Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0X3G4

Protein Details
Accession A0A4U0X3G4    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
121-148LSPPESPQQRRGSRRRSRRDPYMITPLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
132-136GSRRR
Subcellular Location(s) extr 10, cyto 5, mito 4, cyto_nucl 4, nucl 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039745  Vps54  
IPR012501  Vps54_C  
IPR019515  VPS54_N  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000938  C:GARP complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF07928  Vps54  
PF10475  Vps54_N  
Amino Acid Sequences MLIYIAAISTLLQPPTVRTGLLPHTVASAASGHKVPSTRDIPPVTLTNIPHLEPSAFKPYLSHIGSLYDAYQRAKTDAESAPSQLFRKDKQVPKDEFMKLLDRGLRQDHPGGSRHGSISVLSPPESPQQRRGSRRRSRRDPYMITPLSTIPNVYFEENFQLENPRTFDVVSERAEILKPPQGSLSDVNDSTNGSANAPRKALATNAILQEKLSWYMDTVEVHLISSISSASTSFFAALGSLRELQSEAADSVTRIRSLREDLQRVDQDMAIGGLEVVRMRRRRENLRKLTQAIEQLSRVVDGVTRCEGLINSGDFDGAADQMDSLERLIAGQPEPSGTAEATDPDIIDLRRLKALDGISEGISQLRSRIGKGFESRFLEALLADLRNHVQSVPHRDTFQRWATASQRSRGDHSRVHSGPPAYLKTNDELRSDLLASLNSLNRLNHSKPATAAFREAVVREMKGLIRQHLPSSNDDDAESITSVSTRGGRQLSQQDKSAILARNLRALDPEVAEELLINIYTAVGEALRRLGVQVKVLLDVTSSVDLPPGSSAITSPLRSPNLGNTDEYLNKPMPALPPLGVQLQEEMSQALDMSSLLGQAVDVAQTQITKILKVRAEQTVRLPLQRFLRYFTLNRLFADECEAVSGRSGAPLKGVINQQIGDFVHILGELEKQRIAQTLDSDLWEARDFREADDAFLARILQAMTSDPTLWTKGNMVWEEIDGSPDANGALTGNNSVNGTRKEKIRNAIIDEQKYVLVESATSALRGIDRFENLIVSIPSIASDVSSVLLDYLKLFHSRSCQLVLGAGATRSAGLKNITTKHLALASQALSFIIALIPYIREFVRRHSASSNPALAEFDKVKRAYQDHQSGIHDKLVDIMGGRASTHINVMKKIDFDAIVDQQVSPYMATLTKETSTLHRVLSKHLPETNVMMIMEPVFRSYREQWGKAFGGVVVKTEAGKARLLRDAQLFDTKLSKIDGSGDIGTYICNIVREKPVNIPAPATLGATNGRVSSDIPITSSIEPKPP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.23
3 0.23
4 0.2
5 0.17
6 0.23
7 0.27
8 0.32
9 0.3
10 0.24
11 0.25
12 0.25
13 0.25
14 0.2
15 0.17
16 0.13
17 0.15
18 0.16
19 0.15
20 0.18
21 0.2
22 0.22
23 0.27
24 0.31
25 0.32
26 0.38
27 0.4
28 0.4
29 0.41
30 0.42
31 0.37
32 0.38
33 0.35
34 0.35
35 0.34
36 0.33
37 0.3
38 0.28
39 0.26
40 0.23
41 0.27
42 0.29
43 0.27
44 0.26
45 0.26
46 0.29
47 0.37
48 0.36
49 0.32
50 0.24
51 0.26
52 0.27
53 0.27
54 0.24
55 0.19
56 0.2
57 0.21
58 0.23
59 0.22
60 0.22
61 0.23
62 0.22
63 0.24
64 0.26
65 0.28
66 0.27
67 0.29
68 0.31
69 0.33
70 0.33
71 0.32
72 0.33
73 0.31
74 0.38
75 0.46
76 0.5
77 0.57
78 0.66
79 0.66
80 0.67
81 0.73
82 0.66
83 0.6
84 0.55
85 0.51
86 0.42
87 0.41
88 0.41
89 0.34
90 0.35
91 0.37
92 0.37
93 0.35
94 0.39
95 0.38
96 0.36
97 0.38
98 0.39
99 0.37
100 0.36
101 0.34
102 0.3
103 0.26
104 0.23
105 0.22
106 0.22
107 0.21
108 0.19
109 0.19
110 0.2
111 0.28
112 0.35
113 0.36
114 0.4
115 0.48
116 0.56
117 0.66
118 0.74
119 0.77
120 0.79
121 0.87
122 0.89
123 0.9
124 0.9
125 0.9
126 0.9
127 0.86
128 0.83
129 0.82
130 0.73
131 0.64
132 0.56
133 0.47
134 0.4
135 0.32
136 0.26
137 0.16
138 0.17
139 0.18
140 0.18
141 0.17
142 0.15
143 0.2
144 0.2
145 0.2
146 0.18
147 0.23
148 0.23
149 0.25
150 0.27
151 0.23
152 0.22
153 0.22
154 0.23
155 0.21
156 0.24
157 0.23
158 0.23
159 0.22
160 0.23
161 0.23
162 0.23
163 0.21
164 0.23
165 0.21
166 0.19
167 0.21
168 0.21
169 0.23
170 0.26
171 0.27
172 0.26
173 0.26
174 0.26
175 0.24
176 0.23
177 0.21
178 0.2
179 0.16
180 0.13
181 0.18
182 0.21
183 0.23
184 0.24
185 0.23
186 0.21
187 0.21
188 0.22
189 0.21
190 0.21
191 0.22
192 0.26
193 0.27
194 0.25
195 0.24
196 0.24
197 0.21
198 0.2
199 0.17
200 0.12
201 0.12
202 0.14
203 0.16
204 0.15
205 0.15
206 0.15
207 0.14
208 0.14
209 0.13
210 0.11
211 0.09
212 0.09
213 0.07
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.09
235 0.08
236 0.09
237 0.08
238 0.12
239 0.13
240 0.14
241 0.13
242 0.14
243 0.16
244 0.22
245 0.3
246 0.34
247 0.38
248 0.38
249 0.46
250 0.47
251 0.46
252 0.41
253 0.33
254 0.25
255 0.2
256 0.18
257 0.1
258 0.08
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.07
264 0.13
265 0.17
266 0.21
267 0.29
268 0.37
269 0.48
270 0.58
271 0.67
272 0.72
273 0.77
274 0.79
275 0.74
276 0.7
277 0.63
278 0.58
279 0.5
280 0.42
281 0.33
282 0.27
283 0.24
284 0.21
285 0.18
286 0.12
287 0.11
288 0.09
289 0.11
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.11
296 0.14
297 0.11
298 0.11
299 0.1
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.08
304 0.05
305 0.05
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.05
310 0.05
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.05
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.1
333 0.09
334 0.12
335 0.13
336 0.13
337 0.16
338 0.16
339 0.16
340 0.18
341 0.18
342 0.16
343 0.16
344 0.16
345 0.14
346 0.14
347 0.14
348 0.1
349 0.1
350 0.09
351 0.08
352 0.1
353 0.1
354 0.11
355 0.15
356 0.17
357 0.21
358 0.27
359 0.29
360 0.31
361 0.34
362 0.34
363 0.3
364 0.28
365 0.24
366 0.18
367 0.16
368 0.12
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.09
375 0.08
376 0.1
377 0.14
378 0.23
379 0.28
380 0.29
381 0.3
382 0.31
383 0.34
384 0.37
385 0.36
386 0.31
387 0.27
388 0.29
389 0.31
390 0.39
391 0.38
392 0.37
393 0.38
394 0.36
395 0.4
396 0.41
397 0.42
398 0.37
399 0.37
400 0.41
401 0.36
402 0.37
403 0.36
404 0.32
405 0.29
406 0.28
407 0.28
408 0.21
409 0.22
410 0.21
411 0.2
412 0.26
413 0.26
414 0.24
415 0.22
416 0.22
417 0.21
418 0.2
419 0.18
420 0.12
421 0.1
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.11
427 0.11
428 0.13
429 0.18
430 0.18
431 0.22
432 0.23
433 0.23
434 0.22
435 0.27
436 0.27
437 0.23
438 0.23
439 0.18
440 0.17
441 0.17
442 0.16
443 0.14
444 0.12
445 0.11
446 0.1
447 0.11
448 0.1
449 0.14
450 0.15
451 0.15
452 0.18
453 0.19
454 0.2
455 0.24
456 0.25
457 0.23
458 0.27
459 0.25
460 0.22
461 0.21
462 0.2
463 0.15
464 0.14
465 0.12
466 0.06
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.07
472 0.06
473 0.1
474 0.11
475 0.11
476 0.15
477 0.24
478 0.29
479 0.29
480 0.3
481 0.28
482 0.27
483 0.28
484 0.3
485 0.23
486 0.2
487 0.22
488 0.21
489 0.24
490 0.24
491 0.23
492 0.18
493 0.18
494 0.16
495 0.12
496 0.12
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.07
501 0.05
502 0.04
503 0.04
504 0.03
505 0.03
506 0.02
507 0.02
508 0.03
509 0.02
510 0.02
511 0.03
512 0.03
513 0.03
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.08
518 0.08
519 0.09
520 0.11
521 0.11
522 0.11
523 0.12
524 0.11
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.06
529 0.06
530 0.05
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.06
535 0.05
536 0.04
537 0.04
538 0.04
539 0.08
540 0.1
541 0.11
542 0.12
543 0.16
544 0.17
545 0.17
546 0.18
547 0.19
548 0.22
549 0.22
550 0.21
551 0.18
552 0.2
553 0.21
554 0.22
555 0.2
556 0.15
557 0.14
558 0.14
559 0.14
560 0.13
561 0.13
562 0.13
563 0.11
564 0.12
565 0.13
566 0.13
567 0.12
568 0.11
569 0.1
570 0.09
571 0.1
572 0.09
573 0.07
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.05
578 0.04
579 0.03
580 0.04
581 0.03
582 0.03
583 0.03
584 0.03
585 0.03
586 0.03
587 0.03
588 0.03
589 0.03
590 0.03
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.08
595 0.08
596 0.09
597 0.1
598 0.15
599 0.17
600 0.19
601 0.22
602 0.26
603 0.28
604 0.29
605 0.3
606 0.34
607 0.33
608 0.35
609 0.33
610 0.3
611 0.34
612 0.37
613 0.35
614 0.3
615 0.33
616 0.33
617 0.33
618 0.37
619 0.37
620 0.33
621 0.33
622 0.33
623 0.29
624 0.26
625 0.3
626 0.22
627 0.15
628 0.15
629 0.15
630 0.12
631 0.11
632 0.12
633 0.06
634 0.1
635 0.1
636 0.09
637 0.09
638 0.11
639 0.11
640 0.15
641 0.17
642 0.16
643 0.17
644 0.18
645 0.17
646 0.18
647 0.17
648 0.14
649 0.13
650 0.1
651 0.08
652 0.08
653 0.08
654 0.06
655 0.09
656 0.09
657 0.1
658 0.1
659 0.1
660 0.11
661 0.14
662 0.15
663 0.13
664 0.13
665 0.16
666 0.16
667 0.16
668 0.17
669 0.14
670 0.14
671 0.14
672 0.13
673 0.1
674 0.15
675 0.15
676 0.14
677 0.22
678 0.21
679 0.21
680 0.22
681 0.22
682 0.16
683 0.16
684 0.15
685 0.07
686 0.08
687 0.07
688 0.05
689 0.05
690 0.06
691 0.07
692 0.08
693 0.08
694 0.08
695 0.1
696 0.11
697 0.11
698 0.11
699 0.11
700 0.13
701 0.18
702 0.18
703 0.18
704 0.16
705 0.16
706 0.18
707 0.16
708 0.15
709 0.1
710 0.09
711 0.08
712 0.08
713 0.07
714 0.05
715 0.05
716 0.04
717 0.04
718 0.05
719 0.06
720 0.07
721 0.07
722 0.08
723 0.09
724 0.13
725 0.17
726 0.21
727 0.23
728 0.28
729 0.35
730 0.4
731 0.46
732 0.48
733 0.48
734 0.51
735 0.56
736 0.57
737 0.52
738 0.48
739 0.43
740 0.36
741 0.32
742 0.25
743 0.17
744 0.1
745 0.07
746 0.07
747 0.09
748 0.08
749 0.08
750 0.08
751 0.08
752 0.09
753 0.1
754 0.12
755 0.12
756 0.12
757 0.14
758 0.14
759 0.14
760 0.13
761 0.15
762 0.12
763 0.1
764 0.09
765 0.08
766 0.08
767 0.08
768 0.07
769 0.05
770 0.05
771 0.05
772 0.05
773 0.05
774 0.05
775 0.05
776 0.06
777 0.06
778 0.06
779 0.07
780 0.08
781 0.1
782 0.1
783 0.12
784 0.17
785 0.2
786 0.22
787 0.23
788 0.23
789 0.21
790 0.22
791 0.2
792 0.16
793 0.15
794 0.12
795 0.1
796 0.09
797 0.09
798 0.08
799 0.08
800 0.09
801 0.09
802 0.12
803 0.18
804 0.21
805 0.24
806 0.26
807 0.26
808 0.26
809 0.27
810 0.24
811 0.2
812 0.2
813 0.18
814 0.16
815 0.15
816 0.13
817 0.11
818 0.1
819 0.09
820 0.06
821 0.04
822 0.04
823 0.05
824 0.06
825 0.06
826 0.08
827 0.08
828 0.13
829 0.14
830 0.2
831 0.3
832 0.31
833 0.34
834 0.36
835 0.41
836 0.42
837 0.47
838 0.44
839 0.34
840 0.33
841 0.32
842 0.28
843 0.28
844 0.25
845 0.22
846 0.25
847 0.26
848 0.27
849 0.3
850 0.34
851 0.36
852 0.42
853 0.47
854 0.45
855 0.48
856 0.51
857 0.49
858 0.47
859 0.44
860 0.35
861 0.26
862 0.25
863 0.21
864 0.17
865 0.14
866 0.13
867 0.11
868 0.11
869 0.11
870 0.09
871 0.1
872 0.1
873 0.14
874 0.18
875 0.19
876 0.22
877 0.25
878 0.27
879 0.26
880 0.27
881 0.25
882 0.21
883 0.2
884 0.22
885 0.21
886 0.21
887 0.21
888 0.19
889 0.16
890 0.17
891 0.16
892 0.11
893 0.09
894 0.09
895 0.1
896 0.11
897 0.13
898 0.15
899 0.15
900 0.16
901 0.17
902 0.21
903 0.24
904 0.25
905 0.26
906 0.28
907 0.29
908 0.34
909 0.42
910 0.42
911 0.43
912 0.44
913 0.43
914 0.4
915 0.43
916 0.38
917 0.31
918 0.26
919 0.2
920 0.18
921 0.17
922 0.16
923 0.13
924 0.13
925 0.11
926 0.12
927 0.18
928 0.21
929 0.31
930 0.37
931 0.4
932 0.4
933 0.46
934 0.46
935 0.41
936 0.39
937 0.29
938 0.28
939 0.25
940 0.25
941 0.19
942 0.18
943 0.17
944 0.19
945 0.21
946 0.17
947 0.21
948 0.22
949 0.25
950 0.31
951 0.32
952 0.34
953 0.35
954 0.37
955 0.36
956 0.41
957 0.38
958 0.33
959 0.35
960 0.32
961 0.28
962 0.27
963 0.24
964 0.17
965 0.2
966 0.21
967 0.21
968 0.22
969 0.2
970 0.19
971 0.18
972 0.17
973 0.14
974 0.13
975 0.1
976 0.11
977 0.12
978 0.16
979 0.25
980 0.29
981 0.31
982 0.38
983 0.45
984 0.48
985 0.47
986 0.45
987 0.37
988 0.37
989 0.35
990 0.29
991 0.22
992 0.18
993 0.19
994 0.18
995 0.19
996 0.15
997 0.15
998 0.14
999 0.14
1000 0.17
1001 0.18
1002 0.17
1003 0.17
1004 0.19
1005 0.22
1006 0.24
1007 0.27