Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0X5A5

Protein Details
Accession A0A4U0X5A5    Localization Confidence Low Confidence Score 7.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-29AVATRPSPALRQRRESQRPSLTKSNGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 13.5, nucl 9, cyto_mito 9, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATAVATRPSPALRQRRESQRPSLTKSNGRAGPGDGANDNKAQKGKLSEPLVRTSEHILQKFKGKPPSLIVHLYPTHFRFDQQDGNFGYKSPMAVFLEYCRKETVPHDMLEELFQSNVTFYDGCLIVQIYDHKTSAGTAASQHPATNAVGAGLTQPSSIHNYNEHLTPSPYVPYPVKSNSLAQAKTSPLMDQKEKDRENMPAPSQLGSARRKSTSGSKITHIVLHSTPLSLHNEISILASTPASDSRINKRHQNMPSNGKDGATPSTPLTVSVPPTPTLSRGSIAKRPKMILEEKDVHVFEAEVLISAETPLYLEPARDFGHAQAILDALRHPLHENKPPPPKTRKRTTAELAAEDARDAEEERFMLLMDERLGSSTSAAAAGVGSSTAEGQGGAAAFEPRFSRFKTLENIRMRHEESVRVKKEEDARLALEKRQLDAEMAKRKAEAEQQRRKMQRGQEQLMQQQAMMAATQQQQQQQQQHNQTQAHALQATQFFPDPRINDPRHQSFSMQAQLSSPVVQQQTSLMNTSPLAQSTMTANTTDGVPHVTTSSAHGAGSPLQRPSSAAPLMRGGPSAQGQAQLAMVRQQSQQQSQSRHGTPQMAQGTPNMGQAIPATRHMTPTPRLAHGSPVPGLQGTPQNIMMGTPQMNQQQFTPQQMAIIRQQQARLHAQQQAQGMQGSPQQNMTPEQAQQFAIIQAQRMQAAQHQAQQLAAQQQQQQQTNPAVYQAQIARQMQHQMASVQQAQQQQQQNTQGSPPNPSATPTPQLPAQSLPNQTANGTMGTNISQMDPQQQQQMVLQQQRQNQLRAQAARLQQQQTQQQIALLTAQNGGQLPPHIQQQLMMQRQRQAQAQAQAQAAMQGNAGAGGGAGAMINGLAGAQGGGNGGGGGGDAQREAYVAAMRQQQVRLQMMAQMGRGQGGQGGQQQGGQQAQMNMLAMQQALQNGQSVQMPNGMPNGMNSGGQGRGGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.64
3 0.73
4 0.81
5 0.81
6 0.81
7 0.82
8 0.81
9 0.81
10 0.81
11 0.78
12 0.76
13 0.75
14 0.74
15 0.67
16 0.62
17 0.56
18 0.48
19 0.47
20 0.4
21 0.36
22 0.29
23 0.29
24 0.29
25 0.31
26 0.3
27 0.28
28 0.29
29 0.27
30 0.29
31 0.33
32 0.35
33 0.39
34 0.45
35 0.47
36 0.48
37 0.54
38 0.52
39 0.46
40 0.43
41 0.4
42 0.42
43 0.43
44 0.44
45 0.41
46 0.42
47 0.5
48 0.55
49 0.56
50 0.58
51 0.53
52 0.53
53 0.56
54 0.61
55 0.57
56 0.55
57 0.49
58 0.46
59 0.46
60 0.44
61 0.43
62 0.37
63 0.38
64 0.33
65 0.34
66 0.31
67 0.34
68 0.41
69 0.36
70 0.41
71 0.38
72 0.42
73 0.4
74 0.35
75 0.32
76 0.24
77 0.24
78 0.18
79 0.21
80 0.18
81 0.2
82 0.2
83 0.24
84 0.33
85 0.33
86 0.34
87 0.31
88 0.3
89 0.31
90 0.33
91 0.37
92 0.32
93 0.31
94 0.32
95 0.3
96 0.3
97 0.29
98 0.27
99 0.18
100 0.13
101 0.12
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.1
106 0.08
107 0.08
108 0.12
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.12
113 0.1
114 0.12
115 0.16
116 0.16
117 0.18
118 0.19
119 0.18
120 0.18
121 0.18
122 0.18
123 0.15
124 0.12
125 0.12
126 0.17
127 0.2
128 0.21
129 0.2
130 0.19
131 0.2
132 0.19
133 0.18
134 0.13
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.15
145 0.16
146 0.17
147 0.19
148 0.22
149 0.24
150 0.26
151 0.26
152 0.22
153 0.23
154 0.22
155 0.21
156 0.21
157 0.2
158 0.22
159 0.22
160 0.23
161 0.27
162 0.28
163 0.31
164 0.3
165 0.33
166 0.36
167 0.41
168 0.38
169 0.35
170 0.35
171 0.33
172 0.32
173 0.3
174 0.25
175 0.23
176 0.29
177 0.32
178 0.32
179 0.38
180 0.46
181 0.47
182 0.48
183 0.45
184 0.45
185 0.46
186 0.48
187 0.42
188 0.37
189 0.37
190 0.35
191 0.33
192 0.31
193 0.32
194 0.31
195 0.35
196 0.34
197 0.34
198 0.34
199 0.36
200 0.43
201 0.44
202 0.47
203 0.44
204 0.42
205 0.46
206 0.46
207 0.46
208 0.37
209 0.32
210 0.24
211 0.24
212 0.22
213 0.18
214 0.17
215 0.17
216 0.2
217 0.18
218 0.17
219 0.14
220 0.14
221 0.14
222 0.15
223 0.12
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.08
229 0.09
230 0.1
231 0.13
232 0.16
233 0.25
234 0.33
235 0.37
236 0.44
237 0.48
238 0.55
239 0.6
240 0.65
241 0.63
242 0.65
243 0.67
244 0.63
245 0.58
246 0.49
247 0.42
248 0.34
249 0.3
250 0.22
251 0.18
252 0.15
253 0.17
254 0.16
255 0.16
256 0.17
257 0.16
258 0.17
259 0.19
260 0.21
261 0.19
262 0.22
263 0.22
264 0.21
265 0.22
266 0.2
267 0.19
268 0.22
269 0.25
270 0.3
271 0.37
272 0.4
273 0.4
274 0.4
275 0.4
276 0.42
277 0.43
278 0.4
279 0.4
280 0.4
281 0.38
282 0.41
283 0.39
284 0.33
285 0.27
286 0.23
287 0.15
288 0.11
289 0.09
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.03
297 0.04
298 0.03
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.06
303 0.1
304 0.11
305 0.12
306 0.12
307 0.11
308 0.17
309 0.17
310 0.16
311 0.14
312 0.13
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.07
317 0.08
318 0.08
319 0.1
320 0.16
321 0.2
322 0.28
323 0.32
324 0.39
325 0.49
326 0.54
327 0.6
328 0.64
329 0.7
330 0.71
331 0.77
332 0.79
333 0.74
334 0.76
335 0.73
336 0.72
337 0.64
338 0.57
339 0.49
340 0.4
341 0.34
342 0.26
343 0.21
344 0.12
345 0.09
346 0.09
347 0.07
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.07
358 0.06
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.03
373 0.02
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.07
387 0.09
388 0.11
389 0.12
390 0.17
391 0.17
392 0.21
393 0.28
394 0.33
395 0.4
396 0.45
397 0.47
398 0.45
399 0.47
400 0.45
401 0.41
402 0.36
403 0.35
404 0.36
405 0.43
406 0.43
407 0.41
408 0.4
409 0.4
410 0.46
411 0.43
412 0.38
413 0.3
414 0.29
415 0.33
416 0.33
417 0.31
418 0.28
419 0.24
420 0.21
421 0.2
422 0.18
423 0.14
424 0.17
425 0.22
426 0.26
427 0.26
428 0.26
429 0.25
430 0.25
431 0.26
432 0.31
433 0.34
434 0.36
435 0.45
436 0.52
437 0.59
438 0.62
439 0.63
440 0.61
441 0.58
442 0.57
443 0.55
444 0.52
445 0.5
446 0.5
447 0.49
448 0.46
449 0.38
450 0.29
451 0.2
452 0.17
453 0.12
454 0.08
455 0.06
456 0.07
457 0.08
458 0.11
459 0.13
460 0.15
461 0.19
462 0.23
463 0.3
464 0.33
465 0.38
466 0.42
467 0.44
468 0.46
469 0.43
470 0.4
471 0.36
472 0.3
473 0.25
474 0.19
475 0.15
476 0.12
477 0.13
478 0.13
479 0.11
480 0.11
481 0.09
482 0.11
483 0.14
484 0.13
485 0.16
486 0.23
487 0.25
488 0.29
489 0.35
490 0.38
491 0.4
492 0.39
493 0.36
494 0.31
495 0.32
496 0.33
497 0.27
498 0.22
499 0.18
500 0.18
501 0.18
502 0.16
503 0.12
504 0.11
505 0.11
506 0.11
507 0.1
508 0.1
509 0.12
510 0.12
511 0.13
512 0.1
513 0.1
514 0.1
515 0.12
516 0.1
517 0.08
518 0.09
519 0.07
520 0.08
521 0.09
522 0.1
523 0.1
524 0.09
525 0.09
526 0.08
527 0.09
528 0.08
529 0.07
530 0.07
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.06
535 0.06
536 0.09
537 0.11
538 0.1
539 0.09
540 0.09
541 0.1
542 0.13
543 0.16
544 0.15
545 0.14
546 0.14
547 0.14
548 0.15
549 0.16
550 0.18
551 0.17
552 0.16
553 0.16
554 0.17
555 0.19
556 0.18
557 0.17
558 0.12
559 0.11
560 0.12
561 0.12
562 0.1
563 0.1
564 0.1
565 0.1
566 0.1
567 0.09
568 0.08
569 0.1
570 0.1
571 0.11
572 0.12
573 0.17
574 0.19
575 0.22
576 0.29
577 0.31
578 0.35
579 0.39
580 0.45
581 0.41
582 0.41
583 0.4
584 0.36
585 0.31
586 0.35
587 0.33
588 0.27
589 0.26
590 0.24
591 0.25
592 0.22
593 0.22
594 0.14
595 0.1
596 0.1
597 0.1
598 0.13
599 0.11
600 0.13
601 0.15
602 0.14
603 0.17
604 0.18
605 0.22
606 0.21
607 0.27
608 0.28
609 0.27
610 0.3
611 0.28
612 0.32
613 0.3
614 0.3
615 0.24
616 0.21
617 0.19
618 0.16
619 0.16
620 0.13
621 0.15
622 0.14
623 0.15
624 0.15
625 0.14
626 0.14
627 0.14
628 0.13
629 0.11
630 0.1
631 0.1
632 0.13
633 0.18
634 0.18
635 0.19
636 0.19
637 0.24
638 0.25
639 0.27
640 0.26
641 0.21
642 0.23
643 0.24
644 0.26
645 0.23
646 0.28
647 0.28
648 0.27
649 0.31
650 0.3
651 0.34
652 0.36
653 0.35
654 0.33
655 0.35
656 0.35
657 0.36
658 0.36
659 0.33
660 0.28
661 0.25
662 0.21
663 0.16
664 0.2
665 0.18
666 0.16
667 0.16
668 0.15
669 0.17
670 0.19
671 0.21
672 0.18
673 0.19
674 0.2
675 0.2
676 0.2
677 0.19
678 0.17
679 0.14
680 0.15
681 0.13
682 0.13
683 0.14
684 0.15
685 0.15
686 0.14
687 0.14
688 0.14
689 0.2
690 0.21
691 0.23
692 0.24
693 0.24
694 0.24
695 0.24
696 0.23
697 0.22
698 0.23
699 0.21
700 0.24
701 0.29
702 0.35
703 0.37
704 0.35
705 0.34
706 0.35
707 0.33
708 0.28
709 0.25
710 0.2
711 0.17
712 0.2
713 0.17
714 0.18
715 0.22
716 0.23
717 0.22
718 0.24
719 0.28
720 0.24
721 0.25
722 0.23
723 0.17
724 0.18
725 0.21
726 0.21
727 0.19
728 0.23
729 0.26
730 0.27
731 0.34
732 0.39
733 0.37
734 0.41
735 0.45
736 0.43
737 0.39
738 0.41
739 0.4
740 0.34
741 0.36
742 0.33
743 0.29
744 0.27
745 0.28
746 0.28
747 0.27
748 0.3
749 0.27
750 0.27
751 0.26
752 0.28
753 0.27
754 0.26
755 0.27
756 0.28
757 0.29
758 0.3
759 0.3
760 0.3
761 0.28
762 0.27
763 0.22
764 0.18
765 0.15
766 0.12
767 0.11
768 0.11
769 0.11
770 0.1
771 0.1
772 0.09
773 0.1
774 0.16
775 0.18
776 0.19
777 0.24
778 0.25
779 0.25
780 0.26
781 0.32
782 0.33
783 0.36
784 0.4
785 0.39
786 0.44
787 0.52
788 0.55
789 0.51
790 0.47
791 0.48
792 0.49
793 0.47
794 0.45
795 0.42
796 0.43
797 0.48
798 0.52
799 0.48
800 0.44
801 0.48
802 0.52
803 0.5
804 0.48
805 0.4
806 0.35
807 0.32
808 0.29
809 0.25
810 0.19
811 0.15
812 0.14
813 0.13
814 0.13
815 0.13
816 0.13
817 0.11
818 0.11
819 0.13
820 0.15
821 0.2
822 0.19
823 0.19
824 0.2
825 0.27
826 0.35
827 0.4
828 0.42
829 0.41
830 0.46
831 0.51
832 0.53
833 0.49
834 0.45
835 0.43
836 0.46
837 0.48
838 0.46
839 0.42
840 0.39
841 0.35
842 0.34
843 0.28
844 0.21
845 0.16
846 0.12
847 0.11
848 0.1
849 0.1
850 0.05
851 0.04
852 0.03
853 0.03
854 0.03
855 0.03
856 0.02
857 0.02
858 0.02
859 0.02
860 0.02
861 0.02
862 0.02
863 0.02
864 0.03
865 0.03
866 0.03
867 0.03
868 0.04
869 0.04
870 0.04
871 0.03
872 0.03
873 0.03
874 0.04
875 0.04
876 0.04
877 0.05
878 0.05
879 0.05
880 0.06
881 0.06
882 0.07
883 0.09
884 0.09
885 0.15
886 0.21
887 0.24
888 0.27
889 0.29
890 0.31
891 0.35
892 0.38
893 0.34
894 0.28
895 0.3
896 0.3
897 0.3
898 0.28
899 0.24
900 0.21
901 0.2
902 0.2
903 0.16
904 0.13
905 0.13
906 0.15
907 0.18
908 0.2
909 0.19
910 0.21
911 0.23
912 0.24
913 0.24
914 0.22
915 0.19
916 0.18
917 0.19
918 0.18
919 0.18
920 0.14
921 0.14
922 0.14
923 0.1
924 0.1
925 0.1
926 0.1
927 0.11
928 0.11
929 0.12
930 0.12
931 0.13
932 0.16
933 0.16
934 0.16
935 0.21
936 0.21
937 0.2
938 0.23
939 0.22
940 0.18
941 0.18
942 0.22
943 0.17
944 0.17
945 0.16
946 0.17
947 0.17