Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FTD3

Protein Details
Accession C5FTD3    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-68NSPVDKSGTGRDRKRPRCRKIPKPSLSDELHydrophilic
404-430GYVCPFCPDQRHKYPRPDNLQRHVRVHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-59DRKRPRCRKI
453-460NRGRRRRA
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Pfam View protein in Pfam  
PF00096  zf-C2H2  
Amino Acid Sequences MNYDSDDARNLSPPLEKQKIVYEPHESPPPFIPDKSESNSPVDKSGTGRDRKRPRCRKIPKPSLSDELILRSLAPNDPEIAYKSREAPLRADSSSCSSPDSGHTSGAEEGSLQGLDGSTADVDVNMHRRPEESSRVQTLPVLNSPPATIAGSSSEGGSTVCQSLPSFRSSFPCEIVPDVISSKDHFLKNGVPQPTYPAVTSSPRQSHHSHSHSHGHHNSSQSHIRRLSEQFYPTPLLSSTASTPAYSHASPPKTCDISNVSTPSALHQPHYWPDRLKTDHSRPQSHSHSQSLSQSSCEPGSQYSDTPSTGYPTPTDPTSQEGPEKRHDTPTTTISSSGMFKCNYPGCVALPFQTQYLLNSHANVHSQFRPYYCPVQGCPRSEGGKGFKRKNEMIRHGLVHDSPGYVCPFCPDQRHKYPRPDNLQRHVRVHHIDKDREDPLLREVLAQRPEGANRGRRRRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.4
3 0.4
4 0.38
5 0.46
6 0.51
7 0.51
8 0.5
9 0.47
10 0.46
11 0.5
12 0.57
13 0.49
14 0.45
15 0.45
16 0.47
17 0.43
18 0.39
19 0.4
20 0.36
21 0.42
22 0.44
23 0.45
24 0.41
25 0.44
26 0.48
27 0.44
28 0.42
29 0.37
30 0.34
31 0.3
32 0.37
33 0.4
34 0.44
35 0.5
36 0.57
37 0.66
38 0.75
39 0.84
40 0.85
41 0.86
42 0.89
43 0.92
44 0.93
45 0.93
46 0.94
47 0.92
48 0.88
49 0.84
50 0.79
51 0.72
52 0.64
53 0.54
54 0.46
55 0.38
56 0.3
57 0.24
58 0.19
59 0.18
60 0.17
61 0.17
62 0.14
63 0.14
64 0.15
65 0.17
66 0.19
67 0.2
68 0.21
69 0.21
70 0.24
71 0.27
72 0.3
73 0.31
74 0.3
75 0.33
76 0.35
77 0.34
78 0.31
79 0.29
80 0.3
81 0.3
82 0.28
83 0.24
84 0.2
85 0.2
86 0.23
87 0.27
88 0.22
89 0.21
90 0.21
91 0.21
92 0.21
93 0.2
94 0.16
95 0.1
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.05
110 0.07
111 0.12
112 0.13
113 0.14
114 0.14
115 0.15
116 0.19
117 0.24
118 0.3
119 0.32
120 0.36
121 0.41
122 0.41
123 0.41
124 0.39
125 0.36
126 0.3
127 0.26
128 0.23
129 0.18
130 0.18
131 0.18
132 0.16
133 0.14
134 0.12
135 0.1
136 0.08
137 0.09
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.11
151 0.13
152 0.16
153 0.16
154 0.16
155 0.2
156 0.24
157 0.26
158 0.24
159 0.24
160 0.22
161 0.21
162 0.21
163 0.17
164 0.14
165 0.13
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.13
170 0.17
171 0.16
172 0.16
173 0.17
174 0.2
175 0.26
176 0.32
177 0.31
178 0.26
179 0.26
180 0.3
181 0.31
182 0.28
183 0.22
184 0.17
185 0.17
186 0.19
187 0.21
188 0.22
189 0.24
190 0.25
191 0.29
192 0.3
193 0.35
194 0.41
195 0.43
196 0.4
197 0.4
198 0.47
199 0.45
200 0.5
201 0.46
202 0.41
203 0.41
204 0.4
205 0.37
206 0.33
207 0.38
208 0.33
209 0.34
210 0.32
211 0.3
212 0.31
213 0.32
214 0.31
215 0.27
216 0.28
217 0.23
218 0.23
219 0.24
220 0.2
221 0.18
222 0.15
223 0.14
224 0.12
225 0.12
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.12
231 0.11
232 0.14
233 0.13
234 0.15
235 0.18
236 0.22
237 0.22
238 0.25
239 0.28
240 0.27
241 0.27
242 0.27
243 0.26
244 0.26
245 0.29
246 0.28
247 0.23
248 0.22
249 0.22
250 0.21
251 0.21
252 0.18
253 0.16
254 0.15
255 0.17
256 0.23
257 0.26
258 0.27
259 0.24
260 0.27
261 0.33
262 0.35
263 0.38
264 0.41
265 0.46
266 0.52
267 0.56
268 0.59
269 0.56
270 0.6
271 0.62
272 0.6
273 0.56
274 0.51
275 0.47
276 0.42
277 0.44
278 0.4
279 0.33
280 0.28
281 0.24
282 0.22
283 0.21
284 0.19
285 0.14
286 0.11
287 0.15
288 0.15
289 0.15
290 0.16
291 0.17
292 0.17
293 0.18
294 0.17
295 0.16
296 0.16
297 0.16
298 0.14
299 0.15
300 0.17
301 0.17
302 0.18
303 0.16
304 0.19
305 0.21
306 0.22
307 0.26
308 0.28
309 0.32
310 0.38
311 0.41
312 0.39
313 0.44
314 0.43
315 0.41
316 0.41
317 0.41
318 0.38
319 0.34
320 0.33
321 0.25
322 0.25
323 0.24
324 0.22
325 0.22
326 0.18
327 0.17
328 0.23
329 0.25
330 0.24
331 0.22
332 0.22
333 0.19
334 0.22
335 0.22
336 0.18
337 0.19
338 0.19
339 0.18
340 0.18
341 0.17
342 0.15
343 0.17
344 0.2
345 0.17
346 0.18
347 0.19
348 0.19
349 0.22
350 0.22
351 0.23
352 0.22
353 0.25
354 0.26
355 0.26
356 0.3
357 0.32
358 0.37
359 0.37
360 0.36
361 0.36
362 0.44
363 0.49
364 0.47
365 0.46
366 0.45
367 0.43
368 0.42
369 0.45
370 0.43
371 0.46
372 0.51
373 0.55
374 0.55
375 0.6
376 0.65
377 0.68
378 0.7
379 0.69
380 0.68
381 0.65
382 0.63
383 0.57
384 0.53
385 0.44
386 0.36
387 0.29
388 0.23
389 0.18
390 0.18
391 0.19
392 0.17
393 0.16
394 0.17
395 0.21
396 0.24
397 0.33
398 0.38
399 0.45
400 0.55
401 0.65
402 0.7
403 0.76
404 0.82
405 0.83
406 0.85
407 0.87
408 0.85
409 0.86
410 0.88
411 0.84
412 0.8
413 0.73
414 0.7
415 0.67
416 0.64
417 0.63
418 0.62
419 0.62
420 0.6
421 0.64
422 0.58
423 0.54
424 0.49
425 0.42
426 0.36
427 0.35
428 0.31
429 0.3
430 0.31
431 0.34
432 0.36
433 0.35
434 0.34
435 0.32
436 0.34
437 0.36
438 0.4
439 0.42
440 0.49