Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FDF0

Protein Details
Accession C5FDF0    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-52KVVDKNPPRRGKRDGPNEPRDTABasic
219-243AYIKGQSKETKRERQRKEKNVLEVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-43PPRRGKRD
229-235KRERQRK
250-286PRRGGDSFRGRGRGGRGGRGEFRGGRGNSRGAPRGGP
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MADVRSKNPYELLGNDPELDPNREPEPPVKVVDKNPPRRGKRDGPNEPRDTAPPRTNNRGPRLPTNEQAFRDRNAGSQNNRNRPTDGPSDRAQPAAHKNRDARGNMIREDRHSRTDRVVTDKQVEQGWGSRSGESNLKDERAGEDIAQSDEKEADEANAEEPEEEPEDKSKSYADYLAEQAESKLELSAKESRKANEGTKADKKWANAKELKRDDDEEAYIKGQSKETKRERQRKEKNVLEVDMRFVEAPRRGGDSFRGRGRGGRGGRGEFRGGRGNSRGAPRGGPPHASGPTVDEKNFPSLGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.3
3 0.29
4 0.3
5 0.3
6 0.31
7 0.27
8 0.25
9 0.27
10 0.27
11 0.3
12 0.3
13 0.33
14 0.31
15 0.34
16 0.35
17 0.37
18 0.41
19 0.49
20 0.55
21 0.59
22 0.66
23 0.73
24 0.74
25 0.76
26 0.8
27 0.79
28 0.79
29 0.79
30 0.81
31 0.81
32 0.84
33 0.82
34 0.76
35 0.68
36 0.63
37 0.57
38 0.53
39 0.51
40 0.5
41 0.52
42 0.59
43 0.64
44 0.67
45 0.69
46 0.7
47 0.67
48 0.68
49 0.7
50 0.66
51 0.65
52 0.64
53 0.62
54 0.57
55 0.6
56 0.52
57 0.45
58 0.44
59 0.38
60 0.33
61 0.34
62 0.37
63 0.35
64 0.42
65 0.5
66 0.56
67 0.59
68 0.59
69 0.54
70 0.5
71 0.5
72 0.51
73 0.45
74 0.4
75 0.38
76 0.41
77 0.39
78 0.39
79 0.33
80 0.29
81 0.35
82 0.41
83 0.42
84 0.42
85 0.44
86 0.47
87 0.54
88 0.5
89 0.45
90 0.42
91 0.42
92 0.4
93 0.43
94 0.39
95 0.36
96 0.42
97 0.4
98 0.4
99 0.39
100 0.38
101 0.37
102 0.41
103 0.39
104 0.4
105 0.41
106 0.36
107 0.37
108 0.36
109 0.34
110 0.29
111 0.27
112 0.19
113 0.2
114 0.19
115 0.18
116 0.18
117 0.16
118 0.16
119 0.18
120 0.22
121 0.19
122 0.21
123 0.19
124 0.19
125 0.18
126 0.18
127 0.17
128 0.15
129 0.14
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.11
135 0.09
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.09
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.1
158 0.1
159 0.11
160 0.13
161 0.12
162 0.12
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.13
167 0.11
168 0.1
169 0.09
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.1
175 0.18
176 0.2
177 0.25
178 0.28
179 0.28
180 0.32
181 0.35
182 0.35
183 0.35
184 0.36
185 0.38
186 0.44
187 0.44
188 0.45
189 0.44
190 0.43
191 0.43
192 0.44
193 0.46
194 0.46
195 0.49
196 0.55
197 0.58
198 0.59
199 0.53
200 0.52
201 0.46
202 0.41
203 0.38
204 0.29
205 0.25
206 0.22
207 0.2
208 0.21
209 0.19
210 0.2
211 0.24
212 0.28
213 0.37
214 0.45
215 0.55
216 0.63
217 0.72
218 0.79
219 0.83
220 0.88
221 0.88
222 0.89
223 0.86
224 0.85
225 0.8
226 0.72
227 0.66
228 0.56
229 0.49
230 0.4
231 0.33
232 0.24
233 0.19
234 0.22
235 0.2
236 0.21
237 0.2
238 0.24
239 0.24
240 0.25
241 0.33
242 0.36
243 0.39
244 0.42
245 0.45
246 0.4
247 0.44
248 0.47
249 0.48
250 0.43
251 0.44
252 0.44
253 0.45
254 0.49
255 0.48
256 0.48
257 0.41
258 0.41
259 0.42
260 0.39
261 0.38
262 0.38
263 0.39
264 0.39
265 0.44
266 0.45
267 0.38
268 0.39
269 0.39
270 0.44
271 0.43
272 0.42
273 0.38
274 0.4
275 0.41
276 0.39
277 0.34
278 0.31
279 0.36
280 0.36
281 0.34
282 0.3
283 0.3
284 0.34
285 0.34