Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0VPK1

Protein Details
Accession A0A4U0VPK1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
460-481PDDLPPERPPEKRRPRNTAKAPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
467-481RPPEKRRPRNTAKAP
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10, nucl 9, cyto 9, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR021850  Symplekin/Pta1  
IPR032460  Symplekin/Pta1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF11935  SYMPK_PTA1_N  
Amino Acid Sequences MNGAGSSANDTITQLNAARNLALGDAAYYPQIVPGVVPIIGANASLDLRRWGADFLAETFASPTLAGEEKQKLSLVVLQTLKDFLENPSEDTGVVKSVVQAAASIYPLVVRHTITNPTDGATWQKMASIKSSILRRMDTAPAGVRICCIKFVQKVVQTQTPGLITDPRRTEQNEISLSLVPRDHPLIPPSNLEAEASGLLDRLFGVLQENESDALIITATLNSLGVLVRTRASVANKIVSTVLNFNPFKQANSPMTPKTKVMVKSTARTTRAFLMNILKKNPNHPMAGRIQGYIERLHQSLVDIFDETSRKRAAPSEPTDGLDSAKRQRLGADVPGTLPGRPDIPALPQGPVSYAQLFTLTTDEGSKSFDVQTIPIELVVQILVPILAQIGVTNLNDAINAVRARYLSLGRTPPTTALDAAKLATGAPPQGDDDEDDDYEPDYPIEDAEQIVNKLNNAPPDDLPPERPPEKRRPRNTAKAP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.18
4 0.18
5 0.17
6 0.17
7 0.16
8 0.14
9 0.12
10 0.09
11 0.08
12 0.08
13 0.09
14 0.08
15 0.09
16 0.08
17 0.09
18 0.09
19 0.08
20 0.07
21 0.08
22 0.1
23 0.09
24 0.09
25 0.08
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.07
30 0.07
31 0.08
32 0.08
33 0.09
34 0.1
35 0.11
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.12
40 0.14
41 0.14
42 0.15
43 0.18
44 0.16
45 0.16
46 0.16
47 0.16
48 0.14
49 0.12
50 0.1
51 0.09
52 0.11
53 0.11
54 0.15
55 0.21
56 0.22
57 0.23
58 0.23
59 0.21
60 0.21
61 0.25
62 0.21
63 0.22
64 0.23
65 0.22
66 0.23
67 0.23
68 0.22
69 0.18
70 0.17
71 0.12
72 0.18
73 0.18
74 0.2
75 0.21
76 0.21
77 0.2
78 0.21
79 0.2
80 0.13
81 0.12
82 0.1
83 0.09
84 0.11
85 0.12
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.12
99 0.15
100 0.21
101 0.21
102 0.23
103 0.22
104 0.21
105 0.21
106 0.19
107 0.21
108 0.17
109 0.18
110 0.15
111 0.18
112 0.19
113 0.2
114 0.22
115 0.19
116 0.19
117 0.23
118 0.28
119 0.3
120 0.3
121 0.3
122 0.3
123 0.3
124 0.31
125 0.27
126 0.25
127 0.22
128 0.23
129 0.22
130 0.2
131 0.18
132 0.18
133 0.17
134 0.17
135 0.16
136 0.17
137 0.19
138 0.24
139 0.3
140 0.32
141 0.37
142 0.39
143 0.43
144 0.39
145 0.36
146 0.34
147 0.27
148 0.23
149 0.18
150 0.2
151 0.18
152 0.23
153 0.26
154 0.25
155 0.27
156 0.29
157 0.33
158 0.3
159 0.35
160 0.3
161 0.28
162 0.29
163 0.28
164 0.27
165 0.23
166 0.2
167 0.14
168 0.13
169 0.15
170 0.14
171 0.13
172 0.16
173 0.2
174 0.2
175 0.21
176 0.21
177 0.2
178 0.19
179 0.18
180 0.14
181 0.1
182 0.09
183 0.08
184 0.07
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.08
219 0.1
220 0.14
221 0.15
222 0.18
223 0.17
224 0.18
225 0.17
226 0.15
227 0.15
228 0.14
229 0.14
230 0.17
231 0.18
232 0.17
233 0.23
234 0.23
235 0.23
236 0.22
237 0.26
238 0.22
239 0.26
240 0.3
241 0.28
242 0.32
243 0.33
244 0.31
245 0.28
246 0.29
247 0.29
248 0.29
249 0.34
250 0.32
251 0.36
252 0.42
253 0.47
254 0.44
255 0.41
256 0.39
257 0.36
258 0.36
259 0.31
260 0.26
261 0.29
262 0.32
263 0.33
264 0.35
265 0.35
266 0.33
267 0.37
268 0.42
269 0.36
270 0.33
271 0.31
272 0.33
273 0.31
274 0.36
275 0.32
276 0.26
277 0.24
278 0.23
279 0.24
280 0.19
281 0.18
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.13
286 0.12
287 0.13
288 0.13
289 0.11
290 0.1
291 0.09
292 0.12
293 0.14
294 0.13
295 0.15
296 0.15
297 0.14
298 0.15
299 0.19
300 0.22
301 0.29
302 0.34
303 0.38
304 0.38
305 0.39
306 0.39
307 0.35
308 0.31
309 0.25
310 0.23
311 0.21
312 0.25
313 0.25
314 0.23
315 0.24
316 0.26
317 0.26
318 0.29
319 0.26
320 0.21
321 0.21
322 0.25
323 0.25
324 0.21
325 0.19
326 0.14
327 0.12
328 0.12
329 0.13
330 0.1
331 0.13
332 0.18
333 0.19
334 0.19
335 0.19
336 0.18
337 0.18
338 0.19
339 0.18
340 0.14
341 0.13
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.11
346 0.11
347 0.09
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.12
353 0.11
354 0.12
355 0.12
356 0.14
357 0.14
358 0.14
359 0.15
360 0.14
361 0.14
362 0.12
363 0.12
364 0.09
365 0.09
366 0.08
367 0.06
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.03
372 0.03
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.04
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.08
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.11
387 0.11
388 0.11
389 0.12
390 0.12
391 0.13
392 0.16
393 0.18
394 0.16
395 0.22
396 0.27
397 0.28
398 0.3
399 0.3
400 0.3
401 0.31
402 0.29
403 0.25
404 0.22
405 0.22
406 0.2
407 0.19
408 0.17
409 0.14
410 0.12
411 0.12
412 0.11
413 0.11
414 0.1
415 0.11
416 0.12
417 0.13
418 0.14
419 0.14
420 0.15
421 0.17
422 0.17
423 0.16
424 0.15
425 0.15
426 0.15
427 0.14
428 0.11
429 0.09
430 0.08
431 0.08
432 0.09
433 0.09
434 0.09
435 0.12
436 0.15
437 0.15
438 0.19
439 0.2
440 0.2
441 0.23
442 0.26
443 0.28
444 0.29
445 0.31
446 0.28
447 0.33
448 0.38
449 0.37
450 0.4
451 0.4
452 0.44
453 0.47
454 0.53
455 0.55
456 0.61
457 0.69
458 0.74
459 0.79
460 0.82
461 0.86