEALFEYWDSVEGGRLGAMADKNLWHVLRVEKHKKKPSGAIHLLICWVGTPDRSWEPESQVKVYAHQHLESYWRAQGGREKHIKASVVPAKRGRGRPRRSPLPATEDKPVGRTGRKPKRDAAEAGLVEEAAVVVEEVVAPKDKAEKAQNIDEEPPKKRGRGRPRKNPVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.23
3 0.31
4 0.29
5 0.37
6 0.38
7 0.42
8 0.47
9 0.53
10 0.56
11 0.54
12 0.57
13 0.59
14 0.64
15 0.66
16 0.64
17 0.59
18 0.57
19 0.62
20 0.65
21 0.59
22 0.54
23 0.51
24 0.49
25 0.51
26 0.48
27 0.41
28 0.34
29 0.32
30 0.31
31 0.29
32 0.26
33 0.22
34 0.16
35 0.16
36 0.14
37 0.11
38 0.09
39 0.09
40 0.12
41 0.13
42 0.14
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.14
47 0.16
48 0.14
49 0.12
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.08
55 0.06
56 0.06
57 0.07
58 0.08
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.12
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.13
70 0.13
71 0.18
72 0.17
73 0.16
74 0.17
75 0.19
76 0.19
77 0.18
78 0.15
79 0.12
80 0.15
81 0.16
82 0.15
83 0.14
84 0.15
85 0.16
86 0.2
87 0.23
88 0.19
89 0.17
90 0.18
91 0.19
92 0.17
93 0.16
94 0.13
95 0.12
96 0.15
97 0.15
98 0.18
99 0.17
100 0.16
101 0.18
102 0.21
103 0.27
104 0.29
105 0.32
106 0.32
107 0.33
108 0.35
109 0.34
110 0.31
111 0.26
112 0.2
113 0.17
114 0.17
115 0.19
116 0.17
117 0.17
118 0.16
119 0.15
120 0.17
121 0.17
122 0.16
123 0.14
124 0.13
125 0.14
126 0.15
127 0.19
128 0.22
129 0.25
130 0.24
131 0.24
132 0.31
133 0.37
134 0.4
135 0.4
136 0.4
137 0.43
138 0.48
139 0.51
140 0.47
141 0.43
142 0.42
143 0.4
144 0.4
145 0.38
146 0.33
147 0.32
148 0.34
149 0.33
150 0.31
151 0.28
152 0.24
153 0.19
154 0.18
155 0.15
156 0.11
157 0.09
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.09
169 0.09
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.12
193 0.11
194 0.11
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.03
213 0.03
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.08
250 0.12
251 0.14
252 0.14
253 0.16
254 0.22
255 0.23
256 0.24
257 0.31
258 0.31
259 0.39
260 0.42
261 0.48
262 0.5
263 0.51
264 0.53
265 0.53
266 0.51
267 0.42
268 0.47
269 0.42
270 0.43
271 0.43
272 0.42
273 0.35
274 0.33
275 0.33
276 0.28
277 0.29
278 0.25
279 0.29
280 0.27
281 0.27
282 0.29
283 0.31
284 0.29
285 0.27
286 0.21
287 0.15
288 0.14
289 0.14
290 0.09
291 0.07
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.08
312 0.09
313 0.12
314 0.12
315 0.1
316 0.12
317 0.17
318 0.24
319 0.34
320 0.44
321 0.51
322 0.6
323 0.69
324 0.73
325 0.72
326 0.73
327 0.72
328 0.72
329 0.68
330 0.63
331 0.55
332 0.49
333 0.46
334 0.36
335 0.27
336 0.17
337 0.12
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.12
342 0.15
343 0.18
344 0.21
345 0.23
346 0.28
347 0.34
348 0.36
349 0.33
350 0.36
351 0.33
352 0.35
353 0.36
354 0.37
355 0.34
356 0.31
357 0.3
358 0.25
359 0.3
360 0.27
361 0.26
362 0.21
363 0.2
364 0.2
365 0.22
366 0.28
367 0.3
368 0.37
369 0.42
370 0.43
371 0.44
372 0.48
373 0.47
374 0.41
375 0.45
376 0.44
377 0.41
378 0.46
379 0.47
380 0.51
381 0.57
382 0.65
383 0.66
384 0.69
385 0.71
386 0.76
387 0.81
388 0.83
389 0.83
390 0.82
391 0.78
392 0.77
393 0.76
394 0.69
395 0.65
396 0.59
397 0.52
398 0.46
399 0.44
400 0.4
401 0.38
402 0.43
403 0.49
404 0.55
405 0.63
406 0.66
407 0.69
408 0.72
409 0.74
410 0.69
411 0.64
412 0.62
413 0.54
414 0.5
415 0.42
416 0.33
417 0.26
418 0.21
419 0.15
420 0.05
421 0.05
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.04
426 0.04
427 0.06
428 0.08
429 0.08
430 0.1
431 0.17
432 0.18
433 0.25
434 0.32
435 0.39
436 0.43
437 0.51
438 0.55
439 0.52
440 0.57
441 0.59
442 0.58
443 0.55
444 0.57
445 0.54
446 0.56
447 0.61
448 0.65
449 0.68
450 0.73
451 0.79
452 0.82