FuNGI

A0A4U0X8Z6

Protein Details

Accession

A0A4U0X8Z6

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-52	GGAVPPRRKKPVNPLVSKKSTVRKPPRQATPSTV	Hydrophilic
135-158	DESKFTRPIRLHRRDPRARPDKHI	Basic
420-451	EEIAKRKAAERRKKEKKVRKNLIKREKKYEYD	Basic
538-564	EASGTESSRKKQKKKHPLDRPSNSGSA	Hydrophilic
621-644	TETDGGKRKRKLKLKVKTPANGSP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
24-43	PRRKKPVNPLVSKKSTVRKP
424-447	KRKAAERRKKEKKVRKNLIKREKK
472-532	RRKEDERKKEEERKEAEKSKSGDKIPSGASSKGTNTPSGRSEKRSDPSKPKHSSTSLKRPG
544-555	SSRKKQKKKHPL
626-638	GKRKRKLKLKVKT

Subcellular Location(s)

nucl 22, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSASPAGAPFEPNSTTPNGGAVPPRRKKPVNPLVSKKSTVRKPPRQATPSTVVNGVSGTPNGGAQHAPLRQSAGPQTVQDKYGPLPDMDVGGTHDVPDVGGYTDYPIVMTKKSMMEGLRHHAMRFATKEEIRPYDESKFTRPIRLHRRDPRARPDKHIDPTLDPTMDDKEREKQEILKAQRQAQREANQAQMAPVQKAAASQVKRTPFQKKTEQVYRTDDTPESKKWMLLRYEEGRPWHLEDFDNKNTWVGTYEEALSECHVMFVIEDGSFRMVPIEKWYKFSAVGRVKNSLTIDEAEARMSMKTKDTRWFMDTQKANEEKRREQAIRIRTMNKARQGMRGEGKMEGDEEDRERPDLAEDVDDIDYDHNEDFQDDDQDRLFEGDDEDAKDAEERIKREQQQANIFAGTGVKEDKDWDEEEEIAKRKAAERRKKEKKVRKNLIKREKKYEYDSEEESNDYTEESESEDSETERRKEDERKKEEERKEAEKSKSGDKIPSGASSKGTNTPSGRSEKRSDPSKPKHSSTSLKRPGSPNLSEASGTESSRKKQKKKHPLDRPSNSGSAPPSRAMSPEGTSKAPSLSRKSSVVEFNLDPKKLTQIFSAAPRPDRLQPGMAGSGSDTETDGGKRKRKLKLKVKTPANGSPNGSRAGSPDNAGISGGSRATSPAAAAPPKKLPMPSVEEVAQYIPAEGTTLAHLIKIFKGRMHDRGAFVSVVKMCTRFDHATKKLFPKGTPGTAGPPLDPAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.24
3	0.22
4	0.24
5	0.21
6	0.21
7	0.29
8	0.35
9	0.42
10	0.48
11	0.55
12	0.62
13	0.66
14	0.72
15	0.75
16	0.76
17	0.76
18	0.78
19	0.81
20	0.82
21	0.83
22	0.8
23	0.76
24	0.75
25	0.73
26	0.74
27	0.75
28	0.76
29	0.8
30	0.85
31	0.89
32	0.85
33	0.81
34	0.78
35	0.74
36	0.69
37	0.6
38	0.52
39	0.42
40	0.36
41	0.31
42	0.24
43	0.19
44	0.13
45	0.12
46	0.1
47	0.11
48	0.11
49	0.12
50	0.11
51	0.11
52	0.18
53	0.2
54	0.21
55	0.2
56	0.24
57	0.24
58	0.28
59	0.31
60	0.29
61	0.28
62	0.29
63	0.33
64	0.31
65	0.32
66	0.29
67	0.26
68	0.23
69	0.27
70	0.26
71	0.21
72	0.21
73	0.2
74	0.2
75	0.18
76	0.17
77	0.13
78	0.14
79	0.14
80	0.13
81	0.12
82	0.11
83	0.11
84	0.1
85	0.09
86	0.07
87	0.07
88	0.07
89	0.09
90	0.09
91	0.09
92	0.09
93	0.11
94	0.12
95	0.13
96	0.14
97	0.15
98	0.16
99	0.17
100	0.21
101	0.2
102	0.23
103	0.27
104	0.33
105	0.37
106	0.36
107	0.35
108	0.36
109	0.35
110	0.36
111	0.34
112	0.31
113	0.31
114	0.32
115	0.37
116	0.39
117	0.42
118	0.4
119	0.41
120	0.41
121	0.4
122	0.44
123	0.42
124	0.41
125	0.46
126	0.44
127	0.49
128	0.49
129	0.53
130	0.58
131	0.64
132	0.69
133	0.7
134	0.79
135	0.82
136	0.86
137	0.87
138	0.86
139	0.81
140	0.79
141	0.78
142	0.76
143	0.72
144	0.69
145	0.61
146	0.55
147	0.57
148	0.53
149	0.44
150	0.35
151	0.31
152	0.3
153	0.28
154	0.26
155	0.23
156	0.27
157	0.3
158	0.33
159	0.33
160	0.33
161	0.39
162	0.46
163	0.5
164	0.49
165	0.5
166	0.55
167	0.59
168	0.57
169	0.55
170	0.54
171	0.52
172	0.53
173	0.51
174	0.47
175	0.43
176	0.4
177	0.35
178	0.31
179	0.27
180	0.2
181	0.18
182	0.14
183	0.12
184	0.12
185	0.15
186	0.19
187	0.18
188	0.22
189	0.27
190	0.31
191	0.35
192	0.39
193	0.46
194	0.45
195	0.51
196	0.57
197	0.59
198	0.63
199	0.69
200	0.68
201	0.63
202	0.63
203	0.59
204	0.51
205	0.46
206	0.39
207	0.34
208	0.35
209	0.32
210	0.31
211	0.29
212	0.3
213	0.3
214	0.34
215	0.33
216	0.32
217	0.36
218	0.35
219	0.4
220	0.4
221	0.39
222	0.36
223	0.34
224	0.34
225	0.29
226	0.26
227	0.22
228	0.25
229	0.3
230	0.31
231	0.31
232	0.28
233	0.27
234	0.25
235	0.24
236	0.2
237	0.14
238	0.11
239	0.1
240	0.11
241	0.11
242	0.11
243	0.11
244	0.1
245	0.1
246	0.09
247	0.07
248	0.06
249	0.06
250	0.05
251	0.06
252	0.06
253	0.05
254	0.05
255	0.06
256	0.07
257	0.07
258	0.07
259	0.08
260	0.07
261	0.08
262	0.15
263	0.23
264	0.22
265	0.26
266	0.27
267	0.27
268	0.28
269	0.3
270	0.32
271	0.32
272	0.37
273	0.36
274	0.38
275	0.37
276	0.39
277	0.37
278	0.28
279	0.22
280	0.17
281	0.16
282	0.14
283	0.14
284	0.11
285	0.11
286	0.11
287	0.09
288	0.1
289	0.09
290	0.12
291	0.16
292	0.19
293	0.25
294	0.28
295	0.31
296	0.33
297	0.37
298	0.34
299	0.39
300	0.4
301	0.35
302	0.4
303	0.41
304	0.4
305	0.42
306	0.45
307	0.4
308	0.42
309	0.47
310	0.4
311	0.41
312	0.46
313	0.47
314	0.49
315	0.49
316	0.47
317	0.45
318	0.51
319	0.51
320	0.49
321	0.48
322	0.43
323	0.45
324	0.45
325	0.45
326	0.41
327	0.38
328	0.34
329	0.28
330	0.27
331	0.2
332	0.18
333	0.14
334	0.11
335	0.1
336	0.1
337	0.11
338	0.11
339	0.11
340	0.11
341	0.1
342	0.1
343	0.1
344	0.09
345	0.07
346	0.07
347	0.08
348	0.08
349	0.08
350	0.07
351	0.07
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.06
359	0.06
360	0.09
361	0.08
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.08
368	0.05
369	0.06
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.11
379	0.13
380	0.14
381	0.19
382	0.26
383	0.29
384	0.37
385	0.41
386	0.42
387	0.45
388	0.46
389	0.43
390	0.36
391	0.32
392	0.24
393	0.21
394	0.15
395	0.09
396	0.07
397	0.06
398	0.06
399	0.07
400	0.08
401	0.1
402	0.1
403	0.11
404	0.12
405	0.12
406	0.13
407	0.16
408	0.18
409	0.16
410	0.15
411	0.14
412	0.18
413	0.25
414	0.34
415	0.4
416	0.49
417	0.6
418	0.7
419	0.8
420	0.86
421	0.9
422	0.91
423	0.92
424	0.92
425	0.92
426	0.92
427	0.92
428	0.93
429	0.93
430	0.87
431	0.85
432	0.81
433	0.74
434	0.69
435	0.65
436	0.59
437	0.52
438	0.5
439	0.42
440	0.36
441	0.32
442	0.27
443	0.2
444	0.15
445	0.11
446	0.09
447	0.07
448	0.06
449	0.07
450	0.08
451	0.07
452	0.08
453	0.09
454	0.09
455	0.12
456	0.16
457	0.16
458	0.17
459	0.19
460	0.23
461	0.33
462	0.42
463	0.5
464	0.53
465	0.59
466	0.66
467	0.74
468	0.75
469	0.74
470	0.7
471	0.66
472	0.67
473	0.68
474	0.62
475	0.58
476	0.55
477	0.52
478	0.52
479	0.48
480	0.43
481	0.36
482	0.36
483	0.31
484	0.33
485	0.3
486	0.25
487	0.25
488	0.23
489	0.24
490	0.27
491	0.26
492	0.26
493	0.24
494	0.27
495	0.29
496	0.35
497	0.36
498	0.36
499	0.4
500	0.42
501	0.48
502	0.52
503	0.56
504	0.59
505	0.66
506	0.71
507	0.72
508	0.68
509	0.68
510	0.67
511	0.69
512	0.67
513	0.69
514	0.68
515	0.66
516	0.66
517	0.64
518	0.64
519	0.61
520	0.54
521	0.45
522	0.37
523	0.34
524	0.3
525	0.26
526	0.25
527	0.2
528	0.18
529	0.22
530	0.23
531	0.26
532	0.36
533	0.45
534	0.48
535	0.56
536	0.67
537	0.72
538	0.8
539	0.87
540	0.89
541	0.91
542	0.93
543	0.91
544	0.87
545	0.8
546	0.72
547	0.61
548	0.53
549	0.46
550	0.4
551	0.35
552	0.29
553	0.25
554	0.23
555	0.24
556	0.23
557	0.22
558	0.2
559	0.23
560	0.25
561	0.24
562	0.25
563	0.24
564	0.25
565	0.27
566	0.3
567	0.3
568	0.33
569	0.35
570	0.37
571	0.39
572	0.4
573	0.41
574	0.38
575	0.36
576	0.31
577	0.37
578	0.4
579	0.38
580	0.34
581	0.3
582	0.35
583	0.33
584	0.33
585	0.26
586	0.25
587	0.27
588	0.33
589	0.39
590	0.36
591	0.35
592	0.37
593	0.38
594	0.4
595	0.42
596	0.38
597	0.34
598	0.31
599	0.32
600	0.32
601	0.28
602	0.23
603	0.18
604	0.17
605	0.15
606	0.14
607	0.1
608	0.09
609	0.1
610	0.12
611	0.2
612	0.25
613	0.32
614	0.4
615	0.47
616	0.57
617	0.65
618	0.74
619	0.76
620	0.8
621	0.83
622	0.86
623	0.87
624	0.84
625	0.81
626	0.79
627	0.73
628	0.68
629	0.61
630	0.56
631	0.5
632	0.45
633	0.39
634	0.31
635	0.28
636	0.28
637	0.25
638	0.22
639	0.21
640	0.2
641	0.19
642	0.19
643	0.16
644	0.12
645	0.12
646	0.11
647	0.09
648	0.08
649	0.09
650	0.1
651	0.1
652	0.09
653	0.11
654	0.16
655	0.22
656	0.24
657	0.28
658	0.32
659	0.34
660	0.37
661	0.35
662	0.33
663	0.33
664	0.4
665	0.38
666	0.37
667	0.36
668	0.33
669	0.33
670	0.31
671	0.26
672	0.18
673	0.16
674	0.11
675	0.09
676	0.1
677	0.09
678	0.09
679	0.08
680	0.1
681	0.09
682	0.1
683	0.12
684	0.12
685	0.17
686	0.22
687	0.23
688	0.24
689	0.32
690	0.37
691	0.43
692	0.49
693	0.49
694	0.46
695	0.48
696	0.48
697	0.41
698	0.35
699	0.34
700	0.29
701	0.27
702	0.26
703	0.23
704	0.22
705	0.24
706	0.31
707	0.3
708	0.35
709	0.43
710	0.47
711	0.55
712	0.62
713	0.67
714	0.68
715	0.68
716	0.62
717	0.61
718	0.63
719	0.59
720	0.56
721	0.5
722	0.47
723	0.48
724	0.49
725	0.39

A0A4U0X8Z6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer