Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0XF39

Protein Details
Accession A0A4U0XF39    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
398-417RARIARKAAKLLKRQRRETAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
400-413RIARKAAKLLKRQR
481-504RHGGRQRHTARGAPAKKKRAEGFR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019350  RNA_pol_I-sp_TIF_RRN6-like  
Pfam View protein in Pfam  
PF10214  Rrn6  
Amino Acid Sequences MSEGPPSRHGHSGLLDDGWARIVWIGNSHTLMVCSRRQITILDIHSNPVRLKCPELGIARTAHWFLDVRSSPIHKDHVFILTSSNLFWLQVTTLEEQKNNNRSNAIAKVLLSWKHFRSDEDPSLRLSVTADEDDMLILISSRLNTLVTSFRLSMPPYPHAIPLSLSDPAEVMLSPSVVPSSTSEVGVMFAINSLSLWPLQYCEYNGNLLVNADGPGHSYKQLGVRFYSMTVLSESLGVTQRLYYVLPVTGRQVEHDSRLTHDDLGTKALQILAPTWQDKSVRSTYRVHEDDFIVEDGFEDEDEDDFQMSVPVVLVSPRVKLTDSPSDTFSDAITDFKRLRQYTTFSKATPPPPLPKPLSTVLSHWTLGADPAEYDWAATRQALESESRTANEMSEAERARIARKAAKLLKRQRRETAAAEAATAASQQGPVVMASQPVGPSGRWSSPAPLDAGSQLVGPGVQSSQLTQSQRLPASQVEPGRHGGRQRHTARGAPAKKKRAEGFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.26
3 0.21
4 0.2
5 0.17
6 0.14
7 0.1
8 0.09
9 0.1
10 0.1
11 0.14
12 0.16
13 0.17
14 0.19
15 0.19
16 0.18
17 0.18
18 0.2
19 0.21
20 0.22
21 0.25
22 0.27
23 0.27
24 0.28
25 0.28
26 0.29
27 0.33
28 0.34
29 0.35
30 0.32
31 0.35
32 0.36
33 0.38
34 0.36
35 0.32
36 0.32
37 0.28
38 0.32
39 0.32
40 0.33
41 0.37
42 0.39
43 0.37
44 0.35
45 0.35
46 0.32
47 0.32
48 0.29
49 0.22
50 0.2
51 0.18
52 0.15
53 0.23
54 0.23
55 0.23
56 0.27
57 0.3
58 0.3
59 0.34
60 0.4
61 0.3
62 0.31
63 0.31
64 0.31
65 0.29
66 0.26
67 0.25
68 0.21
69 0.21
70 0.19
71 0.18
72 0.13
73 0.12
74 0.12
75 0.1
76 0.08
77 0.1
78 0.13
79 0.14
80 0.19
81 0.22
82 0.23
83 0.27
84 0.35
85 0.42
86 0.42
87 0.42
88 0.37
89 0.36
90 0.4
91 0.39
92 0.33
93 0.26
94 0.23
95 0.25
96 0.29
97 0.31
98 0.3
99 0.31
100 0.3
101 0.34
102 0.35
103 0.34
104 0.34
105 0.39
106 0.44
107 0.44
108 0.43
109 0.39
110 0.4
111 0.37
112 0.32
113 0.24
114 0.17
115 0.14
116 0.13
117 0.12
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.07
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.08
133 0.11
134 0.12
135 0.14
136 0.15
137 0.16
138 0.18
139 0.2
140 0.23
141 0.23
142 0.25
143 0.25
144 0.26
145 0.26
146 0.25
147 0.24
148 0.2
149 0.18
150 0.17
151 0.15
152 0.14
153 0.12
154 0.12
155 0.11
156 0.11
157 0.08
158 0.07
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.11
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.13
173 0.12
174 0.1
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.03
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.04
185 0.06
186 0.07
187 0.08
188 0.09
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.12
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.1
207 0.15
208 0.18
209 0.17
210 0.17
211 0.18
212 0.18
213 0.18
214 0.18
215 0.12
216 0.11
217 0.1
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.09
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.09
236 0.11
237 0.11
238 0.12
239 0.15
240 0.15
241 0.17
242 0.19
243 0.18
244 0.17
245 0.2
246 0.2
247 0.16
248 0.16
249 0.15
250 0.13
251 0.15
252 0.13
253 0.11
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.1
261 0.1
262 0.11
263 0.12
264 0.13
265 0.14
266 0.19
267 0.23
268 0.25
269 0.28
270 0.32
271 0.32
272 0.4
273 0.41
274 0.37
275 0.32
276 0.29
277 0.26
278 0.24
279 0.21
280 0.12
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.06
286 0.05
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.09
305 0.1
306 0.11
307 0.12
308 0.17
309 0.25
310 0.28
311 0.28
312 0.29
313 0.3
314 0.3
315 0.29
316 0.23
317 0.16
318 0.12
319 0.13
320 0.12
321 0.13
322 0.14
323 0.17
324 0.25
325 0.23
326 0.27
327 0.29
328 0.33
329 0.38
330 0.45
331 0.44
332 0.37
333 0.43
334 0.45
335 0.44
336 0.46
337 0.43
338 0.42
339 0.43
340 0.5
341 0.48
342 0.44
343 0.45
344 0.42
345 0.41
346 0.36
347 0.34
348 0.3
349 0.29
350 0.27
351 0.22
352 0.18
353 0.14
354 0.14
355 0.13
356 0.09
357 0.06
358 0.07
359 0.08
360 0.07
361 0.07
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.08
368 0.1
369 0.11
370 0.12
371 0.13
372 0.17
373 0.18
374 0.18
375 0.19
376 0.18
377 0.17
378 0.17
379 0.16
380 0.13
381 0.18
382 0.19
383 0.18
384 0.2
385 0.2
386 0.21
387 0.23
388 0.25
389 0.25
390 0.28
391 0.37
392 0.43
393 0.52
394 0.6
395 0.67
396 0.74
397 0.77
398 0.8
399 0.79
400 0.78
401 0.74
402 0.68
403 0.66
404 0.61
405 0.51
406 0.44
407 0.36
408 0.29
409 0.24
410 0.19
411 0.11
412 0.06
413 0.06
414 0.05
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.09
422 0.11
423 0.1
424 0.11
425 0.12
426 0.11
427 0.15
428 0.19
429 0.21
430 0.23
431 0.24
432 0.28
433 0.3
434 0.32
435 0.3
436 0.26
437 0.25
438 0.22
439 0.21
440 0.16
441 0.13
442 0.11
443 0.09
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.06
448 0.07
449 0.07
450 0.09
451 0.14
452 0.2
453 0.22
454 0.25
455 0.3
456 0.35
457 0.37
458 0.37
459 0.35
460 0.32
461 0.33
462 0.36
463 0.36
464 0.33
465 0.34
466 0.38
467 0.38
468 0.39
469 0.42
470 0.44
471 0.47
472 0.54
473 0.56
474 0.6
475 0.62
476 0.64
477 0.66
478 0.68
479 0.7
480 0.7
481 0.75
482 0.76
483 0.77
484 0.8