FuNGI

A0A4U0XTP8

Protein Details

Accession

A0A4U0XTP8

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
39-61	SSTAQPTKQPIKHQKQNIEHATA	Hydrophilic
338-364	DSDAKPSSTLKQKKKKKTVENGIKLEG	Hydrophilic
470-497	LIVTKGKGFTKEKNKKKRGAYRGGMIDM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
253-271	KKTKKDAKETKVAKLKRSK
350-354	KKKKK
476-489	KGFTKEKNKKKRGA

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006594 LisH IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS50896 LISH

Amino Acid Sequences

MSIPASKMRTFGSSASTSSEAETKEPKNVQQSATQKPLSSTAQPTKQPIKHQKQNIEHATAPAPLLELVSDFLQEYGYEESARSLRVEIRKRGPSNHSKPALSNGTVTATPSLLKVYEAAQTISAPVKDAQKTGKTAKKDGTAGAKESASSSSSSDEDSDDEASDSDSSSSDSDLGTGMSDAGSDSSASSSSSSGRSSSSSAAPAAMKNSAKTAARSLKRKASSSGSDSSSASESSSSSSDSDSAIVPEPVSKKTKKDAKETKVAKLKRSKSSSASTSHSESDSASSSSDSSASDESESDSTSSSGSSISAADISLPSSASDSSLSGSSSSSDSDSEDSDAKPSSTLKQKKKKKTVENGIKLEGTATSTETEPTQLQRKSSDSSATLEAPSTPIEDGSESSLPAHTSAKRKRLVSPEEGTVVPAPEGNTKRVKKENVPFSRIPVDTKVDPKFASNAYVSYDYAERAYRDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGAYRGGMIDMAPKGIKFED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.29
3	0.29
4	0.26
5	0.25
6	0.28
7	0.22
8	0.23
9	0.29
10	0.27
11	0.33
12	0.36
13	0.4
14	0.44
15	0.48
16	0.47
17	0.49
18	0.54
19	0.55
20	0.59
21	0.56
22	0.48
23	0.45
24	0.48
25	0.44
26	0.42
27	0.42
28	0.43
29	0.48
30	0.51
31	0.57
32	0.61
33	0.62
34	0.68
35	0.7
36	0.72
37	0.74
38	0.79
39	0.82
40	0.81
41	0.86
42	0.82
43	0.77
44	0.67
45	0.61
46	0.53
47	0.44
48	0.35
49	0.25
50	0.19
51	0.13
52	0.12
53	0.09
54	0.07
55	0.07
56	0.08
57	0.08
58	0.07
59	0.07
60	0.07
61	0.07
62	0.09
63	0.1
64	0.11
65	0.11
66	0.11
67	0.13
68	0.14
69	0.15
70	0.14
71	0.13
72	0.19
73	0.27
74	0.35
75	0.41
76	0.49
77	0.57
78	0.6
79	0.65
80	0.68
81	0.7
82	0.7
83	0.72
84	0.69
85	0.61
86	0.59
87	0.6
88	0.56
89	0.46
90	0.39
91	0.3
92	0.27
93	0.26
94	0.25
95	0.18
96	0.13
97	0.12
98	0.11
99	0.11
100	0.09
101	0.09
102	0.09
103	0.09
104	0.13
105	0.13
106	0.14
107	0.13
108	0.13
109	0.14
110	0.16
111	0.14
112	0.12
113	0.13
114	0.19
115	0.2
116	0.22
117	0.26
118	0.28
119	0.33
120	0.39
121	0.43
122	0.41
123	0.44
124	0.47
125	0.47
126	0.45
127	0.44
128	0.44
129	0.41
130	0.39
131	0.37
132	0.32
133	0.26
134	0.26
135	0.23
136	0.15
137	0.13
138	0.12
139	0.11
140	0.12
141	0.12
142	0.12
143	0.11
144	0.11
145	0.12
146	0.12
147	0.1
148	0.1
149	0.09
150	0.09
151	0.09
152	0.08
153	0.07
154	0.06
155	0.07
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.06
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.05
164	0.05
165	0.05
166	0.04
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.05
175	0.05
176	0.06
177	0.06
178	0.07
179	0.09
180	0.09
181	0.1
182	0.1
183	0.11
184	0.13
185	0.14
186	0.14
187	0.14
188	0.13
189	0.14
190	0.14
191	0.13
192	0.13
193	0.15
194	0.14
195	0.13
196	0.14
197	0.16
198	0.16
199	0.16
200	0.22
201	0.26
202	0.32
203	0.37
204	0.4
205	0.45
206	0.47
207	0.48
208	0.45
209	0.42
210	0.41
211	0.4
212	0.39
213	0.33
214	0.31
215	0.3
216	0.27
217	0.22
218	0.18
219	0.14
220	0.1
221	0.08
222	0.08
223	0.08
224	0.08
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.08
229	0.09
230	0.07
231	0.08
232	0.08
233	0.08
234	0.07
235	0.09
236	0.11
237	0.13
238	0.17
239	0.18
240	0.2
241	0.28
242	0.35
243	0.37
244	0.46
245	0.53
246	0.54
247	0.62
248	0.63
249	0.63
250	0.65
251	0.63
252	0.59
253	0.58
254	0.6
255	0.59
256	0.61
257	0.57
258	0.53
259	0.56
260	0.53
261	0.47
262	0.43
263	0.37
264	0.34
265	0.32
266	0.27
267	0.22
268	0.18
269	0.16
270	0.14
271	0.12
272	0.1
273	0.09
274	0.09
275	0.08
276	0.09
277	0.07
278	0.07
279	0.08
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.07
290	0.07
291	0.06
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.07
309	0.06
310	0.07
311	0.08
312	0.08
313	0.07
314	0.07
315	0.08
316	0.08
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.09
321	0.09
322	0.1
323	0.11
324	0.12
325	0.11
326	0.12
327	0.12
328	0.11
329	0.12
330	0.12
331	0.16
332	0.25
333	0.34
334	0.43
335	0.53
336	0.63
337	0.73
338	0.83
339	0.87
340	0.87
341	0.89
342	0.9
343	0.91
344	0.9
345	0.84
346	0.76
347	0.66
348	0.55
349	0.44
350	0.33
351	0.23
352	0.14
353	0.11
354	0.09
355	0.09
356	0.1
357	0.1
358	0.12
359	0.11
360	0.15
361	0.22
362	0.22
363	0.24
364	0.26
365	0.29
366	0.31
367	0.32
368	0.32
369	0.26
370	0.27
371	0.29
372	0.27
373	0.24
374	0.21
375	0.19
376	0.16
377	0.14
378	0.12
379	0.09
380	0.08
381	0.08
382	0.09
383	0.09
384	0.13
385	0.13
386	0.12
387	0.12
388	0.13
389	0.13
390	0.14
391	0.17
392	0.18
393	0.27
394	0.35
395	0.43
396	0.48
397	0.5
398	0.56
399	0.62
400	0.64
401	0.62
402	0.58
403	0.53
404	0.5
405	0.48
406	0.42
407	0.34
408	0.27
409	0.19
410	0.16
411	0.14
412	0.19
413	0.22
414	0.25
415	0.33
416	0.36
417	0.43
418	0.5
419	0.55
420	0.57
421	0.64
422	0.71
423	0.7
424	0.74
425	0.69
426	0.66
427	0.67
428	0.58
429	0.52
430	0.45
431	0.42
432	0.39
433	0.45
434	0.43
435	0.4
436	0.39
437	0.38
438	0.37
439	0.33
440	0.33
441	0.26
442	0.23
443	0.24
444	0.26
445	0.24
446	0.22
447	0.22
448	0.18
449	0.19
450	0.21
451	0.17
452	0.16
453	0.18
454	0.17
455	0.18
456	0.2
457	0.22
458	0.26
459	0.27
460	0.28
461	0.33
462	0.34
463	0.4
464	0.42
465	0.48
466	0.52
467	0.61
468	0.69
469	0.75
470	0.81
471	0.83
472	0.89
473	0.9
474	0.89
475	0.89
476	0.86
477	0.83
478	0.81
479	0.74
480	0.64
481	0.53
482	0.48
483	0.38
484	0.33
485	0.25
486	0.18

A0A4U0XTP8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer