Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V5NHM3

Protein Details
Accession A0A4V5NHM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
440-462RKYLEKEREKDMRKSQKRKTMKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
420-433DKAKKEKRDALLKG
438-462EQRKYLEKEREKDMRKSQKRKTMKA
Subcellular Location(s) cyto 12cyto_nucl 12, nucl 10, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MADYLKGLFGGTKSAVSSAVPSADDFADFASAPEPTPVQRSGSAPSGASAGSAFPTGSVGSPQIPYTKRYRVWERVSPSDFIVEAFVVPFILVLILVHVWGTRTNRRKAKAWIQAHAPVLQQEFASVGFSGRRAPTMDSVHAEGLLKALESEDTVIPSELLKEKSANEYVTYATGRQNIAFADIKLSMLKRYNPLSMLGETILGFFFESWTTPSERMEATLYAFDGKESDLVPVSRARAGEEVEQRKRNANSTYDGFVWAVVHKDKMKTLRDDRYDISLTTTKDHPKLPAWATVMSESPEITEAMLTPELVSAVTEAGEAMEALIITDQPIDQPKKLDETVPKKRVSLALTLPSTNTASAHQPTLRLFNYFLRLPDHLVAAAHFRAEVMRRVRQTREDEIRKIRRVDEDEKADERRLLSDKAKKEKRDALLKGLTAEEQRKYLEKEREKDMRKSQKRKTMKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.14
4 0.16
5 0.14
6 0.15
7 0.14
8 0.14
9 0.16
10 0.15
11 0.15
12 0.13
13 0.11
14 0.11
15 0.1
16 0.1
17 0.09
18 0.09
19 0.09
20 0.11
21 0.11
22 0.11
23 0.16
24 0.17
25 0.19
26 0.22
27 0.24
28 0.26
29 0.3
30 0.3
31 0.26
32 0.25
33 0.23
34 0.2
35 0.18
36 0.14
37 0.09
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.06
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.1
47 0.11
48 0.13
49 0.14
50 0.2
51 0.21
52 0.24
53 0.3
54 0.37
55 0.41
56 0.48
57 0.56
58 0.59
59 0.65
60 0.7
61 0.69
62 0.7
63 0.68
64 0.61
65 0.53
66 0.45
67 0.37
68 0.29
69 0.23
70 0.14
71 0.11
72 0.1
73 0.08
74 0.06
75 0.06
76 0.05
77 0.04
78 0.04
79 0.03
80 0.03
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.05
87 0.09
88 0.14
89 0.22
90 0.31
91 0.4
92 0.48
93 0.52
94 0.58
95 0.63
96 0.69
97 0.7
98 0.67
99 0.63
100 0.61
101 0.62
102 0.57
103 0.51
104 0.41
105 0.33
106 0.28
107 0.24
108 0.18
109 0.13
110 0.12
111 0.09
112 0.1
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.11
118 0.11
119 0.12
120 0.13
121 0.15
122 0.2
123 0.23
124 0.25
125 0.24
126 0.26
127 0.24
128 0.23
129 0.22
130 0.16
131 0.12
132 0.1
133 0.07
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.07
139 0.06
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.1
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.15
151 0.19
152 0.21
153 0.2
154 0.17
155 0.16
156 0.16
157 0.17
158 0.16
159 0.13
160 0.13
161 0.15
162 0.15
163 0.14
164 0.14
165 0.12
166 0.15
167 0.15
168 0.13
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.13
173 0.13
174 0.12
175 0.14
176 0.16
177 0.18
178 0.2
179 0.21
180 0.21
181 0.23
182 0.22
183 0.2
184 0.19
185 0.15
186 0.13
187 0.11
188 0.11
189 0.08
190 0.06
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.07
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.12
204 0.12
205 0.11
206 0.1
207 0.1
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.1
222 0.11
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.12
227 0.17
228 0.23
229 0.3
230 0.34
231 0.37
232 0.37
233 0.41
234 0.4
235 0.39
236 0.35
237 0.3
238 0.29
239 0.28
240 0.29
241 0.24
242 0.24
243 0.2
244 0.17
245 0.14
246 0.11
247 0.1
248 0.09
249 0.11
250 0.11
251 0.12
252 0.16
253 0.22
254 0.25
255 0.31
256 0.37
257 0.44
258 0.46
259 0.48
260 0.46
261 0.45
262 0.42
263 0.35
264 0.32
265 0.28
266 0.25
267 0.24
268 0.26
269 0.25
270 0.26
271 0.28
272 0.26
273 0.25
274 0.3
275 0.3
276 0.31
277 0.29
278 0.28
279 0.27
280 0.26
281 0.24
282 0.19
283 0.17
284 0.12
285 0.1
286 0.09
287 0.08
288 0.07
289 0.06
290 0.05
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.03
305 0.04
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.12
318 0.15
319 0.16
320 0.19
321 0.2
322 0.25
323 0.26
324 0.3
325 0.33
326 0.4
327 0.5
328 0.55
329 0.55
330 0.51
331 0.52
332 0.52
333 0.45
334 0.41
335 0.35
336 0.36
337 0.36
338 0.36
339 0.33
340 0.31
341 0.29
342 0.23
343 0.18
344 0.13
345 0.15
346 0.17
347 0.2
348 0.19
349 0.21
350 0.22
351 0.27
352 0.26
353 0.24
354 0.24
355 0.25
356 0.29
357 0.28
358 0.28
359 0.26
360 0.26
361 0.27
362 0.27
363 0.24
364 0.19
365 0.18
366 0.17
367 0.17
368 0.16
369 0.12
370 0.11
371 0.1
372 0.12
373 0.14
374 0.21
375 0.23
376 0.3
377 0.36
378 0.41
379 0.45
380 0.51
381 0.55
382 0.57
383 0.63
384 0.63
385 0.65
386 0.72
387 0.76
388 0.75
389 0.72
390 0.66
391 0.63
392 0.63
393 0.61
394 0.6
395 0.58
396 0.57
397 0.58
398 0.57
399 0.51
400 0.46
401 0.4
402 0.36
403 0.33
404 0.32
405 0.37
406 0.42
407 0.49
408 0.58
409 0.65
410 0.66
411 0.7
412 0.74
413 0.74
414 0.76
415 0.71
416 0.69
417 0.67
418 0.63
419 0.57
420 0.49
421 0.43
422 0.38
423 0.39
424 0.32
425 0.28
426 0.29
427 0.32
428 0.37
429 0.43
430 0.48
431 0.53
432 0.55
433 0.63
434 0.7
435 0.72
436 0.75
437 0.77
438 0.78
439 0.8
440 0.85
441 0.86
442 0.86