Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0X0Y1

Protein Details
Accession A0A4U0X0Y1    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-136ELDTKTWLMQQKKRQKRLEKARRLEQELAHydrophilic
282-308DPSTIKMRKSKKGKKEKMKRQKAADEDBasic
359-384LTAQRRQALKKRKKMRPEDLARQMREHydrophilic
620-646GKGSGKQKTEKRLKKIEDEKRRDAKSTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
78-84KKEAIKK
120-129KRQKRLEKAR
287-303KMRKSKKGKKEKMKRQK
365-374QALKKRKKMR
622-641GSGKQKTEKRLKKIEDEKRR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MADAISIEETNKIRVALGMKPLPVPGAPSGPVFKEAKDSDALSDEDDLSTLDKRQAKGFESWKKLQDEAEAREKQQAKKEAIKKARDAAQRFSKLEGKGLGDVDEGEELDTKTWLMQQKKRQKRLEKARRLEQELAERERQVEYTAADLAGVKVGHELNQFGDGDEQILTLRDTAVDDDEEGDELENLDLREKERLSERLELKKKKPVYNPNDEEEGGSRTLLAQYDAEIDGTQRKRFTLDGHGRTAEEADAAARGDSSKPRGMQISLDILEDDTPISDYVDPSTIKMRKSKKGKKEKMKRQKAADEDAMFLVVEAAPQSPTIDSAAMEIDVQPTQAAPVNPKRHALDVFDDDDLQAQLTAQRRQALKKRKKMRPEDLARQMREEGLATPGAIESIETPEGEDPGLVINETSEFVANLQMPVESDLPSKPKNRNPSMDAGLPTTDVEGDVEMANTYNGVEDEEELLARIKRDESTPAAGITANGLEEEDTLLKGMGGTLAMLRKRDLITDHASDDLSEKHRGRARFLAEKARLENEYENRARVQREADRKSGKLDKMSAREREEQAQYNNTQRERIVARQLAEIYARDYRPDVKLKYVDEFGRSMNQKEAFKQMSHQFHGKGSGKQKTEKRLKKIEDEKRRDAKSTLDSSQSTGMSGVAGETARKNRQAGVRLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.21
4 0.29
5 0.31
6 0.31
7 0.32
8 0.32
9 0.3
10 0.27
11 0.26
12 0.2
13 0.2
14 0.2
15 0.22
16 0.24
17 0.24
18 0.29
19 0.26
20 0.24
21 0.29
22 0.28
23 0.28
24 0.29
25 0.28
26 0.25
27 0.28
28 0.28
29 0.2
30 0.21
31 0.19
32 0.16
33 0.15
34 0.13
35 0.11
36 0.12
37 0.13
38 0.18
39 0.22
40 0.23
41 0.29
42 0.33
43 0.35
44 0.42
45 0.5
46 0.53
47 0.57
48 0.62
49 0.63
50 0.62
51 0.6
52 0.53
53 0.52
54 0.5
55 0.47
56 0.51
57 0.47
58 0.45
59 0.52
60 0.56
61 0.52
62 0.54
63 0.56
64 0.53
65 0.6
66 0.67
67 0.69
68 0.72
69 0.74
70 0.7
71 0.69
72 0.71
73 0.69
74 0.66
75 0.64
76 0.65
77 0.65
78 0.62
79 0.59
80 0.57
81 0.49
82 0.49
83 0.43
84 0.36
85 0.31
86 0.31
87 0.27
88 0.21
89 0.2
90 0.17
91 0.14
92 0.11
93 0.08
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.13
101 0.19
102 0.26
103 0.33
104 0.43
105 0.54
106 0.65
107 0.75
108 0.8
109 0.84
110 0.86
111 0.9
112 0.91
113 0.91
114 0.89
115 0.89
116 0.87
117 0.84
118 0.78
119 0.71
120 0.69
121 0.65
122 0.62
123 0.55
124 0.47
125 0.42
126 0.37
127 0.33
128 0.25
129 0.2
130 0.14
131 0.13
132 0.13
133 0.12
134 0.11
135 0.11
136 0.09
137 0.1
138 0.09
139 0.07
140 0.09
141 0.09
142 0.11
143 0.12
144 0.13
145 0.11
146 0.14
147 0.14
148 0.12
149 0.13
150 0.11
151 0.11
152 0.1
153 0.09
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.06
175 0.08
176 0.09
177 0.1
178 0.14
179 0.14
180 0.16
181 0.2
182 0.24
183 0.26
184 0.34
185 0.39
186 0.45
187 0.54
188 0.59
189 0.59
190 0.63
191 0.66
192 0.66
193 0.7
194 0.7
195 0.7
196 0.73
197 0.73
198 0.68
199 0.65
200 0.57
201 0.48
202 0.39
203 0.33
204 0.22
205 0.17
206 0.13
207 0.1
208 0.11
209 0.1
210 0.09
211 0.07
212 0.07
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.15
219 0.17
220 0.19
221 0.17
222 0.18
223 0.19
224 0.2
225 0.23
226 0.26
227 0.34
228 0.36
229 0.39
230 0.4
231 0.38
232 0.37
233 0.35
234 0.24
235 0.14
236 0.09
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.04
242 0.05
243 0.06
244 0.09
245 0.13
246 0.16
247 0.16
248 0.18
249 0.2
250 0.2
251 0.19
252 0.19
253 0.2
254 0.17
255 0.17
256 0.15
257 0.13
258 0.13
259 0.12
260 0.09
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.17
272 0.19
273 0.21
274 0.28
275 0.33
276 0.39
277 0.5
278 0.59
279 0.62
280 0.71
281 0.8
282 0.84
283 0.88
284 0.91
285 0.91
286 0.93
287 0.9
288 0.85
289 0.82
290 0.76
291 0.7
292 0.64
293 0.54
294 0.44
295 0.37
296 0.29
297 0.22
298 0.17
299 0.11
300 0.06
301 0.04
302 0.03
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.06
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.04
321 0.04
322 0.05
323 0.07
324 0.07
325 0.11
326 0.19
327 0.24
328 0.26
329 0.28
330 0.29
331 0.28
332 0.29
333 0.27
334 0.23
335 0.21
336 0.21
337 0.19
338 0.18
339 0.16
340 0.15
341 0.13
342 0.09
343 0.06
344 0.04
345 0.07
346 0.1
347 0.13
348 0.13
349 0.18
350 0.2
351 0.26
352 0.35
353 0.43
354 0.49
355 0.57
356 0.66
357 0.69
358 0.78
359 0.82
360 0.82
361 0.82
362 0.81
363 0.8
364 0.8
365 0.8
366 0.71
367 0.63
368 0.54
369 0.43
370 0.35
371 0.26
372 0.16
373 0.1
374 0.1
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.04
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.08
388 0.07
389 0.06
390 0.04
391 0.05
392 0.05
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.05
398 0.05
399 0.04
400 0.04
401 0.05
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.09
409 0.09
410 0.08
411 0.09
412 0.11
413 0.15
414 0.19
415 0.24
416 0.28
417 0.34
418 0.43
419 0.48
420 0.53
421 0.53
422 0.56
423 0.54
424 0.51
425 0.46
426 0.38
427 0.31
428 0.26
429 0.22
430 0.15
431 0.11
432 0.07
433 0.06
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.04
444 0.04
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.1
456 0.09
457 0.1
458 0.12
459 0.16
460 0.18
461 0.21
462 0.22
463 0.21
464 0.2
465 0.19
466 0.18
467 0.14
468 0.11
469 0.07
470 0.06
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.06
480 0.05
481 0.05
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.06
486 0.1
487 0.12
488 0.13
489 0.13
490 0.16
491 0.17
492 0.18
493 0.19
494 0.2
495 0.24
496 0.26
497 0.26
498 0.24
499 0.24
500 0.22
501 0.21
502 0.2
503 0.18
504 0.22
505 0.22
506 0.28
507 0.33
508 0.35
509 0.38
510 0.41
511 0.45
512 0.47
513 0.5
514 0.53
515 0.53
516 0.55
517 0.53
518 0.49
519 0.43
520 0.38
521 0.4
522 0.34
523 0.38
524 0.36
525 0.35
526 0.35
527 0.37
528 0.35
529 0.32
530 0.34
531 0.34
532 0.43
533 0.47
534 0.53
535 0.55
536 0.54
537 0.59
538 0.6
539 0.55
540 0.51
541 0.53
542 0.52
543 0.55
544 0.62
545 0.61
546 0.59
547 0.62
548 0.6
549 0.59
550 0.56
551 0.53
552 0.5
553 0.49
554 0.47
555 0.48
556 0.51
557 0.45
558 0.42
559 0.37
560 0.38
561 0.37
562 0.39
563 0.41
564 0.38
565 0.39
566 0.41
567 0.41
568 0.37
569 0.34
570 0.29
571 0.23
572 0.25
573 0.24
574 0.21
575 0.22
576 0.25
577 0.29
578 0.37
579 0.36
580 0.37
581 0.42
582 0.44
583 0.46
584 0.47
585 0.44
586 0.39
587 0.38
588 0.32
589 0.35
590 0.35
591 0.33
592 0.34
593 0.37
594 0.37
595 0.38
596 0.45
597 0.4
598 0.38
599 0.43
600 0.46
601 0.48
602 0.51
603 0.53
604 0.46
605 0.45
606 0.54
607 0.51
608 0.5
609 0.51
610 0.54
611 0.54
612 0.6
613 0.65
614 0.67
615 0.74
616 0.75
617 0.76
618 0.78
619 0.79
620 0.82
621 0.85
622 0.85
623 0.85
624 0.85
625 0.86
626 0.85
627 0.82
628 0.75
629 0.66
630 0.63
631 0.61
632 0.58
633 0.52
634 0.49
635 0.46
636 0.45
637 0.47
638 0.4
639 0.31
640 0.24
641 0.2
642 0.14
643 0.13
644 0.11
645 0.08
646 0.08
647 0.1
648 0.15
649 0.22
650 0.28
651 0.32
652 0.33
653 0.38
654 0.45