Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V5NJH3

Protein Details
Accession A0A4V5NJH3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-133QEVDEKMDKRRRARREAREQKEREEYEBasic
164-186VGDLTGKNRRTKQQQRQRFYAVPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-126KRRRARREAREQ
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_mito 9.333, mito 8, mito_nucl 7.833, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
Amino Acid Sequences MSGRKDFLSQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEDQIKEALAKRAAQLGAAPPTAYGAPEKKDHDDDDEDRYQDPDNEVGLFANGSYDRDDDEADRIFQEVDEKMDKRRRARREAREQKEREEYERNNPKIQQQFADLKRALGSITDEEWANIPEVGDLTGKNRRTKQQQRQRFYAVPDSVIAGARDSTQFETSVSEDGAQTNGGATEVVDGTMTNFADIGAARDKVLRVRLDQAAQGSGTESVSGTSTNIDPKGYLTSLSKSEIKASEIPVGDVKRARVLLESVIKTNPKHGPGWIAAARLEEVAGKIVAARNVIARGCENCPKNEDVWLESIRLNENHNAKIIVANAIMNNDRSVRLWIEAMKLETGVREKKRVLRRALDAVPQSVAIWKEAVNLEEDPADARLLLAKATEIIPLAVELWLALARLETPENAQLVLNKARKAVPTSHEVWIAAARLQEQLGASGMVLKVMERAVKSLAKESAMLKREEWIAEAEKCEEEGAVLTCGAIIRETLGWSLDEDDDRKKVWMDDAKASIGRGKYETARSIYAYALRVFPTRKSIWLAAADLERNHGTKEALWQLLEKAVEACPQSSVLWMQLAKEKWQVGEFHEARLVLARAFNQNPNNEDIWLAAVKLEADNNQTDQVRDLLSTARREAGTDRVWIKSVAFERQLGNTDAALDFVNQGLQLYPKAAKLWMMKGQIYESMSMLPQAREAYSAGTRACPQSVPLWLLASRLDEREGKVVKARSVLDRARLAVPKNGQLWTESVRLERRAGNTTAANQKMAQALQEVPDSGLLWTEKIWHLEPRTQRKPRSLEAIKKVETDPVLFVTVARIFWGERRLDKALGWFQRALVLDSDNGDVWAWYYKFLLQHGTEEKREEVVSKCVLNEPKHGEVWQSVAKDPKNAGKSIEEILKIAVEKLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.31
3 0.28
4 0.25
5 0.2
6 0.15
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.28
37 0.3
38 0.3
39 0.36
40 0.35
41 0.29
42 0.27
43 0.26
44 0.28
45 0.27
46 0.25
47 0.19
48 0.2
49 0.2
50 0.18
51 0.18
52 0.18
53 0.21
54 0.26
55 0.31
56 0.34
57 0.39
58 0.4
59 0.41
60 0.44
61 0.43
62 0.45
63 0.46
64 0.42
65 0.38
66 0.37
67 0.33
68 0.28
69 0.28
70 0.22
71 0.18
72 0.18
73 0.17
74 0.16
75 0.15
76 0.12
77 0.09
78 0.1
79 0.09
80 0.09
81 0.11
82 0.11
83 0.12
84 0.13
85 0.15
86 0.13
87 0.17
88 0.18
89 0.17
90 0.17
91 0.16
92 0.15
93 0.14
94 0.16
95 0.13
96 0.16
97 0.21
98 0.22
99 0.3
100 0.38
101 0.45
102 0.51
103 0.6
104 0.65
105 0.7
106 0.79
107 0.82
108 0.85
109 0.9
110 0.9
111 0.91
112 0.85
113 0.82
114 0.81
115 0.73
116 0.68
117 0.66
118 0.61
119 0.61
120 0.68
121 0.64
122 0.6
123 0.59
124 0.61
125 0.59
126 0.58
127 0.5
128 0.46
129 0.52
130 0.49
131 0.55
132 0.47
133 0.4
134 0.38
135 0.35
136 0.29
137 0.2
138 0.2
139 0.14
140 0.15
141 0.15
142 0.14
143 0.14
144 0.15
145 0.15
146 0.13
147 0.1
148 0.09
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.12
155 0.19
156 0.24
157 0.3
158 0.36
159 0.43
160 0.53
161 0.64
162 0.71
163 0.75
164 0.81
165 0.82
166 0.84
167 0.83
168 0.77
169 0.71
170 0.69
171 0.59
172 0.49
173 0.42
174 0.36
175 0.29
176 0.26
177 0.21
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.12
183 0.13
184 0.13
185 0.13
186 0.13
187 0.15
188 0.15
189 0.15
190 0.13
191 0.12
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.09
196 0.08
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.06
208 0.09
209 0.09
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.11
219 0.12
220 0.13
221 0.16
222 0.21
223 0.2
224 0.2
225 0.25
226 0.28
227 0.28
228 0.3
229 0.28
230 0.24
231 0.21
232 0.19
233 0.15
234 0.12
235 0.1
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.06
242 0.07
243 0.08
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.11
248 0.12
249 0.15
250 0.14
251 0.15
252 0.14
253 0.16
254 0.18
255 0.21
256 0.22
257 0.19
258 0.23
259 0.23
260 0.24
261 0.24
262 0.24
263 0.26
264 0.24
265 0.25
266 0.24
267 0.24
268 0.23
269 0.22
270 0.21
271 0.19
272 0.19
273 0.19
274 0.16
275 0.16
276 0.18
277 0.24
278 0.24
279 0.23
280 0.25
281 0.27
282 0.26
283 0.31
284 0.3
285 0.26
286 0.26
287 0.25
288 0.27
289 0.25
290 0.32
291 0.27
292 0.24
293 0.21
294 0.21
295 0.2
296 0.16
297 0.14
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.05
303 0.06
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.11
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.13
314 0.16
315 0.22
316 0.23
317 0.23
318 0.26
319 0.27
320 0.26
321 0.28
322 0.26
323 0.21
324 0.24
325 0.23
326 0.22
327 0.2
328 0.21
329 0.18
330 0.18
331 0.18
332 0.19
333 0.22
334 0.21
335 0.21
336 0.2
337 0.18
338 0.18
339 0.17
340 0.13
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.1
345 0.11
346 0.1
347 0.1
348 0.09
349 0.09
350 0.09
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.12
355 0.12
356 0.14
357 0.15
358 0.14
359 0.13
360 0.12
361 0.11
362 0.11
363 0.14
364 0.19
365 0.19
366 0.22
367 0.25
368 0.33
369 0.42
370 0.49
371 0.51
372 0.49
373 0.52
374 0.55
375 0.55
376 0.52
377 0.44
378 0.37
379 0.31
380 0.25
381 0.21
382 0.16
383 0.14
384 0.09
385 0.08
386 0.08
387 0.1
388 0.1
389 0.11
390 0.1
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.1
395 0.08
396 0.07
397 0.07
398 0.05
399 0.05
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.06
406 0.06
407 0.07
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.04
414 0.04
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.04
423 0.05
424 0.05
425 0.06
426 0.08
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.09
431 0.11
432 0.19
433 0.2
434 0.19
435 0.2
436 0.21
437 0.22
438 0.24
439 0.25
440 0.21
441 0.23
442 0.26
443 0.26
444 0.25
445 0.24
446 0.21
447 0.18
448 0.16
449 0.12
450 0.09
451 0.08
452 0.08
453 0.07
454 0.08
455 0.07
456 0.07
457 0.06
458 0.05
459 0.05
460 0.06
461 0.06
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.07
468 0.06
469 0.07
470 0.09
471 0.11
472 0.12
473 0.14
474 0.14
475 0.14
476 0.15
477 0.16
478 0.21
479 0.21
480 0.22
481 0.19
482 0.2
483 0.21
484 0.19
485 0.18
486 0.13
487 0.14
488 0.14
489 0.14
490 0.14
491 0.12
492 0.12
493 0.11
494 0.09
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.04
505 0.03
506 0.04
507 0.04
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.06
512 0.06
513 0.08
514 0.07
515 0.08
516 0.09
517 0.11
518 0.11
519 0.12
520 0.12
521 0.11
522 0.11
523 0.16
524 0.2
525 0.21
526 0.24
527 0.26
528 0.27
529 0.26
530 0.26
531 0.24
532 0.19
533 0.17
534 0.14
535 0.14
536 0.15
537 0.18
538 0.21
539 0.2
540 0.2
541 0.2
542 0.2
543 0.19
544 0.19
545 0.17
546 0.16
547 0.15
548 0.14
549 0.16
550 0.16
551 0.17
552 0.2
553 0.19
554 0.2
555 0.23
556 0.23
557 0.23
558 0.24
559 0.23
560 0.19
561 0.19
562 0.18
563 0.15
564 0.16
565 0.14
566 0.13
567 0.12
568 0.11
569 0.1
570 0.1
571 0.15
572 0.17
573 0.17
574 0.17
575 0.17
576 0.17
577 0.19
578 0.18
579 0.13
580 0.1
581 0.09
582 0.12
583 0.12
584 0.11
585 0.09
586 0.11
587 0.1
588 0.1
589 0.1
590 0.08
591 0.1
592 0.1
593 0.11
594 0.15
595 0.16
596 0.17
597 0.2
598 0.2
599 0.19
600 0.21
601 0.21
602 0.19
603 0.29
604 0.27
605 0.24
606 0.25
607 0.24
608 0.22
609 0.23
610 0.21
611 0.1
612 0.11
613 0.12
614 0.15
615 0.17
616 0.22
617 0.24
618 0.26
619 0.28
620 0.3
621 0.29
622 0.25
623 0.23
624 0.18
625 0.16
626 0.13
627 0.11
628 0.07
629 0.07
630 0.07
631 0.07
632 0.08
633 0.07
634 0.09
635 0.1
636 0.11
637 0.14
638 0.15
639 0.14
640 0.15
641 0.15
642 0.13
643 0.12
644 0.12
645 0.13
646 0.16
647 0.18
648 0.18
649 0.2
650 0.2
651 0.21
652 0.22
653 0.23
654 0.22
655 0.25
656 0.26
657 0.24
658 0.25
659 0.25
660 0.23
661 0.22
662 0.23
663 0.22
664 0.22
665 0.23
666 0.23
667 0.25
668 0.28
669 0.24
670 0.22
671 0.17
672 0.17
673 0.14
674 0.14
675 0.12
676 0.09
677 0.08
678 0.07
679 0.07
680 0.06
681 0.06
682 0.06
683 0.07
684 0.07
685 0.09
686 0.1
687 0.11
688 0.12
689 0.12
690 0.17
691 0.19
692 0.24
693 0.29
694 0.31
695 0.31
696 0.31
697 0.32
698 0.3
699 0.28
700 0.23
701 0.17
702 0.15
703 0.13
704 0.15
705 0.15
706 0.12
707 0.13
708 0.13
709 0.13
710 0.13
711 0.13
712 0.14
713 0.14
714 0.17
715 0.15
716 0.16
717 0.18
718 0.19
719 0.19
720 0.16
721 0.16
722 0.17
723 0.2
724 0.2
725 0.19
726 0.19
727 0.18
728 0.19
729 0.18
730 0.19
731 0.17
732 0.16
733 0.18
734 0.18
735 0.2
736 0.26
737 0.27
738 0.25
739 0.3
740 0.32
741 0.31
742 0.34
743 0.35
744 0.32
745 0.38
746 0.4
747 0.39
748 0.39
749 0.39
750 0.4
751 0.41
752 0.38
753 0.37
754 0.37
755 0.37
756 0.37
757 0.36
758 0.31
759 0.29
760 0.3
761 0.27
762 0.27
763 0.23
764 0.24
765 0.27
766 0.29
767 0.31
768 0.32
769 0.32
770 0.34
771 0.34
772 0.34
773 0.32
774 0.36
775 0.41
776 0.38
777 0.36
778 0.31
779 0.31
780 0.31
781 0.28
782 0.23
783 0.17
784 0.16
785 0.17
786 0.18
787 0.16
788 0.13
789 0.14
790 0.14
791 0.11
792 0.13
793 0.11
794 0.1
795 0.1
796 0.13
797 0.15
798 0.18
799 0.2
800 0.24
801 0.27
802 0.34
803 0.44
804 0.51
805 0.59
806 0.65
807 0.69
808 0.72
809 0.75
810 0.73
811 0.74
812 0.73
813 0.73
814 0.74
815 0.76
816 0.69
817 0.65
818 0.6
819 0.54
820 0.46
821 0.38
822 0.3
823 0.24
824 0.23
825 0.2
826 0.19
827 0.18
828 0.18
829 0.16
830 0.14
831 0.13
832 0.12
833 0.16
834 0.22
835 0.23
836 0.24
837 0.3
838 0.33
839 0.34
840 0.34
841 0.39
842 0.42
843 0.43
844 0.44
845 0.39
846 0.35
847 0.39
848 0.39
849 0.33
850 0.26
851 0.22
852 0.18
853 0.19
854 0.21
855 0.16
856 0.15
857 0.13
858 0.11
859 0.1
860 0.16
861 0.14
862 0.14
863 0.15
864 0.17
865 0.2
866 0.21
867 0.27
868 0.22
869 0.29
870 0.36
871 0.41
872 0.41
873 0.43
874 0.42
875 0.38
876 0.37
877 0.34
878 0.29
879 0.29
880 0.3
881 0.28
882 0.28
883 0.33
884 0.4
885 0.39
886 0.44
887 0.45
888 0.45
889 0.46
890 0.45
891 0.41
892 0.35
893 0.38
894 0.35
895 0.31
896 0.3
897 0.35
898 0.36
899 0.38
900 0.41
901 0.44
902 0.43
903 0.42
904 0.42
905 0.38
906 0.39
907 0.4
908 0.42
909 0.34
910 0.3
911 0.29
912 0.28
913 0.25