Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0WDV9

Protein Details
Accession A0A4U0WDV9    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
68-96DEDEEEQHRRRREKKKRRRAEREEEEAVLBasic
107-135ANPEYQRREPPRPKFKRLKQGHKEDRANNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-88RRRREKKKRRRAE
114-129REPPRPKFKRLKQGHK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028083  Spt6_acidic_N_dom  
IPR023319  Tex-like_HTH_dom_sf  
IPR017072  TF_Spt6  
Gene Ontology GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF14632  SPT6_acidic  
Amino Acid Sequences MSTSNLLDIAAELGSEEEDEDFDEETGEARRRTNGTNGALDDSSEEEDDDDNEEEARAIREGFIVDEDEDEEEQHRRRREKKKRRRAEREEEEAVLDEEDLDLIGEANPEYQRREPPRPKFKRLKQGHKEDRANNEPRGMFSDDEDDVADNYDDRRAAANDPFGGDEFADFIEEDDPDDDGRDQDKDDAEVRRPARKGPGGIADMQSTGLDEASLEDMRAAFGDGTEYDWALEQEAVDEDQHERDKVLELKDVFEPSQLIDRMLTDEDNEIRNLDVPERFQIARKIYKQPELSDEEAAARAREES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.06
4 0.05
5 0.05
6 0.07
7 0.08
8 0.08
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.09
13 0.13
14 0.16
15 0.17
16 0.17
17 0.22
18 0.25
19 0.28
20 0.35
21 0.38
22 0.39
23 0.42
24 0.42
25 0.41
26 0.38
27 0.35
28 0.28
29 0.22
30 0.19
31 0.14
32 0.13
33 0.1
34 0.1
35 0.11
36 0.12
37 0.11
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.1
42 0.1
43 0.11
44 0.09
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.13
60 0.17
61 0.23
62 0.29
63 0.35
64 0.45
65 0.56
66 0.66
67 0.74
68 0.81
69 0.86
70 0.91
71 0.95
72 0.96
73 0.95
74 0.95
75 0.92
76 0.89
77 0.81
78 0.7
79 0.6
80 0.49
81 0.39
82 0.28
83 0.18
84 0.1
85 0.06
86 0.05
87 0.04
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.07
96 0.08
97 0.11
98 0.13
99 0.21
100 0.27
101 0.38
102 0.46
103 0.55
104 0.66
105 0.72
106 0.79
107 0.82
108 0.84
109 0.84
110 0.85
111 0.85
112 0.84
113 0.87
114 0.87
115 0.86
116 0.84
117 0.79
118 0.76
119 0.73
120 0.68
121 0.58
122 0.52
123 0.42
124 0.36
125 0.35
126 0.29
127 0.21
128 0.17
129 0.19
130 0.15
131 0.15
132 0.14
133 0.1
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.05
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.09
145 0.11
146 0.12
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.11
151 0.1
152 0.08
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.09
172 0.1
173 0.11
174 0.14
175 0.16
176 0.18
177 0.24
178 0.26
179 0.3
180 0.3
181 0.31
182 0.35
183 0.36
184 0.35
185 0.32
186 0.36
187 0.32
188 0.33
189 0.32
190 0.25
191 0.21
192 0.2
193 0.16
194 0.1
195 0.08
196 0.06
197 0.05
198 0.04
199 0.05
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.04
209 0.04
210 0.06
211 0.06
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.12
228 0.14
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.18
233 0.22
234 0.23
235 0.25
236 0.24
237 0.26
238 0.29
239 0.31
240 0.26
241 0.22
242 0.21
243 0.16
244 0.22
245 0.2
246 0.18
247 0.16
248 0.17
249 0.18
250 0.19
251 0.18
252 0.12
253 0.15
254 0.17
255 0.18
256 0.18
257 0.16
258 0.15
259 0.18
260 0.18
261 0.18
262 0.18
263 0.19
264 0.22
265 0.26
266 0.26
267 0.27
268 0.33
269 0.36
270 0.43
271 0.46
272 0.53
273 0.55
274 0.63
275 0.64
276 0.61
277 0.61
278 0.58
279 0.55
280 0.47
281 0.42
282 0.35
283 0.33
284 0.3
285 0.23