Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0WHM5

Protein Details
Accession A0A4U0WHM5    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
536-581RAEEKKTTTTKKKPRKAENDSDDEALAKKRKTPAKKKANGVKKDESBasic
801-823RGRGEHPKTGKVKKRVSPEQITIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
519-554KEKANIEKRAEKEAKAIRAEEKKTTTTKKKPRKAEN
559-578EALAKKRKTPAKKKANGVKK
588-613LRKKAPMNKAKAKSEPTTPAKKGKKA
802-815GRGEHPKTGKVKKR
Subcellular Location(s) cyto 16.5, cyto_mito 11, nucl 6, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026992  DIOX_N  
IPR013034  DNA_topo_DNA_db_N_dom1  
IPR013030  DNA_topo_DNA_db_N_dom2  
IPR044861  IPNS-like_FE2OG_OXY  
IPR027443  IPNS-like_sf  
IPR005123  Oxoglu/Fe-dep_dioxygenase  
IPR008336  TopoI_DNA-bd_euk  
IPR036202  TopoI_DNA-bd_euk_N_sf  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003917  F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity  
GO:0006265  P:DNA topological change  
GO:1901362  P:organic cyclic compound biosynthetic process  
GO:0044283  P:small molecule biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF03171  2OG-FeII_Oxy  
PF14226  DIOX_N  
PF02919  Topoisom_I_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51471  FE2OG_OXY  
CDD cd03488  Topoisomer_IB_N_htopoI_like  
Amino Acid Sequences MSPSKIPSPSTSPIPVIDFSPFANAPSEPSSRDQKAVAAKIHEAFRSVGFVYLTNHGVPREKVEECFMWSERFFALPQDFKMLAPHPPGGAHHRGYSGLGQEKVSQNVFDGAEIKKLREVPDVKESFESGNVDDKTQPNIWLPENRLPGFRDFAESFLIDCAALVHRVLSSIALGLGLPATFFERSHAHDLFQLRLLHYPPVSTSLLRSGARDRIAAHSDFGTITLLFQDDVGGLEVEDPHAPDTFRGVTPVQGAVLVNVADLMMRWSNDVLRSTVHRVGAPPTVGDDGEGEGKETVTRARYSIPFFATADSDAVIDCLEGCWSEERPKRDYHQQRAEALKQTSISLQPFPGVAYFRPYIAMSSSSDDDAPLINNKAKGAKSADHISKSVDQAMDRGNPSSSRVMPGVSIRMGPVEEMDVDKPETNGHANGTVNGKRKARSSATNGKSYKETSASEDEDDVPLTKRRRTAPVKAGSPSSSELSDVPLAKKTLKKPPKAAAHDIGEESDSDVPLGQKLAKEKANIEKRAEKEAKAIRAEEKKTTTTKKKPRKAENDSDDEALAKKRKTPAKKKANGVKKDESDDDDIPLRKKAPMNKAKAKSEPTTPAKKGKKAVKVEETAEDLEAEEEEEEYRWWEDPTKGDGTKKWTTLEHNGVVFPPPYEPLPKNVKMRYDGTSVTLVPEAEEVAGFYGSMLNSTVNIENPTFNKNFFADFKEVLDKTGHAKDKDGNKIKIKDFEKCDFKPIFEYYDAQRAEKKALPAAEKKALKAAKDEAEAPYMYCTWDGRKQKVGNFRVEPPGLFRGRGEHPKTGKVKKRVSPEQITINIGKEATVPAPPEGHEWKEVKHDNEGTWLAMWQENINGAY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.36
3 0.3
4 0.28
5 0.23
6 0.19
7 0.23
8 0.21
9 0.19
10 0.2
11 0.18
12 0.2
13 0.24
14 0.26
15 0.23
16 0.28
17 0.35
18 0.36
19 0.38
20 0.35
21 0.36
22 0.42
23 0.45
24 0.46
25 0.41
26 0.42
27 0.44
28 0.47
29 0.42
30 0.35
31 0.31
32 0.27
33 0.26
34 0.23
35 0.2
36 0.17
37 0.18
38 0.18
39 0.2
40 0.21
41 0.19
42 0.21
43 0.2
44 0.24
45 0.24
46 0.27
47 0.29
48 0.29
49 0.29
50 0.33
51 0.33
52 0.32
53 0.36
54 0.32
55 0.3
56 0.29
57 0.29
58 0.25
59 0.24
60 0.21
61 0.21
62 0.25
63 0.25
64 0.26
65 0.3
66 0.3
67 0.28
68 0.33
69 0.29
70 0.28
71 0.29
72 0.29
73 0.24
74 0.25
75 0.28
76 0.3
77 0.35
78 0.32
79 0.3
80 0.3
81 0.3
82 0.31
83 0.3
84 0.29
85 0.28
86 0.27
87 0.26
88 0.3
89 0.33
90 0.35
91 0.33
92 0.27
93 0.22
94 0.25
95 0.24
96 0.19
97 0.19
98 0.16
99 0.23
100 0.23
101 0.23
102 0.23
103 0.26
104 0.27
105 0.33
106 0.36
107 0.34
108 0.43
109 0.44
110 0.42
111 0.41
112 0.39
113 0.31
114 0.31
115 0.27
116 0.18
117 0.24
118 0.23
119 0.23
120 0.26
121 0.26
122 0.29
123 0.28
124 0.29
125 0.25
126 0.28
127 0.31
128 0.33
129 0.37
130 0.4
131 0.46
132 0.45
133 0.44
134 0.42
135 0.41
136 0.38
137 0.33
138 0.32
139 0.25
140 0.25
141 0.25
142 0.23
143 0.2
144 0.17
145 0.17
146 0.1
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.1
171 0.12
172 0.17
173 0.23
174 0.24
175 0.22
176 0.26
177 0.28
178 0.27
179 0.3
180 0.28
181 0.22
182 0.25
183 0.25
184 0.24
185 0.22
186 0.21
187 0.16
188 0.19
189 0.2
190 0.17
191 0.17
192 0.18
193 0.23
194 0.23
195 0.24
196 0.24
197 0.27
198 0.28
199 0.28
200 0.25
201 0.26
202 0.29
203 0.28
204 0.25
205 0.2
206 0.2
207 0.18
208 0.17
209 0.13
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.11
232 0.13
233 0.12
234 0.15
235 0.14
236 0.15
237 0.16
238 0.16
239 0.13
240 0.11
241 0.11
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.09
256 0.12
257 0.13
258 0.12
259 0.13
260 0.16
261 0.21
262 0.24
263 0.23
264 0.22
265 0.22
266 0.24
267 0.25
268 0.22
269 0.17
270 0.15
271 0.15
272 0.14
273 0.13
274 0.11
275 0.08
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.09
284 0.1
285 0.1
286 0.11
287 0.14
288 0.18
289 0.21
290 0.24
291 0.24
292 0.23
293 0.23
294 0.23
295 0.2
296 0.17
297 0.14
298 0.11
299 0.09
300 0.07
301 0.07
302 0.06
303 0.05
304 0.04
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.04
309 0.06
310 0.07
311 0.16
312 0.21
313 0.24
314 0.27
315 0.31
316 0.34
317 0.43
318 0.52
319 0.54
320 0.59
321 0.6
322 0.63
323 0.65
324 0.65
325 0.61
326 0.51
327 0.43
328 0.33
329 0.29
330 0.25
331 0.22
332 0.2
333 0.14
334 0.14
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.11
339 0.1
340 0.09
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.13
345 0.13
346 0.12
347 0.12
348 0.13
349 0.1
350 0.12
351 0.12
352 0.12
353 0.12
354 0.11
355 0.1
356 0.09
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.1
361 0.11
362 0.12
363 0.15
364 0.15
365 0.17
366 0.19
367 0.19
368 0.21
369 0.27
370 0.3
371 0.27
372 0.28
373 0.27
374 0.27
375 0.25
376 0.24
377 0.18
378 0.15
379 0.15
380 0.17
381 0.17
382 0.15
383 0.15
384 0.13
385 0.13
386 0.15
387 0.17
388 0.15
389 0.14
390 0.14
391 0.13
392 0.13
393 0.14
394 0.13
395 0.11
396 0.11
397 0.09
398 0.09
399 0.08
400 0.07
401 0.06
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.06
406 0.07
407 0.07
408 0.08
409 0.08
410 0.07
411 0.08
412 0.08
413 0.09
414 0.08
415 0.1
416 0.1
417 0.11
418 0.15
419 0.19
420 0.22
421 0.26
422 0.27
423 0.26
424 0.28
425 0.32
426 0.31
427 0.32
428 0.36
429 0.42
430 0.44
431 0.51
432 0.5
433 0.46
434 0.44
435 0.4
436 0.34
437 0.26
438 0.23
439 0.18
440 0.22
441 0.22
442 0.2
443 0.2
444 0.19
445 0.16
446 0.16
447 0.12
448 0.1
449 0.14
450 0.15
451 0.16
452 0.2
453 0.23
454 0.32
455 0.37
456 0.44
457 0.49
458 0.55
459 0.56
460 0.53
461 0.52
462 0.44
463 0.4
464 0.33
465 0.24
466 0.17
467 0.14
468 0.12
469 0.13
470 0.14
471 0.13
472 0.12
473 0.14
474 0.14
475 0.16
476 0.21
477 0.24
478 0.33
479 0.4
480 0.45
481 0.49
482 0.57
483 0.64
484 0.65
485 0.66
486 0.6
487 0.55
488 0.5
489 0.44
490 0.36
491 0.26
492 0.2
493 0.16
494 0.11
495 0.08
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.07
501 0.07
502 0.08
503 0.11
504 0.15
505 0.18
506 0.19
507 0.22
508 0.31
509 0.39
510 0.41
511 0.43
512 0.45
513 0.45
514 0.53
515 0.52
516 0.43
517 0.42
518 0.43
519 0.45
520 0.4
521 0.39
522 0.36
523 0.41
524 0.43
525 0.39
526 0.37
527 0.36
528 0.39
529 0.46
530 0.49
531 0.53
532 0.61
533 0.67
534 0.73
535 0.79
536 0.84
537 0.86
538 0.86
539 0.86
540 0.83
541 0.79
542 0.73
543 0.64
544 0.53
545 0.43
546 0.34
547 0.28
548 0.25
549 0.18
550 0.2
551 0.27
552 0.35
553 0.45
554 0.55
555 0.61
556 0.68
557 0.76
558 0.81
559 0.84
560 0.86
561 0.83
562 0.8
563 0.77
564 0.69
565 0.65
566 0.58
567 0.52
568 0.47
569 0.39
570 0.33
571 0.3
572 0.29
573 0.26
574 0.26
575 0.23
576 0.22
577 0.25
578 0.31
579 0.38
580 0.45
581 0.53
582 0.61
583 0.67
584 0.69
585 0.71
586 0.69
587 0.61
588 0.58
589 0.57
590 0.55
591 0.56
592 0.54
593 0.58
594 0.59
595 0.62
596 0.64
597 0.63
598 0.65
599 0.65
600 0.69
601 0.67
602 0.64
603 0.61
604 0.56
605 0.5
606 0.42
607 0.34
608 0.25
609 0.17
610 0.13
611 0.11
612 0.09
613 0.06
614 0.05
615 0.05
616 0.06
617 0.06
618 0.07
619 0.08
620 0.08
621 0.09
622 0.12
623 0.14
624 0.17
625 0.21
626 0.26
627 0.27
628 0.29
629 0.32
630 0.36
631 0.39
632 0.38
633 0.36
634 0.33
635 0.37
636 0.42
637 0.45
638 0.41
639 0.37
640 0.35
641 0.33
642 0.32
643 0.27
644 0.2
645 0.14
646 0.12
647 0.12
648 0.18
649 0.18
650 0.23
651 0.31
652 0.37
653 0.44
654 0.46
655 0.5
656 0.48
657 0.51
658 0.48
659 0.43
660 0.38
661 0.33
662 0.32
663 0.27
664 0.23
665 0.21
666 0.17
667 0.13
668 0.13
669 0.1
670 0.08
671 0.07
672 0.06
673 0.06
674 0.06
675 0.05
676 0.05
677 0.06
678 0.06
679 0.07
680 0.07
681 0.06
682 0.07
683 0.1
684 0.11
685 0.1
686 0.13
687 0.13
688 0.16
689 0.17
690 0.22
691 0.21
692 0.21
693 0.22
694 0.21
695 0.24
696 0.23
697 0.27
698 0.26
699 0.26
700 0.28
701 0.32
702 0.31
703 0.29
704 0.28
705 0.24
706 0.24
707 0.32
708 0.35
709 0.29
710 0.31
711 0.36
712 0.44
713 0.54
714 0.58
715 0.58
716 0.6
717 0.67
718 0.69
719 0.71
720 0.66
721 0.64
722 0.62
723 0.63
724 0.63
725 0.57
726 0.61
727 0.53
728 0.51
729 0.48
730 0.43
731 0.39
732 0.32
733 0.34
734 0.29
735 0.36
736 0.35
737 0.31
738 0.34
739 0.31
740 0.34
741 0.35
742 0.35
743 0.31
744 0.35
745 0.4
746 0.42
747 0.47
748 0.51
749 0.49
750 0.47
751 0.5
752 0.48
753 0.43
754 0.41
755 0.41
756 0.37
757 0.38
758 0.39
759 0.33
760 0.33
761 0.32
762 0.28
763 0.24
764 0.19
765 0.17
766 0.16
767 0.15
768 0.17
769 0.26
770 0.34
771 0.36
772 0.45
773 0.5
774 0.56
775 0.65
776 0.66
777 0.66
778 0.63
779 0.63
780 0.62
781 0.59
782 0.52
783 0.47
784 0.49
785 0.41
786 0.38
787 0.33
788 0.3
789 0.36
790 0.46
791 0.46
792 0.47
793 0.49
794 0.57
795 0.66
796 0.71
797 0.73
798 0.73
799 0.77
800 0.75
801 0.81
802 0.82
803 0.83
804 0.81
805 0.77
806 0.76
807 0.7
808 0.68
809 0.6
810 0.51
811 0.44
812 0.35
813 0.29
814 0.21
815 0.2
816 0.16
817 0.17
818 0.17
819 0.17
820 0.19
821 0.19
822 0.24
823 0.27
824 0.29
825 0.33
826 0.33
827 0.33
828 0.42
829 0.48
830 0.45
831 0.48
832 0.49
833 0.43
834 0.48
835 0.47
836 0.38
837 0.32
838 0.3
839 0.23
840 0.21
841 0.21
842 0.15
843 0.15