Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FLM1

Protein Details
Accession C5FLM1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-30RIKGIVGHPLHRRRRSRNDAELGSDBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MLPPFRIKGIVGHPLHRRRRSRNDAELGSDIASTQDPDNQHSAEFEVQGDGVVQVSAKEYDQTIKELPAARLQYQDDDDGEIVVIFGRIFVSGPSAIVYMDSLLANRPTDGTPKSLFEASSSGGNDFITEEGKKQAHAAGRQLRDARKLYWPDAYWLEPAENSSACNSGDFWRTYEPAQQFFEPSPNPREREPESPESPIETSSKPLLSQFEAELSRLMAQNAGWESLPPTTAEPTIVVGKGSDAGSHSAEVQEPKPDSREDFAANSTADQAPDTAETISHIVTVFGKSFQSLLSRVNLLTTELTARLPEIEQRMRDMQHHIPDQMHTTIHETLQAMGSHIQTLAGVMQHAATSARSSSTATNEAERVVTTQLNNLRTLASDIRDIGGSLIAGFEKGLKPQENTNISDPSLAPEAVNPAANNIFIGNLPPDATEESVVAALANQGFVGTVTLPKDSLTGDHAGFCYVRFPTTYAAVAALQALRGTFIGENCINVEPTSESLHPEPDNTVEPSDGPIVHPTSGLLCGTTEAEMANPEVPVSELDNNTDNVVHPQQHLAPTSQCASVTLPVPEGPVNTQPPPNTALLDESEANLAERYPSLLASQGANSLGPNAQHDIHIDFPFGPNDINSGISRYPSMQQLELQHLLTHNPQPVSDWEATRTRPTHGCSEQNTNRFSSREPLAPTVPDRIPGSWPWDQETQQSSIPSRPHRNENQAGPSTSDSMNHFNRPILSDLSHPFNPLPRHFPPIPTSNSSSLRRSATERVHRSPPRPFEFHPYPRRRSSTHELAEISTGRDHQHSDLPGTFPRESQAATIAETPLNDKTELCLSHLRALGFGNDRSQDENRLRIFAEAADGNLEEAIEMIEEERKAYEQGPVSM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.68
3 0.72
4 0.75
5 0.75
6 0.84
7 0.87
8 0.88
9 0.88
10 0.87
11 0.81
12 0.77
13 0.69
14 0.59
15 0.49
16 0.39
17 0.28
18 0.2
19 0.17
20 0.13
21 0.11
22 0.14
23 0.15
24 0.19
25 0.23
26 0.22
27 0.22
28 0.21
29 0.24
30 0.22
31 0.21
32 0.18
33 0.15
34 0.14
35 0.14
36 0.13
37 0.1
38 0.08
39 0.07
40 0.06
41 0.05
42 0.08
43 0.09
44 0.09
45 0.1
46 0.11
47 0.16
48 0.18
49 0.22
50 0.22
51 0.22
52 0.26
53 0.3
54 0.31
55 0.33
56 0.35
57 0.33
58 0.36
59 0.36
60 0.36
61 0.33
62 0.34
63 0.27
64 0.26
65 0.24
66 0.19
67 0.17
68 0.13
69 0.1
70 0.08
71 0.08
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.06
78 0.09
79 0.08
80 0.09
81 0.1
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.1
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.1
91 0.12
92 0.12
93 0.12
94 0.14
95 0.14
96 0.19
97 0.2
98 0.23
99 0.23
100 0.25
101 0.28
102 0.28
103 0.27
104 0.23
105 0.24
106 0.2
107 0.22
108 0.2
109 0.17
110 0.16
111 0.16
112 0.14
113 0.13
114 0.12
115 0.11
116 0.1
117 0.11
118 0.17
119 0.17
120 0.17
121 0.18
122 0.22
123 0.25
124 0.28
125 0.36
126 0.39
127 0.42
128 0.47
129 0.52
130 0.51
131 0.52
132 0.51
133 0.45
134 0.45
135 0.48
136 0.45
137 0.45
138 0.43
139 0.4
140 0.4
141 0.39
142 0.31
143 0.27
144 0.25
145 0.18
146 0.19
147 0.17
148 0.14
149 0.13
150 0.13
151 0.14
152 0.13
153 0.13
154 0.14
155 0.14
156 0.2
157 0.2
158 0.21
159 0.23
160 0.24
161 0.25
162 0.31
163 0.31
164 0.3
165 0.32
166 0.31
167 0.29
168 0.29
169 0.33
170 0.29
171 0.3
172 0.33
173 0.36
174 0.38
175 0.38
176 0.43
177 0.42
178 0.47
179 0.5
180 0.5
181 0.48
182 0.48
183 0.47
184 0.43
185 0.39
186 0.33
187 0.28
188 0.21
189 0.21
190 0.2
191 0.21
192 0.18
193 0.19
194 0.2
195 0.19
196 0.2
197 0.18
198 0.2
199 0.2
200 0.2
201 0.18
202 0.16
203 0.15
204 0.14
205 0.14
206 0.1
207 0.09
208 0.13
209 0.13
210 0.13
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.13
216 0.09
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.1
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.12
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.09
231 0.08
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.12
236 0.1
237 0.12
238 0.14
239 0.13
240 0.16
241 0.17
242 0.18
243 0.2
244 0.21
245 0.21
246 0.21
247 0.24
248 0.21
249 0.21
250 0.21
251 0.21
252 0.2
253 0.17
254 0.18
255 0.15
256 0.13
257 0.11
258 0.1
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.07
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.11
280 0.12
281 0.13
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.13
286 0.12
287 0.11
288 0.1
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.1
297 0.15
298 0.18
299 0.18
300 0.22
301 0.25
302 0.25
303 0.27
304 0.29
305 0.28
306 0.31
307 0.32
308 0.3
309 0.28
310 0.28
311 0.29
312 0.25
313 0.2
314 0.15
315 0.16
316 0.16
317 0.15
318 0.16
319 0.13
320 0.12
321 0.15
322 0.14
323 0.11
324 0.12
325 0.12
326 0.1
327 0.1
328 0.09
329 0.06
330 0.07
331 0.06
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.05
338 0.05
339 0.04
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.08
345 0.09
346 0.11
347 0.15
348 0.15
349 0.16
350 0.16
351 0.16
352 0.15
353 0.13
354 0.12
355 0.1
356 0.1
357 0.09
358 0.13
359 0.17
360 0.18
361 0.19
362 0.18
363 0.16
364 0.15
365 0.18
366 0.15
367 0.12
368 0.11
369 0.11
370 0.11
371 0.11
372 0.1
373 0.08
374 0.06
375 0.05
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.03
381 0.05
382 0.05
383 0.06
384 0.1
385 0.11
386 0.12
387 0.15
388 0.23
389 0.25
390 0.27
391 0.29
392 0.27
393 0.26
394 0.26
395 0.23
396 0.17
397 0.15
398 0.12
399 0.09
400 0.08
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.06
410 0.05
411 0.05
412 0.06
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.06
419 0.07
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.05
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.03
433 0.03
434 0.03
435 0.03
436 0.04
437 0.05
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.07
442 0.06
443 0.07
444 0.08
445 0.09
446 0.1
447 0.1
448 0.1
449 0.1
450 0.1
451 0.1
452 0.09
453 0.07
454 0.07
455 0.07
456 0.08
457 0.09
458 0.1
459 0.11
460 0.09
461 0.1
462 0.09
463 0.09
464 0.08
465 0.07
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.04
470 0.04
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.1
478 0.11
479 0.1
480 0.09
481 0.1
482 0.07
483 0.09
484 0.11
485 0.1
486 0.12
487 0.12
488 0.15
489 0.14
490 0.14
491 0.13
492 0.13
493 0.14
494 0.14
495 0.13
496 0.11
497 0.11
498 0.12
499 0.12
500 0.1
501 0.09
502 0.1
503 0.11
504 0.11
505 0.1
506 0.09
507 0.09
508 0.1
509 0.09
510 0.07
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.07
515 0.06
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.06
520 0.06
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.06
525 0.06
526 0.08
527 0.1
528 0.1
529 0.11
530 0.13
531 0.13
532 0.13
533 0.13
534 0.11
535 0.12
536 0.14
537 0.13
538 0.13
539 0.14
540 0.16
541 0.18
542 0.19
543 0.17
544 0.16
545 0.17
546 0.18
547 0.17
548 0.15
549 0.14
550 0.14
551 0.14
552 0.14
553 0.13
554 0.12
555 0.11
556 0.13
557 0.12
558 0.11
559 0.11
560 0.14
561 0.17
562 0.18
563 0.21
564 0.2
565 0.21
566 0.24
567 0.22
568 0.19
569 0.16
570 0.16
571 0.14
572 0.16
573 0.14
574 0.11
575 0.11
576 0.1
577 0.1
578 0.09
579 0.07
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.07
585 0.07
586 0.08
587 0.09
588 0.1
589 0.1
590 0.1
591 0.1
592 0.1
593 0.09
594 0.09
595 0.09
596 0.09
597 0.1
598 0.11
599 0.11
600 0.11
601 0.13
602 0.14
603 0.16
604 0.16
605 0.16
606 0.14
607 0.15
608 0.15
609 0.14
610 0.12
611 0.08
612 0.09
613 0.09
614 0.11
615 0.1
616 0.12
617 0.12
618 0.12
619 0.13
620 0.13
621 0.15
622 0.18
623 0.2
624 0.18
625 0.21
626 0.23
627 0.28
628 0.28
629 0.26
630 0.22
631 0.21
632 0.22
633 0.22
634 0.23
635 0.21
636 0.2
637 0.19
638 0.2
639 0.22
640 0.26
641 0.25
642 0.22
643 0.22
644 0.26
645 0.27
646 0.31
647 0.31
648 0.29
649 0.31
650 0.33
651 0.38
652 0.39
653 0.44
654 0.42
655 0.52
656 0.55
657 0.56
658 0.55
659 0.49
660 0.46
661 0.41
662 0.38
663 0.34
664 0.3
665 0.29
666 0.31
667 0.32
668 0.31
669 0.33
670 0.33
671 0.34
672 0.31
673 0.29
674 0.27
675 0.24
676 0.25
677 0.24
678 0.29
679 0.27
680 0.28
681 0.29
682 0.31
683 0.31
684 0.34
685 0.35
686 0.31
687 0.3
688 0.31
689 0.29
690 0.3
691 0.35
692 0.38
693 0.45
694 0.47
695 0.53
696 0.59
697 0.66
698 0.68
699 0.68
700 0.69
701 0.64
702 0.6
703 0.53
704 0.47
705 0.41
706 0.34
707 0.3
708 0.24
709 0.27
710 0.29
711 0.3
712 0.29
713 0.28
714 0.29
715 0.29
716 0.29
717 0.25
718 0.23
719 0.24
720 0.26
721 0.31
722 0.29
723 0.29
724 0.27
725 0.3
726 0.34
727 0.33
728 0.37
729 0.34
730 0.42
731 0.41
732 0.45
733 0.44
734 0.46
735 0.48
736 0.46
737 0.48
738 0.46
739 0.52
740 0.51
741 0.49
742 0.47
743 0.44
744 0.41
745 0.41
746 0.43
747 0.46
748 0.52
749 0.57
750 0.58
751 0.65
752 0.69
753 0.7
754 0.72
755 0.72
756 0.68
757 0.67
758 0.64
759 0.63
760 0.67
761 0.71
762 0.73
763 0.72
764 0.72
765 0.75
766 0.77
767 0.7
768 0.69
769 0.68
770 0.68
771 0.63
772 0.61
773 0.54
774 0.5
775 0.51
776 0.43
777 0.35
778 0.26
779 0.23
780 0.19
781 0.19
782 0.21
783 0.19
784 0.25
785 0.25
786 0.28
787 0.29
788 0.31
789 0.33
790 0.37
791 0.35
792 0.29
793 0.29
794 0.26
795 0.24
796 0.22
797 0.23
798 0.18
799 0.19
800 0.21
801 0.21
802 0.2
803 0.19
804 0.21
805 0.19
806 0.2
807 0.19
808 0.17
809 0.18
810 0.24
811 0.24
812 0.26
813 0.29
814 0.3
815 0.36
816 0.39
817 0.36
818 0.31
819 0.31
820 0.33
821 0.3
822 0.29
823 0.27
824 0.26
825 0.28
826 0.32
827 0.33
828 0.36
829 0.36
830 0.42
831 0.4
832 0.39
833 0.38
834 0.35
835 0.33
836 0.25
837 0.25
838 0.18
839 0.16
840 0.16
841 0.15
842 0.14
843 0.13
844 0.12
845 0.07
846 0.07
847 0.06
848 0.04
849 0.05
850 0.05
851 0.09
852 0.09
853 0.1
854 0.12
855 0.13
856 0.14
857 0.15
858 0.21