Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0XWC9

Protein Details
Accession A0A4U0XWC9    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-60ATPAPAKKSAAKKKTPKPKVEEASEAHydrophilic
65-86ITPASSRKRTRAPVKKEEDPDEHydrophilic
107-129EAEPSPQKKRARTSKSKKSEDVEHydrophilic
466-495VDGAGKKGKAKNGKAKKEKGKKRAVSEESSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
39-79PAKKSAAKKKTPKPKVEEASEARAEPITPASSRKRTRAPVK
114-123KKRARTSKSK
147-152AKKAKK
462-488RKGGVDGAGKKGKAKNGKAKKEKGKKR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito_nucl 12.166, mito 10, cyto_nucl 9.166, cyto_mito 7.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MSTRTTRSAAAASVVKTQEALKVEEEPQQLSSPPATPAPAKKSAAKKKTPKPKVEEASEARAEPITPASSRKRTRAPVKKEEDPDELPHNLGPPTTNGDAKVEAAEEAEPSPQKKRARTSKSKKSEDVESLVAKAATVADTAKSSPAKKAKKAKDTSYGLTPGQTPYPDWPHPTPEECQEVNRILSKAHGEVKAPKTIPMPSLEVSGCGEVPSVLDALIRTRLSAATTGANSSRAFQGLVKTFGIIQEGVGKGSVDWDKVRRADLSEVFEAIKSGGLAKVKSKDIKDILQRVYEENQARKDTYKEAEASNKSSGPAGADNASEEDKKAEVERAESNVLSLDHLHMLSNDEAFAQLVKYPGIDPKTASCVLLFCLQRPSFAVDTHVFRLCKYLRWVPPDKATRNSTYAHCEVRVPDDLKYPLHQLLIRHGKSCPRCRAATGEGGGSWKDGCPIDHLVTRTGARKGGVDGAGKKGKAKNGKAKKEKGKKRAVSEESSELSDVASEDLTSEEEAPSDLEMEDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.26
3 0.25
4 0.25
5 0.25
6 0.23
7 0.24
8 0.19
9 0.23
10 0.26
11 0.32
12 0.33
13 0.29
14 0.29
15 0.28
16 0.27
17 0.25
18 0.25
19 0.19
20 0.2
21 0.2
22 0.2
23 0.24
24 0.31
25 0.36
26 0.41
27 0.42
28 0.48
29 0.57
30 0.65
31 0.7
32 0.73
33 0.76
34 0.79
35 0.87
36 0.89
37 0.88
38 0.86
39 0.86
40 0.85
41 0.8
42 0.8
43 0.74
44 0.71
45 0.64
46 0.56
47 0.46
48 0.38
49 0.32
50 0.24
51 0.21
52 0.16
53 0.15
54 0.21
55 0.28
56 0.38
57 0.43
58 0.48
59 0.54
60 0.61
61 0.71
62 0.76
63 0.77
64 0.78
65 0.81
66 0.83
67 0.81
68 0.77
69 0.73
70 0.66
71 0.6
72 0.54
73 0.47
74 0.39
75 0.33
76 0.29
77 0.23
78 0.19
79 0.16
80 0.13
81 0.18
82 0.19
83 0.2
84 0.19
85 0.2
86 0.21
87 0.2
88 0.19
89 0.14
90 0.11
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.11
96 0.12
97 0.14
98 0.18
99 0.25
100 0.3
101 0.36
102 0.45
103 0.53
104 0.62
105 0.72
106 0.78
107 0.82
108 0.87
109 0.88
110 0.84
111 0.77
112 0.74
113 0.67
114 0.6
115 0.53
116 0.44
117 0.37
118 0.32
119 0.27
120 0.2
121 0.15
122 0.11
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.06
127 0.07
128 0.08
129 0.12
130 0.14
131 0.15
132 0.22
133 0.31
134 0.38
135 0.45
136 0.56
137 0.61
138 0.69
139 0.74
140 0.73
141 0.74
142 0.72
143 0.67
144 0.61
145 0.55
146 0.45
147 0.39
148 0.34
149 0.25
150 0.22
151 0.19
152 0.15
153 0.17
154 0.23
155 0.24
156 0.28
157 0.28
158 0.31
159 0.34
160 0.35
161 0.33
162 0.3
163 0.34
164 0.29
165 0.29
166 0.28
167 0.26
168 0.25
169 0.26
170 0.22
171 0.16
172 0.18
173 0.18
174 0.17
175 0.21
176 0.21
177 0.19
178 0.27
179 0.3
180 0.34
181 0.33
182 0.32
183 0.29
184 0.29
185 0.29
186 0.24
187 0.24
188 0.18
189 0.21
190 0.18
191 0.17
192 0.16
193 0.15
194 0.12
195 0.09
196 0.08
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.12
218 0.11
219 0.12
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.14
225 0.14
226 0.16
227 0.15
228 0.14
229 0.14
230 0.14
231 0.14
232 0.09
233 0.07
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.07
240 0.1
241 0.11
242 0.08
243 0.09
244 0.11
245 0.15
246 0.16
247 0.17
248 0.15
249 0.16
250 0.19
251 0.2
252 0.22
253 0.19
254 0.19
255 0.18
256 0.18
257 0.16
258 0.12
259 0.09
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.07
264 0.08
265 0.11
266 0.14
267 0.17
268 0.21
269 0.22
270 0.25
271 0.27
272 0.32
273 0.35
274 0.39
275 0.37
276 0.36
277 0.36
278 0.33
279 0.32
280 0.33
281 0.3
282 0.27
283 0.29
284 0.27
285 0.28
286 0.27
287 0.27
288 0.25
289 0.23
290 0.23
291 0.21
292 0.21
293 0.28
294 0.29
295 0.3
296 0.28
297 0.27
298 0.24
299 0.22
300 0.2
301 0.15
302 0.13
303 0.11
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.11
308 0.12
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.1
315 0.12
316 0.11
317 0.14
318 0.16
319 0.17
320 0.19
321 0.18
322 0.17
323 0.15
324 0.15
325 0.12
326 0.1
327 0.09
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.07
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.08
346 0.12
347 0.14
348 0.15
349 0.15
350 0.16
351 0.22
352 0.22
353 0.21
354 0.17
355 0.15
356 0.16
357 0.22
358 0.2
359 0.16
360 0.24
361 0.24
362 0.24
363 0.25
364 0.28
365 0.23
366 0.23
367 0.27
368 0.21
369 0.25
370 0.27
371 0.31
372 0.26
373 0.24
374 0.31
375 0.28
376 0.3
377 0.32
378 0.38
379 0.39
380 0.47
381 0.54
382 0.51
383 0.6
384 0.64
385 0.62
386 0.6
387 0.59
388 0.55
389 0.52
390 0.5
391 0.44
392 0.42
393 0.42
394 0.38
395 0.34
396 0.31
397 0.3
398 0.31
399 0.35
400 0.29
401 0.27
402 0.3
403 0.31
404 0.31
405 0.32
406 0.31
407 0.26
408 0.27
409 0.28
410 0.23
411 0.31
412 0.4
413 0.39
414 0.37
415 0.38
416 0.43
417 0.5
418 0.59
419 0.58
420 0.53
421 0.54
422 0.55
423 0.6
424 0.56
425 0.54
426 0.46
427 0.38
428 0.33
429 0.33
430 0.3
431 0.23
432 0.19
433 0.12
434 0.13
435 0.13
436 0.12
437 0.15
438 0.2
439 0.23
440 0.26
441 0.28
442 0.27
443 0.29
444 0.31
445 0.31
446 0.29
447 0.28
448 0.25
449 0.25
450 0.25
451 0.28
452 0.29
453 0.29
454 0.3
455 0.36
456 0.4
457 0.39
458 0.42
459 0.41
460 0.45
461 0.5
462 0.57
463 0.6
464 0.65
465 0.76
466 0.81
467 0.87
468 0.9
469 0.91
470 0.92
471 0.91
472 0.92
473 0.89
474 0.88
475 0.88
476 0.84
477 0.8
478 0.75
479 0.71
480 0.62
481 0.56
482 0.47
483 0.36
484 0.29
485 0.22
486 0.17
487 0.11
488 0.09
489 0.07
490 0.07
491 0.08
492 0.09
493 0.09
494 0.1
495 0.09
496 0.09
497 0.1
498 0.1
499 0.1
500 0.1