Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0VPD9

Protein Details
Accession A0A4U0VPD9    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-29ATTTVTKTSKKEKSSKKPRSAPVPAEEVHydrophilic
49-68AESSPEPSRKRKRAVASADEHydrophilic
74-97SLPEPPSKKAMRKAKKGHKLSIATHydrophilic
342-372EGTKDMTSKKKAKSKKTRKWFVNRLKGRSLRHydrophilic
422-451SRSPPRAREGHRGRKNKDERREPRKVDARTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-20KKEKSSKKPR
80-92SKKAMRKAKKGHK
350-368KKKAKSKKTRKWFVNRLKG
424-450SPPRAREGHRGRKNKDERREPRKVDAR
Subcellular Location(s) mito 10, nucl 9, cyto_mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MATTTVTKTSKKEKSSKKPRSAPVPAEEVVPVSPSPPPAAVDESSNVIAESSPEPSRKRKRAVASADELEIDVSLPEPPSKKAMRKAKKGHKLSIATTDVPSTQQAQSTDGQAVDVNGVAPDATAESAVRSQYGIWIGNLPWTATKDSLRTFLTDHAKIEEDKITRIHMPPPSGPPNPRLAIKPTNKGFAYVDLSTQAVLDKVMGVSETLMSGRRVLIKNAKSFEGRPEKKEDRASAGDGTNGAAGVGEFKSAKPPAKRIFVGNLGFDVEKDDLIEHFTPCGEVVDVHMATFEDTGKCKGFAWVTFDALEASEAAVKGWTMISVEKDESESGPDGEDVAEEEGTKDMTSKKKAKSKKTRKWFVNRLKGRSLRCEFAEDAASRYKKRYGKVGAAGKKQDGTAVDVQEGNLAGNGTAPVDAEASRSPPRAREGHRGRKNKDERREPRKVDARTIKPGAALANAQRATTGAIVESKGTRKTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.84
3 0.89
4 0.9
5 0.91
6 0.91
7 0.91
8 0.9
9 0.86
10 0.8
11 0.75
12 0.65
13 0.57
14 0.48
15 0.39
16 0.29
17 0.24
18 0.18
19 0.12
20 0.13
21 0.13
22 0.15
23 0.15
24 0.16
25 0.17
26 0.21
27 0.21
28 0.22
29 0.22
30 0.23
31 0.23
32 0.21
33 0.18
34 0.14
35 0.13
36 0.12
37 0.12
38 0.13
39 0.17
40 0.21
41 0.26
42 0.36
43 0.47
44 0.54
45 0.6
46 0.65
47 0.7
48 0.76
49 0.81
50 0.78
51 0.75
52 0.68
53 0.61
54 0.53
55 0.43
56 0.33
57 0.24
58 0.16
59 0.08
60 0.06
61 0.06
62 0.07
63 0.1
64 0.12
65 0.13
66 0.2
67 0.27
68 0.33
69 0.42
70 0.52
71 0.6
72 0.69
73 0.78
74 0.82
75 0.86
76 0.87
77 0.85
78 0.83
79 0.78
80 0.7
81 0.68
82 0.61
83 0.52
84 0.45
85 0.39
86 0.3
87 0.26
88 0.24
89 0.19
90 0.16
91 0.18
92 0.18
93 0.2
94 0.2
95 0.21
96 0.22
97 0.18
98 0.17
99 0.14
100 0.13
101 0.1
102 0.09
103 0.07
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.05
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.1
120 0.13
121 0.12
122 0.11
123 0.13
124 0.13
125 0.16
126 0.16
127 0.14
128 0.13
129 0.14
130 0.15
131 0.15
132 0.17
133 0.17
134 0.19
135 0.22
136 0.21
137 0.2
138 0.2
139 0.25
140 0.3
141 0.28
142 0.27
143 0.25
144 0.26
145 0.25
146 0.26
147 0.25
148 0.19
149 0.19
150 0.19
151 0.2
152 0.21
153 0.22
154 0.25
155 0.23
156 0.25
157 0.26
158 0.32
159 0.37
160 0.38
161 0.39
162 0.37
163 0.39
164 0.38
165 0.37
166 0.33
167 0.32
168 0.37
169 0.4
170 0.46
171 0.42
172 0.45
173 0.43
174 0.43
175 0.37
176 0.31
177 0.3
178 0.22
179 0.21
180 0.16
181 0.16
182 0.14
183 0.13
184 0.1
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.13
202 0.13
203 0.16
204 0.24
205 0.28
206 0.32
207 0.33
208 0.34
209 0.3
210 0.3
211 0.36
212 0.39
213 0.37
214 0.35
215 0.42
216 0.43
217 0.47
218 0.5
219 0.43
220 0.38
221 0.38
222 0.36
223 0.3
224 0.28
225 0.23
226 0.18
227 0.17
228 0.11
229 0.08
230 0.06
231 0.04
232 0.03
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.09
239 0.11
240 0.16
241 0.17
242 0.25
243 0.29
244 0.35
245 0.36
246 0.34
247 0.36
248 0.37
249 0.37
250 0.3
251 0.25
252 0.2
253 0.19
254 0.17
255 0.15
256 0.09
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.1
262 0.11
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.09
269 0.06
270 0.05
271 0.06
272 0.1
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.07
281 0.08
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.14
287 0.15
288 0.15
289 0.2
290 0.19
291 0.2
292 0.19
293 0.19
294 0.16
295 0.15
296 0.13
297 0.07
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.08
310 0.1
311 0.11
312 0.1
313 0.12
314 0.12
315 0.12
316 0.13
317 0.12
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.06
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.11
334 0.18
335 0.26
336 0.33
337 0.41
338 0.5
339 0.59
340 0.68
341 0.75
342 0.81
343 0.83
344 0.87
345 0.89
346 0.9
347 0.93
348 0.92
349 0.92
350 0.91
351 0.89
352 0.84
353 0.83
354 0.8
355 0.73
356 0.72
357 0.66
358 0.59
359 0.52
360 0.51
361 0.42
362 0.38
363 0.39
364 0.29
365 0.28
366 0.31
367 0.33
368 0.29
369 0.31
370 0.37
371 0.36
372 0.38
373 0.45
374 0.45
375 0.5
376 0.58
377 0.65
378 0.66
379 0.68
380 0.69
381 0.62
382 0.56
383 0.47
384 0.41
385 0.32
386 0.29
387 0.27
388 0.24
389 0.24
390 0.23
391 0.23
392 0.21
393 0.2
394 0.14
395 0.1
396 0.09
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.07
405 0.07
406 0.09
407 0.1
408 0.14
409 0.18
410 0.22
411 0.23
412 0.26
413 0.32
414 0.38
415 0.44
416 0.51
417 0.58
418 0.65
419 0.73
420 0.8
421 0.78
422 0.81
423 0.86
424 0.85
425 0.84
426 0.85
427 0.85
428 0.85
429 0.91
430 0.86
431 0.86
432 0.85
433 0.79
434 0.79
435 0.78
436 0.76
437 0.74
438 0.73
439 0.63
440 0.54
441 0.51
442 0.42
443 0.34
444 0.31
445 0.25
446 0.3
447 0.29
448 0.28
449 0.26
450 0.25
451 0.24
452 0.21
453 0.18
454 0.11
455 0.13
456 0.14
457 0.16
458 0.2
459 0.22
460 0.27