Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0WZ40

Protein Details
Accession A0A4U0WZ40    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-43QQPPTPSKSRRSAKAKAKSTLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-40KSRRSAKAKAK
53-60KKKSGRRK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12, cyto 9, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012309  DNA_ligase_ATP-dep_C  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF04679  DNA_ligase_A_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
CDD cd07969  OBF_DNA_ligase_I  
Amino Acid Sequences VLDNLPNPDLLDEDGAAEQPTPQQPPTPSKSRRSAKAKAKSTLNNAEDGTEEKKKSGRRKALLATYEPDKRLDSWLKVKKDYNTSADTLDLVPIAAWHGMGRKSKWWSPILLAVRNPETGGLEAVTKCMSGFTDAFYKTHRERYDPEGDNVIDRPAYVEYSGPNPAVWFEPQEVWETAFADITLSPTYTAALGLVSQERGLSLRFPRFLKVRDDKSIDEASTADFLASLWRKQEAKTPVAAAHVTKGEGDEDEEED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.11
4 0.1
5 0.09
6 0.13
7 0.16
8 0.18
9 0.18
10 0.23
11 0.28
12 0.36
13 0.43
14 0.48
15 0.52
16 0.57
17 0.67
18 0.69
19 0.75
20 0.75
21 0.78
22 0.78
23 0.81
24 0.81
25 0.78
26 0.78
27 0.75
28 0.74
29 0.74
30 0.65
31 0.58
32 0.5
33 0.43
34 0.36
35 0.32
36 0.29
37 0.25
38 0.24
39 0.22
40 0.27
41 0.34
42 0.43
43 0.5
44 0.55
45 0.55
46 0.62
47 0.68
48 0.71
49 0.68
50 0.61
51 0.54
52 0.49
53 0.49
54 0.42
55 0.36
56 0.29
57 0.26
58 0.29
59 0.31
60 0.3
61 0.36
62 0.44
63 0.46
64 0.5
65 0.53
66 0.52
67 0.55
68 0.54
69 0.49
70 0.44
71 0.41
72 0.37
73 0.33
74 0.28
75 0.2
76 0.16
77 0.11
78 0.07
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.07
86 0.11
87 0.14
88 0.15
89 0.19
90 0.24
91 0.27
92 0.32
93 0.31
94 0.29
95 0.28
96 0.34
97 0.33
98 0.32
99 0.3
100 0.27
101 0.27
102 0.25
103 0.23
104 0.16
105 0.13
106 0.1
107 0.09
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.11
121 0.12
122 0.13
123 0.14
124 0.18
125 0.18
126 0.25
127 0.25
128 0.24
129 0.26
130 0.33
131 0.41
132 0.39
133 0.39
134 0.35
135 0.34
136 0.32
137 0.29
138 0.23
139 0.13
140 0.1
141 0.1
142 0.07
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.1
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.11
157 0.12
158 0.13
159 0.16
160 0.15
161 0.14
162 0.14
163 0.14
164 0.12
165 0.11
166 0.1
167 0.08
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.11
189 0.16
190 0.21
191 0.26
192 0.27
193 0.32
194 0.37
195 0.39
196 0.45
197 0.49
198 0.5
199 0.54
200 0.57
201 0.54
202 0.54
203 0.55
204 0.45
205 0.36
206 0.3
207 0.23
208 0.2
209 0.18
210 0.12
211 0.08
212 0.08
213 0.15
214 0.17
215 0.17
216 0.18
217 0.23
218 0.25
219 0.26
220 0.34
221 0.33
222 0.34
223 0.37
224 0.38
225 0.34
226 0.37
227 0.38
228 0.3
229 0.28
230 0.26
231 0.22
232 0.2
233 0.19
234 0.16
235 0.15
236 0.17