FuNGI

A0A4U0WP09

Protein Details

Accession

A0A4U0WP09

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
985-1006	DEVMRPSVKRRHTNQFNRHLGV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 8, nucl 7, cyto 5, extr 4, plas 1, E.R. 1, golg 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR023580 RNA_pol_su_RPB10 IPR020789 RNA_pol_suN_Zn-BS IPR000268 RPABC5/Rpb10 IPR007219 Transcription_factor_dom_fun
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0016020 C:membrane GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04082 Fungal_trans PF01194 RNA_pol_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS01112 RNA_POL_N_8KD
CDD	cd12148 fungal_TF_MHR

Amino Acid Sequences

MIIPIRCFSCGKVIADLWERYLKLIDEGLTDGDAMDQLGLNRYCCRRMVMTHVDLIEKLLRDPNTVLLALSRDGRMNPEAQILPLTVGATRNLPPPGLSGPVFLADASTQTNISSKDVAYISCDPSSYPGNINALNVFTTATMKNATAVIFYSTTALYCGYSSGMSDYVFVYSMVSQNASQGILSELRTTSGTPYATIQLASTVNQANNNTNPFNGPNPLGPSPSTAVAMIILYSITGIITALFLIIIITGAVRAHRHPERYGPRNVLGRTRQSRAKGLARAMLDTLPIVKFGEREENKPPDIELAGSGAATSSHVQGTGTEETERRLSTSAASEPENADLPHPTTSLAPVDNVTFAARAGTAAHDISDATEGLGPISRAYMSSLAERVQLLESMLKEKGTEPPPANHPPKTTRGGSTGNDEISSTRATLPRNTLVYENLGQEHSSPGSQLDDLAEESPGYDDNSNQLTGDASAGSPQSILASPKKEGLVSRLLSTRGHLSFDQLSGRLRYFGPTTNCHVHSEFEMIMEDTRESLEQARRAERIIRTLSLETQDYLMDMFWQHYNSVLHVVHKDAFHEDRENGHSQFYSGFLHICILAMGYRCADKNRPDMQRISLPQRESTLHREAKYMLDCELERSGGIPSVAALLLLGDLECGVGRDNLGWMYSGMAVRLCFDIGLHLDSRLSGLPEREVEIRHMTLWACVVYDKYWALFLGRPTSMKSTDLEIYNLTKQFERLGSCKPAGPQKSLETQIYEALLDLMELAGKITENIDPRSQSAVNIDRNGYLRMAALDRELGAWYARLPEPLKWSTANINTAPFSFFLLHQQYHSALILLHRPFAMYDDPNSSDSEETTGLDNHFSALSRTVCTKHAITVARIFWQHRQRFDTRQIFVTGLQHAGTAATALVAALAFLKDSSDRSNNMQYLECLAGALQDMAYTYQPAERMSTVLQAVMIELRGGSSSSVLRLGPSRSAVVPARRGSSNDEVMRPSVKRRHTNQFNRHLGVPGNKGLIGEANMNINIPQRAAKPVPDMNRQDDFVMVTPRNELSSWPNITTDAFFQQAMPPTPASTNRSLPAVPRMSGSTAWMGTEAEEPEVSFLNSIQLPGIPSVSDVENTQPFDLLTLPNDEDWRNWHSSGGVGLQNDLDGFPPRGQYSGAFSNGGGRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.42
3	0.41
4	0.36
5	0.36
6	0.34
7	0.31
8	0.32
9	0.27
10	0.22
11	0.24
12	0.21
13	0.17
14	0.18
15	0.18
16	0.16
17	0.15
18	0.12
19	0.1
20	0.09
21	0.07
22	0.06
23	0.06
24	0.07
25	0.14
26	0.15
27	0.17
28	0.23
29	0.27
30	0.3
31	0.3
32	0.34
33	0.32
34	0.35
35	0.42
36	0.45
37	0.45
38	0.47
39	0.47
40	0.43
41	0.39
42	0.37
43	0.32
44	0.23
45	0.22
46	0.23
47	0.23
48	0.24
49	0.26
50	0.27
51	0.26
52	0.25
53	0.24
54	0.19
55	0.2
56	0.19
57	0.2
58	0.17
59	0.16
60	0.17
61	0.21
62	0.21
63	0.21
64	0.21
65	0.25
66	0.24
67	0.23
68	0.24
69	0.2
70	0.19
71	0.17
72	0.16
73	0.11
74	0.12
75	0.13
76	0.14
77	0.15
78	0.19
79	0.2
80	0.2
81	0.19
82	0.21
83	0.22
84	0.23
85	0.22
86	0.19
87	0.19
88	0.2
89	0.19
90	0.16
91	0.14
92	0.1
93	0.11
94	0.11
95	0.11
96	0.1
97	0.1
98	0.14
99	0.14
100	0.17
101	0.17
102	0.15
103	0.19
104	0.2
105	0.2
106	0.22
107	0.25
108	0.26
109	0.25
110	0.25
111	0.2
112	0.23
113	0.26
114	0.22
115	0.21
116	0.21
117	0.24
118	0.24
119	0.25
120	0.23
121	0.2
122	0.19
123	0.16
124	0.13
125	0.1
126	0.12
127	0.12
128	0.12
129	0.13
130	0.12
131	0.13
132	0.14
133	0.14
134	0.11
135	0.12
136	0.13
137	0.12
138	0.12
139	0.13
140	0.11
141	0.11
142	0.11
143	0.11
144	0.08
145	0.08
146	0.08
147	0.08
148	0.08
149	0.08
150	0.09
151	0.1
152	0.1
153	0.1
154	0.1
155	0.1
156	0.1
157	0.1
158	0.09
159	0.09
160	0.11
161	0.11
162	0.12
163	0.11
164	0.12
165	0.13
166	0.12
167	0.11
168	0.09
169	0.11
170	0.11
171	0.12
172	0.13
173	0.12
174	0.13
175	0.14
176	0.14
177	0.14
178	0.17
179	0.16
180	0.15
181	0.17
182	0.18
183	0.18
184	0.18
185	0.15
186	0.14
187	0.14
188	0.14
189	0.16
190	0.16
191	0.17
192	0.2
193	0.22
194	0.23
195	0.27
196	0.3
197	0.28
198	0.25
199	0.26
200	0.25
201	0.26
202	0.25
203	0.23
204	0.22
205	0.27
206	0.27
207	0.27
208	0.25
209	0.26
210	0.25
211	0.24
212	0.22
213	0.16
214	0.14
215	0.13
216	0.12
217	0.09
218	0.07
219	0.05
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.04
239	0.05
240	0.07
241	0.08
242	0.16
243	0.21
244	0.25
245	0.27
246	0.36
247	0.45
248	0.51
249	0.57
250	0.54
251	0.55
252	0.58
253	0.58
254	0.56
255	0.52
256	0.55
257	0.54
258	0.54
259	0.54
260	0.51
261	0.55
262	0.54
263	0.55
264	0.5
265	0.48
266	0.48
267	0.43
268	0.4
269	0.35
270	0.28
271	0.21
272	0.16
273	0.15
274	0.1
275	0.1
276	0.09
277	0.09
278	0.09
279	0.11
280	0.21
281	0.21
282	0.25
283	0.32
284	0.37
285	0.37
286	0.37
287	0.36
288	0.27
289	0.26
290	0.22
291	0.15
292	0.11
293	0.1
294	0.09
295	0.09
296	0.07
297	0.06
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.08
305	0.12
306	0.13
307	0.13
308	0.14
309	0.14
310	0.16
311	0.18
312	0.18
313	0.14
314	0.14
315	0.13
316	0.13
317	0.16
318	0.17
319	0.17
320	0.18
321	0.18
322	0.18
323	0.19
324	0.19
325	0.15
326	0.13
327	0.13
328	0.13
329	0.13
330	0.12
331	0.12
332	0.11
333	0.12
334	0.13
335	0.12
336	0.11
337	0.11
338	0.11
339	0.11
340	0.11
341	0.09
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.08
356	0.07
357	0.06
358	0.07
359	0.07
360	0.07
361	0.08
362	0.07
363	0.06
364	0.07
365	0.06
366	0.06
367	0.07
368	0.09
369	0.09
370	0.11
371	0.12
372	0.12
373	0.13
374	0.12
375	0.12
376	0.11
377	0.1
378	0.09
379	0.1
380	0.1
381	0.12
382	0.12
383	0.11
384	0.11
385	0.12
386	0.19
387	0.19
388	0.25
389	0.25
390	0.28
391	0.34
392	0.43
393	0.47
394	0.42
395	0.44
396	0.43
397	0.46
398	0.48
399	0.44
400	0.37
401	0.37
402	0.39
403	0.36
404	0.36
405	0.32
406	0.27
407	0.25
408	0.23
409	0.18
410	0.15
411	0.15
412	0.1
413	0.1
414	0.13
415	0.14
416	0.17
417	0.21
418	0.23
419	0.24
420	0.24
421	0.23
422	0.21
423	0.23
424	0.22
425	0.19
426	0.16
427	0.15
428	0.14
429	0.13
430	0.14
431	0.11
432	0.09
433	0.08
434	0.07
435	0.08
436	0.08
437	0.08
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.08
442	0.07
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.08
451	0.1
452	0.1
453	0.09
454	0.09
455	0.08
456	0.08
457	0.08
458	0.06
459	0.05
460	0.06
461	0.06
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.05
466	0.06
467	0.09
468	0.11
469	0.13
470	0.14
471	0.16
472	0.17
473	0.17
474	0.16
475	0.17
476	0.21
477	0.2
478	0.21
479	0.21
480	0.22
481	0.21
482	0.21
483	0.22
484	0.16
485	0.18
486	0.16
487	0.17
488	0.17
489	0.18
490	0.18
491	0.14
492	0.15
493	0.14
494	0.14
495	0.13
496	0.12
497	0.12
498	0.13
499	0.17
500	0.2
501	0.21
502	0.26
503	0.3
504	0.31
505	0.31
506	0.31
507	0.26
508	0.23
509	0.23
510	0.18
511	0.13
512	0.12
513	0.1
514	0.09
515	0.09
516	0.08
517	0.05
518	0.06
519	0.05
520	0.05
521	0.09
522	0.12
523	0.15
524	0.17
525	0.2
526	0.2
527	0.21
528	0.25
529	0.22
530	0.25
531	0.23
532	0.22
533	0.22
534	0.22
535	0.22
536	0.19
537	0.18
538	0.13
539	0.12
540	0.11
541	0.08
542	0.08
543	0.06
544	0.05
545	0.05
546	0.06
547	0.06
548	0.06
549	0.06
550	0.08
551	0.09
552	0.09
553	0.12
554	0.12
555	0.12
556	0.12
557	0.14
558	0.14
559	0.14
560	0.14
561	0.13
562	0.14
563	0.14
564	0.15
565	0.15
566	0.15
567	0.19
568	0.21
569	0.18
570	0.18
571	0.16
572	0.14
573	0.14
574	0.13
575	0.1
576	0.08
577	0.08
578	0.07
579	0.07
580	0.07
581	0.07
582	0.05
583	0.04
584	0.05
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.06
589	0.07
590	0.09
591	0.13
592	0.15
593	0.23
594	0.3
595	0.34
596	0.36
597	0.38
598	0.39
599	0.42
600	0.41
601	0.4
602	0.36
603	0.33
604	0.31
605	0.31
606	0.3
607	0.28
608	0.3
609	0.32
610	0.32
611	0.32
612	0.32
613	0.31
614	0.32
615	0.31
616	0.26
617	0.18
618	0.16
619	0.15
620	0.16
621	0.16
622	0.12
623	0.1
624	0.09
625	0.09
626	0.08
627	0.08
628	0.05
629	0.05
630	0.05
631	0.05
632	0.04
633	0.04
634	0.03
635	0.03
636	0.03
637	0.03
638	0.02
639	0.02
640	0.02
641	0.02
642	0.03
643	0.03
644	0.03
645	0.04
646	0.04
647	0.05
648	0.05
649	0.05
650	0.05
651	0.05
652	0.06
653	0.07
654	0.07
655	0.06
656	0.07
657	0.07
658	0.07
659	0.08
660	0.07
661	0.05
662	0.05
663	0.06
664	0.06
665	0.08
666	0.07
667	0.07
668	0.07
669	0.07
670	0.09
671	0.08
672	0.08
673	0.08
674	0.08
675	0.09
676	0.1
677	0.12
678	0.12
679	0.13
680	0.14
681	0.16
682	0.15
683	0.14
684	0.15
685	0.13
686	0.12
687	0.12
688	0.1
689	0.07
690	0.07
691	0.08
692	0.07
693	0.08
694	0.08
695	0.08
696	0.08
697	0.08
698	0.09
699	0.1
700	0.12
701	0.14
702	0.15
703	0.15
704	0.17
705	0.2
706	0.2
707	0.18
708	0.18
709	0.17
710	0.19
711	0.19
712	0.18
713	0.16
714	0.18
715	0.2
716	0.21
717	0.18
718	0.16
719	0.15
720	0.17
721	0.18
722	0.18
723	0.17
724	0.21
725	0.25
726	0.25
727	0.27
728	0.27
729	0.32
730	0.32
731	0.33
732	0.31
733	0.3
734	0.35
735	0.36
736	0.35
737	0.29
738	0.27
739	0.24
740	0.21
741	0.18
742	0.12
743	0.09
744	0.08
745	0.06
746	0.05
747	0.03
748	0.03
749	0.03
750	0.03
751	0.03
752	0.03
753	0.03
754	0.04
755	0.07
756	0.1
757	0.12
758	0.15
759	0.15
760	0.17
761	0.21
762	0.2
763	0.18
764	0.21
765	0.26
766	0.27
767	0.28
768	0.28
769	0.26
770	0.27
771	0.27
772	0.22
773	0.15
774	0.12
775	0.12
776	0.12
777	0.1
778	0.09
779	0.08
780	0.08
781	0.08
782	0.08
783	0.07
784	0.07
785	0.07
786	0.06
787	0.1
788	0.1
789	0.13
790	0.14
791	0.16
792	0.22
793	0.23
794	0.25
795	0.23
796	0.24
797	0.27
798	0.29
799	0.3
800	0.25
801	0.26
802	0.24
803	0.24
804	0.23
805	0.18
806	0.16
807	0.13
808	0.12
809	0.16
810	0.2
811	0.2
812	0.19
813	0.21
814	0.2
815	0.2
816	0.2
817	0.14
818	0.1
819	0.11
820	0.17
821	0.16
822	0.16
823	0.14
824	0.14
825	0.14
826	0.16
827	0.18
828	0.13
829	0.15
830	0.18
831	0.21
832	0.21
833	0.22
834	0.21
835	0.17
836	0.16
837	0.16
838	0.12
839	0.11
840	0.12
841	0.13
842	0.12
843	0.12
844	0.12
845	0.1
846	0.1
847	0.1
848	0.09
849	0.11
850	0.12
851	0.13
852	0.15
853	0.17
854	0.18
855	0.21
856	0.21
857	0.2
858	0.25
859	0.26
860	0.26
861	0.3
862	0.3
863	0.3
864	0.31
865	0.31
866	0.33
867	0.4
868	0.42
869	0.42
870	0.48
871	0.49
872	0.54
873	0.62
874	0.63
875	0.55
876	0.53
877	0.5
878	0.44
879	0.41
880	0.36
881	0.27
882	0.2
883	0.17
884	0.14
885	0.12
886	0.11
887	0.09
888	0.06
889	0.05
890	0.04
891	0.03
892	0.03
893	0.03
894	0.03
895	0.03
896	0.03
897	0.03
898	0.03
899	0.03
900	0.05
901	0.05
902	0.07
903	0.13
904	0.16
905	0.18
906	0.23
907	0.3
908	0.31
909	0.33
910	0.32
911	0.28
912	0.28
913	0.26
914	0.21
915	0.14
916	0.12
917	0.1
918	0.09
919	0.09
920	0.05
921	0.04
922	0.05
923	0.06
924	0.07
925	0.07
926	0.07
927	0.09
928	0.1
929	0.11
930	0.13
931	0.12
932	0.14
933	0.14
934	0.17
935	0.15
936	0.14
937	0.14
938	0.11
939	0.11
940	0.1
941	0.09
942	0.06
943	0.05
944	0.05
945	0.05
946	0.06
947	0.06
948	0.07
949	0.07
950	0.08
951	0.1
952	0.1
953	0.11
954	0.14
955	0.16
956	0.17
957	0.19
958	0.2
959	0.19
960	0.24
961	0.28
962	0.3
963	0.35
964	0.35
965	0.37
966	0.36
967	0.38
968	0.4
969	0.41
970	0.43
971	0.4
972	0.39
973	0.38
974	0.38
975	0.41
976	0.36
977	0.37
978	0.37
979	0.42
980	0.49
981	0.54
982	0.64
983	0.7
984	0.8
985	0.82
986	0.85
987	0.83
988	0.78
989	0.72
990	0.64
991	0.57
992	0.53
993	0.47
994	0.39
995	0.33
996	0.3
997	0.28
998	0.26
999	0.23
1000	0.18
1001	0.16
1002	0.13
1003	0.14
1004	0.14
1005	0.14
1006	0.15
1007	0.16
1008	0.15
1009	0.13
1010	0.16
1011	0.15
1012	0.22
1013	0.24
1014	0.26
1015	0.3
1016	0.36
1017	0.43
1018	0.49
1019	0.52
1020	0.52
1021	0.53
1022	0.51
1023	0.45
1024	0.39
1025	0.34
1026	0.28
1027	0.3
1028	0.24
1029	0.21
1030	0.22
1031	0.22
1032	0.23
1033	0.21
1034	0.2
1035	0.19
1036	0.27
1037	0.3
1038	0.28
1039	0.29
1040	0.28
1041	0.29
1042	0.28
1043	0.26
1044	0.2
1045	0.18
1046	0.17
1047	0.17
1048	0.21
1049	0.25
1050	0.27
1051	0.26
1052	0.24
1053	0.24
1054	0.28
1055	0.32
1056	0.33
1057	0.33
1058	0.34
1059	0.34
1060	0.36
1061	0.35
1062	0.34
1063	0.38
1064	0.37
1065	0.32
1066	0.3
1067	0.31
1068	0.3
1069	0.3
1070	0.3
1071	0.25
1072	0.21
1073	0.2
1074	0.19
1075	0.16
1076	0.15
1077	0.18
1078	0.16
1079	0.13
1080	0.13
1081	0.13
1082	0.13
1083	0.14
1084	0.13
1085	0.1
1086	0.09
1087	0.12
1088	0.12
1089	0.12
1090	0.12
1091	0.12
1092	0.13
1093	0.14
1094	0.14
1095	0.1
1096	0.11
1097	0.13
1098	0.13
1099	0.13
1100	0.13
1101	0.17
1102	0.21
1103	0.23
1104	0.23
1105	0.21
1106	0.19
1107	0.19
1108	0.2
1109	0.17
1110	0.14
1111	0.16
1112	0.17
1113	0.19
1114	0.21
1115	0.21
1116	0.21
1117	0.24
1118	0.28
1119	0.27
1120	0.27
1121	0.26
1122	0.24
1123	0.24
1124	0.26
1125	0.26
1126	0.24
1127	0.2
1128	0.2
1129	0.19
1130	0.19
1131	0.18
1132	0.15
1133	0.12
1134	0.12
1135	0.15
1136	0.16
1137	0.19
1138	0.2
1139	0.21
1140	0.22
1141	0.22
1142	0.25
1143	0.28
1144	0.29
1145	0.26
1146	0.25

A0A4U0WP09

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer