Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FDL9

Protein Details
Accession C5FDL9    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MAKRRVKKRTHVPPPQARAPATHydrophilic
366-396KLDASWEKKRKEKELRRKIQKENVERKKALKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-11KRRVKKRTH
232-246KRIRRLNPKEYRGKE
373-402KKRKEKELRRKIQKENVERKKALKAKTPRE
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 10.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MAKRRVKKRTHVPPPQARAPATKNGAASMNRSPKSMVIRIGAGQVGSSMSQLAKDVRSMMEPDTASRLKERTKNRLKDYTVMTGPLGVTHLLLFSKSSNGNSNLRIALTPRGPTLNFRIENYSLCKDVIKALKRPRGLGKSHTTPPLLVMNNFMSSKEGASSEKIPKHLESLVTTVFQSLFPPISPQTTPLASIRRIMLLDRDQSSKKDTDESFIINLRHYAITTKRIDLSKRIRRLNPKEYRGKEKDKAVPNLGKLNDVADYLLSAGGDAGFTSASETEMDTDAEVEVLESTTRKVLNKKDLQRMKEGGSKSGRSSGSNVEKRAVKLVELGPRMKLKLMKVEEGLCGGRVMWHDYVTKTREEAQKLDASWEKKRKEKELRRKIQKENVERKKALKAKTPREGKDDEEDDSDEIDDEDNWDSEDFIHEEEEEEEAGEEDVEMEEEEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.89
3 0.84
4 0.75
5 0.72
6 0.66
7 0.65
8 0.59
9 0.54
10 0.46
11 0.42
12 0.45
13 0.39
14 0.38
15 0.38
16 0.43
17 0.4
18 0.41
19 0.4
20 0.39
21 0.45
22 0.45
23 0.39
24 0.33
25 0.34
26 0.34
27 0.35
28 0.31
29 0.23
30 0.18
31 0.14
32 0.12
33 0.1
34 0.09
35 0.08
36 0.07
37 0.08
38 0.1
39 0.12
40 0.12
41 0.13
42 0.15
43 0.15
44 0.17
45 0.19
46 0.19
47 0.22
48 0.21
49 0.21
50 0.27
51 0.27
52 0.26
53 0.27
54 0.3
55 0.31
56 0.39
57 0.46
58 0.5
59 0.6
60 0.68
61 0.73
62 0.78
63 0.75
64 0.74
65 0.7
66 0.67
67 0.58
68 0.5
69 0.41
70 0.33
71 0.29
72 0.23
73 0.18
74 0.1
75 0.09
76 0.07
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.07
82 0.11
83 0.13
84 0.15
85 0.2
86 0.24
87 0.27
88 0.28
89 0.3
90 0.27
91 0.27
92 0.25
93 0.21
94 0.23
95 0.22
96 0.22
97 0.2
98 0.22
99 0.22
100 0.24
101 0.29
102 0.32
103 0.31
104 0.31
105 0.35
106 0.33
107 0.36
108 0.38
109 0.34
110 0.26
111 0.25
112 0.24
113 0.19
114 0.24
115 0.29
116 0.29
117 0.34
118 0.43
119 0.49
120 0.5
121 0.54
122 0.56
123 0.55
124 0.54
125 0.53
126 0.52
127 0.51
128 0.54
129 0.54
130 0.47
131 0.39
132 0.38
133 0.37
134 0.3
135 0.24
136 0.23
137 0.2
138 0.21
139 0.21
140 0.19
141 0.14
142 0.13
143 0.13
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.12
148 0.17
149 0.23
150 0.25
151 0.27
152 0.28
153 0.27
154 0.29
155 0.28
156 0.25
157 0.2
158 0.2
159 0.19
160 0.17
161 0.17
162 0.15
163 0.13
164 0.11
165 0.1
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.09
170 0.09
171 0.12
172 0.12
173 0.13
174 0.14
175 0.14
176 0.16
177 0.17
178 0.2
179 0.18
180 0.19
181 0.18
182 0.17
183 0.17
184 0.15
185 0.17
186 0.16
187 0.19
188 0.19
189 0.22
190 0.22
191 0.23
192 0.26
193 0.24
194 0.21
195 0.23
196 0.22
197 0.21
198 0.22
199 0.22
200 0.2
201 0.21
202 0.21
203 0.15
204 0.15
205 0.14
206 0.12
207 0.11
208 0.12
209 0.11
210 0.17
211 0.19
212 0.19
213 0.21
214 0.23
215 0.25
216 0.3
217 0.39
218 0.41
219 0.47
220 0.52
221 0.55
222 0.63
223 0.7
224 0.73
225 0.72
226 0.71
227 0.73
228 0.71
229 0.75
230 0.72
231 0.71
232 0.65
233 0.63
234 0.63
235 0.61
236 0.61
237 0.58
238 0.54
239 0.48
240 0.49
241 0.42
242 0.35
243 0.28
244 0.24
245 0.18
246 0.15
247 0.13
248 0.06
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.06
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.05
280 0.07
281 0.09
282 0.11
283 0.17
284 0.24
285 0.34
286 0.43
287 0.51
288 0.59
289 0.64
290 0.65
291 0.66
292 0.63
293 0.56
294 0.53
295 0.46
296 0.43
297 0.41
298 0.4
299 0.35
300 0.38
301 0.36
302 0.31
303 0.33
304 0.34
305 0.39
306 0.42
307 0.42
308 0.4
309 0.42
310 0.41
311 0.44
312 0.36
313 0.26
314 0.26
315 0.3
316 0.33
317 0.33
318 0.33
319 0.31
320 0.33
321 0.33
322 0.31
323 0.3
324 0.25
325 0.31
326 0.34
327 0.34
328 0.34
329 0.35
330 0.33
331 0.32
332 0.29
333 0.2
334 0.17
335 0.13
336 0.13
337 0.12
338 0.16
339 0.14
340 0.16
341 0.17
342 0.19
343 0.26
344 0.26
345 0.26
346 0.23
347 0.3
348 0.34
349 0.36
350 0.37
351 0.36
352 0.38
353 0.37
354 0.41
355 0.4
356 0.37
357 0.43
358 0.49
359 0.5
360 0.52
361 0.59
362 0.64
363 0.7
364 0.77
365 0.78
366 0.81
367 0.86
368 0.91
369 0.93
370 0.92
371 0.9
372 0.89
373 0.89
374 0.88
375 0.88
376 0.86
377 0.8
378 0.75
379 0.76
380 0.73
381 0.68
382 0.67
383 0.67
384 0.67
385 0.74
386 0.8
387 0.74
388 0.73
389 0.71
390 0.65
391 0.64
392 0.56
393 0.49
394 0.42
395 0.39
396 0.33
397 0.3
398 0.26
399 0.17
400 0.15
401 0.12
402 0.09
403 0.1
404 0.11
405 0.1
406 0.11
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.14
411 0.13
412 0.12
413 0.13
414 0.12
415 0.13
416 0.14
417 0.14
418 0.11
419 0.1
420 0.1
421 0.09
422 0.09
423 0.08
424 0.07
425 0.06
426 0.06
427 0.07