Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V6DIF4

Protein Details
Accession A0A4V6DIF4    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-101KNYAPKKPSKWYKIYERYAEHydrophilic
399-418QELPRKRKAVDIFMPKKKARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
351-354PKPK
402-419PRKRKAVDIFMPKKKARR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MAPAKSLAELCIAVCQRHIAELTSVGNGDTLQYHHVRDILIRVTNPAQLREIELNSPHIQGETSELWLRLIKKEFPTESHEKNYAPKKPSKWYKIYERYAEERRQAQQQAEAELLARVQGLQQKKDNNVSRIVDPKFARFLPTPPKTGRTFGTRGRGGKELPSSLSFAAGSRMKTTTGASVMKKARREAKEIVGIRSNMAVPSGLIRAPRLSKAPPSMAAEHRISTQPVFRPTSTSARPPTHSTYVAPPRTTYVSDSSDDENGDLFGDEETPKKKSKDSNPVGSISPSNKPVVPSNSTGLKARTLTASPRFSSAVKSSSSPSSSQPAGLRRGGGILGNAPRPNSNIRVERPKPKPEPVIRSTEPPRSHKLLAHNNGPRSPPLPASLDEMHPARPIPGNQELPRKRKAVDIFMPKKKARR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.19
4 0.21
5 0.22
6 0.17
7 0.17
8 0.2
9 0.21
10 0.19
11 0.19
12 0.16
13 0.15
14 0.13
15 0.12
16 0.1
17 0.1
18 0.13
19 0.15
20 0.16
21 0.17
22 0.19
23 0.19
24 0.19
25 0.23
26 0.23
27 0.25
28 0.24
29 0.27
30 0.27
31 0.32
32 0.32
33 0.29
34 0.26
35 0.23
36 0.27
37 0.28
38 0.28
39 0.26
40 0.26
41 0.29
42 0.29
43 0.29
44 0.25
45 0.21
46 0.19
47 0.15
48 0.19
49 0.15
50 0.17
51 0.18
52 0.18
53 0.19
54 0.22
55 0.24
56 0.24
57 0.27
58 0.29
59 0.32
60 0.39
61 0.4
62 0.4
63 0.47
64 0.48
65 0.49
66 0.5
67 0.48
68 0.42
69 0.48
70 0.53
71 0.53
72 0.52
73 0.54
74 0.55
75 0.62
76 0.71
77 0.72
78 0.72
79 0.72
80 0.77
81 0.79
82 0.81
83 0.77
84 0.72
85 0.7
86 0.7
87 0.68
88 0.62
89 0.57
90 0.52
91 0.52
92 0.5
93 0.44
94 0.42
95 0.38
96 0.35
97 0.3
98 0.27
99 0.2
100 0.17
101 0.15
102 0.09
103 0.07
104 0.05
105 0.07
106 0.12
107 0.15
108 0.19
109 0.24
110 0.29
111 0.33
112 0.42
113 0.47
114 0.44
115 0.47
116 0.45
117 0.44
118 0.47
119 0.45
120 0.42
121 0.37
122 0.37
123 0.34
124 0.32
125 0.32
126 0.26
127 0.3
128 0.34
129 0.36
130 0.39
131 0.37
132 0.42
133 0.4
134 0.42
135 0.39
136 0.35
137 0.36
138 0.37
139 0.43
140 0.42
141 0.42
142 0.42
143 0.41
144 0.35
145 0.35
146 0.33
147 0.26
148 0.23
149 0.22
150 0.21
151 0.18
152 0.18
153 0.14
154 0.11
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.13
159 0.14
160 0.14
161 0.14
162 0.15
163 0.13
164 0.14
165 0.18
166 0.17
167 0.23
168 0.28
169 0.31
170 0.33
171 0.35
172 0.4
173 0.39
174 0.44
175 0.41
176 0.41
177 0.45
178 0.45
179 0.43
180 0.38
181 0.35
182 0.3
183 0.27
184 0.22
185 0.13
186 0.11
187 0.09
188 0.05
189 0.06
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.09
195 0.1
196 0.12
197 0.13
198 0.13
199 0.16
200 0.19
201 0.2
202 0.21
203 0.23
204 0.25
205 0.25
206 0.28
207 0.25
208 0.23
209 0.23
210 0.21
211 0.18
212 0.16
213 0.18
214 0.17
215 0.21
216 0.23
217 0.22
218 0.25
219 0.27
220 0.33
221 0.32
222 0.34
223 0.35
224 0.35
225 0.38
226 0.39
227 0.4
228 0.37
229 0.36
230 0.32
231 0.34
232 0.4
233 0.41
234 0.37
235 0.32
236 0.31
237 0.32
238 0.31
239 0.25
240 0.2
241 0.2
242 0.21
243 0.22
244 0.22
245 0.21
246 0.2
247 0.18
248 0.13
249 0.1
250 0.09
251 0.07
252 0.06
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.09
257 0.11
258 0.14
259 0.18
260 0.19
261 0.23
262 0.31
263 0.4
264 0.49
265 0.54
266 0.61
267 0.61
268 0.62
269 0.58
270 0.51
271 0.44
272 0.36
273 0.32
274 0.24
275 0.23
276 0.22
277 0.23
278 0.26
279 0.28
280 0.29
281 0.29
282 0.3
283 0.32
284 0.32
285 0.33
286 0.29
287 0.26
288 0.23
289 0.22
290 0.21
291 0.19
292 0.24
293 0.29
294 0.32
295 0.3
296 0.31
297 0.32
298 0.3
299 0.33
300 0.3
301 0.26
302 0.23
303 0.24
304 0.24
305 0.27
306 0.29
307 0.26
308 0.25
309 0.27
310 0.26
311 0.28
312 0.3
313 0.3
314 0.33
315 0.33
316 0.31
317 0.26
318 0.26
319 0.23
320 0.19
321 0.15
322 0.15
323 0.17
324 0.21
325 0.22
326 0.21
327 0.22
328 0.24
329 0.27
330 0.28
331 0.32
332 0.35
333 0.4
334 0.5
335 0.56
336 0.63
337 0.67
338 0.72
339 0.71
340 0.72
341 0.76
342 0.74
343 0.77
344 0.72
345 0.73
346 0.65
347 0.67
348 0.65
349 0.64
350 0.62
351 0.58
352 0.6
353 0.57
354 0.58
355 0.54
356 0.58
357 0.6
358 0.6
359 0.64
360 0.64
361 0.63
362 0.64
363 0.61
364 0.54
365 0.46
366 0.42
367 0.35
368 0.31
369 0.3
370 0.27
371 0.31
372 0.32
373 0.31
374 0.32
375 0.31
376 0.28
377 0.26
378 0.25
379 0.22
380 0.24
381 0.24
382 0.26
383 0.34
384 0.4
385 0.45
386 0.55
387 0.62
388 0.63
389 0.68
390 0.64
391 0.57
392 0.57
393 0.58
394 0.57
395 0.58
396 0.63
397 0.66
398 0.72
399 0.8