Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U6XQQ3

Protein Details
Accession A0A4U6XQQ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
546-577PSRSTPLTPDTQKRKRRPRKICFVEHNRKEATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
392-401KYASPRKRAR
558-565KRKRRPRK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
Amino Acid Sequences MFRRHDYEHLMIVYFDALLIDGESLLGVRQNERFERLEDLIICRKGHAALVEHQVISFDHSLGPHRLRQAFAKSIAAREEGLVLKPDDPYFDFNKNHRPLSGCPIKLKKEYIGGFGDVGDFAVVAARYDVDQAKRYSIPNLQWTHFYLGCLENKEDVQRCQSQPEFTVVHQVELNETLLKMVVAYGNPLPVPFKDNDALILNIAPGIAQQKMPSVVFTEPLVFDVRCFSFDKEGNTGFWQPRFPQVSKVHFDRSFIDTISFSELQSVAKDATTAPAMEDSQEMLDWIARLEGADPRGIPVDAASQSTTTSLMTPSRNSSIRPSNSPDPSPAQSSLKSRISLPVLLEAPGCVLATAPTTTSVTADMMADATGDSPTSEASQIPSNNKRAPEGKYASPRKRARVRSEPAPVPQESPRSMHQPLIDMGTDRTTPSPHASQTQPPTAKQDELGNTVTNPATPVSIELGEKSMEYAIIIPESPAPSASKPSAAAQKHVCQHAGDNCPLANTTVLLSSCIAQQAWITENLLPIHGIREWTTDPQDWVGDPAPSRSTPLTPDTQKRKRRPRKICFVEHNRKEATRALMMRLESCPQYTPSGRREYVEVYDWRILEDMTALEKAFKGSKPSAEHPDPKRKWWVGLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.12
3 0.07
4 0.06
5 0.05
6 0.06
7 0.05
8 0.05
9 0.05
10 0.05
11 0.05
12 0.05
13 0.08
14 0.08
15 0.11
16 0.15
17 0.22
18 0.25
19 0.3
20 0.32
21 0.31
22 0.36
23 0.35
24 0.36
25 0.33
26 0.36
27 0.39
28 0.41
29 0.39
30 0.33
31 0.32
32 0.28
33 0.29
34 0.26
35 0.22
36 0.24
37 0.31
38 0.34
39 0.32
40 0.31
41 0.29
42 0.26
43 0.26
44 0.21
45 0.15
46 0.13
47 0.14
48 0.19
49 0.24
50 0.27
51 0.27
52 0.33
53 0.36
54 0.37
55 0.42
56 0.45
57 0.44
58 0.43
59 0.47
60 0.41
61 0.42
62 0.42
63 0.37
64 0.3
65 0.25
66 0.26
67 0.19
68 0.19
69 0.19
70 0.18
71 0.17
72 0.19
73 0.19
74 0.18
75 0.19
76 0.22
77 0.24
78 0.3
79 0.34
80 0.36
81 0.46
82 0.49
83 0.48
84 0.46
85 0.46
86 0.43
87 0.48
88 0.53
89 0.46
90 0.49
91 0.55
92 0.58
93 0.59
94 0.59
95 0.52
96 0.51
97 0.49
98 0.46
99 0.41
100 0.36
101 0.31
102 0.28
103 0.24
104 0.16
105 0.14
106 0.09
107 0.06
108 0.04
109 0.06
110 0.06
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.09
116 0.13
117 0.14
118 0.19
119 0.2
120 0.24
121 0.26
122 0.27
123 0.29
124 0.31
125 0.34
126 0.37
127 0.41
128 0.38
129 0.38
130 0.4
131 0.4
132 0.35
133 0.3
134 0.25
135 0.24
136 0.26
137 0.27
138 0.25
139 0.22
140 0.22
141 0.27
142 0.28
143 0.26
144 0.28
145 0.32
146 0.32
147 0.37
148 0.39
149 0.35
150 0.34
151 0.36
152 0.32
153 0.25
154 0.34
155 0.28
156 0.26
157 0.25
158 0.23
159 0.2
160 0.19
161 0.2
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.11
177 0.1
178 0.14
179 0.12
180 0.15
181 0.15
182 0.16
183 0.18
184 0.18
185 0.18
186 0.14
187 0.14
188 0.1
189 0.09
190 0.08
191 0.06
192 0.04
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.09
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.12
202 0.12
203 0.12
204 0.13
205 0.12
206 0.1
207 0.12
208 0.13
209 0.11
210 0.1
211 0.13
212 0.13
213 0.13
214 0.15
215 0.15
216 0.19
217 0.21
218 0.24
219 0.24
220 0.25
221 0.24
222 0.25
223 0.28
224 0.24
225 0.24
226 0.23
227 0.2
228 0.27
229 0.31
230 0.29
231 0.34
232 0.39
233 0.44
234 0.46
235 0.49
236 0.48
237 0.44
238 0.44
239 0.38
240 0.35
241 0.3
242 0.25
243 0.23
244 0.16
245 0.16
246 0.19
247 0.16
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.06
279 0.07
280 0.08
281 0.07
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.06
287 0.09
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.09
299 0.1
300 0.11
301 0.13
302 0.16
303 0.17
304 0.18
305 0.22
306 0.27
307 0.28
308 0.31
309 0.34
310 0.37
311 0.39
312 0.39
313 0.36
314 0.32
315 0.31
316 0.3
317 0.27
318 0.22
319 0.22
320 0.24
321 0.28
322 0.27
323 0.26
324 0.24
325 0.25
326 0.25
327 0.24
328 0.22
329 0.19
330 0.17
331 0.16
332 0.16
333 0.12
334 0.1
335 0.09
336 0.08
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.06
349 0.07
350 0.06
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.04
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.07
366 0.11
367 0.14
368 0.2
369 0.25
370 0.29
371 0.32
372 0.33
373 0.34
374 0.35
375 0.37
376 0.39
377 0.38
378 0.39
379 0.46
380 0.55
381 0.58
382 0.65
383 0.65
384 0.65
385 0.7
386 0.72
387 0.71
388 0.72
389 0.71
390 0.69
391 0.73
392 0.67
393 0.62
394 0.58
395 0.5
396 0.42
397 0.4
398 0.36
399 0.29
400 0.29
401 0.27
402 0.28
403 0.29
404 0.29
405 0.26
406 0.25
407 0.24
408 0.23
409 0.21
410 0.16
411 0.16
412 0.15
413 0.14
414 0.12
415 0.12
416 0.11
417 0.12
418 0.15
419 0.18
420 0.17
421 0.21
422 0.24
423 0.3
424 0.34
425 0.41
426 0.4
427 0.38
428 0.42
429 0.4
430 0.38
431 0.32
432 0.33
433 0.27
434 0.28
435 0.29
436 0.24
437 0.21
438 0.22
439 0.21
440 0.15
441 0.13
442 0.1
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.09
447 0.1
448 0.1
449 0.1
450 0.11
451 0.11
452 0.1
453 0.1
454 0.08
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.09
463 0.1
464 0.1
465 0.1
466 0.11
467 0.12
468 0.16
469 0.17
470 0.16
471 0.17
472 0.21
473 0.28
474 0.28
475 0.32
476 0.33
477 0.38
478 0.42
479 0.43
480 0.4
481 0.32
482 0.36
483 0.39
484 0.39
485 0.33
486 0.3
487 0.27
488 0.27
489 0.27
490 0.22
491 0.15
492 0.1
493 0.09
494 0.1
495 0.1
496 0.11
497 0.11
498 0.11
499 0.12
500 0.13
501 0.12
502 0.09
503 0.1
504 0.11
505 0.12
506 0.12
507 0.13
508 0.13
509 0.16
510 0.16
511 0.16
512 0.14
513 0.12
514 0.13
515 0.13
516 0.13
517 0.11
518 0.15
519 0.17
520 0.21
521 0.26
522 0.25
523 0.26
524 0.26
525 0.26
526 0.22
527 0.23
528 0.2
529 0.19
530 0.18
531 0.19
532 0.21
533 0.2
534 0.23
535 0.22
536 0.22
537 0.23
538 0.27
539 0.32
540 0.37
541 0.46
542 0.54
543 0.62
544 0.71
545 0.77
546 0.84
547 0.87
548 0.91
549 0.92
550 0.93
551 0.94
552 0.94
553 0.93
554 0.93
555 0.93
556 0.93
557 0.89
558 0.85
559 0.78
560 0.69
561 0.61
562 0.55
563 0.5
564 0.46
565 0.42
566 0.39
567 0.38
568 0.38
569 0.38
570 0.35
571 0.33
572 0.26
573 0.26
574 0.24
575 0.22
576 0.28
577 0.31
578 0.36
579 0.4
580 0.47
581 0.47
582 0.46
583 0.47
584 0.45
585 0.44
586 0.44
587 0.39
588 0.36
589 0.39
590 0.37
591 0.34
592 0.3
593 0.26
594 0.19
595 0.18
596 0.13
597 0.11
598 0.13
599 0.12
600 0.12
601 0.13
602 0.16
603 0.19
604 0.2
605 0.24
606 0.28
607 0.35
608 0.41
609 0.47
610 0.54
611 0.58
612 0.66
613 0.68
614 0.75
615 0.72
616 0.71
617 0.75
618 0.69