Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U6XPF1

Protein Details
Accession A0A4U6XPF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-97APSSNSTSSKKRRTDKDVQKYYAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
413-419KGRKKLK
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 10, cyto_mito 9, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009027  Ribosomal_L9/RNase_H1_N  
IPR011320  RNase_H1_N  
IPR037056  RNase_H1_N_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR002156  RNaseH_domain  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004523  F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01693  Cauli_VI  
PF00075  RNase_H  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50879  RNASE_H_1  
CDD cd09280  RNase_HI_eukaryote_like  
Amino Acid Sequences MRLQAQASWTKATDLFNPRARATTTTRRFLLPPILIRRRAAAFWQGRPDDRDSTLQLLSHILNDLYDMPANKRGAPSSNSTSSKKRRTDKDVQKYYAVRTGARPGIYLTWAECQKQTAGFRGAQYKSFLTREDAQAFVEGKKIPSEEGEEKPLRFYAVARGIFTGIFMDWGTASLAIAGTKGPKYKKFDTYEDALDFIREWGDEQTIAIAEKEARRNGMTVPSSNKTFVKAEKSEDTSDSDDDSEQSDDILSVEPETKIYTQVYTDGSSLGNGTAGSVAGVGVYFGPNDPRNVSERLEGELQTNQRAELTAILRAFQLSPLTQPIEIVTDSKYSIKCVTEWYENWEKNKWRTSTNNEVKNKDLIQAVRDEIAKRDAAGTKTNFVWVKGHNNHPGNVAADELAVAGASMGLPAKGRKKLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.42
3 0.46
4 0.5
5 0.48
6 0.49
7 0.48
8 0.45
9 0.46
10 0.49
11 0.49
12 0.52
13 0.53
14 0.52
15 0.51
16 0.5
17 0.51
18 0.46
19 0.47
20 0.5
21 0.57
22 0.57
23 0.57
24 0.56
25 0.5
26 0.45
27 0.41
28 0.4
29 0.39
30 0.41
31 0.5
32 0.49
33 0.49
34 0.52
35 0.52
36 0.46
37 0.43
38 0.42
39 0.36
40 0.36
41 0.34
42 0.3
43 0.26
44 0.24
45 0.22
46 0.18
47 0.16
48 0.12
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.12
54 0.12
55 0.14
56 0.21
57 0.22
58 0.23
59 0.24
60 0.25
61 0.28
62 0.3
63 0.34
64 0.34
65 0.41
66 0.44
67 0.47
68 0.54
69 0.59
70 0.65
71 0.67
72 0.69
73 0.7
74 0.74
75 0.81
76 0.83
77 0.84
78 0.85
79 0.79
80 0.77
81 0.71
82 0.65
83 0.59
84 0.5
85 0.4
86 0.33
87 0.36
88 0.33
89 0.31
90 0.28
91 0.23
92 0.24
93 0.23
94 0.21
95 0.15
96 0.18
97 0.19
98 0.2
99 0.19
100 0.19
101 0.19
102 0.23
103 0.24
104 0.23
105 0.25
106 0.26
107 0.28
108 0.34
109 0.34
110 0.31
111 0.32
112 0.29
113 0.29
114 0.28
115 0.26
116 0.23
117 0.26
118 0.29
119 0.28
120 0.27
121 0.24
122 0.25
123 0.25
124 0.21
125 0.2
126 0.16
127 0.14
128 0.15
129 0.15
130 0.13
131 0.13
132 0.18
133 0.2
134 0.21
135 0.28
136 0.29
137 0.29
138 0.29
139 0.28
140 0.23
141 0.18
142 0.17
143 0.17
144 0.22
145 0.23
146 0.23
147 0.23
148 0.23
149 0.22
150 0.21
151 0.15
152 0.07
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.07
168 0.11
169 0.14
170 0.2
171 0.27
172 0.32
173 0.41
174 0.44
175 0.47
176 0.47
177 0.48
178 0.45
179 0.39
180 0.34
181 0.26
182 0.21
183 0.16
184 0.12
185 0.09
186 0.05
187 0.06
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.09
199 0.12
200 0.13
201 0.14
202 0.14
203 0.15
204 0.15
205 0.2
206 0.18
207 0.18
208 0.22
209 0.23
210 0.24
211 0.25
212 0.24
213 0.2
214 0.21
215 0.21
216 0.24
217 0.23
218 0.26
219 0.28
220 0.32
221 0.31
222 0.3
223 0.3
224 0.25
225 0.24
226 0.2
227 0.17
228 0.13
229 0.12
230 0.12
231 0.1
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.11
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.12
254 0.11
255 0.11
256 0.1
257 0.08
258 0.07
259 0.05
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.04
273 0.08
274 0.09
275 0.11
276 0.12
277 0.14
278 0.18
279 0.2
280 0.22
281 0.22
282 0.22
283 0.24
284 0.25
285 0.23
286 0.21
287 0.23
288 0.23
289 0.22
290 0.21
291 0.18
292 0.16
293 0.16
294 0.15
295 0.15
296 0.15
297 0.15
298 0.15
299 0.16
300 0.15
301 0.16
302 0.15
303 0.12
304 0.13
305 0.09
306 0.11
307 0.14
308 0.15
309 0.14
310 0.14
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.14
315 0.12
316 0.12
317 0.13
318 0.17
319 0.17
320 0.17
321 0.2
322 0.2
323 0.19
324 0.23
325 0.28
326 0.3
327 0.31
328 0.36
329 0.42
330 0.44
331 0.47
332 0.49
333 0.51
334 0.52
335 0.59
336 0.54
337 0.52
338 0.57
339 0.62
340 0.66
341 0.69
342 0.71
343 0.7
344 0.7
345 0.66
346 0.63
347 0.56
348 0.48
349 0.44
350 0.35
351 0.31
352 0.31
353 0.3
354 0.27
355 0.28
356 0.26
357 0.24
358 0.25
359 0.23
360 0.2
361 0.24
362 0.25
363 0.26
364 0.32
365 0.32
366 0.33
367 0.33
368 0.39
369 0.35
370 0.32
371 0.34
372 0.31
373 0.38
374 0.42
375 0.49
376 0.52
377 0.55
378 0.55
379 0.53
380 0.51
381 0.43
382 0.36
383 0.29
384 0.19
385 0.16
386 0.14
387 0.11
388 0.08
389 0.06
390 0.05
391 0.04
392 0.03
393 0.03
394 0.04
395 0.04
396 0.05
397 0.07
398 0.13
399 0.21