Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0WUD6

Protein Details
Accession A0A4U0WUD6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
720-740AEERRKEDKARKVAGKRTKIIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
723-738RRKEDKARKVAGKRTK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 10, mito 5, cyto_pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12565  RRM1_MRD1  
Amino Acid Sequences MASSRIFVRGLPPTYSEEEFKKHFAKQLSITDAKLLPHRRIGYVGYKTPDDAAKAVKYFNKSFIRMSKIGVELALPIDHESLPRPRRADPRDTANHRQQNTADHGIVADSNSLKRKRGAPNEIEPDSKLKEFLEVMQPPSKPKTWTNEASSTTAPTAVGSEDFTEPVVVPAGDSDIEYEAVPKKTKRLVPPTIRPSAAEEATDLGHEDRGKSGTNKGEASLPQDVIADEHDRQDTQPEGQPLTDADWLRSRTSRLLGLVDDRNEEVANRDTARASDQGAVTTEQIQVVPDPVETHAIVDVEDEQQPENTSEAFKGKTNAQAIEDSSRLFLRNLPYGITESEIREHFGSFGELQEARAFLIRVHVPMDPHSGTAKGFAYVHYTDPEHAVQAYQDMDGKIVQGRLMHILPAASKRESRLDDFAMSKLPLKKQKQIQRKRDAATTIFNWNALYMNNDAVMSSISDRLGVAKSELLDPTSSDAAVKQAHAETHIVQETKAYFANNGIDLNAFKKHERGDTGILVKNFPYGTNVDELRKMFEEHGQVSKVLMPPTGTIAIVEFAQAPQARAAFAALAYRKVKDSVLFLEKAPKDLFQKGTNPAGDVVTTAAPEGSAPKLSTTDLLQEQPPHETVDTSTLFVRNLNFSTTTERLTEVFKPLDGFLSARVKTKSDLKKPGQVLSMGFGFLEFRSKQQAQAALSAMNGYNLEGHKLLVKTSHKALDAAEERRKEDKARKVAGKRTKIIIKNLPFETSKKDVRALFGSYGQLRSVRVPKKFDKGARGFAFADFTTPREAENAMDALRDTHLLGRRLVLDFAAEDPEDAEAEIEKMQKKVGSQINKVALQRLTSSGRKKFNVEGNNDLDAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.4
3 0.39
4 0.35
5 0.37
6 0.38
7 0.41
8 0.4
9 0.39
10 0.43
11 0.44
12 0.47
13 0.48
14 0.53
15 0.55
16 0.54
17 0.51
18 0.49
19 0.46
20 0.42
21 0.43
22 0.4
23 0.36
24 0.41
25 0.43
26 0.4
27 0.41
28 0.43
29 0.44
30 0.46
31 0.48
32 0.44
33 0.42
34 0.41
35 0.41
36 0.39
37 0.32
38 0.27
39 0.26
40 0.27
41 0.27
42 0.31
43 0.33
44 0.37
45 0.37
46 0.44
47 0.46
48 0.44
49 0.49
50 0.53
51 0.56
52 0.51
53 0.51
54 0.48
55 0.42
56 0.4
57 0.33
58 0.26
59 0.19
60 0.2
61 0.17
62 0.11
63 0.1
64 0.12
65 0.12
66 0.12
67 0.15
68 0.23
69 0.28
70 0.33
71 0.35
72 0.4
73 0.5
74 0.56
75 0.62
76 0.59
77 0.64
78 0.69
79 0.75
80 0.77
81 0.77
82 0.78
83 0.7
84 0.69
85 0.6
86 0.57
87 0.56
88 0.52
89 0.42
90 0.34
91 0.32
92 0.28
93 0.26
94 0.2
95 0.15
96 0.11
97 0.15
98 0.22
99 0.25
100 0.27
101 0.31
102 0.39
103 0.46
104 0.55
105 0.61
106 0.61
107 0.68
108 0.74
109 0.72
110 0.66
111 0.57
112 0.51
113 0.45
114 0.38
115 0.29
116 0.21
117 0.21
118 0.2
119 0.22
120 0.27
121 0.26
122 0.3
123 0.34
124 0.35
125 0.36
126 0.4
127 0.4
128 0.35
129 0.38
130 0.42
131 0.45
132 0.51
133 0.54
134 0.56
135 0.56
136 0.56
137 0.51
138 0.45
139 0.37
140 0.3
141 0.23
142 0.16
143 0.13
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.1
166 0.14
167 0.17
168 0.21
169 0.21
170 0.25
171 0.32
172 0.39
173 0.46
174 0.51
175 0.58
176 0.65
177 0.74
178 0.76
179 0.75
180 0.69
181 0.6
182 0.56
183 0.51
184 0.42
185 0.32
186 0.24
187 0.19
188 0.19
189 0.18
190 0.13
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.13
197 0.15
198 0.16
199 0.21
200 0.24
201 0.27
202 0.27
203 0.27
204 0.29
205 0.28
206 0.31
207 0.28
208 0.23
209 0.2
210 0.2
211 0.19
212 0.15
213 0.16
214 0.14
215 0.11
216 0.13
217 0.14
218 0.14
219 0.14
220 0.17
221 0.16
222 0.16
223 0.2
224 0.2
225 0.2
226 0.2
227 0.2
228 0.17
229 0.19
230 0.21
231 0.17
232 0.16
233 0.2
234 0.22
235 0.24
236 0.25
237 0.24
238 0.23
239 0.25
240 0.25
241 0.21
242 0.21
243 0.2
244 0.24
245 0.25
246 0.23
247 0.22
248 0.2
249 0.19
250 0.17
251 0.16
252 0.14
253 0.13
254 0.14
255 0.14
256 0.15
257 0.14
258 0.15
259 0.17
260 0.15
261 0.15
262 0.16
263 0.15
264 0.15
265 0.16
266 0.16
267 0.14
268 0.15
269 0.13
270 0.1
271 0.1
272 0.09
273 0.08
274 0.09
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.1
280 0.09
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.11
294 0.1
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.14
302 0.15
303 0.2
304 0.22
305 0.22
306 0.21
307 0.21
308 0.22
309 0.22
310 0.21
311 0.15
312 0.14
313 0.13
314 0.13
315 0.12
316 0.13
317 0.14
318 0.17
319 0.17
320 0.17
321 0.17
322 0.18
323 0.18
324 0.17
325 0.15
326 0.11
327 0.14
328 0.13
329 0.14
330 0.13
331 0.13
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.09
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.08
343 0.09
344 0.09
345 0.06
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.12
350 0.13
351 0.12
352 0.14
353 0.18
354 0.14
355 0.15
356 0.15
357 0.14
358 0.13
359 0.14
360 0.13
361 0.1
362 0.1
363 0.09
364 0.13
365 0.13
366 0.14
367 0.13
368 0.13
369 0.13
370 0.15
371 0.15
372 0.11
373 0.1
374 0.09
375 0.07
376 0.08
377 0.08
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.07
388 0.08
389 0.1
390 0.1
391 0.09
392 0.08
393 0.08
394 0.09
395 0.11
396 0.13
397 0.12
398 0.12
399 0.14
400 0.18
401 0.2
402 0.22
403 0.22
404 0.21
405 0.22
406 0.23
407 0.22
408 0.18
409 0.17
410 0.18
411 0.18
412 0.21
413 0.28
414 0.3
415 0.36
416 0.43
417 0.52
418 0.59
419 0.66
420 0.72
421 0.73
422 0.77
423 0.72
424 0.68
425 0.62
426 0.53
427 0.46
428 0.37
429 0.31
430 0.24
431 0.22
432 0.18
433 0.15
434 0.14
435 0.1
436 0.1
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.05
445 0.05
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.08
456 0.09
457 0.09
458 0.08
459 0.08
460 0.08
461 0.1
462 0.09
463 0.08
464 0.07
465 0.07
466 0.09
467 0.09
468 0.09
469 0.08
470 0.09
471 0.09
472 0.1
473 0.11
474 0.1
475 0.12
476 0.14
477 0.13
478 0.12
479 0.14
480 0.13
481 0.13
482 0.13
483 0.11
484 0.09
485 0.1
486 0.11
487 0.1
488 0.1
489 0.09
490 0.08
491 0.09
492 0.1
493 0.12
494 0.11
495 0.11
496 0.13
497 0.15
498 0.17
499 0.2
500 0.22
501 0.22
502 0.25
503 0.29
504 0.3
505 0.28
506 0.26
507 0.23
508 0.21
509 0.18
510 0.14
511 0.12
512 0.1
513 0.1
514 0.13
515 0.15
516 0.14
517 0.17
518 0.17
519 0.18
520 0.18
521 0.18
522 0.15
523 0.18
524 0.2
525 0.19
526 0.22
527 0.2
528 0.19
529 0.18
530 0.21
531 0.19
532 0.16
533 0.15
534 0.13
535 0.12
536 0.14
537 0.15
538 0.11
539 0.09
540 0.09
541 0.09
542 0.08
543 0.08
544 0.06
545 0.05
546 0.08
547 0.09
548 0.09
549 0.1
550 0.1
551 0.1
552 0.09
553 0.1
554 0.06
555 0.06
556 0.1
557 0.09
558 0.14
559 0.15
560 0.16
561 0.16
562 0.17
563 0.18
564 0.15
565 0.18
566 0.19
567 0.23
568 0.23
569 0.22
570 0.3
571 0.29
572 0.31
573 0.29
574 0.26
575 0.25
576 0.29
577 0.32
578 0.27
579 0.32
580 0.33
581 0.37
582 0.35
583 0.32
584 0.28
585 0.25
586 0.21
587 0.16
588 0.14
589 0.09
590 0.08
591 0.07
592 0.06
593 0.05
594 0.05
595 0.07
596 0.07
597 0.08
598 0.08
599 0.09
600 0.1
601 0.11
602 0.12
603 0.11
604 0.15
605 0.15
606 0.17
607 0.18
608 0.2
609 0.2
610 0.22
611 0.22
612 0.19
613 0.17
614 0.16
615 0.15
616 0.18
617 0.18
618 0.16
619 0.17
620 0.16
621 0.16
622 0.17
623 0.17
624 0.14
625 0.14
626 0.15
627 0.16
628 0.16
629 0.22
630 0.23
631 0.23
632 0.21
633 0.21
634 0.2
635 0.22
636 0.23
637 0.21
638 0.2
639 0.19
640 0.19
641 0.18
642 0.19
643 0.16
644 0.15
645 0.15
646 0.21
647 0.22
648 0.25
649 0.26
650 0.26
651 0.28
652 0.37
653 0.42
654 0.44
655 0.54
656 0.54
657 0.62
658 0.63
659 0.65
660 0.58
661 0.5
662 0.41
663 0.34
664 0.3
665 0.21
666 0.18
667 0.13
668 0.11
669 0.09
670 0.14
671 0.12
672 0.12
673 0.2
674 0.21
675 0.24
676 0.27
677 0.33
678 0.29
679 0.32
680 0.32
681 0.24
682 0.23
683 0.22
684 0.18
685 0.13
686 0.12
687 0.08
688 0.1
689 0.1
690 0.12
691 0.11
692 0.12
693 0.15
694 0.16
695 0.16
696 0.2
697 0.23
698 0.25
699 0.3
700 0.34
701 0.3
702 0.31
703 0.31
704 0.33
705 0.35
706 0.39
707 0.41
708 0.39
709 0.41
710 0.44
711 0.46
712 0.44
713 0.47
714 0.5
715 0.53
716 0.59
717 0.66
718 0.71
719 0.78
720 0.81
721 0.81
722 0.76
723 0.74
724 0.74
725 0.7
726 0.7
727 0.7
728 0.67
729 0.65
730 0.62
731 0.58
732 0.52
733 0.48
734 0.47
735 0.44
736 0.42
737 0.37
738 0.41
739 0.39
740 0.41
741 0.43
742 0.39
743 0.35
744 0.33
745 0.35
746 0.31
747 0.31
748 0.28
749 0.25
750 0.23
751 0.27
752 0.33
753 0.36
754 0.4
755 0.46
756 0.52
757 0.59
758 0.67
759 0.67
760 0.68
761 0.67
762 0.71
763 0.67
764 0.64
765 0.56
766 0.49
767 0.46
768 0.35
769 0.32
770 0.23
771 0.21
772 0.21
773 0.2
774 0.19
775 0.17
776 0.18
777 0.15
778 0.18
779 0.19
780 0.14
781 0.15
782 0.14
783 0.14
784 0.14
785 0.14
786 0.11
787 0.16
788 0.22
789 0.24
790 0.24
791 0.26
792 0.28
793 0.29
794 0.28
795 0.22
796 0.17
797 0.16
798 0.16
799 0.17
800 0.13
801 0.12
802 0.12
803 0.12
804 0.11
805 0.1
806 0.09
807 0.07
808 0.08
809 0.1
810 0.15
811 0.17
812 0.17
813 0.2
814 0.21
815 0.22
816 0.3
817 0.36
818 0.41
819 0.44
820 0.52
821 0.57
822 0.6
823 0.6
824 0.57
825 0.5
826 0.44
827 0.4
828 0.37
829 0.36
830 0.39
831 0.47
832 0.49
833 0.56
834 0.57
835 0.59
836 0.61
837 0.64
838 0.65
839 0.62
840 0.62
841 0.58