Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0XJ90

Protein Details
Accession A0A4U0XJ90    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
436-464QGWKSGKKTTYYKKRRRWERARQTVDQTRHydrophilic
607-629GNVQARGKFAKKRRRVEEGEGEGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
448-452KKRRR
613-621GKFAKKRRR
Subcellular Location(s) mito 20.5, cyto_mito 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSYISPNTYITLRLPSGTLRVLRILPNTTISIGKFGSFPANLLLGRPYHLTYEILEADDDRAQTELRIVPAAEIHAEALAEDATATESRADPLIDHIDGDASPMVAENGDVLGKSNRLTVDNAARQTLSYGEIEQLKKAKTGTGKEIIAKIMEAHANLDEKTAFSLAKYTLRKAKKFWRRFTVLPLDVSMLTQYMLSDKESSKVMDLREEMLGLIGCWANVHYGVSNEVRTTDDGLGQIGGGRWLMIDDTGGLLVAAMAEKMGILYPEEEDEGQESETVQETEDGQLRPDGILDTPVINSDGTRFDEAEAPPNPNTAEDQPMPDAMGNVPSNSVPAAKTTTARPTDATSSSPAIVPTRKSQQLALNNTLTVLHANAQPNLALLKYFSYDTSNPANASSSHPLHTHLRTLSWLQLLHPSEDPTYLEPERFTPQQMQGWKSGKKTTYYKKRRRWERARQTVDQTRAGGFDGLIVASAMAPATILQHTIPLLRGGAQVVVYSPTIEPLTELADLYSRDRRAAFLLLQQQQRQQSQQPDSDPPPQSVATATHVPAPDFPLNPTLLLAPSLQTARARAYQVLPGRTHPLMTSRGGAEGYVFSATRVLPAEGNVQARGKFAKKRRRVEEGEGEGEAAASGVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.22
3 0.22
4 0.25
5 0.28
6 0.28
7 0.24
8 0.26
9 0.28
10 0.31
11 0.34
12 0.34
13 0.3
14 0.31
15 0.3
16 0.29
17 0.29
18 0.25
19 0.24
20 0.21
21 0.2
22 0.17
23 0.17
24 0.21
25 0.18
26 0.18
27 0.17
28 0.19
29 0.18
30 0.19
31 0.21
32 0.16
33 0.18
34 0.19
35 0.18
36 0.17
37 0.19
38 0.19
39 0.17
40 0.22
41 0.21
42 0.19
43 0.18
44 0.17
45 0.17
46 0.19
47 0.17
48 0.12
49 0.12
50 0.12
51 0.12
52 0.15
53 0.15
54 0.14
55 0.16
56 0.15
57 0.15
58 0.16
59 0.17
60 0.14
61 0.11
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.07
67 0.06
68 0.05
69 0.04
70 0.04
71 0.06
72 0.06
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.11
78 0.11
79 0.09
80 0.13
81 0.17
82 0.16
83 0.15
84 0.14
85 0.14
86 0.14
87 0.15
88 0.11
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.07
100 0.09
101 0.1
102 0.1
103 0.13
104 0.14
105 0.15
106 0.18
107 0.21
108 0.29
109 0.33
110 0.34
111 0.33
112 0.31
113 0.3
114 0.28
115 0.24
116 0.17
117 0.12
118 0.11
119 0.13
120 0.19
121 0.2
122 0.22
123 0.26
124 0.24
125 0.25
126 0.25
127 0.27
128 0.27
129 0.31
130 0.35
131 0.37
132 0.39
133 0.4
134 0.41
135 0.38
136 0.31
137 0.26
138 0.2
139 0.16
140 0.15
141 0.12
142 0.12
143 0.12
144 0.14
145 0.13
146 0.14
147 0.11
148 0.1
149 0.11
150 0.11
151 0.09
152 0.08
153 0.11
154 0.11
155 0.19
156 0.21
157 0.24
158 0.32
159 0.4
160 0.43
161 0.47
162 0.55
163 0.59
164 0.67
165 0.71
166 0.72
167 0.71
168 0.7
169 0.72
170 0.72
171 0.63
172 0.54
173 0.46
174 0.38
175 0.32
176 0.3
177 0.21
178 0.11
179 0.08
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.08
185 0.1
186 0.1
187 0.12
188 0.13
189 0.14
190 0.15
191 0.17
192 0.17
193 0.18
194 0.19
195 0.19
196 0.18
197 0.17
198 0.15
199 0.12
200 0.11
201 0.07
202 0.08
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.05
211 0.06
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.14
220 0.12
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.09
226 0.09
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.02
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.02
250 0.02
251 0.03
252 0.03
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.08
271 0.12
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.06
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.14
295 0.15
296 0.19
297 0.18
298 0.19
299 0.18
300 0.19
301 0.18
302 0.14
303 0.16
304 0.11
305 0.14
306 0.12
307 0.14
308 0.14
309 0.13
310 0.13
311 0.11
312 0.11
313 0.07
314 0.1
315 0.09
316 0.08
317 0.09
318 0.08
319 0.09
320 0.08
321 0.09
322 0.05
323 0.06
324 0.09
325 0.09
326 0.11
327 0.12
328 0.19
329 0.2
330 0.2
331 0.2
332 0.2
333 0.22
334 0.22
335 0.22
336 0.17
337 0.17
338 0.16
339 0.16
340 0.15
341 0.13
342 0.14
343 0.15
344 0.17
345 0.22
346 0.24
347 0.24
348 0.27
349 0.32
350 0.38
351 0.41
352 0.42
353 0.36
354 0.33
355 0.32
356 0.29
357 0.23
358 0.15
359 0.1
360 0.07
361 0.1
362 0.11
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.12
367 0.11
368 0.1
369 0.06
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.11
376 0.11
377 0.15
378 0.19
379 0.19
380 0.18
381 0.18
382 0.19
383 0.16
384 0.2
385 0.22
386 0.19
387 0.2
388 0.2
389 0.23
390 0.26
391 0.27
392 0.26
393 0.22
394 0.21
395 0.21
396 0.22
397 0.22
398 0.2
399 0.19
400 0.15
401 0.21
402 0.22
403 0.22
404 0.21
405 0.2
406 0.18
407 0.19
408 0.19
409 0.14
410 0.18
411 0.16
412 0.16
413 0.15
414 0.17
415 0.2
416 0.2
417 0.21
418 0.2
419 0.23
420 0.28
421 0.32
422 0.32
423 0.35
424 0.41
425 0.43
426 0.41
427 0.44
428 0.41
429 0.42
430 0.49
431 0.52
432 0.57
433 0.65
434 0.72
435 0.77
436 0.84
437 0.89
438 0.92
439 0.92
440 0.92
441 0.92
442 0.93
443 0.9
444 0.85
445 0.83
446 0.8
447 0.74
448 0.65
449 0.55
450 0.44
451 0.37
452 0.33
453 0.24
454 0.16
455 0.12
456 0.09
457 0.07
458 0.06
459 0.05
460 0.05
461 0.04
462 0.04
463 0.03
464 0.03
465 0.03
466 0.03
467 0.05
468 0.05
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.08
473 0.09
474 0.1
475 0.09
476 0.09
477 0.1
478 0.11
479 0.1
480 0.1
481 0.1
482 0.09
483 0.09
484 0.1
485 0.09
486 0.09
487 0.08
488 0.1
489 0.1
490 0.09
491 0.09
492 0.08
493 0.11
494 0.1
495 0.1
496 0.08
497 0.11
498 0.12
499 0.15
500 0.2
501 0.19
502 0.2
503 0.2
504 0.21
505 0.22
506 0.25
507 0.23
508 0.24
509 0.32
510 0.37
511 0.42
512 0.43
513 0.46
514 0.48
515 0.49
516 0.47
517 0.45
518 0.47
519 0.48
520 0.51
521 0.5
522 0.51
523 0.53
524 0.57
525 0.53
526 0.45
527 0.43
528 0.37
529 0.34
530 0.28
531 0.26
532 0.22
533 0.23
534 0.22
535 0.23
536 0.24
537 0.24
538 0.23
539 0.27
540 0.26
541 0.24
542 0.25
543 0.24
544 0.24
545 0.23
546 0.23
547 0.17
548 0.14
549 0.14
550 0.13
551 0.1
552 0.12
553 0.13
554 0.14
555 0.14
556 0.16
557 0.19
558 0.22
559 0.24
560 0.24
561 0.26
562 0.32
563 0.37
564 0.41
565 0.39
566 0.37
567 0.41
568 0.39
569 0.37
570 0.31
571 0.29
572 0.27
573 0.28
574 0.28
575 0.23
576 0.24
577 0.23
578 0.22
579 0.18
580 0.15
581 0.14
582 0.12
583 0.11
584 0.1
585 0.12
586 0.12
587 0.13
588 0.14
589 0.14
590 0.13
591 0.15
592 0.2
593 0.22
594 0.24
595 0.25
596 0.26
597 0.25
598 0.27
599 0.3
600 0.32
601 0.38
602 0.45
603 0.54
604 0.61
605 0.71
606 0.77
607 0.81
608 0.82
609 0.82
610 0.83
611 0.8
612 0.73
613 0.63
614 0.55
615 0.45
616 0.37
617 0.27