Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0XCA6

Protein Details
Accession A0A4U0XCA6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
520-542TATPSRWRFKKDKDGTPRFRDDKBasic
572-593SMIAKAWKKRHPEEEQAKKRMAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 9, mito 1, pero 1, golg 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013921  Mediator_Med20  
IPR001339  mRNA_cap_enzyme_adenylation  
IPR013846  mRNA_cap_enzyme_C  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004484  F:mRNA guanylyltransferase activity  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006370  P:7-methylguanosine mRNA capping  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08612  Med20  
PF03919  mRNA_cap_C  
PF01331  mRNA_cap_enzyme  
CDD cd07895  Adenylation_mRNA_capping  
Amino Acid Sequences MSITVMFYFPDNVQDNEANLDFFVRRLEQYYKTTELPNWSIQHQLFQSTKAPRHSIACDPFATRWMALMNFSDYSERTYISIWSPSASQHEDKDLCTITISPDQTDEFVQLLGEKYSTLWSPRPRAAYIPNGRAFQANGFSVKIADVKDNAEQQRHRGVIVSVSAPTVLRPEDSVLSDEELLQSKIEARTHGLLSIALMGGAVPLLSDVGEKADNELADHYRREVARLLNRRQLSFPGAQPVSFCRHHIEELQRTDYLLCEKTDGIRCLLYFTKDESGNEMHFLIDRKNDYYLVPQLTLHFPLPDQPPTTFHTDTLIDGELVIDALPDGREEKNYLVFDCMMLDNRSYIEKPLDKRIGAFSEFVFKPYDKLLKEYPEEIEHQAFIVKFKAMQKSYGTEMMFRDILPNLPHGNDGLVFTCKDTPYMFGTDQHILKWKPPHENTVDFKLQMGDFPMFDPQDGEEGLIPDYHAMPSFELLVHYERNDDRFFAHLYVTEDEWQLLKSLNQQLDGRIIECYKDSTATPSRWRFKKDKDGTPRFRDDKIDANHISTVNSVLQSFEDGVSERDLIGAASMIAKAWKKRHPEEEQAKKRMAQRTIPGAPNGTNGQPALQRNGTAH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.28
4 0.28
5 0.21
6 0.18
7 0.19
8 0.15
9 0.14
10 0.16
11 0.14
12 0.15
13 0.2
14 0.25
15 0.28
16 0.33
17 0.39
18 0.4
19 0.4
20 0.42
21 0.41
22 0.43
23 0.42
24 0.45
25 0.41
26 0.38
27 0.43
28 0.4
29 0.42
30 0.36
31 0.38
32 0.32
33 0.33
34 0.39
35 0.4
36 0.45
37 0.45
38 0.48
39 0.44
40 0.48
41 0.49
42 0.51
43 0.49
44 0.47
45 0.43
46 0.42
47 0.4
48 0.38
49 0.36
50 0.26
51 0.21
52 0.2
53 0.18
54 0.17
55 0.18
56 0.19
57 0.17
58 0.18
59 0.19
60 0.17
61 0.2
62 0.19
63 0.18
64 0.15
65 0.16
66 0.17
67 0.18
68 0.21
69 0.17
70 0.18
71 0.18
72 0.19
73 0.23
74 0.26
75 0.26
76 0.24
77 0.32
78 0.32
79 0.32
80 0.34
81 0.3
82 0.25
83 0.24
84 0.22
85 0.18
86 0.23
87 0.23
88 0.2
89 0.2
90 0.2
91 0.21
92 0.21
93 0.18
94 0.12
95 0.11
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.1
104 0.11
105 0.14
106 0.19
107 0.26
108 0.32
109 0.37
110 0.41
111 0.4
112 0.43
113 0.45
114 0.49
115 0.5
116 0.53
117 0.52
118 0.49
119 0.48
120 0.45
121 0.4
122 0.32
123 0.27
124 0.2
125 0.17
126 0.16
127 0.16
128 0.15
129 0.15
130 0.15
131 0.12
132 0.13
133 0.13
134 0.14
135 0.18
136 0.25
137 0.26
138 0.31
139 0.31
140 0.33
141 0.39
142 0.37
143 0.34
144 0.28
145 0.26
146 0.22
147 0.23
148 0.21
149 0.14
150 0.13
151 0.14
152 0.12
153 0.11
154 0.1
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.1
159 0.12
160 0.13
161 0.14
162 0.13
163 0.14
164 0.14
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.11
169 0.1
170 0.09
171 0.11
172 0.14
173 0.15
174 0.14
175 0.15
176 0.18
177 0.19
178 0.19
179 0.16
180 0.13
181 0.12
182 0.12
183 0.09
184 0.06
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.02
191 0.02
192 0.02
193 0.02
194 0.03
195 0.03
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.11
204 0.12
205 0.14
206 0.14
207 0.14
208 0.16
209 0.17
210 0.18
211 0.2
212 0.23
213 0.3
214 0.39
215 0.43
216 0.46
217 0.48
218 0.47
219 0.45
220 0.41
221 0.37
222 0.31
223 0.27
224 0.28
225 0.26
226 0.25
227 0.24
228 0.24
229 0.25
230 0.23
231 0.23
232 0.18
233 0.2
234 0.21
235 0.26
236 0.31
237 0.32
238 0.35
239 0.37
240 0.33
241 0.32
242 0.3
243 0.26
244 0.22
245 0.16
246 0.13
247 0.11
248 0.12
249 0.16
250 0.21
251 0.21
252 0.19
253 0.18
254 0.18
255 0.19
256 0.2
257 0.18
258 0.14
259 0.15
260 0.17
261 0.17
262 0.17
263 0.18
264 0.18
265 0.17
266 0.17
267 0.15
268 0.11
269 0.12
270 0.12
271 0.1
272 0.11
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.14
277 0.13
278 0.15
279 0.18
280 0.17
281 0.16
282 0.15
283 0.16
284 0.16
285 0.17
286 0.14
287 0.1
288 0.09
289 0.13
290 0.16
291 0.16
292 0.16
293 0.15
294 0.18
295 0.2
296 0.26
297 0.22
298 0.19
299 0.2
300 0.19
301 0.18
302 0.17
303 0.15
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.03
311 0.02
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.08
319 0.09
320 0.13
321 0.14
322 0.14
323 0.14
324 0.13
325 0.13
326 0.13
327 0.12
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.09
335 0.1
336 0.13
337 0.17
338 0.19
339 0.27
340 0.3
341 0.29
342 0.29
343 0.31
344 0.3
345 0.27
346 0.25
347 0.17
348 0.21
349 0.21
350 0.21
351 0.2
352 0.17
353 0.17
354 0.19
355 0.24
356 0.17
357 0.21
358 0.23
359 0.26
360 0.28
361 0.28
362 0.27
363 0.24
364 0.26
365 0.24
366 0.22
367 0.17
368 0.15
369 0.15
370 0.14
371 0.12
372 0.11
373 0.09
374 0.11
375 0.15
376 0.23
377 0.21
378 0.24
379 0.25
380 0.27
381 0.3
382 0.32
383 0.28
384 0.23
385 0.23
386 0.22
387 0.21
388 0.18
389 0.17
390 0.12
391 0.14
392 0.13
393 0.14
394 0.13
395 0.13
396 0.13
397 0.12
398 0.12
399 0.1
400 0.1
401 0.09
402 0.1
403 0.09
404 0.1
405 0.13
406 0.12
407 0.13
408 0.12
409 0.13
410 0.15
411 0.19
412 0.18
413 0.18
414 0.22
415 0.25
416 0.25
417 0.24
418 0.28
419 0.24
420 0.28
421 0.33
422 0.35
423 0.4
424 0.42
425 0.48
426 0.47
427 0.54
428 0.54
429 0.53
430 0.51
431 0.41
432 0.39
433 0.35
434 0.29
435 0.22
436 0.2
437 0.14
438 0.12
439 0.12
440 0.15
441 0.13
442 0.13
443 0.13
444 0.11
445 0.12
446 0.11
447 0.11
448 0.09
449 0.09
450 0.1
451 0.09
452 0.08
453 0.07
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.09
461 0.09
462 0.09
463 0.1
464 0.12
465 0.13
466 0.13
467 0.16
468 0.16
469 0.2
470 0.2
471 0.19
472 0.18
473 0.19
474 0.21
475 0.18
476 0.17
477 0.16
478 0.19
479 0.2
480 0.2
481 0.2
482 0.18
483 0.18
484 0.17
485 0.15
486 0.12
487 0.11
488 0.11
489 0.16
490 0.22
491 0.24
492 0.27
493 0.27
494 0.28
495 0.32
496 0.32
497 0.25
498 0.21
499 0.2
500 0.17
501 0.17
502 0.18
503 0.14
504 0.15
505 0.15
506 0.2
507 0.26
508 0.3
509 0.39
510 0.46
511 0.54
512 0.59
513 0.66
514 0.67
515 0.7
516 0.76
517 0.76
518 0.77
519 0.79
520 0.84
521 0.87
522 0.87
523 0.87
524 0.79
525 0.73
526 0.68
527 0.6
528 0.59
529 0.54
530 0.54
531 0.45
532 0.44
533 0.44
534 0.39
535 0.36
536 0.27
537 0.25
538 0.18
539 0.18
540 0.15
541 0.12
542 0.12
543 0.13
544 0.14
545 0.12
546 0.11
547 0.11
548 0.12
549 0.14
550 0.14
551 0.12
552 0.11
553 0.11
554 0.09
555 0.09
556 0.07
557 0.05
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.1
562 0.14
563 0.21
564 0.28
565 0.34
566 0.43
567 0.51
568 0.61
569 0.65
570 0.72
571 0.77
572 0.81
573 0.85
574 0.83
575 0.78
576 0.73
577 0.72
578 0.7
579 0.65
580 0.62
581 0.6
582 0.63
583 0.67
584 0.66
585 0.62
586 0.57
587 0.51
588 0.47
589 0.42
590 0.34
591 0.29
592 0.24
593 0.25
594 0.27
595 0.29
596 0.32
597 0.3