Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5G003

Protein Details
Accession C5G003    Localization Confidence High Confidence Score 24.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MSDSRSPSPVRPRKRKHVAEDEAPLEHydrophilic
31-55APEPASKKALRKEKKAKLKAGPGDAHydrophilic
279-306AEGSNVKKPKKQRMKKVWVNRLQGRQLRHydrophilic
311-330EDSSTRYKKRFGKEKSEGDEBasic
336-361SENRAPQKTAREPKKPAKYYSRYSNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-15RKR
36-50SKKALRKEKKAKLKA
285-294KKPKKQRMKK
346-350REPKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDSRSPSPVRPRKRKHVAEDEAPLEIDLNAPEPASKKALRKEKKAKLKAGPGDAAVASATEATEQQQEENKAETSNKKQRTGFGVWIGNLPFTATREALRTFLTTKSGILDSEITRIHIPEGESKQKGVKRNKGFAYVDFASQKVVDLALALSEELVGGRRVLIKDATNFEGRPEKNADQEDGSKAAGNPPSTKIFVGNLSFDTTKEDLEAHFGPCGTVSHVHVATFEDSGKCKGYAWVEFESTESSQAAVRGFIKVPDPADEVEDAEEEEAEADKEAEGSNVKKPKKQRMKKVWVNRLQGRQLRMEFAEDSSTRYKKRFGKEKSEGDEASKQASENRAPQKTAREPKKPAKYYSRYSNETVQKLSGAMVEAKGTKVTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.91
3 0.9
4 0.91
5 0.88
6 0.85
7 0.82
8 0.73
9 0.63
10 0.53
11 0.43
12 0.32
13 0.24
14 0.17
15 0.1
16 0.1
17 0.09
18 0.09
19 0.1
20 0.12
21 0.15
22 0.19
23 0.24
24 0.29
25 0.39
26 0.5
27 0.57
28 0.66
29 0.74
30 0.79
31 0.85
32 0.87
33 0.87
34 0.85
35 0.87
36 0.83
37 0.79
38 0.71
39 0.6
40 0.53
41 0.44
42 0.35
43 0.24
44 0.17
45 0.1
46 0.08
47 0.07
48 0.05
49 0.05
50 0.07
51 0.1
52 0.1
53 0.13
54 0.18
55 0.21
56 0.22
57 0.25
58 0.24
59 0.22
60 0.27
61 0.31
62 0.36
63 0.44
64 0.49
65 0.53
66 0.54
67 0.57
68 0.6
69 0.58
70 0.53
71 0.5
72 0.47
73 0.41
74 0.42
75 0.37
76 0.3
77 0.24
78 0.2
79 0.14
80 0.12
81 0.14
82 0.11
83 0.12
84 0.15
85 0.16
86 0.16
87 0.17
88 0.17
89 0.16
90 0.17
91 0.19
92 0.17
93 0.16
94 0.17
95 0.16
96 0.14
97 0.14
98 0.16
99 0.13
100 0.16
101 0.16
102 0.15
103 0.15
104 0.15
105 0.14
106 0.13
107 0.14
108 0.18
109 0.24
110 0.29
111 0.3
112 0.3
113 0.36
114 0.38
115 0.46
116 0.48
117 0.52
118 0.53
119 0.6
120 0.62
121 0.63
122 0.61
123 0.53
124 0.51
125 0.42
126 0.37
127 0.3
128 0.27
129 0.2
130 0.18
131 0.17
132 0.09
133 0.08
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.07
149 0.07
150 0.09
151 0.1
152 0.11
153 0.14
154 0.17
155 0.19
156 0.18
157 0.18
158 0.19
159 0.25
160 0.23
161 0.23
162 0.26
163 0.25
164 0.28
165 0.29
166 0.28
167 0.22
168 0.24
169 0.22
170 0.17
171 0.16
172 0.13
173 0.12
174 0.14
175 0.14
176 0.14
177 0.14
178 0.15
179 0.17
180 0.18
181 0.18
182 0.15
183 0.14
184 0.15
185 0.15
186 0.13
187 0.12
188 0.13
189 0.13
190 0.12
191 0.15
192 0.13
193 0.12
194 0.12
195 0.11
196 0.09
197 0.13
198 0.14
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.12
209 0.13
210 0.13
211 0.13
212 0.14
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.09
217 0.1
218 0.12
219 0.13
220 0.12
221 0.11
222 0.14
223 0.16
224 0.18
225 0.21
226 0.21
227 0.21
228 0.21
229 0.21
230 0.2
231 0.18
232 0.15
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.1
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.12
243 0.13
244 0.13
245 0.14
246 0.15
247 0.16
248 0.14
249 0.16
250 0.15
251 0.14
252 0.13
253 0.12
254 0.09
255 0.08
256 0.07
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.08
268 0.1
269 0.17
270 0.24
271 0.27
272 0.32
273 0.4
274 0.5
275 0.59
276 0.67
277 0.72
278 0.75
279 0.84
280 0.9
281 0.93
282 0.92
283 0.9
284 0.89
285 0.86
286 0.83
287 0.8
288 0.75
289 0.67
290 0.63
291 0.56
292 0.5
293 0.43
294 0.38
295 0.3
296 0.26
297 0.28
298 0.22
299 0.25
300 0.28
301 0.32
302 0.31
303 0.33
304 0.4
305 0.42
306 0.52
307 0.58
308 0.6
309 0.67
310 0.74
311 0.81
312 0.79
313 0.78
314 0.68
315 0.64
316 0.61
317 0.51
318 0.44
319 0.36
320 0.3
321 0.27
322 0.32
323 0.31
324 0.34
325 0.42
326 0.43
327 0.45
328 0.49
329 0.54
330 0.59
331 0.66
332 0.66
333 0.67
334 0.71
335 0.79
336 0.87
337 0.84
338 0.82
339 0.82
340 0.81
341 0.8
342 0.82
343 0.8
344 0.74
345 0.71
346 0.72
347 0.69
348 0.65
349 0.59
350 0.49
351 0.42
352 0.37
353 0.33
354 0.25
355 0.19
356 0.17
357 0.15
358 0.17
359 0.17
360 0.17
361 0.19