Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0X0M7

Protein Details
Accession A0A4U0X0M7    Localization Confidence Low Confidence Score 6.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
346-369LFTGRRAPRRLMRKEVLRNYRNEKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 16, cyto_nucl 11, nucl 4, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046346  Aminoacid_DH-like_N_sf  
IPR036291  NAD(P)-bd_dom_sf  
IPR041121  SDH_C  
IPR013708  Shikimate_DH-bd_N  
IPR006151  Shikm_DH/Glu-tRNA_Rdtase  
Gene Ontology GO:0004764  F:shikimate 3-dehydrogenase (NADP+) activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF18317  SDH_C  
PF01488  Shikimate_DH  
PF08501  Shikimate_dh_N  
CDD cd01065  NAD_bind_Shikimate_DH  
Amino Acid Sequences DTSQQVPGGASHGAMLDLGRTTSNDEAPLVTACEANQALYSSFILDPMHFYIYGASVNYSLSPAMHNAAYRICGMPHDYKTYQATSLKGLYDLVSDPNFGGAAITQPYKIEVIALTHSLSRHAKAIGAVNTLIPIRNLPPNGGIPDDLSFLQERNHAGPVKALYGDNTDWIGIRVCLRRGLSPVNAVRNSSSGLVIGAGGMARAAVYAMIQMGVKNIFICNRTLENAERLAAHYNRLDTSSFTPQGPAATVRVIRSYTDAWPEEHRLPTMVVCCIPANSIDGQPAANFVLPTKWLKSPTGGVVIEAPYKPLVTPLVTQIRAEAHRGWIAIDGLELLPEQGFAQFELFTGRRAPRRLMRKEVLRNYRNEKGQRDVDMLQSRIDRLEDQT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.07
4 0.07
5 0.08
6 0.08
7 0.08
8 0.12
9 0.15
10 0.17
11 0.17
12 0.17
13 0.17
14 0.18
15 0.18
16 0.16
17 0.13
18 0.12
19 0.11
20 0.15
21 0.15
22 0.14
23 0.14
24 0.14
25 0.13
26 0.14
27 0.15
28 0.12
29 0.12
30 0.13
31 0.13
32 0.12
33 0.14
34 0.15
35 0.16
36 0.14
37 0.14
38 0.14
39 0.14
40 0.15
41 0.12
42 0.11
43 0.09
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.08
49 0.09
50 0.09
51 0.11
52 0.12
53 0.12
54 0.13
55 0.14
56 0.15
57 0.15
58 0.15
59 0.13
60 0.13
61 0.18
62 0.23
63 0.25
64 0.31
65 0.3
66 0.33
67 0.36
68 0.36
69 0.36
70 0.32
71 0.3
72 0.27
73 0.29
74 0.25
75 0.22
76 0.21
77 0.16
78 0.15
79 0.15
80 0.14
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.11
85 0.11
86 0.09
87 0.08
88 0.05
89 0.06
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.09
98 0.07
99 0.08
100 0.1
101 0.11
102 0.1
103 0.11
104 0.12
105 0.15
106 0.16
107 0.15
108 0.16
109 0.15
110 0.16
111 0.16
112 0.22
113 0.2
114 0.2
115 0.19
116 0.17
117 0.17
118 0.17
119 0.15
120 0.1
121 0.08
122 0.09
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.15
127 0.17
128 0.18
129 0.18
130 0.16
131 0.13
132 0.13
133 0.14
134 0.11
135 0.11
136 0.1
137 0.09
138 0.1
139 0.11
140 0.12
141 0.12
142 0.16
143 0.16
144 0.16
145 0.17
146 0.17
147 0.16
148 0.16
149 0.14
150 0.11
151 0.13
152 0.13
153 0.12
154 0.11
155 0.1
156 0.09
157 0.1
158 0.09
159 0.07
160 0.1
161 0.11
162 0.12
163 0.15
164 0.16
165 0.17
166 0.19
167 0.21
168 0.19
169 0.23
170 0.25
171 0.28
172 0.28
173 0.27
174 0.25
175 0.23
176 0.22
177 0.17
178 0.14
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.02
188 0.02
189 0.02
190 0.02
191 0.02
192 0.02
193 0.02
194 0.02
195 0.02
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.07
205 0.08
206 0.09
207 0.11
208 0.12
209 0.13
210 0.15
211 0.16
212 0.16
213 0.16
214 0.16
215 0.14
216 0.14
217 0.18
218 0.16
219 0.17
220 0.15
221 0.16
222 0.15
223 0.17
224 0.16
225 0.13
226 0.17
227 0.21
228 0.22
229 0.21
230 0.21
231 0.2
232 0.2
233 0.19
234 0.16
235 0.1
236 0.11
237 0.13
238 0.13
239 0.15
240 0.15
241 0.14
242 0.16
243 0.17
244 0.16
245 0.2
246 0.21
247 0.21
248 0.24
249 0.28
250 0.28
251 0.27
252 0.26
253 0.21
254 0.21
255 0.21
256 0.19
257 0.16
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.12
262 0.12
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.1
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.11
278 0.14
279 0.16
280 0.18
281 0.21
282 0.22
283 0.24
284 0.26
285 0.27
286 0.31
287 0.27
288 0.25
289 0.24
290 0.24
291 0.25
292 0.22
293 0.2
294 0.14
295 0.14
296 0.13
297 0.13
298 0.13
299 0.12
300 0.14
301 0.2
302 0.27
303 0.28
304 0.28
305 0.28
306 0.31
307 0.3
308 0.32
309 0.26
310 0.22
311 0.23
312 0.24
313 0.22
314 0.19
315 0.18
316 0.15
317 0.13
318 0.11
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.14
333 0.14
334 0.15
335 0.2
336 0.26
337 0.32
338 0.36
339 0.43
340 0.46
341 0.56
342 0.63
343 0.67
344 0.7
345 0.73
346 0.8
347 0.83
348 0.85
349 0.81
350 0.81
351 0.79
352 0.78
353 0.77
354 0.74
355 0.69
356 0.66
357 0.66
358 0.62
359 0.6
360 0.54
361 0.54
362 0.53
363 0.49
364 0.44
365 0.4
366 0.37
367 0.33
368 0.33