Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0WE66

Protein Details
Accession A0A4U0WE66    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-22FEYWKSTPKYWCKFCKTYVRDHydrophilic
266-288QGIVFKKRKAPKGEYKKPKQLAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
271-284KKRKAPKGEYKKPK
Subcellular Location(s) cyto 9.5cyto_nucl 9.5, nucl 8.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031120  HIR1-like  
IPR011494  HIRA-like_C  
IPR019015  HIRA_B_motif  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR013085  U1-CZ_Znf_C2H2  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF07569  Hira  
PF09453  HIRA_B  
PF00400  WD40  
PF06220  zf-U1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MFEYWKSTPKYWCKFCKTYVRDTIFEKKQHEATPRHQGNIQRSLRDLHRGHEREERDKQRAKDEVARLNGIVAGTSSSSGSTDAPWKRQPPTPSAPAQATAEDRKKQLKQLAEMGVAVPDEFRKEMAMAGDWHTVSVTPLGSGGSAGSRGGIKKEENEDTKPSAINVGVRKRKFEGQEEAEEAGNTVVRKGWGTTFKSYTASKDSSDDIEALLSGSALGQDSVPPAGFVPTIKKEESEEGVAFAVAAPDIDVAAAPVKTEDGAPGQGIVFKKRKAPKGEYKKPKQLAALSYHSGTIHTVRFSGNNKYLASGADDKILCVYNLDPNPPTHTTFGSNEVPPAENWRIFRRLIGHDNDIQDLGWSYDSSILVSVGLDSKVVVWSGYTFEKLKTISQHQSHVKGITFDPANKYFATASDDRTIKIFRFTSPAANATAHDQAGNFILEKSIAAPFTTSPLTTYFRRCSWSPEGNHIAAANAVNGPVSSVAIINRGSWESEINLIGHEGPVEVCAFSPRLFCKEPTTRANVDAKGHTLQHSVTVVACAGHDKTLSVWNNSFPRPFVVTAELTAKSITDLAWTPDGETLFLSSLDGTIAAAKFEVGELGYPAPLQDNEKSLSKYGAGRRVGVIEGTDALLLEESSKAGELKGVQGRMGALMGDGGSTNDVTVNGTAGGAHTNGTSNDTPAAVAADAANGATAGQASTTAHGTVTDPNNARLERLKSRITITKDGKKRIAPLLVSNSSGLAESTLPRPQLMTGAAQGTKFDAPHTILDLSKPYDGLPKGGLAALIFGNKRKYADVEGDEERRMERRVATAGRNGAVPVVENGPEGLTLLKASKAPDETEVPAALRPAIVDPSLAISQLRLAVPMVRSVILRPVGGVGNTAVDGSDTQRTEGQDEEAIVLETRNASGPSRTGRPQDKEPTRISVARRGQALWQDFLPRQYWNTTDSSVGNLQSAPKPSKAANEDNDLNPENVSAGIIPLLERNTTTQTLVRGRAYYLQRLVKSLLSAEGFEGFESSVSIAHLENRVAAAMTLGAKEEFRLHLLVYAKRLGAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.81
3 0.82
4 0.78
5 0.78
6 0.79
7 0.74
8 0.69
9 0.68
10 0.7
11 0.67
12 0.67
13 0.61
14 0.56
15 0.56
16 0.59
17 0.62
18 0.59
19 0.59
20 0.64
21 0.64
22 0.61
23 0.59
24 0.6
25 0.59
26 0.62
27 0.6
28 0.51
29 0.49
30 0.52
31 0.51
32 0.54
33 0.47
34 0.42
35 0.48
36 0.48
37 0.5
38 0.53
39 0.56
40 0.55
41 0.64
42 0.67
43 0.66
44 0.71
45 0.71
46 0.71
47 0.71
48 0.68
49 0.67
50 0.67
51 0.66
52 0.63
53 0.61
54 0.52
55 0.45
56 0.41
57 0.31
58 0.23
59 0.14
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.1
68 0.11
69 0.19
70 0.24
71 0.3
72 0.37
73 0.42
74 0.45
75 0.51
76 0.54
77 0.54
78 0.57
79 0.58
80 0.57
81 0.57
82 0.54
83 0.51
84 0.47
85 0.41
86 0.38
87 0.4
88 0.41
89 0.4
90 0.43
91 0.48
92 0.5
93 0.55
94 0.56
95 0.55
96 0.53
97 0.57
98 0.58
99 0.51
100 0.48
101 0.4
102 0.34
103 0.27
104 0.21
105 0.14
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.12
113 0.13
114 0.15
115 0.15
116 0.18
117 0.21
118 0.2
119 0.2
120 0.18
121 0.16
122 0.15
123 0.15
124 0.11
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.06
132 0.07
133 0.06
134 0.07
135 0.09
136 0.11
137 0.13
138 0.16
139 0.17
140 0.23
141 0.29
142 0.36
143 0.38
144 0.42
145 0.44
146 0.44
147 0.44
148 0.39
149 0.33
150 0.28
151 0.24
152 0.26
153 0.28
154 0.35
155 0.42
156 0.43
157 0.46
158 0.48
159 0.53
160 0.53
161 0.52
162 0.52
163 0.49
164 0.53
165 0.52
166 0.5
167 0.43
168 0.38
169 0.31
170 0.22
171 0.18
172 0.12
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.12
178 0.17
179 0.23
180 0.28
181 0.33
182 0.35
183 0.36
184 0.39
185 0.38
186 0.37
187 0.35
188 0.33
189 0.28
190 0.28
191 0.28
192 0.26
193 0.27
194 0.23
195 0.16
196 0.14
197 0.13
198 0.11
199 0.08
200 0.06
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.14
217 0.18
218 0.22
219 0.22
220 0.23
221 0.24
222 0.27
223 0.29
224 0.27
225 0.23
226 0.2
227 0.2
228 0.19
229 0.16
230 0.12
231 0.09
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.12
254 0.13
255 0.19
256 0.22
257 0.23
258 0.32
259 0.39
260 0.47
261 0.51
262 0.6
263 0.64
264 0.7
265 0.8
266 0.82
267 0.84
268 0.87
269 0.83
270 0.77
271 0.71
272 0.65
273 0.6
274 0.55
275 0.51
276 0.43
277 0.39
278 0.36
279 0.31
280 0.25
281 0.21
282 0.17
283 0.14
284 0.12
285 0.13
286 0.13
287 0.17
288 0.2
289 0.26
290 0.28
291 0.3
292 0.29
293 0.29
294 0.29
295 0.26
296 0.27
297 0.24
298 0.19
299 0.2
300 0.2
301 0.19
302 0.2
303 0.2
304 0.15
305 0.12
306 0.13
307 0.15
308 0.16
309 0.19
310 0.18
311 0.19
312 0.24
313 0.26
314 0.27
315 0.22
316 0.22
317 0.24
318 0.24
319 0.29
320 0.27
321 0.25
322 0.23
323 0.23
324 0.22
325 0.19
326 0.24
327 0.22
328 0.21
329 0.23
330 0.26
331 0.28
332 0.27
333 0.29
334 0.28
335 0.3
336 0.34
337 0.36
338 0.35
339 0.36
340 0.37
341 0.36
342 0.3
343 0.24
344 0.18
345 0.14
346 0.11
347 0.08
348 0.06
349 0.06
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.05
366 0.04
367 0.05
368 0.07
369 0.08
370 0.1
371 0.1
372 0.11
373 0.13
374 0.14
375 0.16
376 0.18
377 0.24
378 0.3
379 0.31
380 0.38
381 0.4
382 0.43
383 0.42
384 0.4
385 0.34
386 0.28
387 0.26
388 0.24
389 0.21
390 0.19
391 0.22
392 0.22
393 0.23
394 0.21
395 0.21
396 0.17
397 0.16
398 0.2
399 0.16
400 0.18
401 0.22
402 0.22
403 0.21
404 0.23
405 0.23
406 0.18
407 0.22
408 0.2
409 0.15
410 0.19
411 0.2
412 0.22
413 0.23
414 0.24
415 0.21
416 0.2
417 0.2
418 0.18
419 0.18
420 0.14
421 0.13
422 0.11
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.08
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.09
438 0.09
439 0.08
440 0.08
441 0.11
442 0.14
443 0.16
444 0.21
445 0.22
446 0.23
447 0.27
448 0.26
449 0.3
450 0.34
451 0.4
452 0.36
453 0.4
454 0.43
455 0.4
456 0.39
457 0.32
458 0.25
459 0.18
460 0.16
461 0.1
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.04
469 0.03
470 0.04
471 0.04
472 0.06
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.08
477 0.08
478 0.08
479 0.08
480 0.07
481 0.08
482 0.08
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.06
488 0.05
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.05
496 0.06
497 0.06
498 0.08
499 0.09
500 0.13
501 0.15
502 0.16
503 0.22
504 0.27
505 0.32
506 0.34
507 0.39
508 0.35
509 0.37
510 0.4
511 0.35
512 0.31
513 0.27
514 0.25
515 0.21
516 0.2
517 0.18
518 0.14
519 0.12
520 0.12
521 0.12
522 0.1
523 0.08
524 0.08
525 0.07
526 0.06
527 0.06
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.06
534 0.13
535 0.15
536 0.16
537 0.16
538 0.2
539 0.23
540 0.24
541 0.24
542 0.17
543 0.18
544 0.18
545 0.18
546 0.16
547 0.15
548 0.15
549 0.15
550 0.18
551 0.16
552 0.14
553 0.13
554 0.11
555 0.08
556 0.08
557 0.07
558 0.06
559 0.06
560 0.07
561 0.09
562 0.09
563 0.09
564 0.11
565 0.11
566 0.1
567 0.09
568 0.08
569 0.07
570 0.07
571 0.06
572 0.05
573 0.05
574 0.04
575 0.04
576 0.03
577 0.05
578 0.05
579 0.05
580 0.05
581 0.04
582 0.04
583 0.04
584 0.04
585 0.03
586 0.03
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.05
593 0.06
594 0.08
595 0.09
596 0.11
597 0.13
598 0.16
599 0.17
600 0.16
601 0.17
602 0.16
603 0.2
604 0.23
605 0.28
606 0.27
607 0.27
608 0.27
609 0.27
610 0.26
611 0.2
612 0.16
613 0.08
614 0.08
615 0.07
616 0.06
617 0.05
618 0.05
619 0.04
620 0.04
621 0.04
622 0.04
623 0.04
624 0.04
625 0.04
626 0.04
627 0.04
628 0.06
629 0.06
630 0.11
631 0.15
632 0.15
633 0.15
634 0.15
635 0.15
636 0.14
637 0.14
638 0.08
639 0.04
640 0.04
641 0.04
642 0.04
643 0.04
644 0.03
645 0.04
646 0.04
647 0.04
648 0.04
649 0.04
650 0.05
651 0.05
652 0.05
653 0.05
654 0.05
655 0.05
656 0.05
657 0.05
658 0.05
659 0.05
660 0.05
661 0.06
662 0.06
663 0.1
664 0.1
665 0.1
666 0.11
667 0.11
668 0.1
669 0.09
670 0.1
671 0.06
672 0.06
673 0.05
674 0.04
675 0.04
676 0.04
677 0.04
678 0.03
679 0.03
680 0.03
681 0.03
682 0.02
683 0.02
684 0.03
685 0.04
686 0.05
687 0.06
688 0.06
689 0.06
690 0.06
691 0.08
692 0.13
693 0.15
694 0.2
695 0.2
696 0.22
697 0.26
698 0.26
699 0.26
700 0.25
701 0.29
702 0.29
703 0.33
704 0.34
705 0.32
706 0.36
707 0.42
708 0.42
709 0.46
710 0.47
711 0.52
712 0.56
713 0.6
714 0.61
715 0.57
716 0.56
717 0.52
718 0.5
719 0.42
720 0.4
721 0.43
722 0.39
723 0.37
724 0.33
725 0.27
726 0.22
727 0.21
728 0.15
729 0.08
730 0.07
731 0.08
732 0.1
733 0.13
734 0.13
735 0.13
736 0.13
737 0.13
738 0.14
739 0.14
740 0.13
741 0.12
742 0.15
743 0.16
744 0.15
745 0.15
746 0.15
747 0.15
748 0.13
749 0.12
750 0.11
751 0.12
752 0.13
753 0.16
754 0.15
755 0.14
756 0.15
757 0.18
758 0.17
759 0.16
760 0.15
761 0.13
762 0.18
763 0.18
764 0.19
765 0.17
766 0.15
767 0.16
768 0.16
769 0.15
770 0.09
771 0.09
772 0.08
773 0.11
774 0.11
775 0.13
776 0.16
777 0.17
778 0.18
779 0.18
780 0.2
781 0.2
782 0.26
783 0.26
784 0.29
785 0.32
786 0.34
787 0.33
788 0.31
789 0.28
790 0.24
791 0.23
792 0.2
793 0.17
794 0.18
795 0.24
796 0.28
797 0.3
798 0.33
799 0.34
800 0.33
801 0.32
802 0.29
803 0.23
804 0.18
805 0.15
806 0.11
807 0.1
808 0.1
809 0.09
810 0.1
811 0.09
812 0.09
813 0.08
814 0.07
815 0.05
816 0.06
817 0.07
818 0.08
819 0.09
820 0.11
821 0.14
822 0.16
823 0.17
824 0.2
825 0.22
826 0.23
827 0.24
828 0.24
829 0.2
830 0.19
831 0.18
832 0.15
833 0.12
834 0.1
835 0.09
836 0.1
837 0.09
838 0.09
839 0.08
840 0.12
841 0.12
842 0.12
843 0.1
844 0.09
845 0.1
846 0.13
847 0.13
848 0.1
849 0.1
850 0.13
851 0.14
852 0.16
853 0.16
854 0.14
855 0.14
856 0.15
857 0.2
858 0.18
859 0.17
860 0.15
861 0.16
862 0.17
863 0.16
864 0.16
865 0.11
866 0.1
867 0.1
868 0.1
869 0.07
870 0.06
871 0.07
872 0.08
873 0.14
874 0.13
875 0.15
876 0.18
877 0.19
878 0.2
879 0.21
880 0.21
881 0.17
882 0.17
883 0.16
884 0.14
885 0.14
886 0.12
887 0.11
888 0.1
889 0.08
890 0.08
891 0.09
892 0.1
893 0.11
894 0.12
895 0.16
896 0.21
897 0.26
898 0.3
899 0.37
900 0.44
901 0.49
902 0.56
903 0.63
904 0.66
905 0.68
906 0.67
907 0.65
908 0.62
909 0.61
910 0.56
911 0.55
912 0.54
913 0.51
914 0.5
915 0.44
916 0.43
917 0.46
918 0.46
919 0.38
920 0.32
921 0.34
922 0.33
923 0.35
924 0.32
925 0.26
926 0.25
927 0.26
928 0.26
929 0.24
930 0.26
931 0.25
932 0.26
933 0.24
934 0.26
935 0.26
936 0.24
937 0.22
938 0.19
939 0.22
940 0.23
941 0.29
942 0.28
943 0.27
944 0.3
945 0.3
946 0.38
947 0.41
948 0.45
949 0.43
950 0.48
951 0.5
952 0.49
953 0.53
954 0.46
955 0.4
956 0.31
957 0.27
958 0.2
959 0.15
960 0.14
961 0.08
962 0.07
963 0.07
964 0.07
965 0.07
966 0.09
967 0.1
968 0.1
969 0.11
970 0.14
971 0.18
972 0.2
973 0.22
974 0.22
975 0.27
976 0.33
977 0.36
978 0.37
979 0.33
980 0.33
981 0.39
982 0.41
983 0.42
984 0.44
985 0.47
986 0.45
987 0.47
988 0.47
989 0.41
990 0.38
991 0.31
992 0.28
993 0.22
994 0.22
995 0.2
996 0.2
997 0.18
998 0.17
999 0.16
1000 0.11
1001 0.1
1002 0.1
1003 0.09
1004 0.07
1005 0.07
1006 0.08
1007 0.08
1008 0.12
1009 0.14
1010 0.14
1011 0.15
1012 0.15
1013 0.15
1014 0.14
1015 0.13
1016 0.1
1017 0.1
1018 0.11
1019 0.1
1020 0.11
1021 0.11
1022 0.11
1023 0.12
1024 0.15
1025 0.14
1026 0.15
1027 0.16
1028 0.15
1029 0.2
1030 0.25
1031 0.28
1032 0.29
1033 0.31