Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U6XCT0

Protein Details
Accession A0A4U6XCT0    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
121-140SSQHKKRREIEQRQHERAQKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-106KDEEKKRGKR
126-128KRR
140-140K
147-148KR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039853  Pinin  
IPR006786  Pinin_SDK_MemA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04696  Pinin_SDK_memA  
Amino Acid Sequences MATATEYGARGSLEPDEKLTEPRAPADTTRTVPTSSEIDVAQKRKASPDSFEGEDPSKRPKIEESDPPTQDSVLSTDSRPRDQGADTNAPRRAPLSKDEEKKRGKRLFGGLLSTLSQTSASSQHKKRREIEQRQHERAQKQRAEDDKRRTEKLARITEARWREQIKLDEKAMKARHVNMLAMAHSLRSKAKPPVYYRPWKLTSEQEDRIDGQIEDTKVVIAREVEAFRDRKEEHQRRYGQTSPARDEVSADKVSAPVVIDDAAKANTEPLVEVAPTHAPTVADEVPSSHHQQDEPGDVVEDAEDTVIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.23
4 0.24
5 0.27
6 0.29
7 0.28
8 0.26
9 0.29
10 0.3
11 0.29
12 0.3
13 0.33
14 0.35
15 0.33
16 0.35
17 0.34
18 0.31
19 0.3
20 0.31
21 0.27
22 0.23
23 0.22
24 0.18
25 0.23
26 0.28
27 0.31
28 0.32
29 0.32
30 0.32
31 0.36
32 0.42
33 0.38
34 0.37
35 0.4
36 0.41
37 0.4
38 0.4
39 0.38
40 0.34
41 0.34
42 0.32
43 0.33
44 0.32
45 0.29
46 0.3
47 0.32
48 0.36
49 0.4
50 0.48
51 0.49
52 0.54
53 0.55
54 0.55
55 0.5
56 0.43
57 0.36
58 0.27
59 0.22
60 0.15
61 0.15
62 0.14
63 0.2
64 0.23
65 0.24
66 0.24
67 0.23
68 0.23
69 0.23
70 0.27
71 0.27
72 0.34
73 0.35
74 0.4
75 0.41
76 0.39
77 0.37
78 0.34
79 0.31
80 0.23
81 0.27
82 0.29
83 0.35
84 0.44
85 0.51
86 0.59
87 0.65
88 0.69
89 0.73
90 0.71
91 0.65
92 0.62
93 0.61
94 0.59
95 0.52
96 0.48
97 0.38
98 0.33
99 0.31
100 0.26
101 0.19
102 0.12
103 0.1
104 0.07
105 0.08
106 0.13
107 0.18
108 0.25
109 0.32
110 0.41
111 0.48
112 0.54
113 0.58
114 0.62
115 0.68
116 0.71
117 0.75
118 0.77
119 0.8
120 0.79
121 0.81
122 0.76
123 0.71
124 0.67
125 0.66
126 0.58
127 0.51
128 0.52
129 0.54
130 0.57
131 0.59
132 0.6
133 0.61
134 0.61
135 0.61
136 0.56
137 0.53
138 0.49
139 0.51
140 0.48
141 0.4
142 0.38
143 0.38
144 0.42
145 0.41
146 0.37
147 0.33
148 0.28
149 0.28
150 0.31
151 0.36
152 0.34
153 0.33
154 0.34
155 0.34
156 0.33
157 0.38
158 0.35
159 0.32
160 0.29
161 0.28
162 0.3
163 0.26
164 0.26
165 0.21
166 0.2
167 0.17
168 0.16
169 0.14
170 0.1
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.15
176 0.21
177 0.26
178 0.32
179 0.38
180 0.47
181 0.53
182 0.61
183 0.61
184 0.62
185 0.61
186 0.57
187 0.54
188 0.52
189 0.51
190 0.49
191 0.5
192 0.44
193 0.41
194 0.41
195 0.39
196 0.32
197 0.24
198 0.18
199 0.17
200 0.16
201 0.15
202 0.13
203 0.13
204 0.12
205 0.12
206 0.11
207 0.07
208 0.08
209 0.11
210 0.12
211 0.14
212 0.18
213 0.19
214 0.19
215 0.25
216 0.25
217 0.31
218 0.42
219 0.49
220 0.51
221 0.6
222 0.66
223 0.65
224 0.71
225 0.68
226 0.65
227 0.63
228 0.63
229 0.58
230 0.55
231 0.51
232 0.43
233 0.4
234 0.35
235 0.34
236 0.27
237 0.23
238 0.19
239 0.18
240 0.18
241 0.16
242 0.14
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.11
261 0.13
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.14
267 0.2
268 0.19
269 0.17
270 0.16
271 0.16
272 0.19
273 0.23
274 0.27
275 0.24
276 0.24
277 0.23
278 0.27
279 0.31
280 0.31
281 0.29
282 0.25
283 0.24
284 0.22
285 0.22
286 0.18
287 0.14
288 0.09