Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V6DGN3

Protein Details
Accession A0A4V6DGN3    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-30CGDVLTKKKLDPHRNRCRGATFHydrophilic
55-84QKYQGALYKEKNNNNKKNKTHNNQPQPAPVHydrophilic
206-235APKHERRRKDGSEKKDKKRKRLHVDTDQMMBasic
302-336LSRSSAKAKIKTKAKKRKVSSSTKKHSHHRSDSEKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
207-226PKHERRRKDGSEKKDKKRKR
282-291KTKSSKHKKE
304-337RSSAKAKIKTKAKKRKVSSSTKKHSHHRSDSEKA
Subcellular Location(s) nucl 22, mito_nucl 13.333, cyto_nucl 12.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039999  LYAR  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51804  ZF_C2HC_LYAR  
Amino Acid Sequences MVSFSCESCGDVLTKKKLDPHRNRCRGATFTCIDCMVYFPGTEYRSHTSCMSEAQKYQGALYKEKNNNNKKNKTHNNQPQPAPVHEYEAMAQHAYVEEVPDAEFESFPYETSDNGNSPAELLPEAPTPPSANEGNVNVFDFLDPSATPNASTLGPKEVTEETQLVRYEYEGEAYLDDDGAMMNEDRRALVQYGTGPIPTTGYETPAPKHERRRKDGSEKKDKKRKRLHVDTDQMMVDAPPTLAHSGLTGGLNRMMRPPVFPPSPDYSGGDVADPGLTSPLRKTKSSKHKKEAGIGNNFLGLLSRSSAKAKIKTKAKKRKVSSSTKKHSHHRSDSEKAPKLIEYRPGSRDSKKDEDGDDEGQMVVYRPRADLFLSFVNKGPESERGCSMNKALKRFHRERSSSEDTLGKLSEEKELWRSLRLRRNDRGEIVLFAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.38
3 0.46
4 0.54
5 0.63
6 0.69
7 0.72
8 0.76
9 0.82
10 0.85
11 0.82
12 0.78
13 0.74
14 0.67
15 0.64
16 0.56
17 0.48
18 0.46
19 0.4
20 0.34
21 0.27
22 0.25
23 0.19
24 0.17
25 0.14
26 0.14
27 0.19
28 0.2
29 0.21
30 0.24
31 0.27
32 0.28
33 0.3
34 0.29
35 0.27
36 0.26
37 0.32
38 0.33
39 0.31
40 0.31
41 0.34
42 0.36
43 0.33
44 0.34
45 0.32
46 0.3
47 0.32
48 0.36
49 0.41
50 0.46
51 0.54
52 0.63
53 0.68
54 0.75
55 0.81
56 0.84
57 0.83
58 0.86
59 0.88
60 0.87
61 0.87
62 0.88
63 0.88
64 0.86
65 0.82
66 0.79
67 0.73
68 0.66
69 0.62
70 0.52
71 0.46
72 0.38
73 0.35
74 0.28
75 0.26
76 0.24
77 0.17
78 0.16
79 0.11
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.07
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.13
96 0.12
97 0.12
98 0.15
99 0.18
100 0.15
101 0.17
102 0.17
103 0.14
104 0.15
105 0.15
106 0.13
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.1
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.14
117 0.13
118 0.13
119 0.14
120 0.16
121 0.17
122 0.16
123 0.17
124 0.13
125 0.13
126 0.12
127 0.1
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.11
137 0.1
138 0.11
139 0.1
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.16
144 0.15
145 0.16
146 0.17
147 0.17
148 0.14
149 0.17
150 0.17
151 0.15
152 0.14
153 0.13
154 0.13
155 0.12
156 0.12
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.09
161 0.08
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.04
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.08
186 0.11
187 0.08
188 0.11
189 0.13
190 0.14
191 0.15
192 0.21
193 0.27
194 0.28
195 0.39
196 0.45
197 0.52
198 0.58
199 0.66
200 0.66
201 0.72
202 0.76
203 0.75
204 0.78
205 0.79
206 0.82
207 0.83
208 0.81
209 0.81
210 0.83
211 0.83
212 0.82
213 0.83
214 0.82
215 0.82
216 0.83
217 0.74
218 0.66
219 0.55
220 0.45
221 0.34
222 0.24
223 0.15
224 0.08
225 0.06
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.06
236 0.07
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.13
244 0.15
245 0.19
246 0.2
247 0.2
248 0.24
249 0.28
250 0.3
251 0.3
252 0.3
253 0.25
254 0.25
255 0.25
256 0.2
257 0.14
258 0.11
259 0.1
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.09
266 0.16
267 0.19
268 0.21
269 0.26
270 0.34
271 0.46
272 0.57
273 0.64
274 0.66
275 0.72
276 0.74
277 0.78
278 0.77
279 0.74
280 0.7
281 0.61
282 0.52
283 0.44
284 0.4
285 0.31
286 0.22
287 0.14
288 0.08
289 0.07
290 0.08
291 0.09
292 0.11
293 0.17
294 0.22
295 0.29
296 0.34
297 0.42
298 0.51
299 0.6
300 0.69
301 0.75
302 0.8
303 0.82
304 0.83
305 0.86
306 0.85
307 0.87
308 0.87
309 0.87
310 0.87
311 0.86
312 0.86
313 0.84
314 0.85
315 0.84
316 0.82
317 0.81
318 0.79
319 0.76
320 0.78
321 0.79
322 0.74
323 0.66
324 0.58
325 0.51
326 0.47
327 0.44
328 0.44
329 0.4
330 0.39
331 0.42
332 0.46
333 0.48
334 0.5
335 0.53
336 0.52
337 0.54
338 0.52
339 0.52
340 0.48
341 0.49
342 0.48
343 0.43
344 0.35
345 0.28
346 0.24
347 0.2
348 0.18
349 0.14
350 0.11
351 0.12
352 0.12
353 0.12
354 0.13
355 0.14
356 0.15
357 0.16
358 0.18
359 0.23
360 0.25
361 0.25
362 0.27
363 0.29
364 0.28
365 0.28
366 0.26
367 0.27
368 0.29
369 0.31
370 0.32
371 0.33
372 0.35
373 0.36
374 0.39
375 0.39
376 0.39
377 0.42
378 0.46
379 0.51
380 0.59
381 0.64
382 0.69
383 0.72
384 0.72
385 0.71
386 0.72
387 0.72
388 0.63
389 0.59
390 0.53
391 0.44
392 0.42
393 0.37
394 0.28
395 0.23
396 0.22
397 0.24
398 0.22
399 0.24
400 0.25
401 0.31
402 0.32
403 0.36
404 0.41
405 0.45
406 0.52
407 0.59
408 0.64
409 0.67
410 0.75
411 0.75
412 0.74
413 0.71
414 0.64